More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_6512 on replicon NC_008062
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008062  Bcen_6512  ABC transporter related  100 
 
 		 264 aa  527  1e-149  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6746  ABC transporter related  100 
 
 		 264 aa  527  1e-149  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.665072  normal  0.226989 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6335  ABC transporter related  99.24 
 
 		 264 aa  521  1e-147  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1539  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  59.04 
 
 		 264 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0101  nitrate/nitrite/cyanate ABC transporter ATPase  60.94 
 
 		 264 aa  272  4.0000000000000004e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.435899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2096  ABC transporter related  59.36 
 
 		 273 aa  268  8e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.487139 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3637  sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  59.36 
 
 		 273 aa  267  1e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.854122  normal  0.438372 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2275  ABC transporter related  58.57 
 
 		 273 aa  265  8e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.753386  normal  0.352835 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0458  ABC transporter, ATPase subunit  54.18 
 
 		 270 aa  259  3e-68  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2930  ABC transporter ATP-binding protein  55.85 
 
 		 278 aa  257  1e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.232111  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34500  putative ATP-binding component of ABC transporter  55.85 
 
 		 278 aa  257  1e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000586  normal  0.0781306 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5824  ABC transporter related  51.78 
 
 		 271 aa  237  1e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.971522  normal  0.461602 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2628  sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  50.41 
 
 		 270 aa  229  3e-59  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.197945  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4034  ABC transporter related  47.97 
 
 		 276 aa  203  3e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.105857 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7505  ABC transporter, ATPase subunit  47.77 
 
 		 273 aa  198  9e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000247297  normal  0.575396 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6521  ABC transporter related  47.77 
 
 		 270 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6755  ABC transporter related  47.77 
 
 		 270 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0664482 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3440  ABC transporter related  50.64 
 
 		 275 aa  197  2.0000000000000003e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.358394  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1384  ABC transporter related protein  46.35 
 
 		 277 aa  196  4.0000000000000005e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0283767 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6344  ABC transporter related  47.37 
 
 		 270 aa  195  5.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.942875  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0769  ABC transporter related  48.07 
 
 		 252 aa  194  1e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.159721 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3009  ABC transporter related  45.2 
 
 		 245 aa  194  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2673  ABC transporter related  51.67 
 
 		 262 aa  191  8e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7645  putative sulfonate ABC transporter, ATP binding protein  45.69 
 
 		 261 aa  191  1e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0412308  normal  0.633643 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0218  ABC transporter related  41.67 
 
 		 251 aa  191  1e-47  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1919  ABC transporter related  42.02 
 
 		 265 aa  190  2e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19370  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  48.52 
 
 		 326 aa  189  2.9999999999999997e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.813225 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1572  ABC transporter related protein  41.67 
 
 		 267 aa  189  2.9999999999999997e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0113  ABC transporter related  45.8 
 
 		 261 aa  189  4e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.692675 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1358  ABC transporter related  42.79 
 
 		 262 aa  188  8e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2893  ABC transporter related  47.54 
 
 		 259 aa  188  9e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.767338  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3306  alkanesulfonate ABC transporter, ATP binding protein  47.35 
 
 		 263 aa  187  1e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1352  ABC transporter related  47.62 
 
 		 262 aa  187  1e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2221  ABC transporter-related protein  46.94 
 
 		 262 aa  187  2e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000225021  normal  0.260255 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3655  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  46.3 
 
 		 263 aa  186  3e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1979  ABC transporter related  44.13 
 
 		 258 aa  186  4e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000563857  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0209  nitrate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  47.39 
 
 		 283 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.465549 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4539  ABC transporter related  45.08 
 
 		 256 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.113352 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22550  ABC transporter ATP-binding protein  47.41 
 
 		 255 aa  184  1.0000000000000001e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0347  ABC transporter, ATP-binding protein  39.69 
 
 		 511 aa  184  1.0000000000000001e-45  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3269  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  45.71 
 
 		 270 aa  184  2.0000000000000003e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.454908  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6389  ABC transporter related  45.12 
 
 		 256 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.350257  normal  0.506492 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0832  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  42.27 
 
 		 266 aa  182  5.0000000000000004e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0180389 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0378  hypothetical protein  42.67 
 
 		 260 aa  182  7e-45  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2274  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  46.7 
 
 		 265 aa  181  1e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.362973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0735  ABC transporter related  40.08 
 
 		 253 aa  181  1e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0415182  normal  0.371016 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0275  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  47.14 
 
 		 267 aa  181  1e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.219358 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2643  ABC transporter related  44.24 
 
