More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3412 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_3412  ABC transporter related protein  100 
 
 		 258 aa  500  1e-141  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3412  ABC transporter-related protein  62.5 
 
 		 250 aa  256  3e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0308441  normal  0.818563 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3817  ABC transporter related protein  50.82 
 
 		 249 aa  211  1e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1974  ABC transporter related  54.05 
 
 		 299 aa  210  2e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3158  ABC transporter related  54.17 
 
 		 245 aa  210  2e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0465  ABC transporter related protein  54.85 
 
 		 244 aa  210  2e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1647  ABC transporter related  51.72 
 
 		 330 aa  209  5e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.480345  normal  0.121683 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1379  ABC transporter-like protein  54.94 
 
 		 246 aa  206  3e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.279047 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1746  ABC transporter related  54.93 
 
 		 333 aa  206  3e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4138  ABC transporter-like  48.71 
 
 		 255 aa  206  4e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000371805  hitchhiker  0.00945872 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2621  ABC transporter related  54.43 
 
 		 245 aa  206  4e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.585434  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2303  ABC transporter related  47.69 
 
 		 275 aa  205  6e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.711472 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21610  aliphatic sulfonates ABC transporter, ATP binding component  51.07 
 
 		 266 aa  205  7e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0023  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  54.29 
 
 		 266 aa  205  7e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1084  ABC transporter related  51.38 
 
 		 319 aa  205  7e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1564  ABC transporter related  51.38 
 
 		 319 aa  205  7e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4706  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  51.85 
 
 		 319 aa  204  1e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1540  ABC transporter related  51.38 
 
 		 318 aa  204  1e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0499832  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4636  ABC transporter related  53.46 
 
 		 326 aa  203  2e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.214467  hitchhiker  0.0000194183 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1465  ABC transporter related  52.34 
 
 		 319 aa  204  2e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.08781  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1373  ABC transporter-related protein  55.09 
 
 		 291 aa  202  3e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2582  ABC transporter related  54.01 
 
 		 245 aa  202  4e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.799893  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2627  ABC transporter related  54.01 
 
 		 245 aa  202  4e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0950652  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1486  ABC transporter related  52.36 
 
 		 319 aa  202  5e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3716  ABC transporter related  50.83 
 
 		 263 aa  202  6e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00980305 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3407  ABC transporter related  50.41 
 
 		 263 aa  201  9e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.81445  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0029  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  52 
 
 		 266 aa  201  9.999999999999999e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.05113  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1775  ABC transporter related  54.19 
 
 		 278 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2881  ABC transporter related  48.82 
 
 		 280 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.542857  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1237  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  49.58 
 
 		 271 aa  200  9.999999999999999e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0017659 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30480  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  50.21 
 
 		 266 aa  200  1.9999999999999998e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.3789  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1237  aliphatic sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  52.42 
 
 		 273 aa  199  3e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0356  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  49.58 
 
 		 271 aa  199  3e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2973  ABC transporter related  51.13 
 
 		 276 aa  199  3e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.493702  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1823  aliphatic sulfonates ABC transporter, ATP-binding protein  52.42 
 
 		 327 aa  199  3e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5411  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  51.54 
 
 		 268 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.125743  hitchhiker  0.00768268 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1685  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  52.59 
 
 		 274 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2186  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  51.15 
 
 		 255 aa  199  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0564256  normal  0.601575 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2416  ABC transporter related  52.94 
 
 		 270 aa  199  3.9999999999999996e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.769125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1838  aliphatic sulfonates ABC transporter, ATP-binding protein  52.42 
 
 		 335 aa  199  5e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.391117  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0781  aliphatic sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  52.42 
 
 		 335 aa  199  5e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.309085  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2491  ABC aliphatic sulfonates transporter, ATPase subunit  53.52 
 
 		 261 aa  199  5e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.761124 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0773  ABC transporter related  54.11 
 
 		 262 aa  199  5e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.050143 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3041  ABC transporter-related protein  54.59 
 
 		 272 aa  199  5e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.784211  normal  0.0417825 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1723  aliphatic sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  52.42 
 
 		 335 aa  199  5e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.915177  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0380  aliphatic sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  52.42 
 
 		 335 aa  199  5e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.625066  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1991  aliphatic sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  52.42 
 
 		 335 aa  198  6e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0937962  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2658  ABC transporter related  50.21 
 
 		 271 aa  198  7e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.360126 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0424  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  49.16 
 
 		 271 aa  198  7e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0658  ABC transporter, ATP-binding protein  49.48 
 
