More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A2164 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A2164  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  100 
 
 
276 aa  543  1e-153  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0116  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  91.67 
 
 
276 aa  479  1e-134  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2775  ABC transporter related  70 
 
 
268 aa  339  2.9999999999999998e-92  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2673  ABC transporter related  67.58 
 
 
262 aa  336  2.9999999999999997e-91  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2221  ABC transporter-related protein  68.2 
 
 
262 aa  333  2e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000225021  normal  0.260255 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3306  alkanesulfonate ABC transporter, ATP binding protein  66.41 
 
 
263 aa  329  3e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4149  ABC transporter related  66.54 
 
 
266 aa  328  8e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0621662 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3676  ABC transporter related  68.36 
 
 
266 aa  328  9e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.618015 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3265  ABC transporter related  68.36 
 
 
273 aa  326  2.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.745893  normal  0.952951 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1759  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  67.58 
 
 
275 aa  326  3e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.352483  hitchhiker  0.00557552 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4338  ABC transporter related  67.58 
 
 
271 aa  323  3e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5010  ABC transporter related  62.07 
 
 
263 aa  322  3e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4114  ABC transporter related  67.58 
 
 
273 aa  322  4e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.406402  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4252  ABC transporter related  67.58 
 
 
273 aa  322  4e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0391855  normal  0.0823186 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3867  ABC transporter related  66.8 
 
 
265 aa  322  5e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.685954  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4591  ABC transporter related  65.69 
 
 
265 aa  322  6e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4457  ABC transporter related  65.69 
 
 
265 aa  322  6e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0721203  normal  0.624279 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2688  ABC transporter related  62.18 
 
 
264 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.232656  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2057  ABC transporter related  58.84 
 
 
280 aa  317  1e-85  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2904  ABC transporter related  60.47 
 
 
270 aa  311  6.999999999999999e-84  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4837  ABC transporter related  65.41 
 
 
263 aa  308  4e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.856491 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4901  ABC transporter related  63.33 
 
 
265 aa  308  5e-83  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1327  ABC transporter related  64.1 
 
 
266 aa  305  5.0000000000000004e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.193146  normal  0.338067 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1167  ABC transporter related  63.74 
 
 
266 aa  304  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.259654  normal  0.174224 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5619  ABC transporter related  67.46 
 
 
278 aa  303  2.0000000000000002e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.406047 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31130  ABC transporter ATP binding protein  62.02 
 
 
264 aa  298  9e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.098287  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3269  ABC transporter related  61.42 
 
 
263 aa  294  8e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.874896 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0859  ABC transporter related  61.35 
 
 
258 aa  277  1e-73  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0340597  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4843  putative ABC transporter ATP-binding protein  52.55 
 
 
284 aa  247  2e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.365039 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1358  ABC transporter related  46.83 
 
 
262 aa  240  2e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0218  ABC transporter related  46.8 
 
 
251 aa  236  4e-61  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4347  ABC transporter related  50.19 
 
 
281 aa  233  3e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4019  ABC transporter related  50.19 
 
 
281 aa  233  3e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3505  ABC transporter related  49.03 
 
 
281 aa  230  2e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.870495  hitchhiker  0.000930317 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3352  ABC transporter related  45.6 
 
 
261 aa  230  2e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22550  ABC transporter ATP-binding protein  50.41 
 
 
255 aa  229  3e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1909  ABC transporter related  47.04 
 
 
286 aa  229  3e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0378  hypothetical protein  42.91 
 
 
260 aa  229  4e-59  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2157  sulfate ester ABC transporter ATPase  50.6 
 
 
288 aa  228  9e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0499335  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1975  ABC transporter related  45.7 
 
 
263 aa  227  2e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000056178  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3458  ABC transporter related  46.88 
 
 
260 aa  226  2e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.914516  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0131  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  47.66 
 
 
281 aa  225  6e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  41.27 
 
 
258 aa  224  9e-58  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0677  ABC transporter related  46.06 
 
 
262 aa  224  1e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.28609 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4565  ABC transporter related  48.24 
 
 
281 aa  224  1e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0209  ABC transporter-like  47.04 
 
 
271 aa  223  2e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1899  ABC transporter-related protein  44.49 
 
 
264 aa  223  2e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.126966  hitchhiker  0.000000000000779353 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7199  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (nitrate/sulfonates)  46.25 
 
 
278 aa  223  2e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0286852  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0849  ABC transporter-related protein  47.01 
 
 
253 aa  223  2e-57  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0140067  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7233  ABC transporter related  47.69 
 
