More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2480 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_2480  ABC transporter related protein  100 
 
 		 263 aa  532  1e-150  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3080  ABC transporter related  70.7 
 
 		 290 aa  369  1e-101  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.178187  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0285  ABC transporter related protein  64.64 
 
 		 267 aa  343  2e-93  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.120651  hitchhiker  0.0000760001 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2333  ABC transporter related protein  61.85 
 
 		 260 aa  319  3.9999999999999996e-86  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34330  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  57.6 
 
 		 262 aa  293  1e-78  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5351  ABC transporter related  57.43 
 
 		 262 aa  290  2e-77  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5440  ABC transporter related  57.43 
 
 		 262 aa  290  2e-77  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.556345 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5730  ABC transporter related  56.91 
 
 		 259 aa  286  2.9999999999999996e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1817  ABC transporter  53.47 
 
 		 261 aa  270  2e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5421  ABC transporter related  54.37 
 
 		 294 aa  268  5e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1802  ABC transporter related protein  53.06 
 
 		 267 aa  265  8e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00421209  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4567  ABC transporter related  46 
 
 		 260 aa  228  9e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1262  ABC transporter related  46.8 
 
 		 259 aa  227  1e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0287206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1857  ABC transporter related  44.71 
 
 		 304 aa  224  1e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4936  ABC transporter related protein  46.1 
 
 		 278 aa  224  2e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0551994  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1030  ABC transporter, ATP-binding protein  48 
 
 		 254 aa  223  3e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1128  ABC transporter related  47.19 
 
 		 267 aa  221  9.999999999999999e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1387  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  45.31 
 
 		 304 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.195746  normal  0.160104 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3254  ABC transporter related  45.58 
 
 		 258 aa  220  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0994591 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4331  alkanesulfonate ABC transporter ATP-binding protein  48.48 
 
 		 256 aa  220  1.9999999999999999e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4929  ABC transporter-like  46.06 
 
 		 278 aa  219  3e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0218  ABC transporter related  46.29 
 
 		 251 aa  219  3e-56  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0467  ABC transporter related  44.14 
 
 		 274 aa  219  3.9999999999999997e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1645  ABC transporter related  45.34 
 
 		 253 aa  219  5e-56  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3876  ABC transporter related  45.53 
 
 		 297 aa  218  6e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1975  ABC transporter related  45.04 
 
 		 263 aa  218  6e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000056178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2086  ABC transporter related  43.97 
 
 		 291 aa  218  1e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.124601 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0398  ABC transporter related  44.8 
 
 		 259 aa  217  1e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.698259 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5225  ABC transporter related  44.88 
 
 		 304 aa  217  2e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.272963  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0792  ABC transporter related protein  43.87 
 
 		 308 aa  217  2e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5516  ABC transporter related  46.93 
 
 		 271 aa  215  8e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.25838  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3034  ABC transporter related  48.92 
 
 		 292 aa  214  8e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.652183  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8276  ABC-type transporter, ATP-binding protein  46.15 
 
 		 264 aa  214  9e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3066  ABC transporter related protein  49.57 
 
 		 267 aa  214  1.9999999999999998e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.583352  normal  0.320404 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1691  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  50.43 
 
 		 280 aa  213  1.9999999999999998e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0162641  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0849  ABC transporter-related protein  50.22 
 
 		 253 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0140067  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0156  ABC transporter related  42.47 
 
 		 260 aa  213  1.9999999999999998e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2954  ABC transporter related  43.78 
 
 		 272 aa  212  4.9999999999999996e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0059  ABC transporter related  40.76 
 
 		 257 aa  212  4.9999999999999996e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0079  ABC transporter related  44.96 
 
 		 307 aa  212  5.999999999999999e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3083  ABC transporter related  42.21 
 
 		 306 aa  211  7e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.724622  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2147  ABC transporter related  46.47 
 
 		 274 aa  211  7.999999999999999e-54  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0147  ABC transporter related  42.08 
 
 		 259 aa  211  7.999999999999999e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.288686 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2804  ABC transporter related protein  41.34 
 
 		 256 aa  211  7.999999999999999e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00228299  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2275  ABC transporter related  43.09 
 
 		 264 aa  211  9e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0996963 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0378  hypothetical protein  44.31 
 
 		 260 aa  211  1e-53  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6457  ABC transporter ATP-binding protein  44.35 
 
 		 261 aa  211  1e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1788  ABC transporter related  41.67 
 
 		 303 aa  209  3e-53  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18140  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  48.55 
 
 		 267 aa  209  3e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1428  ABC transporter related  41.2 
 
