More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_7233 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010625  Bphy_7233  ABC transporter related  100 
 
 
285 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.373776  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0131  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  75.87 
 
 
281 aa  422  1e-117  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2157  sulfate ester ABC transporter ATPase  73.61 
 
 
288 aa  419  1e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0499335  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2099  ABC transporter related  71.48 
 
 
298 aa  409  1e-113  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4347  ABC transporter related  69.58 
 
 
281 aa  390  1e-107  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4019  ABC transporter related  69.58 
 
 
281 aa  390  1e-107  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3505  ABC transporter related  68.53 
 
 
281 aa  385  1e-106  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.870495  hitchhiker  0.000930317 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2064  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  67.94 
 
 
281 aa  379  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.768493  normal  0.657795 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4565  ABC transporter related  67.13 
 
 
281 aa  372  1e-102  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1909  ABC transporter related  66.67 
 
 
286 aa  348  4e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4843  putative ABC transporter ATP-binding protein  63.42 
 
 
284 aa  333  2e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.365039 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0580  ABC transporter related  63.41 
 
 
265 aa  320  1.9999999999999998e-86  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.860273  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22550  ABC transporter ATP-binding protein  59.3 
 
 
255 aa  302  5.000000000000001e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3458  ABC transporter related  61.35 
 
 
260 aa  301  6.000000000000001e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.914516  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3352  ABC transporter related  58.89 
 
 
261 aa  298  9e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0238  ABC sulfate ester transporter, ATPase subunit  59.68 
 
 
286 aa  296  2e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.81925  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4887  ABC transporter related  63.33 
 
 
259 aa  293  2e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.546298  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0677  ABC transporter related  57.71 
 
 
262 aa  289  3e-77  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.28609 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0550  ABC transporter related  57.77 
 
 
276 aa  288  9e-77  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.589055  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7199  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (nitrate/sulfonates)  56.45 
 
 
278 aa  286  2e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0286852  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3882  ABC transporter related  54.29 
 
 
259 aa  283  2.0000000000000002e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08090  ABC transporter, ATP-binding component  55.21 
 
 
269 aa  280  1e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5006  ABC transporter related  58.1 
 
 
287 aa  279  5e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1573  ABC transporter related  56.61 
 
 
269 aa  278  8e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1561  ABC transporter related  56.28 
 
 
291 aa  277  1e-73  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000732497 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0264  ABC transporter ATP-binding protein  58.13 
 
 
279 aa  277  1e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.419692  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0209  ABC transporter-like  60.36 
 
 
271 aa  277  2e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0230  ABC transporter related  57.32 
 
 
287 aa  276  3e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02330  ABC transporter ATP-binding protein  57.72 
 
 
279 aa  275  7e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.366752  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2623  ABC transporter related  52.36 
 
 
255 aa  271  7e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000578325  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2000  ABC transporter-related protein  51.02 
 
 
251 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.554575  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1831  ABC transporter related protein  53.85 
 
 
266 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1431  ABC transporter related  55.42 
 
 
269 aa  268  5.9999999999999995e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.242163  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2311  putative sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  50.61 
 
 
251 aa  267  1e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.89952  hitchhiker  0.0000000038093 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2932  putative sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  50.2 
 
 
251 aa  267  2e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0748  ABC transporter related  59.67 
 
 
261 aa  266  2e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.539344 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1979  ABC transporter related  50.81 
 
 
258 aa  261  8e-69  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000563857  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2642  alkanesulfonates transport ATP-binding protein  48.98 
 
 
251 aa  260  1e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.164892  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2968  putative sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  48.98 
 
 
251 aa  261  1e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.503094  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1358  ABC transporter related  51.65 
 
 
262 aa  260  2e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2665  alkanesulfonates transport ATP-binding protein  49.8 
 
 
251 aa  259  4e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.273275  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1352  ABC transporter related  54.1 
 
 
262 aa  258  7e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1572  ABC transporter related protein  52.56 
 
 
267 aa  258  8e-68  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2714  sulfonate ABC transporter ATP-binding protein  49.8 
 
 
287 aa  257  1e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0521621  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2922  sulfonate ABC transporter ATP-binding protein  49.8 
 
 
251 aa  257  1e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.900883  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2921  putative sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  49.8 
 
 
251 aa  257  1e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.88235e-19 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2961  sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  48.57 
 
 
251 aa  256  2e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0749803  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2625  ABC transporter related  55.46 
 
 
267 aa  257  2e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.173465  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0218  ABC transporter related  49.39 
 