 		 261 aa  181  1e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.430112  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4338  ABC transporter related  44.08 
 
 		 271 aa  181  2e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1975  ABC transporter related  41.54 
 
 		 263 aa  180  2e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000056178  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0235  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  46.67 
 
 		 267 aa  180  2e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.926583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2103  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  42 
 
 		 263 aa  180  2e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0097031  normal  0.0581699 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3265  ABC transporter related  44.9 
 
 		 273 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.745893  normal  0.952951 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3325  ABC transporter related protein  41.83 
 
 		 440 aa  179  2.9999999999999997e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2833  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  46.48 
 
 		 267 aa  180  2.9999999999999997e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.848417  normal  0.24141 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0768  ABC transporter, conserved site  38.72 
 
 		 432 aa  179  4e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1379  ABC transporter-like protein  46.56 
 
 		 246 aa  179  4.999999999999999e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.279047 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1802  ABC transporter related protein  45.26 
 
 		 267 aa  179  4.999999999999999e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00421209  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2718  ABC transporter related  46.15 
 
 		 259 aa  178  7e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2904  ABC transporter related  47.14 
 
 		 270 aa  178  7e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1412  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  44.76 
 
 		 271 aa  178  7e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.867581  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0256  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  46.19 
 
 		 267 aa  178  8e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.378501 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0156  ABC transporter related  43.12 
 
 		 260 aa  178  9e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2688  ABC transporter related  46.26 
 
 		 264 aa  177  1e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.232656  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5009  ABC transporter related  47.34 
 
 		 285 aa  178  1e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0238  ABC sulfate ester transporter, ATPase subunit  44.74 
 
 		 286 aa  177  1e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.81925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1390  NO3-/NO2- ABC transporter  44.13 
 
 		 266 aa  177  1e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.365373 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1733  ABC transporter related protein  42.6 
 
 		 265 aa  177  2e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0059  ABC transporter related  42.41 
 
 		 257 aa  177  2e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0116  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  44.4 
 
 		 276 aa  177  2e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2385  putrescine transporter ATP-binding subunit  42.68 
 
 		 375 aa  176  2e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4114  ABC transporter related  44.49 
 
 		 273 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.406402  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3269  ABC transporter related  47.14 
 
 		 263 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.874896 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4252  ABC transporter related  44.49 
 
 		 273 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0391855  normal  0.0823186 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1075  ABC transporter related  43.23 
 
 		 252 aa  177  2e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.137281  normal  0.464106 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3643  ABC transporter related  45.58 
 
 		 259 aa  177  2e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.857726  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3841  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  48.15 
 
 		 278 aa  176  3e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4591  ABC transporter related  45.42 
 
 		 265 aa  176  3e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2286  putrescine transporter ATP-binding subunit  42.56 
 
 		 377 aa  176  3e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.58176  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1759  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  42.86 
 
 		 275 aa  176  3e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.352483  hitchhiker  0.00557552 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4372  ABC transporter related  45.69 
 
 		 253 aa  176  3e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.191075 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3867  ABC transporter related  47.14 
 
 		 265 aa  176  3e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.685954  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3525  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  43.6 
 
 		 669 aa  176  3e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.769679 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5128  ABC transporter related  46.93 
 
 		 256 aa  176  3e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.012319  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1693  putrescine transporter ATP-binding subunit  42.68 
 
 		 400 aa  176  3e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2592  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  47.37 
 
 		 290 aa  176  3e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.939043  normal  0.0506059 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4457  ABC transporter related  45.42 
 
 		 265 aa  176  3e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0721203  normal  0.624279 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1959  putrescine transporter ATP-binding subunit  42.68 
 
 		 377 aa  176  4e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2164  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  45.73 
 
 		 276 aa  176  4e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3339  ABC transporter related  42.5 
 
 		 260 aa  176  4e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00741331  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6161  ABC transporter related  39.16 
 
 		 287 aa  176  5e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.551746 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2375  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  43.33 
 
 		 268 aa  176  5e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0378  ABC transporter related  43.41 
 
 		 259 aa  175  5e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3412  ABC transporter related protein  48.68 
 
 		 258 aa  176  5e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1082  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  41.74 
 
 		 573 aa  175  5e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2188  ABC transporter related  48.61 
 
 		 260 aa  175  6e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0571708  normal  0.474002 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2322  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  45.54 
 
 		 267 aa  175  6e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.237754  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0331  ABC transporter related  43.41 
 
 		 259 aa  175  6e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4149  ABC transporter related  42.86 
 
 		 266 aa  175  6e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0621662 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3524  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  45.24 
 
 		 269 aa  175  8e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.569935  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>