More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_19370 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_19370  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  100 
 
 		 326 aa  622  1e-177  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.813225 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1384  ABC transporter related protein  73.93 
 
 		 277 aa  352  4e-96  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0283767 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3440  ABC transporter related  70.75 
 
 		 275 aa  325  6e-88  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.358394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0440  ABC transporter related  59.19 
 
 		 270 aa  243  5e-63  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.280532 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4335  ABC transporter related protein  45.53 
 
 		 247 aa  212  5.999999999999999e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4843  putative ABC transporter ATP-binding protein  47.64 
 
 		 284 aa  212  7.999999999999999e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.365039 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1352  ABC transporter related  46.64 
 
 		 262 aa  209  7e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5128  ABC transporter related  45.67 
 
 		 256 aa  207  1e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.012319  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0150  ABC transporter related  49.03 
 
 		 252 aa  204  2e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3269  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  46.67 
 
 		 270 aa  202  8e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.454908  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1831  ABC transporter related protein  44.44 
 
 		 266 aa  201  9.999999999999999e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1412  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  46.09 
 
 		 271 aa  201  9.999999999999999e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.867581  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6389  ABC transporter related  44.88 
 
 		 256 aa  200  3e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.350257  normal  0.506492 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0275  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  45.59 
 
 		 267 aa  199  3.9999999999999996e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.219358 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4539  ABC transporter related  44.49 
 
 		 256 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.113352 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0209  ABC transporter-like  43.31 
 
 		 271 aa  199  7e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1975  ABC transporter related  44.87 
 
 		 263 aa  199  7e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000056178  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4922  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  41.99 
 
 		 286 aa  198  9e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.659379  normal  0.550165 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4675  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  43.41 
 
 		 280 aa  198  9e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1260  ABC transporter related  44.16 
 
 		 293 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.227509 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0580  ABC transporter related  41.67 
 
 		 265 aa  197  2.0000000000000003e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.860273  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0328  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  45.21 
 
 		 267 aa  197  3e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0238  ABC sulfate ester transporter, ATPase subunit  46.61 
 
 		 286 aa  197  3e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.81925  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2625  ABC transporter related  49.03 
 
 		 267 aa  197  3e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.173465  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2099  ABC transporter related  45.14 
 
 		 298 aa  196  3e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1075  ABC transporter related  44 
 
 		 252 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.137281  normal  0.464106 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0769  ABC transporter related  49.01 
 
 		 252 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.159721 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0832  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  45 
 
 		 266 aa  196  5.000000000000001e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0180389 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2375  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  45.87 
 
 		 268 aa  196  5.000000000000001e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3518  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  42.08 
 
 		 285 aa  196  6e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2817  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  42.39 
 
 		 282 aa  196  6e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.042803  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2599  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  42.08 
 
 		 285 aa  196  6e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4216  ABC transporter related  45.88 
 
 		 256 aa  196  7e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1421  ABC transporter related  44.16 
 
 		 293 aa  195  7e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2157  sulfate ester ABC transporter ATPase  44.36 
 
 		 288 aa  195  7e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0499335  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3867  ABC transporter related  47.13 
 
 		 265 aa  195  7e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.685954  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2064  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  45.14 
 
 		 281 aa  195  9e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.768493  normal  0.657795 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0378  hypothetical protein  44 
 
 		 260 aa  195  1e-48  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3882  ABC transporter related  40 
 
 		 259 aa  195  1e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5555  ABC transporter related  43.13 
 
 		 303 aa  194  1e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356356  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1431  ABC transporter related  44.06 
 
 		 269 aa  194  1e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.242163  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0235  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  44.83 
 
 		 267 aa  194  2e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.926583  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0256  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  45.98 
 
 		 267 aa  194  2e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.378501 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3524  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  44.67 
 
 		 269 aa  194  2e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.569935  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0325  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  42.91 
 
 		 268 aa  194  2e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03652  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  42.25 
 
 		 295 aa  194  2e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5062  ABC transporter related  43.53 
 
 		 246 aa  194  2e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.314971  normal  0.024914 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2000  ABC transporter-related protein  40.4 
 
 		 251 aa  194  3e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.554575  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2164  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  43.82 
 
 		 276 aa  193  4e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0131  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  40.43 
 
 		 281 aa  193  4e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6427  ABC transporter related  42.75 
 
