More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0927 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0927  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  100 
 
 
251 aa  503  1e-141  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.941712  normal  0.18902 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1909  ABC transporter related  45.9 
 
 
286 aa  186  3e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3407  ABC transporter related  42.86 
 
 
263 aa  179  4e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.81445  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0190  ABC transporter related  44.16 
 
 
244 aa  179  4e-44  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3716  ABC transporter related  43.67 
 
 
263 aa  178  5.999999999999999e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00980305 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0406  ABC transporter related  40.89 
 
 
249 aa  178  8e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0871971  decreased coverage  0.00677494 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2147  ABC transporter related  41.2 
 
 
274 aa  178  8e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2338  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  48.37 
 
 
276 aa  176  4e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.685879  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2628  ABC transporter related  41.2 
 
 
275 aa  175  7e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0679  ABC transporter related  44.91 
 
 
244 aa  175  7e-43  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0882795 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0779  ABC transporter related  42.86 
 
 
249 aa  175  8e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3600  ABC transporter related  42.74 
 
 
263 aa  174  9e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00199632  normal  0.177255 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1868  ABC transporter ATP-binding protein  48.8 
 
 
288 aa  174  9.999999999999999e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2303  ABC transporter related  42.91 
 
 
275 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.711472 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0164  ABC transporter related  44.2 
 
 
436 aa  174  9.999999999999999e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4503  ABC transporter related protein  46.78 
 
 
267 aa  174  9.999999999999999e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5128  ABC transporter related  40.4 
 
 
256 aa  174  9.999999999999999e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.012319  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0331  ABC transporter related  42.62 
 
 
259 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0378  ABC transporter related  42.62 
 
 
259 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3808  ABC transporter-related protein  40.89 
 
 
271 aa  172  5e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4594  ABC transporter related  43.48 
 
 
436 aa  172  5e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.138769  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5496  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  42.13 
 
 
446 aa  172  5e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0572  ABC transporter related  44.92 
 
 
269 aa  172  5e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0113  ABC transporter related  42.91 
 
 
261 aa  172  5.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.692675 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3339  ABC transporter related  43.04 
 
 
260 aa  171  6.999999999999999e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00741331  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0889  ABC transporter, conserved site  41.74 
 
 
439 aa  171  7.999999999999999e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.807362  hitchhiker  0.00457345 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1956  ABC transporter related  40.08 
 
 
272 aa  171  1e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1756  ABC transporter related  40.83 
 
 
433 aa  171  1e-41  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0769  ABC transporter related  42.74 
 
 
252 aa  171  1e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.159721 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1824  putative nitrate transport system ATP-binding protein  40.83 
 
 
433 aa  171  1e-41  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7199  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (nitrate/sulfonates)  43.98 
 
 
278 aa  171  1e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0286852  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0408  ABC transporter related  42.62 
 
 
259 aa  171  1e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0896853  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0235  ABC transporter ATP-binding protein  40.68 
 
 
438 aa  170  2e-41  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3892  ABC transporter related  40.89 
 
 
271 aa  170  2e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1965  ABC transporter, ATP-binding protein  40.68 
 
 
434 aa  170  2e-41  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4786  ABC transporter related  42.67 
 
 
260 aa  170  2e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0276947  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7489  ABC transporter ATP-binding protein  42.68 
 
 
433 aa  169  3e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.57359  normal  0.121802 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3545  ABC transporter related  43.18 
 
 
453 aa  169  3e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0800  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  43.53 
 
 
276 aa  169  3e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.872437  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2275  ABC transporter related  41.81 
 
 
264 aa  169  3e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0996963 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7645  putative sulfonate ABC transporter, ATP binding protein  42.53 
 
 
261 aa  169  3e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0412308  normal  0.633643 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2436  ABC transporter related  43.35 
 
 
277 aa  169  4e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4050  ABC transporter related  41.87 
 
 
289 aa  169  5e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.95226  normal  0.382919 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3751  ABC transporter, ATPase subunit  40.73 
 
 
271 aa  169  5e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1025  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  43.04 
 
 
667 aa  168  6e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.129474 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1847  ABC transporter ATP-binding protein  39.68 
 
 
272 aa  169  6e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22550  ABC transporter ATP-binding protein  43.55 
 
 
255 aa  168  6e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2274  ABC transporter ATP-binding protein  39.68 
 
