More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_0458 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007406  Nwi_0458  ABC transporter, ATPase subunit  100 
 
 
270 aa  538  9.999999999999999e-153  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3637  sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  64 
 
 
273 aa  302  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.854122  normal  0.438372 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2275  ABC transporter related  64 
 
 
273 aa  300  2e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.753386  normal  0.352835 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2096  ABC transporter related  63.6 
 
 
273 aa  300  2e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.487139 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2930  ABC transporter ATP-binding protein  63.75 
 
 
278 aa  297  1e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.232111  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34500  putative ATP-binding component of ABC transporter  63.75 
 
 
278 aa  297  1e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000586  normal  0.0781306 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1539  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  57.77 
 
 
264 aa  275  8e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0101  nitrate/nitrite/cyanate ABC transporter ATPase  57.79 
 
 
264 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.435899  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5824  ABC transporter related  50.75 
 
 
271 aa  248  5e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.971522  normal  0.461602 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6335  ABC transporter related  54.58 
 
 
264 aa  238  9e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6512  ABC transporter related  54.18 
 
 
264 aa  235  6e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6746  ABC transporter related  54.18 
 
 
264 aa  235  6e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.665072  normal  0.226989 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2628  sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  47.96 
 
 
270 aa  206  2e-52  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.197945  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0116  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  40.75 
 
 
276 aa  190  2e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4034  ABC transporter related  46.02 
 
 
276 aa  188  8e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.105857 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2164  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  41.51 
 
 
276 aa  188  8e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2718  ABC transporter related  40.87 
 
 
259 aa  187  2e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5421  ABC transporter related  43.53 
 
 
294 aa  187  2e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34330  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  39.61 
 
 
262 aa  185  6e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0962  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  42.42 
 
 
304 aa  182  3e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.439268 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4676  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  43.33 
 
 
673 aa  183  3e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2857  ABC transporter-related protein  40.43 
 
 
259 aa  183  3e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.99142  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4923  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  44.29 
 
 
668 aa  182  4.0000000000000006e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.502071 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1030  ABC transporter, ATP-binding protein  42.86 
 
 
254 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2592  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  40.93 
 
 
290 aa  182  5.0000000000000004e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.939043  normal  0.0506059 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0768  ABC transporter, conserved site  40.94 
 
 
432 aa  181  1e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3440  ABC transporter related  43.82 
 
 
275 aa  181  1e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.358394  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1490  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  43.81 
 
 
663 aa  181  1e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.810592  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0275  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  42.51 
 
 
267 aa  181  1e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.219358 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0792  ABC transporter related protein  41.67 
 
 
308 aa  181  1e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0378  hypothetical protein  41.15 
 
 
260 aa  180  2e-44  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1384  ABC transporter related protein  45.1 
 
 
277 aa  180  2e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0283767 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08090  ABC transporter, ATP-binding component  40.5 
 
 
269 aa  181  2e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1572  ABC transporter related protein  39.83 
 
 
267 aa  180  2e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1802  ABC transporter related protein  41.45 
 
 
267 aa  180  2e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00421209  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5010  ABC transporter related  39.46 
 
 
263 aa  181  2e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3519  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  41.43 
 
 
669 aa  180  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1045  ABC transporter related  38.06 
 
 
259 aa  179  2.9999999999999997e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.162928  normal  0.159703 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2598  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  41.43 
 
 
669 aa  180  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.992008  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2643  ABC transporter related  36.78 
 
 
261 aa  179  2.9999999999999997e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.430112  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3525  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  40.6 
 
 
669 aa  179  4e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.769679 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2333  ABC transporter related protein  42.65 
 
 
260 aa  179  4e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2673  ABC transporter related  40.68 
 
 
262 aa  179  4.999999999999999e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0156  ABC transporter related  38.15 
 
 
260 aa  179  4.999999999999999e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3676  ABC transporter related  42.49 
 
 
266 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.618015 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1975  ABC transporter related  40.16 
 
 
263 aa  178  8e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000056178  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1387  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  45.07 
 
 
304 aa  178  8e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.195746  normal  0.160104 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2904  ABC transporter related  42.57 
 
 
270 aa  178  9e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1428  ABC transporter related  40.08 
 
 
267 aa  177  1e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.250833  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3352  ABC transporter related  41.84 
 