 		 303 aa  193  4e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5920  ABC transporter related  42.75 
 
 		 303 aa  193  4e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1572  ABC transporter related protein  38.17 
 
 		 267 aa  192  5e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1210  ABC transporter related  45.78 
 
 		 287 aa  192  5e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.502786  normal  0.459492 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4565  ABC transporter related  44.09 
 
 		 281 aa  192  6e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2833  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  47.3 
 
 		 267 aa  192  6e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.848417  normal  0.24141 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2556  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  44.84 
 
 		 274 aa  192  7e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.140772  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0445  ABC transporter related  38.4 
 
 		 254 aa  192  7e-48  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4543  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  41.73 
 
 		 277 aa  192  9e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3525  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  40.67 
 
 		 669 aa  191  1e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.769679 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3158  ABC transporter related  48.08 
 
 		 245 aa  191  1e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0482  ABC transporter related protein  43.14 
 
 		 255 aa  191  1e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3083  ABC transporter related  41.06 
 
 		 306 aa  191  1e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.724622  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2322  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  46.89 
 
 		 267 aa  191  1e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.237754  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1475  ABC transporter related  38 
 
 		 254 aa  191  1e-47  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22550  ABC transporter ATP-binding protein  45.82 
 
 		 255 aa  191  1e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4472  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  44.84 
 
 		 265 aa  191  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.75399 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7505  ABC transporter, ATPase subunit  49.58 
 
 		 273 aa  190  2e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000247297  normal  0.575396 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2057  ABC transporter related  44.92 
 
 		 280 aa  191  2e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2820  nitrate transport protein  44.73 
 
 		 263 aa  191  2e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.326558  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1758  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  45.15 
 
 		 264 aa  191  2e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.228695  normal  0.0130766 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2415  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  42.91 
 
 		 284 aa  191  2e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.247099  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3841  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  45.45 
 
 		 278 aa  190  2e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7199  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (nitrate/sulfonates)  44.05 
 
 		 278 aa  190  2.9999999999999997e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0286852  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0087  ABC transporter related  41.6 
 
 		 263 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4347  ABC transporter related  44.92 
 
 		 281 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4569  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  43.24 
 
 		 275 aa  190  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.571931  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4019  ABC transporter related  44.92 
 
 		 281 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4523  ABC transporter related  41.22 
 
 		 280 aa  189  4e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6459  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  44.84 
 
 		 265 aa  189  4e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.100631 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4520  ABC transporter related  45.96 
 
 		 249 aa  189  5e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.719426 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0230  ABC transporter related  43.37 
 
 		 287 aa  189  5.999999999999999e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4542  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  41.16 
 
 		 657 aa  189  7e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08090  ABC transporter, ATP-binding component  43.87 
 
 		 269 aa  189  7e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3505  ABC transporter related  44.53 
 
 		 281 aa  189  7e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.870495  hitchhiker  0.000930317 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3306  alkanesulfonate ABC transporter, ATP binding protein  43.54 
 
 		 263 aa  189  7e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0116  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  42.59 
 
 		 276 aa  189  8e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2714  sulfonate ABC transporter ATP-binding protein  39.36 
 
 		 287 aa  188  1e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0521621  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2665  alkanesulfonates transport ATP-binding protein  39.36 
 
 		 251 aa  188  1e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.273275  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1573  ABC transporter related  43.87 
 
 		 269 aa  188  1e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2922  sulfonate ABC transporter ATP-binding protein  39.36 
 
 		 251 aa  188  1e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.900883  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2643  ABC transporter related  42.62 
 
 		 261 aa  188  1e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.430112  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0392  ABC transporter related  37.2 
 
 		 254 aa  188  1e-46  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.238571  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2921  putative sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  39.36 
 
 		 251 aa  188  1e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.88235e-19 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6405  ABC transporter related  47.55 
 
 		 249 aa  188  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0333973  normal  0.45445 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3352  ABC transporter related  44.26 
 
 		 261 aa  188  1e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5010  ABC transporter related  45.63 
 
 		 263 aa  188  1e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0175  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  40.54 
 
 		 286 aa  188  1e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.482703  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05590  hypothetical protein  42.97 
 
 		 278 aa  187  2e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0735  ABC transporter related  41.04 
 
 		 253 aa  187  2e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0415182  normal  0.371016 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>