More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_02330 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_02330  ABC transporter ATP-binding protein  100 
 
 		 279 aa  553  1e-157  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.366752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0264  ABC transporter ATP-binding protein  98.92 
 
 		 279 aa  548  1e-155  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.419692  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5006  ABC transporter related  69.93 
 
 		 287 aa  389  1e-107  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0209  ABC transporter-like  69.26 
 
 		 271 aa  387  1e-106  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0230  ABC transporter related  68.53 
 
 		 287 aa  385  1e-106  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08090  ABC transporter, ATP-binding component  65.92 
 
 		 269 aa  348  8e-95  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1573  ABC transporter related  63.77 
 
 		 269 aa  338  4e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1431  ABC transporter related  61.11 
 
 		 269 aa  305  4.0000000000000004e-82  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.242163  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1831  ABC transporter related protein  60.24 
 
 		 266 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0580  ABC transporter related  57.69 
 
 		 265 aa  297  1e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.860273  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2625  ABC transporter related  60.87 
 
 		 267 aa  297  1e-79  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.173465  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1352  ABC transporter related  58.63 
 
 		 262 aa  295  7e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1909  ABC transporter related  57.79 
 
 		 286 aa  288  6e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4335  ABC transporter related protein  57.92 
 
 		 247 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3352  ABC transporter related  54.2 
 
 		 261 aa  276  3e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0150  ABC transporter related  56.67 
 
 		 252 aa  276  3e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4843  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.36 
 
 		 284 aa  275  5e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.365039 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7233  ABC transporter related  57.72 
 
 		 285 aa  275  7e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.373776  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0131  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  56.68 
 
 		 281 aa  270  2e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22550  ABC transporter ATP-binding protein  55.65 
 
 		 255 aa  269  4e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2064  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  57.26 
 
 		 281 aa  267  1e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.768493  normal  0.657795 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2157  sulfate ester ABC transporter ATPase  53.9 
 
 		 288 aa  267  2e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0499335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4347  ABC transporter related  57.26 
 
 		 281 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4019  ABC transporter related  57.26 
 
 		 281 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2099  ABC transporter related  55.6 
 
 		 298 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3505  ABC transporter related  57.26 
 
 		 281 aa  265  4e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.870495  hitchhiker  0.000930317 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0677  ABC transporter related  55.92 
 
 		 262 aa  264  8.999999999999999e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.28609 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4565  ABC transporter related  58.3 
 
 		 281 aa  262  4.999999999999999e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1561  ABC transporter related  55.79 
 
 		 291 aa  255  6e-67  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000732497 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7199  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (nitrate/sulfonates)  52.23 
 
 		 278 aa  255  7e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0286852  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2623  ABC transporter related  52.12 
 
 		 255 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000578325  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1572  ABC transporter related protein  52.4 
 
 		 267 aa  254  2.0000000000000002e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3458  ABC transporter related  52.23 
 
 		 260 aa  252  4.0000000000000004e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.914516  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4887  ABC transporter related  52.44 
 
 		 259 aa  251  7e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.546298  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0238  ABC sulfate ester transporter, ATPase subunit  53.33 
 
 		 286 aa  251  9.000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.81925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3882  ABC transporter related  47.86 
 
 		 259 aa  251  1e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0550  ABC transporter related  50.97 
 
 		 276 aa  246  2e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.589055  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1979  ABC transporter related  48.56 
 
 		 258 aa  243  1.9999999999999999e-63  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000563857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0218  ABC transporter related  47.97 
 
 		 251 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2311  putative sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  43.5 
 
 		 251 aa  241  7e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.89952  hitchhiker  0.0000000038093 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2968  putative sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  43.9 
 
 		 251 aa  241  7.999999999999999e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.503094  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2642  alkanesulfonates transport ATP-binding protein  43.9 
 
 		 251 aa  240  2e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.164892  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2665  alkanesulfonates transport ATP-binding protein  43.9 
 
 		 251 aa  239  2.9999999999999997e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.273275  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2714  sulfonate ABC transporter ATP-binding protein  43.9 
 
 		 287 aa  239  5e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0521621  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2922  sulfonate ABC transporter ATP-binding protein  43.9 
 
 		 251 aa  238  5.999999999999999e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.900883  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2921  putative sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  43.9 
 
 		 251 aa  238  5.999999999999999e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.88235e-19 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2932  putative sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  43.09 
 
 		 251 aa  237  2e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2961  sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  43.9 
 
 		 251 aa  236  3e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0749803  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4539  ABC transporter related  49.58 
 
 		 256 aa  236  3e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.113352 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0079  ABC transporter related  46.48 
 
