More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B1539 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007952  Bxe_B1539  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  100 
 
 
264 aa  520  1e-147  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0101  nitrate/nitrite/cyanate ABC transporter ATPase  76.72 
 
 
264 aa  394  1e-109  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.435899  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0458  ABC transporter, ATPase subunit  57.77 
 
 
270 aa  275  8e-73  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2096  ABC transporter related  58.8 
 
 
273 aa  266  2e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.487139 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3637  sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  58.8 
 
 
273 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.854122  normal  0.438372 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2275  ABC transporter related  58 
 
 
273 aa  265  7e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.753386  normal  0.352835 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6335  ABC transporter related  59.04 
 
 
264 aa  261  1e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6512  ABC transporter related  59.04 
 
 
264 aa  260  2e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6746  ABC transporter related  59.04 
 
 
264 aa  260  2e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.665072  normal  0.226989 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34500  putative ATP-binding component of ABC transporter  58.8 
 
 
278 aa  257  1e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000586  normal  0.0781306 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2930  ABC transporter ATP-binding protein  58.8 
 
 
278 aa  257  2e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.232111  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2628  sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  50.88 
 
 
270 aa  225  7e-58  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.197945  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5824  ABC transporter related  49.6 
 
 
271 aa  222  4e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.971522  normal  0.461602 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4034  ABC transporter related  49 
 
 
276 aa  212  5.999999999999999e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.105857 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3643  ABC transporter related  48.02 
 
 
259 aa  211  1e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.857726  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2718  ABC transporter related  46.26 
 
 
259 aa  207  2e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2857  ABC transporter-related protein  45.81 
 
 
259 aa  205  5e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.99142  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2643  ABC transporter related  43.65 
 
 
261 aa  205  5e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.430112  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0546  ABC transporter related  46.99 
 
 
245 aa  204  1e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0156  ABC transporter related  48.1 
 
 
260 aa  204  2e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3306  alkanesulfonate ABC transporter, ATP binding protein  50.22 
 
 
263 aa  201  9.999999999999999e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0467  ABC transporter related  44.66 
 
 
274 aa  200  1.9999999999999998e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4338  ABC transporter related  47.2 
 
 
271 aa  199  3e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1759  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  47.2 
 
 
275 aa  198  7.999999999999999e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.352483  hitchhiker  0.00557552 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1505  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  44.74 
 
 
262 aa  198  9e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0234474  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3676  ABC transporter related  46.8 
 
 
266 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.618015 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5154  ABC transporter related  47.64 
 
 
268 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.597589  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2967  ABC transporter-related protein  46.19 
 
 
259 aa  196  3e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0379202  normal  0.762779 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3339  ABC transporter related  46.34 
 
 
260 aa  196  3e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00741331  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4149  ABC transporter related  46.4 
 
 
266 aa  196  3e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0621662 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4114  ABC transporter related  46.8 
 
 
273 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.406402  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4252  ABC transporter related  46.8 
 
 
273 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0391855  normal  0.0823186 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0147  ABC transporter related  46.12 
 
 
259 aa  194  1e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.288686 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3867  ABC transporter related  45.49 
 
 
265 aa  194  1e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.685954  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7505  ABC transporter, ATPase subunit  44.79 
 
 
273 aa  194  1e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000247297  normal  0.575396 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1045  ABC transporter related  45.24 
 
 
259 aa  194  1e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.162928  normal  0.159703 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3265  ABC transporter related  46.4 
 
 
273 aa  194  1e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.745893  normal  0.952951 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1979  ABC transporter related  47.62 
 
 
258 aa  193  2e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000563857  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2164  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  45.85 
 
 
276 aa  193  2e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1387  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  45.57 
 
 
304 aa  194  2e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.195746  normal  0.160104 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6521  ABC transporter related  47.5 
 
 
270 aa  193  2e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0327  ABC transporter related  45 
 
 
264 aa  193  2e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.341199  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6755  ABC transporter related  47.5 
 
 
270 aa  193  2e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0664482 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6344  ABC transporter related  47.92 
 
 
270 aa  193  2e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.942875  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2057  ABC transporter related  46.91 
 
 
280 aa  192  3e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1428  ABC transporter related  43.48 
 
 
267 aa  192  5e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.250833  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4457  ABC transporter related  43.82 
 
 
265 aa  191  7e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0721203  normal  0.624279 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4591  ABC transporter related  43.82 
 
