More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_2144 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_2144  ABC transporter related  100 
 
 		 257 aa  496  1e-139  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.964618  normal  0.431214 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1808  ABC transporter related  99.22 
 
 		 257 aa  491  9.999999999999999e-139  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.611078 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1760  ABC transporter related  87.55 
 
 		 265 aa  434  1e-121  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.70916 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5975  ABC transporter related  64.45 
 
 		 246 aa  308  4e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0887356  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5750  ABC transporter related  66.41 
 
 		 246 aa  289  3e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0500187 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2775  ABC transporter related  69.65 
 
 		 244 aa  287  1e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0974078 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1783  ABC transporter related  55.74 
 
 		 251 aa  231  8.000000000000001e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.520432 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0014  ABC transporter related  51.64 
 
 		 235 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5957  putative ABC transporter ATP-binding protein  46.32 
 
 		 236 aa  176  4e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.844305  normal  0.429944 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1866  ABC transporter related  40.08 
 
 		 246 aa  172  6.999999999999999e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2850  ABC transporter related  41.53 
 
 		 255 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.220732  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1431  ABC transporter related  38.52 
 
 		 269 aa  155  7e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.242163  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1930  putative sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  35.69 
 
 		 262 aa  152  4e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0780137  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0307  ABC transporter related  42.11 
 
 		 259 aa  152  5e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0230  ABC transporter related  38.08 
 
 		 287 aa  152  7e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2786  ABC transporter, ATP-binding protein  39.46 
 
 		 232 aa  151  1e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0961461  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08090  ABC transporter, ATP-binding component  40.24 
 
 		 269 aa  151  1e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2147  ABC transporter related  37.82 
 
 		 274 aa  150  1e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5006  ABC transporter related  40.48 
 
 		 287 aa  150  1e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0264  ABC transporter ATP-binding protein  38.31 
 
 		 279 aa  150  1e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.419692  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2783  ABC transporter related  41.92 
 
 		 257 aa  150  2e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02330  ABC transporter ATP-binding protein  38.31 
 
 		 279 aa  150  3e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.366752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1831  ABC transporter related protein  38.94 
 
 		 266 aa  149  3e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6344  ABC transporter related  39.57 
 
 		 270 aa  150  3e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.942875  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6521  ABC transporter related  39.15 
 
 		 270 aa  149  4e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6755  ABC transporter related  39.15 
 
 		 270 aa  149  4e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0664482 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1146  ABC transporter related  37.14 
 
 		 237 aa  149  5e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0318577  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0285  ABC transporter related protein  40.83 
 
 		 267 aa  149  5e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.120651  hitchhiker  0.0000760001 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0190  ABC transporter related  41.25 
 
 		 244 aa  149  5e-35  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3306  alkanesulfonate ABC transporter, ATP binding protein  43.66 
 
 		 263 aa  149  6e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3080  ABC transporter related  38.4 
 
 		 290 aa  148  8e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.178187  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0209  nitrate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  41.67 
 
 		 283 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.465549 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1352  ABC transporter related  37.71 
 
 		 262 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0876  ABC transporter related  33.17 
 
 		 218 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1030  ABC transporter, ATP-binding protein  36.09 
 
 		 254 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7505  ABC transporter, ATPase subunit  38.96 
 
 		 273 aa  146  3e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000247297  normal  0.575396 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3339  ABC transporter related  40.56 
 
 		 260 aa  146  3e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00741331  normal  1 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2628  sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  40.44 
 
 		 270 aa  146  3e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.197945  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1481  ABC transporter related  40.89 
 
 		 283 aa  146  3e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4164  ABC transporter related  41.75 
 
 		 268 aa  145  4.0000000000000006e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.143983  normal  0.780966 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2133  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  36.61 
 
 		 252 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3666  ABC transporter related  42.18 
 
 		 266 aa  145  4.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.844383  normal  0.10889 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0406  ABC transporter related  37.3 
 
 		 249 aa  145  6e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0871971  decreased coverage  0.00677494 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2673  ABC transporter related  40.83 
 
 		 262 aa  145  7.0000000000000006e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3034  ABC transporter related  38.26 
 
 		 265 aa  145  7.0000000000000006e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.971108  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  35.59 
 
 		 258 aa  145  7.0000000000000006e-34  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4372  ABC transporter related  36.99 
 
 		 253 aa  145  8.000000000000001e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.191075 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3269  ABC transporter related  41.55 
 
 		 263 aa  145  9e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.874896 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2480  ABC transporter related protein  39.39 
 
 		 263 aa  144  1e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3180  ABC transporter related  37.02 
 
