More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_3637 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_3637  sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  100 
 
 		 273 aa  535  1e-151  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.854122  normal  0.438372 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2096  ABC transporter related  98.17 
 
 		 273 aa  525  1e-148  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.487139 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2275  ABC transporter related  94.51 
 
 		 273 aa  483  1e-135  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.753386  normal  0.352835 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2930  ABC transporter ATP-binding protein  76.19 
 
 		 278 aa  372  1e-102  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.232111  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34500  putative ATP-binding component of ABC transporter  76.19 
 
 		 278 aa  372  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000586  normal  0.0781306 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0458  ABC transporter, ATPase subunit  64 
 
 		 270 aa  321  9.000000000000001e-87  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0101  nitrate/nitrite/cyanate ABC transporter ATPase  64.35 
 
 		 264 aa  282  4.0000000000000003e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.435899  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1539  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  58.8 
 
 		 264 aa  280  1e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6512  ABC transporter related  59.36 
 
 		 264 aa  260  1e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6746  ABC transporter related  59.36 
 
 		 264 aa  260  1e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.665072  normal  0.226989 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6335  ABC transporter related  57.36 
 
 		 264 aa  260  2e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5824  ABC transporter related  51.38 
 
 		 271 aa  250  1e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.971522  normal  0.461602 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2628  sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  51.81 
 
 		 270 aa  242  5e-63  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.197945  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2718  ABC transporter related  43.7 
 
 		 259 aa  207  1e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3009  ABC transporter related  46.38 
 
 		 245 aa  204  8e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4034  ABC transporter related  47.33 
 
 		 276 aa  205  8e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.105857 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4923  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  45.97 
 
 		 668 aa  204  9e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.502071 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1490  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  41.45 
 
 		 663 aa  203  3e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.810592  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2857  ABC transporter-related protein  42.91 
 
 		 259 aa  203  3e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.99142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1572  ABC transporter related protein  42.21 
 
 		 267 aa  203  3e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7505  ABC transporter, ATPase subunit  46.77 
 
 		 273 aa  201  7e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000247297  normal  0.575396 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3519  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  42.45 
 
 		 669 aa  201  8e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2598  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  42.45 
 
 		 669 aa  201  8e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.992008  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3440  ABC transporter related  46.88 
 
 		 275 aa  198  7e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.358394  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4676  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  42.69 
 
 		 673 aa  198  7.999999999999999e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1117  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  42.02 
 
 		 265 aa  198  9e-50  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6344  ABC transporter related  44.35 
 
 		 270 aa  198  9e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.942875  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22550  ABC transporter ATP-binding protein  47.48 
 
 		 255 aa  197  1.0000000000000001e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1919  ABC transporter related  39.92 
 
 		 265 aa  197  1.0000000000000001e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3042  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  43.29 
 
 		 557 aa  197  1.0000000000000001e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.499138  normal  0.908503 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6521  ABC transporter related  44.72 
 
 		 270 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5351  ABC transporter related  43.15 
 
 		 262 aa  197  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6755  ABC transporter related  44.72 
 
 		 270 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0664482 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5440  ABC transporter related  43.15 
 
 		 262 aa  197  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.556345 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5730  ABC transporter related  43.15 
 
 		 259 aa  197  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1802  ABC transporter related protein  45.06 
 
 		 267 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00421209  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3655  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  45.76 
 
 		 263 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03652  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  40.84 
 
 		 295 aa  196  2.0000000000000003e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0275  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  42.62 
 
 		 267 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.219358 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1665  ABC transporter  42.79 
 
 		 561 aa  195  7e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0690908  normal  0.0741534 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4542  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  45.23 
 
 		 657 aa  194  9e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1384  ABC transporter related protein  46.95 
 
 		 277 aa  194  9e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0283767 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1236  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  44.03 
 
 		 274 aa  194  9e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.875823 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2103  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  43.38 
 
 		 263 aa  194  1e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0097031  normal  0.0581699 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1975  ABC transporter related  41.22 
 
 		 263 aa  194  1e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000056178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2592  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  49.07 
 
 		 290 aa  194  1e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.939043  normal  0.0506059 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1358  ABC transporter related  42.06 
 
 		 262 aa  194  2e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3525  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  42.59 
 
 		 669 aa  194  2e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.769679 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0849  ABC transporter-related protein  41.25 
 
