More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0658 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0658  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 		 245 aa  504  9.999999999999999e-143  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1735  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  47.87 
 
 		 257 aa  199  3e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.117102  normal  0.144233 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30480  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  46.12 
 
 		 266 aa  199  3.9999999999999996e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.3789  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3412  ABC transporter related protein  49.48 
 
 		 258 aa  198  6e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3716  ABC transporter related  43.12 
 
 		 263 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00980305 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4320  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  45.78 
 
 		 266 aa  196  3e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.151299 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3407  ABC transporter related  42.66 
 
 		 263 aa  196  3e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.81445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0117  ATPase  47.78 
 
 		 312 aa  195  5.000000000000001e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.182044  hitchhiker  0.000782511 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1647  ABC transporter related  47 
 
 		 330 aa  194  8.000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.480345  normal  0.121683 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1452  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  48.98 
 
 		 256 aa  194  9e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2186  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  48.47 
 
 		 255 aa  193  2e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0564256  normal  0.601575 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0240  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  44.76 
 
 		 270 aa  192  3e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.10949  hitchhiker  0.000841582 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1746  ABC transporter related  45.58 
 
 		 333 aa  192  3e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0255  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  44.76 
 
 		 270 aa  192  3e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.213675  normal  0.0453993 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5411  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  47.94 
 
 		 268 aa  192  3e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.125743  hitchhiker  0.00768268 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4972  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  45.81 
 
 		 270 aa  192  3e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.243489  normal  0.0217357 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0023  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  47.45 
 
 		 266 aa  192  4e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3600  ABC transporter related  40.89 
 
 		 263 aa  192  4e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00199632  normal  0.177255 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1237  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  45.97 
 
 		 271 aa  192  4e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0017659 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0356  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  45.97 
 
 		 271 aa  192  5e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0264  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  44.76 
 
 		 270 aa  191  8e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1341  aliphatic sulfonate ABC transporter ATP-binding protein  48.73 
 
 		 284 aa  191  1e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.120657  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1974  ABC transporter related  41.88 
 
 		 299 aa  191  1e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0766  ABC transporter related  40.59 
 
 		 253 aa  190  1e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19580  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  47.37 
 
 		 274 aa  190  1e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3412  ABC transporter-related protein  48.95 
 
 		 250 aa  190  1e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0308441  normal  0.818563 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4636  ABC transporter related  43.86 
 
 		 326 aa  191  1e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.214467  hitchhiker  0.0000194183 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0424  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  45.5 
 
 		 271 aa  191  1e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1084  ABC transporter related  47.09 
 
 		 319 aa  189  2e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1564  ABC transporter related  47.09 
 
 		 319 aa  189  2e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1540  ABC transporter related  47.09 
 
 		 318 aa  190  2e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0499832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1685  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  47.37 
 
 		 274 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1373  ABC transporter-related protein  43.78 
 
 		 291 aa  189  2.9999999999999997e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1217  ABC transporter related  46.23 
 
 		 279 aa  189  2.9999999999999997e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.216616 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2973  ABC transporter related  46.15 
 
 		 276 aa  189  5e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.493702  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0029  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  46.43 
 
 		 266 aa  188  5.999999999999999e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.05113  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1152  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  47.29 
 
 		 240 aa  188  7e-47  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1280  ABC transporter related  45 
 
 		 279 aa  188  8e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.161997  normal  0.0814876 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2303  ABC transporter related  40.96 
 
 		 275 aa  187  9e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.711472 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5314  aliphatic sulfonates ABC transporter, ATP-binding protein  46.7 
 
 		 270 aa  188  9e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1641  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  46.94 
 
 		 269 aa  187  9e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4422  ABC transporter related  48.13 
 
 		 226 aa  187  1e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4706  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  46.34 
 
 		 319 aa  187  1e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1486  ABC transporter related  46.08 
 
 		 319 aa  187  1e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1465  ABC transporter related  46.08 
 
 		 319 aa  187  1e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.08781  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4874  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  45.69 
 
 		 270 aa  187  2e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1775  ABC transporter related  45.41 
 
 		 278 aa  186  2e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2637  ABC sulfonate transporter, ATPase subunit  41.2 
 
 		 247 aa  186  2e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.327484  hitchhiker  0.00000882208 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1672  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  46.12 
 
 		 267 aa  187  2e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2416  ABC transporter related  45.62 
 
 		 270 aa  186  2e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.769125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5515  ABC transporter related  42.92 
 