 		 254 aa  144  1e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.219824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2802  ABC transporter related protein  39.27 
 
 		 260 aa  144  1e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4034  ABC transporter related  39.92 
 
 		 276 aa  144  1e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.105857 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0378  hypothetical protein  35.9 
 
 		 260 aa  144  1e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0347  ABC transporter, ATP-binding protein  38.53 
 
 		 511 aa  144  2e-33  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1573  ABC transporter related  38.82 
 
 		 269 aa  144  2e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2625  ABC transporter related  36.75 
 
 		 267 aa  144  2e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.173465  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1489  ABC transporter related  37.45 
 
 		 283 aa  144  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4848  Sigma 54 interacting domain protein  36.59 
 
 		 253 aa  144  2e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.627338 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2775  ABC transporter related  42.16 
 
 		 268 aa  143  3e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5009  ABC transporter related  41.1 
 
 		 285 aa  143  3e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1475  ABC transporter related  35.27 
 
 		 254 aa  143  3e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0014  ABC transporter related  37.61 
 
 		 245 aa  143  3e-33  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2804  ABC transporter related protein  34.98 
 
 		 256 aa  143  3e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00228299  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4096  ABC transporter related protein  36.71 
 
 		 261 aa  143  4e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0795194 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2057  ABC transporter related  39.15 
 
 		 280 aa  142  4e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1899  ABC transporter-related protein  37.12 
 
 		 264 aa  142  4e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.126966  hitchhiker  0.000000000000779353 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0768  ABC transporter, conserved site  36.77 
 
 		 432 aa  142  4e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1075  ABC transporter related  37.17 
 
 		 252 aa  142  4e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.137281  normal  0.464106 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4886  ABC transporter related  41.55 
 
 		 297 aa  142  5e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0282  ABC transporter related  43.3 
 
 		 244 aa  142  5e-33  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.686525  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4360  ABC transporter related  43.06 
 
 		 257 aa  142  5e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5983  ABC transporter ATP-binding protein  41.87 
 
 		 267 aa  142  6e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.289741 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1979  ABC transporter related  36.28 
 
 		 258 aa  142  7e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000563857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0816  ABC transporter related  36.16 
 
 		 263 aa  142  8e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.117233  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1258  ABC transporter related  41.4 
 
 		 244 aa  141  8e-33  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0404  ABC transporter related protein  34.11 
 
 		 261 aa  141  9e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2718  ABC transporter related  41.35 
 
 		 259 aa  141  9.999999999999999e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3159  ABC transporter-like  38.57 
 
 		 282 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5010  ABC transporter related  39.8 
 
 		 263 aa  140  9.999999999999999e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0378  ABC transporter related  39.11 
 
 		 259 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0849  ABC transporter-related protein  37.44 
 
 		 253 aa  141  9.999999999999999e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0140067  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1680  ABC transporter ATP-binding protein  41.15 
 
 		 249 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.391829  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0458  ABC transporter, ATPase subunit  38.53 
 
 		 270 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2760  ABC transporter related protein  42.31 
 
 		 278 aa  140  1.9999999999999998e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.398097  normal  0.0252415 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0445  ABC transporter related  34.82 
 
 		 254 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1045  ABC transporter related  38.68 
 
 		 259 aa  140  1.9999999999999998e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.162928  normal  0.159703 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5062  ABC transporter related  34.76 
 
 		 246 aa  140  1.9999999999999998e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.314971  normal  0.024914 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2104  ABC transporter related protein  36.16 
 
 		 268 aa  140  1.9999999999999998e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2857  ABC transporter-related protein  39.9 
 
 		 259 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.99142  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4338  ABC transporter related  41.79 
 
 		 271 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0218  ABC transporter related  36.8 
 
 		 251 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2978  ABC transporter related  39.72 
 
 		 255 aa  139  3e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3676  ABC transporter related  40.16 
 
 		 266 aa  140  3e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.618015 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19520  ABC transporter ATP-binding protein  40.67 
 
 		 249 aa  140  3e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1296  ABC transporter related  36.86 
 
 		 265 aa  140  3e-32  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2514  ABC transporter  39.29 
 
 		 237 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.36817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4843  putative ABC transporter ATP-binding protein  39.53 
 
 		 284 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.365039 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4878  putative ABC transporter, ATP-binding protein  38.32 
 
 		 265 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.5505  normal  0.0921087 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1435  ABC transporter related protein  38.78 
 
 		 291 aa  139  3.9999999999999997e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.597503  normal  0.846861 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1857  ABC transporter related  37.39 
 
 		 304 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>