 		 267 aa  209  4e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.250833  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0404  ABC transporter related protein  41.2 
 
 		 261 aa  209  4e-53  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  39.68 
 
 		 258 aa  208  6e-53  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1368  ABC transporter ATP-binding protein  45.82 
 
 		 278 aa  208  7e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0478866 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0667  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  44.27 
 
 		 266 aa  208  7e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0738173  normal  0.024802 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0513  ABC transporter related  41.2 
 
 		 254 aa  208  7e-53  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1045  ABC transporter related  40.7 
 
 		 259 aa  208  8e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.162928  normal  0.159703 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0435  ABC transporter related  41.2 
 
 		 256 aa  208  9e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.30818  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1733  ABC transporter related protein  45.02 
 
 		 265 aa  207  2e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4202  ABC transporter related  42.41 
 
 		 286 aa  207  2e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.657394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3870  ABC transporter related  42.25 
 
 		 272 aa  206  3e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6427  ABC transporter related  43.31 
 
 		 303 aa  206  3e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4059  ABC transporter related  40.51 
 
 		 276 aa  206  3e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6155  ABC transporter related  41.22 
 
 		 286 aa  206  3e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.300039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1090  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  45.02 
 
 		 260 aa  206  3e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5983  ABC transporter ATP-binding protein  44.69 
 
 		 267 aa  205  7e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.289741 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5920  ABC transporter related  42.64 
 
 		 303 aa  205  7e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5555  ABC transporter related  42.64 
 
 		 303 aa  205  8e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356356  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2967  ABC transporter-related protein  40.16 
 
 		 259 aa  204  8e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0379202  normal  0.762779 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0104  ABC transporter related  45.02 
 
 		 260 aa  204  9e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.464024  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4305  ABC transporter related  46.81 
 
 		 273 aa  204  1e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272884  hitchhiker  0.0022322 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2643  ABC transporter related  41.09 
 
 		 261 aa  204  1e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.430112  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3751  ABC transporter, ATPase subunit  41.8 
 
 		 271 aa  204  1e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0327  ABC transporter related  40.8 
 
 		 264 aa  203  2e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.341199  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2836  ABC transporter related  43.27 
 
 		 272 aa  204  2e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.840356  normal  0.83525 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6359  nitrate ABC transporter, ATP-binding protein  44.58 
 
 		 274 aa  204  2e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3808  ABC transporter-related protein  41.8 
 
 		 271 aa  203  2e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0147  ABC transporter related  38.13 
 
 		 273 aa  202  3e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2884  ABC transporter related  44.15 
 
 		 263 aa  203  3e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2857  ABC transporter-related protein  40.56 
 
 		 259 aa  202  4e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.99142  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3159  ABC transporter-like  46.95 
 
 		 282 aa  202  6e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1210  ABC transporter related  41.31 
 
 		 287 aa  202  6e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.502786  normal  0.459492 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2718  ABC transporter related  43.53 
 
 		 259 aa  202  7e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1899  ABC transporter-related protein  43.83 
 
 		 264 aa  202  7e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.126966  hitchhiker  0.000000000000779353 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1505  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  42.58 
 
 		 262 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0234474  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1421  ABC transporter related  40.54 
 
 		 293 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3892  ABC transporter related  41.39 
 
 		 271 aa  201  9.999999999999999e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1260  ABC transporter related  40.54 
 
 		 293 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.227509 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0392  ABC transporter related  41.37 
 
 		 254 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.238571  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0209  nitrate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  44.35 
 
 		 283 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.465549 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3148  ABC transporter related  42.15 
 
 		 266 aa  200  1.9999999999999998e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3643  ABC transporter related  42.4 
 
 		 259 aa  200  1.9999999999999998e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.857726  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0087  ABC transporter related  46.22 
 
 		 263 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0888  ABC transporter related  45.56 
 
 		 284 aa  200  1.9999999999999998e-50  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.3127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0735  ABC transporter related  40.91 
 
 		 253 aa  199  3e-50  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0415182  normal  0.371016 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5145  ABC transporter related  42.46 
 
 		 267 aa  199  3e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.537076  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0445  ABC transporter related  41.63 
 
 		 254 aa  199  3e-50  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1475  ABC transporter related  40.96 
 
 		 254 aa  199  3e-50  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3541  ABC transporter related  42.74 
 
 		 255 aa  199  3.9999999999999996e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.774244  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7248  ABC transporter ATP-binding protein  45.33 
 
 		 222 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00375076  normal  0.359257 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2563  ABC-transport protein, ATP-binding protein  42.37 
 
 		 288 aa  199  5e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.25889 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>