More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_0113 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_0113  ABC transporter related  100 
 
 		 261 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.692675 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7645  putative sulfonate ABC transporter, ATP binding protein  77.78 
 
 		 261 aa  414  9.999999999999999e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0412308  normal  0.633643 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2893  ABC transporter related  84.3 
 
 		 259 aa  395  1e-109  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.767338  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0779  ABC transporter related  66.39 
 
 		 249 aa  315  6e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3009  ABC transporter related  63.64 
 
 		 245 aa  312  2.9999999999999996e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0769  ABC transporter related  63.07 
 
 		 252 aa  310  1e-83  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.159721 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3339  ABC transporter related  59.7 
 
 		 260 aa  307  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00741331  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2188  ABC transporter related  59.7 
 
 		 260 aa  306  3e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0571708  normal  0.474002 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0331  ABC transporter related  61.98 
 
 		 259 aa  305  5.0000000000000004e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0378  ABC transporter related  61.57 
 
 		 259 aa  303  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0408  ABC transporter related  62.81 
 
 		 259 aa  300  2e-80  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0896853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7222  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  55.1 
 
 		 245 aa  276  4e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22550  ABC transporter ATP-binding protein  51.43 
 
 		 255 aa  228  6e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1572  ABC transporter related protein  45.63 
 
 		 267 aa  225  5.0000000000000005e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4034  ABC transporter related  54.59 
 
 		 276 aa  225  6e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.105857 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1919  ABC transporter related  45.71 
 
 		 265 aa  224  1e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1358  ABC transporter related  47.03 
 
 		 262 aa  224  1e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7199  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (nitrate/sulfonates)  51.28 
 
 		 278 aa  222  4.9999999999999996e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0286852  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0378  hypothetical protein  45.61 
 
 		 260 aa  221  7e-57  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0209  ABC transporter-like  49.38 
 
 		 271 aa  219  3e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5062  ABC transporter related  48.62 
 
 		 246 aa  218  6e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.314971  normal  0.024914 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1573  ABC transporter related  52.25 
 
 		 269 aa  218  8.999999999999998e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1909  ABC transporter related  49.24 
 
 		 286 aa  218  8.999999999999998e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0849  ABC transporter-related protein  47.72 
 
 		 253 aa  217  2e-55  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0140067  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1979  ABC transporter related  45.7 
 
 		 258 aa  216  2.9999999999999998e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000563857  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5145  ABC transporter related  50.9 
 
 		 267 aa  215  5.9999999999999996e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.537076  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0528  ABC transporter related  44.44 
 
 		 247 aa  215  7e-55  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0264  ABC transporter ATP-binding protein  52.94 
 
 		 279 aa  215  7e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.419692  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6521  ABC transporter related  51.32 
 
 		 270 aa  214  9e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6755  ABC transporter related  51.32 
 
 		 270 aa  214  9e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0664482 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4509  ABC transporter related  49.58 
 
 		 267 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3345  ABC transporter related  51.77 
 
 		 293 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0546  ABC transporter related  52.16 
 
 		 245 aa  214  9.999999999999999e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7505  ABC transporter, ATPase subunit  51.8 
 
 		 273 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000247297  normal  0.575396 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1899  ABC transporter-related protein  45.64 
 
 		 264 aa  213  1.9999999999999998e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.126966  hitchhiker  0.000000000000779353 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0482  ABC transporter related protein  42.98 
 
 		 255 aa  213  1.9999999999999998e-54  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3670  ABC transporter related  51.77 
 
 		 293 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.206821  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02330  ABC transporter ATP-binding protein  52.94 
 
 		 279 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.366752  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2932  putative sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  44.35 
 
 		 251 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5128  ABC transporter related  49.38 
 
 		 256 aa  213  2.9999999999999995e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.012319  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6344  ABC transporter related  50.88 
 
 		 270 aa  212  3.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.942875  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1030  ABC transporter, ATP-binding protein  50.7 
 
 		 254 aa  212  4.9999999999999996e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0087  ABC transporter related  47.58 
 
 		 263 aa  212  4.9999999999999996e-54  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2961  sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  44.17 
 
 		 251 aa  209  2e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0749803  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4843  putative ABC transporter ATP-binding protein  49.79 
 
 		 284 aa  210  2e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.365039 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2623  ABC transporter related  45.71 
 
 		 255 aa  210  2e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000578325  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0435  ABC transporter related  44.89 
 
 		 256 aa  210  2e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.30818  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0218  ABC transporter related  46.12 
 
 		 251 aa  209  3e-53  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1733  ABC transporter related protein  45.09 
 
 		 265 aa  209  4e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4184  ABC transporter related  52.21 
 