 
272 aa  168  6e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1258  ABC transporter related  43.58 
 
 
244 aa  169  6e-41  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2064  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  43.7 
 
 
281 aa  168  8e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.768493  normal  0.657795 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4843  putative ABC transporter ATP-binding protein  41.53 
 
 
284 aa  168  8e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.365039 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4565  ABC transporter related  43.28 
 
 
281 aa  168  8e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4676  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  39.77 
 
 
673 aa  168  8e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0271  ABC transporter related  44.07 
 
 
435 aa  168  9e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.342926 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3009  ABC transporter related  41.95 
 
 
245 aa  167  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0802  ABC transporter related  41.53 
 
 
434 aa  167  1e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2598  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  40.15 
 
 
669 aa  167  1e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.992008  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2893  ABC transporter related  41.13 
 
 
259 aa  167  1e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.767338  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0110  ABC transporter related  39.36 
 
 
445 aa  167  1e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2904  ABC transporter related  41.94 
 
 
270 aa  167  1e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4562  ABC transporter related  38.06 
 
 
445 aa  167  1e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.661059  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5006  ABC transporter related  42.49 
 
 
257 aa  166  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1490  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  41.31 
 
 
663 aa  167  2e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.810592  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2157  sulfate ester ABC transporter ATPase  43.93 
 
 
288 aa  167  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0499335  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3519  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  40.15 
 
 
669 aa  167  2e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3130  ABC transporter related  43.1 
 
 
278 aa  166  2.9999999999999998e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0282  ABC transporter related  41.67 
 
 
244 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.686525  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2881  ABC transporter related  41.67 
 
 
280 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.542857  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0429  ABC transporter related  44.29 
 
 
313 aa  166  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0115377  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0404  ABC transporter related protein  38.63 
 
 
261 aa  166  4e-40  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4923  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  43.88 
 
 
668 aa  166  4e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.502071 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5010  ABC transporter related  43.5 
 
 
263 aa  166  4e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3870  ABC transporter related  43.29 
 
 
272 aa  166  5e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5145  ABC transporter related  43.78 
 
 
267 aa  166  5e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.537076  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4347  ABC transporter related  42.92 
 
 
281 aa  166  5e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4019  ABC transporter related  42.92 
 
 
281 aa  166  5e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0546  ABC transporter related  43.29 
 
 
245 aa  165  5e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1899  ABC transporter-related protein  41.05 
 
 
264 aa  165  5.9999999999999996e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.126966  hitchhiker  0.000000000000779353 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0014  ABC transporter related  39.51 
 
 
245 aa  165  5.9999999999999996e-40  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0307  ABC transporter related  42.02 
 
 
259 aa  165  6.9999999999999995e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3505  ABC transporter related  42.5 
 
 
281 aa  164  9e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.870495  hitchhiker  0.000930317 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30480  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  43.91 
 
 
266 aa  164  9e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.3789  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1930  putative sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  40.25 
 
 
262 aa  164  1.0000000000000001e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0780137  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0136  hypothetical protein  40.16 
 
 
432 aa  164  1.0000000000000001e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0121  hypothetical protein  40.16 
 
 
432 aa  164  1.0000000000000001e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1183  ABC transporter related  37.75 
 
 
279 aa  164  1.0000000000000001e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0458641  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4543  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  40.24 
 
 
277 aa  164  1.0000000000000001e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4675  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  40.08 
 
 
280 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1020  ABC transporter-like protein  40.33 
 
 
437 aa  164  1.0000000000000001e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.381169 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2188  ABC transporter related  43.46 
 
 
260 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0571708  normal  0.474002 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2099  ABC transporter related  40.96 
 
 
298 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4341  ABC transporter related  41.1 
 
 
448 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.253377 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6544  putative ABC transporter  40.16 
 
 
259 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.353316 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1561  ABC transporter related  43.48 
 
 
291 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000732497 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4509  ABC transporter related  43.35 
 
 
267 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1270  ABC transporter related  40.5 
 
 
447 aa  164  2.0000000000000002e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.904151 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5154  ABC transporter related  41.6 
 
 
268 aa  163  3e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.597589  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0580  ABC transporter related  41.2 
 
 
265 aa  162  4.0000000000000004e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.860273  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2932  putative sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  36.14 
 
 
251 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5922  ABC transporter related  40.68 
 
 
447 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.390336 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>