 
265 aa  191  7e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5225  ABC transporter related  44.73 
 
 
304 aa  191  7e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.272963  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6457  ABC transporter ATP-binding protein  42.37 
 
 
261 aa  191  8e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1788  ABC transporter related  42.17 
 
 
303 aa  191  1e-47  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2338  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  43.97 
 
 
276 aa  191  1e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.685879  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4570  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  48.31 
 
 
668 aa  191  1e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.177412  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2275  ABC transporter related  45.12 
 
 
264 aa  191  1e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0996963 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0769  ABC transporter related  48.83 
 
 
252 aa  190  2e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.159721 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4542  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  46.82 
 
 
657 aa  190  2e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0059  ABC transporter related  44.39 
 
 
257 aa  190  2e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3009  ABC transporter related  43.44 
 
 
245 aa  190  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0116  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  44.49 
 
 
276 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16920  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  47.89 
 
 
269 aa  189  4e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.407228  normal  0.132168 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4202  ABC transporter related  42.91 
 
 
286 aa  189  4e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.657394  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2221  ABC transporter-related protein  45.17 
 
 
262 aa  189  4e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000225021  normal  0.260255 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6427  ABC transporter related  45.31 
 
 
303 aa  189  4e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5555  ABC transporter related  45.31 
 
 
303 aa  189  4e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356356  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5920  ABC transporter related  45.31 
 
 
303 aa  189  4e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1909  ABC transporter related  40.44 
 
 
286 aa  189  5e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1384  ABC transporter related protein  47.2 
 
 
277 aa  188  5.999999999999999e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0283767 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0175  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  43.81 
 
 
286 aa  188  7e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.482703  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0378  ABC transporter related  43.14 
 
 
259 aa  188  7e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1975  ABC transporter related  41.83 
 
 
263 aa  188  8e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000056178  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2688  ABC transporter related  47.77 
 
 
264 aa  188  8e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.232656  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0331  ABC transporter related  43.14 
 
 
259 aa  188  9e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0667  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  45.5 
 
 
266 aa  188  9e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0738173  normal  0.024802 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0962  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  43.13 
 
 
304 aa  188  9e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.439268 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2333  ABC transporter related protein  43.3 
 
 
260 aa  187  1e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2904  ABC transporter related  46.77 
 
 
270 aa  187  1e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2147  ABC transporter related  44.3 
 
 
274 aa  187  2e-46  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2598  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  45.21 
 
 
669 aa  186  2e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.992008  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3519  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  45.21 
 
 
669 aa  186  2e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7645  putative sulfonate ABC transporter, ATP binding protein  42.37 
 
 
261 aa  187  2e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0412308  normal  0.633643 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0792  ABC transporter related protein  44.05 
 
 
308 aa  186  3e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3655  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  43.2 
 
 
263 aa  186  3e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2188  ABC transporter related  50.76 
 
 
260 aa  186  3e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0571708  normal  0.474002 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1490  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  42.56 
 
 
663 aa  186  3e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.810592  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3269  ABC transporter related  48.02 
 
 
263 aa  186  3e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.874896 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22550  ABC transporter ATP-binding protein  47.11 
 
 
255 aa  186  3e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6389  ABC transporter related  45.87 
 
 
256 aa  186  4e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.350257  normal  0.506492 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4923  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  46.67 
 
 
668 aa  186  5e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.502071 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2775  ABC transporter related  46.12 
 
 
268 aa  185  5e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0528  ABC transporter related  38.56 
 
 
247 aa  185  7e-46  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1802  ABC transporter related protein  44.62 
 
 
267 aa  185  8e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00421209  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1358  ABC transporter related  42.29 
 
 
262 aa  185  8e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2954  ABC transporter related  43.86 
 
 
272 aa  184  9e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3786  ABC transporter related  43.51 
 
 
305 aa  184  9e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2673  ABC transporter related  48.26 
 
 
262 aa  184  9e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3440  ABC transporter related  45.49 
 
 
275 aa  184  1.0000000000000001e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.358394  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2893  ABC transporter related  44.53 
 
 
259 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.767338  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31130  ABC transporter ATP binding protein  50.43 
 
 
264 aa  184  1.0000000000000001e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.098287  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1572  ABC transporter related protein  41.22 
 
 
267 aa  184  1.0000000000000001e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1352  ABC transporter related  47.22 
 
 
262 aa  183  2.0000000000000003e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>