 		 307 aa  236  4e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6389  ABC transporter related  49.58 
 
 		 256 aa  236  4e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.350257  normal  0.506492 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0404  ABC transporter related protein  48.66 
 
 		 261 aa  235  5.0000000000000005e-61  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0748  ABC transporter related  52.76 
 
 		 261 aa  235  7e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.539344 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2643  ABC transporter related  50.44 
 
 		 261 aa  234  1.0000000000000001e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.430112  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2000  ABC transporter-related protein  45.45 
 
 		 251 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.554575  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5128  ABC transporter related  50 
 
 		 256 aa  233  2.0000000000000002e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.012319  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1919  ABC transporter related  48.29 
 
 		 265 aa  233  3e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0087  ABC transporter related  48.72 
 
 		 263 aa  231  1e-59  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6457  ABC transporter ATP-binding protein  48.94 
 
 		 261 aa  231  1e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1899  ABC transporter-related protein  46.09 
 
 		 264 aa  230  2e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.126966  hitchhiker  0.000000000000779353 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4216  ABC transporter related  50.82 
 
 		 256 aa  229  3e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2673  ABC transporter related  48.83 
 
 		 262 aa  229  4e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0513  ABC transporter related  41.06 
 
 		 254 aa  229  5e-59  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0482  ABC transporter related protein  44.13 
 
 		 255 aa  229  5e-59  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3034  ABC transporter related  47.22 
 
 		 292 aa  228  6e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.652183  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0849  ABC transporter-related protein  48.13 
 
 		 253 aa  228  6e-59  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0140067  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2936  ABC transporter related  47.74 
 
 		 250 aa  228  8e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4936  ABC transporter related protein  49.8 
 
 		 278 aa  228  9e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0551994  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2718  ABC transporter related  49.78 
 
 		 259 aa  228  1e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1128  ABC transporter related  47.39 
 
 		 267 aa  227  1e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  42.74 
 
 		 258 aa  228  1e-58  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1475  ABC transporter related  42.68 
 
 		 254 aa  227  2e-58  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4567  ABC transporter related  50.44 
 
 		 260 aa  227  2e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1900  ABC transporter related  45.49 
 
 		 269 aa  227  2e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5010  ABC transporter related  49.61 
 
 		 263 aa  226  2e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2147  ABC transporter related  52.09 
 
 		 274 aa  226  3e-58  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2954  ABC transporter related  48.12 
 
 		 272 aa  226  3e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1045  ABC transporter related  47.46 
 
 		 259 aa  226  3e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.162928  normal  0.159703 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0156  ABC transporter related  47.3 
 
 		 260 aa  226  4e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2857  ABC transporter-related protein  49.78 
 
 		 259 aa  226  4e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.99142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1428  ABC transporter related  50.71 
 
 		 267 aa  225  7e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.250833  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0392  ABC transporter related  42.68 
 
 		 254 aa  225  8e-58  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.238571  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3066  ABC transporter related protein  48.47 
 
 		 267 aa  224  9e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.583352  normal  0.320404 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1358  ABC transporter related  45.56 
 
 		 262 aa  224  1e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0445  ABC transporter related  42.28 
 
 		 254 aa  224  2e-57  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0398  ABC transporter related  50.88 
 
 		 259 aa  224  2e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.698259 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2133  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  48.03 
 
 		 252 aa  223  3e-57  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1075  ABC transporter related  46.67 
 
 		 252 aa  222  4.9999999999999996e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.137281  normal  0.464106 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2802  ABC transporter related protein  52 
 
 		 260 aa  222  7e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0735  ABC transporter related  46.78 
 
 		 253 aa  221  7e-57  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0415182  normal  0.371016 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0435  ABC transporter related  41.8 
 
 		 256 aa  221  8e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.30818  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2804  ABC transporter related protein  42.56 
 
 		 256 aa  221  9.999999999999999e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00228299  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44540  ABC transporter  47.08 
 
 		 288 aa  221  9.999999999999999e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0546  ABC transporter related  50.2 
 
 		 245 aa  221  9.999999999999999e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1132  ABC transporter related  50 
 
 		 301 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.20268 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0467  ABC transporter related  46.22 
 
 		 274 aa  220  1.9999999999999999e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0164  ABC transporter related  47.74 
 
 		 436 aa  220  1.9999999999999999e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1857  ABC transporter related  45 
 
 		 304 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0147  ABC transporter related  45.02 
 
 		 259 aa  219  3e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.288686 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1030  ABC transporter, ATP-binding protein  47.37 
 
 		 254 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>