 		 245 aa  198  7e-50  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1735  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  48.95 
 
 		 257 aa  198  7.999999999999999e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.117102  normal  0.144233 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1797  sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  50.63 
 
 		 270 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.555456  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1452  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  50.64 
 
 		 256 aa  197  1.0000000000000001e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4972  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  50.43 
 
 		 270 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.243489  normal  0.0217357 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19580  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  52.16 
 
 		 274 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4422  ABC transporter related  54.35 
 
 		 226 aa  197  2.0000000000000003e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3597  ABC transporter  50.42 
 
 		 274 aa  196  3e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.284861 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5314  aliphatic sulfonates ABC transporter, ATP-binding protein  49.79 
 
 		 270 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1868  ABC transporter ATP-binding protein  51.57 
 
 		 288 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0240  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  50.22 
 
 		 270 aa  195  5.000000000000001e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.10949  hitchhiker  0.000841582 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4874  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  50.22 
 
 		 270 aa  195  5.000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0255  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  50.22 
 
 		 270 aa  195  5.000000000000001e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.213675  normal  0.0453993 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0264  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  50 
 
 		 270 aa  195  7e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3600  ABC transporter related  51.1 
 
 		 263 aa  195  7e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00199632  normal  0.177255 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2499  aliphatic sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  52.36 
 
 		 335 aa  195  8.000000000000001e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1557  ABC transporter-like protein  52.34 
 
 		 247 aa  194  9e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1217  ABC transporter related  50 
 
 		 279 aa  194  1e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.216616 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3399  ABC transporter related protein  50.82 
 
 		 246 aa  194  1e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.857812  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1280  ABC transporter related  50.45 
 
 		 279 aa  194  2e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.161997  normal  0.0814876 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0117  ATPase  52.21 
 
 		 312 aa  193  2e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.182044  hitchhiker  0.000782511 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1341  aliphatic sulfonate ABC transporter ATP-binding protein  49.57 
 
 		 284 aa  193  3e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.120657  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5515  ABC transporter related  51.61 
 
 		 278 aa  192  4e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3867  ABC transporter related  50.38 
 
 		 265 aa  192  4e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.685954  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2436  ABC transporter related  50 
 
 		 277 aa  192  6e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2786  ABC transporter related  45.04 
 
 		 251 aa  191  7e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00998807  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2057  ABC transporter related  47.55 
 
 		 280 aa  191  8e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00937  alkanesulfonate transporter subunit  50.21 
 
 		 255 aa  191  1e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.059764  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2710  ABC transporter related protein  50.21 
 
 		 255 aa  191  1e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.35574  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2663  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  50.21 
 
 		 255 aa  191  1e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.501147  normal  0.0102717 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1095  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  50.21 
 
 		 255 aa  191  1e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00325172  normal  0.604485 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00944  hypothetical protein  50.21 
 
 		 255 aa  191  1e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0618654  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1042  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  50.21 
 
 		 255 aa  191  1e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0723  ABC transporter related  52.56 
 
 		 251 aa  190  2e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00967662  normal  0.0967044 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0424  ABC transporter related protein  51.52 
 
 		 254 aa  190  2e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.573696  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1035  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  50.21 
 
 		 255 aa  190  2e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0244681  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6405  ABC transporter related  50 
 
 		 249 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0333973  normal  0.45445 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2510  ABC transporter related  51.52 
 
 		 261 aa  189  2.9999999999999997e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.827702  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0551  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  41.6 
 
 		 236 aa  189  5e-47  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.978201  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1672  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  49.79 
 
 		 267 aa  189  5e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3465  ABC transporter related  49.39 
 
 		 241 aa  189  5e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.158921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1339  ABC transporter related  52.09 
 
 		 283 aa  188  5.999999999999999e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0379728 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4338  ABC transporter related  53.02 
 
 		 271 aa  188  5.999999999999999e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2407  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  50.24 
 
 		 245 aa  188  7e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.626164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3306  alkanesulfonate ABC transporter, ATP binding protein  49.42 
 
 		 263 aa  188  8e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4320  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  51.98 
 
 		 266 aa  187  2e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.151299 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0249  ABC transporter related  48.8 
 
 		 302 aa  187  2e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4520  ABC transporter related  51.11 
 
 		 249 aa  186  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.719426 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0769  ABC transporter related  56.67 
 
 		 252 aa  187  2e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.159721 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22550  ABC transporter ATP-binding protein  49.78 
 
 		 255 aa  187  2e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4418  ABC transporter related  52 
 
 		 241 aa  186  3e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.26331  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>