 		 278 aa  186  3e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0325  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  41.09 
 
 		 268 aa  186  3e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2499  aliphatic sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  49.73 
 
 		 335 aa  185  5e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0424  ABC transporter related protein  42.79 
 
 		 254 aa  185  5e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.573696  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3041  ABC transporter-related protein  44.5 
 
 		 272 aa  185  5e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.784211  normal  0.0417825 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4107  ABC transporter related  43.36 
 
 		 242 aa  185  6e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1868  ABC transporter ATP-binding protein  47.78 
 
 		 288 aa  185  7e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2881  ABC transporter related  44.64 
 
 		 280 aa  184  8e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.542857  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00937  alkanesulfonate transporter subunit  47.45 
 
 		 255 aa  184  9e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.059764  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2710  ABC transporter related protein  47.45 
 
 		 255 aa  184  9e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.35574  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1095  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  47.45 
 
 		 255 aa  184  9e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00325172  normal  0.604485 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2663  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  47.45 
 
 		 255 aa  184  9e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.501147  normal  0.0102717 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00944  hypothetical protein  47.45 
 
 		 255 aa  184  9e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0618654  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1042  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  47.45 
 
 		 255 aa  184  9e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2786  ABC transporter related  48.48 
 
 		 251 aa  184  1.0000000000000001e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00998807  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1035  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  47.45 
 
 		 255 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0244681  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3781  ABC transporter related  45.32 
 
 		 259 aa  183  2.0000000000000003e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1237  aliphatic sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  46.31 
 
 		 273 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0832  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  44.16 
 
 		 266 aa  183  2.0000000000000003e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0180389 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0781  aliphatic sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  46.57 
 
 		 335 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.309085  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3841  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  45.12 
 
 		 278 aa  183  2.0000000000000003e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3465  ABC transporter related  41.15 
 
 		 241 aa  184  2.0000000000000003e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.158921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0482  ABC transporter related protein  47.98 
 
 		 255 aa  183  2.0000000000000003e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2491  ABC aliphatic sulfonates transporter, ATPase subunit  48.4 
 
 		 261 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.761124 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1838  aliphatic sulfonates ABC transporter, ATP-binding protein  46.57 
 
 		 335 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.391117  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1823  aliphatic sulfonates ABC transporter, ATP-binding protein  46.57 
 
 		 327 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1723  aliphatic sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  46.57 
 
 		 335 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.915177  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0380  aliphatic sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  46.57 
 
 		 335 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.625066  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1991  aliphatic sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  46.57 
 
 		 335 aa  183  3e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0937962  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7802  ABC transporter ATP-binding protein  47.34 
 
 		 237 aa  182  3e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.208198  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2980  ABC transporter related protein  44.59 
 
 		 255 aa  182  4.0000000000000006e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0773  ABC transporter related  45 
 
 		 262 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.050143 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7222  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  44.39 
 
 		 245 aa  182  5.0000000000000004e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0275  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  42.26 
 
 		 267 aa  182  5.0000000000000004e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.219358 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1339  ABC transporter related  44.34 
 
 		 283 aa  181  1e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0379728 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1375  ABC transporter related protein  45.85 
 
 		 258 aa  181  1e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.239653  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2820  nitrate transport protein  46.41 
 
 		 263 aa  181  1e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.326558  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19370  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  41.32 
 
 		 326 aa  179  2.9999999999999997e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.813225 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3597  ABC transporter  47.62 
 
 		 274 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.284861 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4138  ABC transporter-like  48.15 
 
 		 255 aa  179  2.9999999999999997e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000371805  hitchhiker  0.00945872 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6405  ABC transporter related  47.37 
 
 		 249 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0333973  normal  0.45445 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4339  ABC transporter related  42.66 
 
 		 252 aa  179  4.999999999999999e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.764562  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21610  aliphatic sulfonates ABC transporter, ATP binding component  43.32 
 
 		 266 aa  178  5.999999999999999e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2449  ABC transporter related  45.23 
 
 		 255 aa  178  5.999999999999999e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.259885 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0328  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  41.84 
 
 		 267 aa  178  8e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1237  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  41.81 
 
 		 659 aa  178  9e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3524  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  42.98 
 
 		 269 aa  177  9e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.569935  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2815  ABC transporter related  44.23 
 
 		 241 aa  177  1e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000485223 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2436  ABC transporter related  42.52 
 
 		 277 aa  177  1e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5129  ABC transporter related  42.86 
 
 		 275 aa  177  2e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0502881 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>