 
285 aa  223  2e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.373776  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1030  ABC transporter, ATP-binding protein  45.38 
 
 
254 aa  222  6e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2064  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  49.6 
 
 
281 aa  222  6e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.768493  normal  0.657795 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2099  ABC transporter related  46.9 
 
 
298 aa  221  7e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5128  ABC transporter related  47.51 
 
 
256 aa  221  9e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.012319  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2718  ABC transporter related  48.58 
 
 
259 aa  221  9.999999999999999e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4846  ABC transporter related protein  46.92 
 
 
257 aa  221  9.999999999999999e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0449477  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1979  ABC transporter related  45.49 
 
 
258 aa  221  9.999999999999999e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000563857  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2836  ABC transporter related  48.13 
 
 
272 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.840356  normal  0.83525 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2954  ABC transporter related  44.8 
 
 
272 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2643  ABC transporter related  43.85 
 
 
261 aa  220  1.9999999999999999e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.430112  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3997  ABC transporter, ATPase subunit  48.85 
 
 
311 aa  220  1.9999999999999999e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.734003  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1572  ABC transporter related protein  44.77 
 
 
267 aa  220  1.9999999999999999e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5062  ABC transporter related  43.48 
 
 
246 aa  219  3e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.314971  normal  0.024914 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0398  ABC transporter related  47.24 
 
 
259 aa  219  3e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.698259 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2857  ABC transporter-related protein  47.77 
 
 
259 aa  220  3e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.99142  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3159  ABC transporter-like  50.64 
 
 
282 aa  219  5e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3066  ABC transporter related protein  46.9 
 
 
267 aa  218  6e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.583352  normal  0.320404 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4112  ABC transporter-related protein  47.71 
 
 
311 aa  218  7e-56  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.607237  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0735  ABC transporter related  43.95 
 
 
253 aa  218  7e-56  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0415182  normal  0.371016 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3882  ABC transporter related  43.87 
 
 
259 aa  218  8.999999999999998e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1352  ABC transporter related  46.8 
 
 
262 aa  218  1e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0467  ABC transporter related  44.11 
 
 
274 aa  217  2e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1733  ABC transporter related protein  41.57 
 
 
265 aa  217  2e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4567  ABC transporter related  47.22 
 
 
260 aa  216  4e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1481  ABC transporter related  44.8 
 
 
283 aa  216  4e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3136  ABC transporter related protein  43.24 
 
 
261 aa  216  4e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.257722  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0580  ABC transporter related  43.7 
 
 
265 aa  215  5e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.860273  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4138  ABC transporter related  48.29 
 
 
311 aa  214  9e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2932  putative sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  38.8 
 
 
251 aa  214  9e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0209  nitrate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  47.45 
 
 
283 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.465549 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4887  ABC transporter related  46.09 
 
 
259 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.546298  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2804  ABC transporter related protein  40.87 
 
 
256 aa  214  9.999999999999999e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00228299  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0513  ABC transporter related  37.2 
 
 
254 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1919  ABC transporter related  47.06 
 
 
265 aa  213  2.9999999999999995e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1505  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  44.06 
 
 
262 aa  212  4.9999999999999996e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0234474  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5555  ABC transporter related  45.79 
 
 
303 aa  212  4.9999999999999996e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356356  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0550  ABC transporter related  45.31 
 
 
276 aa  212  4.9999999999999996e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.589055  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1168  putative ABC transporter, ATP-binding protein  44.78 
 
 
275 aa  212  4.9999999999999996e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0147  ABC transporter related  44.94 
 
 
259 aa  212  5.999999999999999e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.288686 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6457  ABC transporter ATP-binding protein  44.27 
 
 
261 aa  211  9e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0230  ABC transporter related  43.82 
 
 
287 aa  211  1e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3642  ABC transporter related  47.21 
 
 
239 aa  211  1e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000649736  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0435  ABC transporter related  38.52 
 
 
256 aa  211  1e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.30818  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6427  ABC transporter related  45.42 
 
 
303 aa  211  1e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0792  ABC transporter related protein  42.17 
 
 
308 aa  211  1e-53  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5920  ABC transporter related  45.42 
 
 
303 aa  211  1e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0156  ABC transporter related  46.37 
 
 
260 aa  210  2e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0087  ABC transporter related  43.31 
 
 
263 aa  210  2e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1857  ABC transporter related  46.7 
 
 
304 aa  210  2e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2625  ABC transporter related  47.58 
 
 
267 aa  210  2e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.173465  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>