 		 283 aa  209  5e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.378272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2000  ABC transporter-related protein  45.19 
 
 		 251 aa  209  5e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.554575  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1475  ABC transporter related  43.21 
 
 		 254 aa  209  5e-53  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3505  ABC transporter related  50.88 
 
 		 281 aa  209  5e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.870495  hitchhiker  0.000930317 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2311  putative sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  43.1 
 
 		 251 aa  208  6e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.89952  hitchhiker  0.0000000038093 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5154  ABC transporter related  47.64 
 
 		 268 aa  208  7e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.597589  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1421  ABC transporter related  46.81 
 
 		 293 aa  208  9e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2133  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  46.58 
 
 		 252 aa  207  9e-53  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1260  ABC transporter related  46.81 
 
 		 293 aa  208  9e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.227509 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2714  sulfonate ABC transporter ATP-binding protein  45.13 
 
 		 287 aa  207  1e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0521621  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2642  alkanesulfonates transport ATP-binding protein  45.78 
 
 		 251 aa  207  1e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.164892  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4050  ABC transporter related  46.22 
 
 		 289 aa  207  1e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.95226  normal  0.382919 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2147  ABC transporter related  47.21 
 
 		 274 aa  207  1e-52  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4347  ABC transporter related  50.88 
 
 		 281 aa  207  1e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4019  ABC transporter related  50.88 
 
 		 281 aa  207  1e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3352  ABC transporter related  46.28 
 
 		 261 aa  207  1e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0580  ABC transporter related  49.58 
 
 		 265 aa  207  1e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.860273  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0209  nitrate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  47.58 
 
 		 283 aa  207  2e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.465549 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2665  alkanesulfonates transport ATP-binding protein  45.13 
 
 		 251 aa  207  2e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.273275  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2922  sulfonate ABC transporter ATP-binding protein  45.13 
 
 		 251 aa  207  2e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.900883  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2921  putative sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  45.13 
 
 		 251 aa  207  2e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.88235e-19 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1645  ABC transporter related  46.77 
 
 		 253 aa  207  2e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3642  ABC transporter related  50.93 
 
 		 239 aa  207  2e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000649736  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2968  putative sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  45.33 
 
 		 251 aa  206  3e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.503094  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0513  ABC transporter related  43.81 
 
 		 254 aa  206  4e-52  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0230  ABC transporter related  46.09 
 
 		 287 aa  206  4e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5006  ABC transporter related  46.91 
 
 		 287 aa  205  5e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08090  ABC transporter, ATP-binding component  47.81 
 
 		 269 aa  205  5e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2836  ABC transporter related  46.5 
 
 		 272 aa  205  7e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.840356  normal  0.83525 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4539  ABC transporter related  49.14 
 
 		 256 aa  205  7e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.113352 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0445  ABC transporter related  42.8 
 
 		 254 aa  205  7e-52  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2064  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  51.07 
 
 		 281 aa  204  8e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.768493  normal  0.657795 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1210  ABC transporter related  46.81 
 
 		 287 aa  204  1e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.502786  normal  0.459492 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0392  ABC transporter related  42.8 
 
 		 254 aa  204  1e-51  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.238571  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3066  ABC transporter related protein  50.22 
 
 		 267 aa  204  1e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.583352  normal  0.320404 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2338  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  46.43 
 
 		 276 aa  204  1e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.685879  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1020  ABC transporter-like protein  47.11 
 
 		 437 aa  203  2e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.381169 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4138  ABC transporter-like  50 
 
 		 255 aa  203  2e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000371805  hitchhiker  0.00945872 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4565  ABC transporter related  51.58 
 
 		 281 aa  203  2e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0677  ABC transporter related  45.9 
 
 		 262 aa  202  4e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.28609 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1505  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  46.09 
 
 		 262 aa  202  4e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0234474  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0467  ABC transporter related  49.78 
 
 		 274 aa  202  5e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3867  ABC transporter related  50 
 
 		 265 aa  202  5e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.685954  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  41.3 
 
 		 258 aa  202  5e-51  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6389  ABC transporter related  48.28 
 
 		 256 aa  202  6e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.350257  normal  0.506492 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0235  ABC transporter ATP-binding protein  45.99 
 
 		 438 aa  201  7e-51  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1090  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  47.86 
 
 		 260 aa  201  7e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1965  ABC transporter, ATP-binding protein  45.99 
 
 		 434 aa  201  8e-51  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0032  ABC transporter related  42.86 
 
 		 265 aa  201  8e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1168  putative ABC transporter, ATP-binding protein  47.11 
 
 		 275 aa  201  9e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0238  ABC sulfate ester transporter, ATPase subunit  50.67 
 
 		 286 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.81925  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>