 
261 aa  177  1e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2967  ABC transporter-related protein  39.02 
 
 
259 aa  178  1e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0379202  normal  0.762779 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2323  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  40.48 
 
 
262 aa  177  2e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3643  ABC transporter related  39.75 
 
 
259 aa  177  2e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.857726  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1817  ABC transporter  44.76 
 
 
261 aa  177  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4149  ABC transporter related  42.06 
 
 
266 aa  177  2e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0621662 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1155  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  38.43 
 
 
264 aa  177  2e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5225  ABC transporter related  45.07 
 
 
304 aa  177  2e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.272963  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1759  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  41.63 
 
 
275 aa  176  3e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.352483  hitchhiker  0.00557552 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2057  ABC transporter related  41.84 
 
 
280 aa  176  4e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0264  ABC transporter ATP-binding protein  41.86 
 
 
279 aa  176  4e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.419692  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3009  ABC transporter related  42.04 
 
 
245 aa  176  4e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3867  ABC transporter related  42.73 
 
 
265 aa  176  4e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.685954  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1236  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  42.86 
 
 
274 aa  176  5e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.875823 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0677  ABC transporter related  45.37 
 
 
262 aa  175  6e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.28609 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22550  ABC transporter ATP-binding protein  41.8 
 
 
255 aa  175  7e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2954  ABC transporter related  37.8 
 
 
272 aa  175  7e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2311  putative sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  36.44 
 
 
251 aa  175  7e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.89952  hitchhiker  0.0000000038093 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4393  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  43.1 
 
 
280 aa  175  8e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4456  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  43.1 
 
 
280 aa  175  8e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.458938  normal  0.759518 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6521  ABC transporter related  46.05 
 
 
270 aa  175  8e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02330  ABC transporter ATP-binding protein  41.86 
 
 
279 aa  175  8e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.366752  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3485  putative nitrate transport system ATP-binding protein  41.41 
 
 
308 aa  175  8e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6755  ABC transporter related  46.05 
 
 
270 aa  175  8e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0664482 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7505  ABC transporter, ATPase subunit  45.79 
 
 
273 aa  174  9e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000247297  normal  0.575396 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  36.72 
 
 
258 aa  174  9.999999999999999e-43  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19370  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  44.35 
 
 
326 aa  174  9.999999999999999e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.813225 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0218  ABC transporter related  38.4 
 
 
251 aa  174  9.999999999999999e-43  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0769  ABC transporter related  41.49 
 
 
252 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.159721 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2907  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  41.75 
 
 
262 aa  174  1.9999999999999998e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.98485  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4543  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  40.34 
 
 
277 aa  173  1.9999999999999998e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4338  ABC transporter related  42.11 
 
 
271 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1082  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  40.95 
 
 
573 aa  173  1.9999999999999998e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5730  ABC transporter related  39.91 
 
 
259 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6389  ABC transporter related  43.46 
 
 
256 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.350257  normal  0.506492 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4059  ABC transporter related  39.55 
 
 
276 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4539  ABC transporter related  43.42 
 
 
256 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.113352 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0147  ABC transporter related  40.99 
 
 
259 aa  173  1.9999999999999998e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.288686 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6344  ABC transporter related  45.33 
 
 
270 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.942875  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5351  ABC transporter related  39.91 
 
 
262 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3265  ABC transporter related  41.2 
 
 
273 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.745893  normal  0.952951 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5440  ABC transporter related  39.91 
 
 
262 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.556345 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0285  ABC transporter related protein  41.63 
 
 
267 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.120651  hitchhiker  0.0000760001 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6457  ABC transporter ATP-binding protein  39.64 
 
 
261 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5154  ABC transporter related  43.05 
 
 
268 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.597589  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5128  ABC transporter related  43.66 
 
 
256 aa  173  2.9999999999999996e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.012319  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0079  ABC transporter related  42.17 
 
 
307 aa  172  3.9999999999999995e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2170  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  42.52 
 
 
308 aa  172  5e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0468857  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5006  ABC transporter related  39.59 
 
 
287 aa  172  5e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0209  nitrate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  44.71 
 
 
283 aa  172  5.999999999999999e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.465549 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3083  ABC transporter related  40.87 
 
 
306 aa  172  5.999999999999999e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.724622  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>