 		 253 aa  193  2e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0140067  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0328  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  42.62 
 
 		 267 aa  193  3e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1155  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  38.4 
 
 		 264 aa  192  4e-48  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3643  ABC transporter related  44.03 
 
 		 259 aa  192  5e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.857726  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0175  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  41.28 
 
 		 286 aa  192  5e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.482703  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2904  ABC transporter related  43.78 
 
 		 270 aa  192  6e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1237  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  45 
 
 		 659 aa  192  6e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0218  ABC transporter related  39.92 
 
 		 251 aa  192  7e-48  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0792  ABC transporter related protein  43.91 
 
 		 308 aa  191  9e-48  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1817  ABC transporter  45.69 
 
 		 261 aa  191  1e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0832  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  42.92 
 
 		 266 aa  191  1e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0180389 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34330  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  42.46 
 
 		 262 aa  191  1e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3269  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  41.74 
 
 		 270 aa  191  1e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.454908  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2833  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  45.67 
 
 		 267 aa  191  1e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.848417  normal  0.24141 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0667  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  41.32 
 
 		 266 aa  191  1e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0738173  normal  0.024802 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2375  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  41.03 
 
 		 268 aa  191  1e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7645  putative sulfonate ABC transporter, ATP binding protein  44.02 
 
 		 261 aa  191  1e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0412308  normal  0.633643 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2599  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  43.38 
 
 		 285 aa  191  2e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3867  ABC transporter related  44.08 
 
 		 265 aa  191  2e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.685954  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0113  ABC transporter related  42.55 
 
 		 261 aa  190  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.692675 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3306  alkanesulfonate ABC transporter, ATP binding protein  44.73 
 
 		 263 aa  191  2e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3518  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  43.38 
 
 		 285 aa  191  2e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1107  ABC transporter related  46.61 
 
 		 255 aa  189  2.9999999999999997e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.129879 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21980  ABC transporter, ATP binding component  45.45 
 
 		 271 aa  190  2.9999999999999997e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0325  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  41.46 
 
 		 268 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5010  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  43.38 
 
 		 264 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.453812  normal  0.426331 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3314  putative nitrate ABC transporter, ATP-binding protein  39 
 
 		 292 aa  189  4e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.662783  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2164  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  42.8 
 
 		 276 aa  189  4e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2502  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  41.31 
 
 		 264 aa  189  4e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.541276  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4059  ABC transporter related  40.25 
 
 		 276 aa  189  5e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4922  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  41.05 
 
 		 286 aa  188  5.999999999999999e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.659379  normal  0.550165 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2967  ABC transporter-related protein  41.42 
 
 		 259 aa  189  5.999999999999999e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0379202  normal  0.762779 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0528  ABC transporter related  39.32 
 
 		 247 aa  188  7e-47  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3159  ABC transporter-like  43.27 
 
 		 282 aa  188  8e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0285  ABC transporter related protein  40.91 
 
 		 267 aa  188  8e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.120651  hitchhiker  0.0000760001 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2643  ABC transporter related  42.24 
 
 		 261 aa  188  8e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.430112  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4570  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  42.31 
 
 		 668 aa  188  8e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.177412  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2322  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  45.19 
 
 		 267 aa  188  8e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.237754  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2057  ABC transporter related  43.27 
 
 		 280 aa  188  9e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4957  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  43.38 
 
 		 264 aa  187  1e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0893912  normal  0.168509 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1428  ABC transporter related  42.48 
 
 		 267 aa  187  1e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.250833  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3745  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  41.96 
 
 		 264 aa  187  1e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.267021  normal  0.105964 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0769  ABC transporter related  42.86 
 
 		 252 aa  187  1e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.159721 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4494  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  43.38 
 
 		 264 aa  187  1e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2817  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  38.72 
 
 		 282 aa  188  1e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.042803  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0116  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  43.31 
 
 		 276 aa  187  1e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2775  ABC transporter related  43.67 
 
 		 268 aa  187  2e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0156  ABC transporter related  42.73 
 
 		 260 aa  187  2e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3269  ABC transporter related  47.58 
 
 		 263 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.874896 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2556  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  41.87 
 
 		 274 aa  187  2e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.140772  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1045  ABC transporter related  40 
 
 		 259 aa  187  2e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.162928  normal  0.159703 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2954  ABC transporter related  39.92 
 
 		 272 aa  187  2e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>