 
251 aa  247  1e-64  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5010  ABC transporter related  54.07 
 
 
263 aa  247  1e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2133  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  46.96 
 
 
252 aa  246  3e-64  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0513  ABC transporter related  44.9 
 
 
254 aa  245  8e-64  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2904  ABC transporter related  53.69 
 
 
270 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1899  ABC transporter-related protein  48.16 
 
 
264 aa  242  5e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.126966  hitchhiker  0.000000000000779353 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0150  ABC transporter related  49.59 
 
 
252 aa  241  7e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0435  ABC transporter related  43.78 
 
 
256 aa  241  7e-63  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.30818  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  41.73 
 
 
258 aa  239  2.9999999999999997e-62  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1030  ABC transporter, ATP-binding protein  48.91 
 
 
254 aa  239  4e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4335  ABC transporter related protein  47.93 
 
 
247 aa  236  2e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0404  ABC transporter related protein  48.46 
 
 
261 aa  236  3e-61  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2804  ABC transporter related protein  44.08 
 
 
256 aa  235  8e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00228299  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5062  ABC transporter related  46.12 
 
 
246 aa  234  9e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.314971  normal  0.024914 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0445  ABC transporter related  42.86 
 
 
254 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1475  ABC transporter related  42.45 
 
 
254 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5128  ABC transporter related  48.16 
 
 
256 aa  233  3e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.012319  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6389  ABC transporter related  50.2 
 
 
256 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.350257  normal  0.506492 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5006  ABC transporter related  48.39 
 
 
257 aa  232  5e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0392  ABC transporter related  42.45 
 
 
254 aa  231  1e-59  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.238571  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1428  ABC transporter related  47.2 
 
 
267 aa  230  2e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.250833  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0378  hypothetical protein  41.34 
 
 
260 aa  230  2e-59  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4539  ABC transporter related  49.39 
 
 
256 aa  229  4e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.113352 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4077  ABC transporter related protein  47.01 
 
 
290 aa  229  5e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.264112 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5555  ABC transporter related  49.12 
 
 
303 aa  229  5e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356356  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0849  ABC transporter-related protein  44.66 
 
 
253 aa  229  5e-59  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0140067  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0327  ABC transporter related  50.43 
 
 
264 aa  228  6e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.341199  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3034  ABC transporter related  45.32 
 
 
292 aa  229  6e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.652183  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1128  ABC transporter related  46.31 
 
 
267 aa  228  7e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6427  ABC transporter related  45.67 
 
 
303 aa  228  9e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2954  ABC transporter related  46.22 
 
 
272 aa  227  1e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4936  ABC transporter related protein  46.54 
 
 
278 aa  227  1e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0551994  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5920  ABC transporter related  48.67 
 
 
303 aa  227  1e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3876  ABC transporter related  47.44 
 
 
297 aa  227  1e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0735  ABC transporter related  44.21 
 
 
253 aa  227  2e-58  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0415182  normal  0.371016 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2275  ABC transporter related  51.5 
 
 
264 aa  226  2e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0996963 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1857  ABC transporter related  48.46 
 
 
304 aa  227  2e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0522  ABC transporter related  46.09 
 
 
249 aa  227  2e-58  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.351686 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4149  ABC transporter related  49.59 
 
 
266 aa  226  3e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0621662 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6544  putative ABC transporter  48.77 
 
 
259 aa  226  3e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.353316 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1759  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  49.59 
 
 
275 aa  226  4e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.352483  hitchhiker  0.00557552 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2836  ABC transporter related  48.75 
 
 
272 aa  226  4e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.840356  normal  0.83525 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0482  ABC transporter related protein  42.75 
 
 
255 aa  226  5.0000000000000005e-58  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2967  ABC transporter-related protein  45.56 
 
 
259 aa  225  5.0000000000000005e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0379202  normal  0.762779 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2221  ABC transporter-related protein  49.59 
 
 
262 aa  225  6e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000225021  normal  0.260255 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5225  ABC transporter related  46.72 
 
 
304 aa  225  7e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.272963  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0528  ABC transporter related  42.91 
 
 
247 aa  225  7e-58  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4338  ABC transporter related  49.59 
 
 
271 aa  225  7e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3676  ABC transporter related  49.59 
 
 
266 aa  225  7e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.618015 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0079  ABC transporter related  46.96 
 
 
307 aa  224  9e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4567  ABC transporter related  46.61 
 
 
260 aa  224  9e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1919  ABC transporter related  49.77 
 
 
265 aa  224  9e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>