More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6405 on replicon NC_012854
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012854  Rleg_6405  ABC transporter related  100 
 
 		 249 aa  489  1e-137  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0333973  normal  0.45445 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4520  ABC transporter related  90.76 
 
 		 249 aa  443  1e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.719426 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1557  ABC transporter-like protein  68.05 
 
 		 247 aa  320  1.9999999999999998e-86  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2980  ABC transporter related protein  66.94 
 
 		 255 aa  295  4e-79  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3781  ABC transporter related  64.73 
 
 		 259 aa  286  2.9999999999999996e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3281  ABC transporter related  61.54 
 
 		 261 aa  277  9e-74  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29410  ABC transporter, ATP binding component  62.77 
 
 		 250 aa  274  9e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0249  ABC transporter related  62.88 
 
 		 302 aa  272  4.0000000000000004e-72  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0723  ABC transporter related  61.47 
 
 		 251 aa  262  4e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00967662  normal  0.0967044 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0434  ABC transporter related protein  66.06 
 
 		 291 aa  255  4e-67  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.997554  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2658  ABC transporter related  59.66 
 
 		 271 aa  252  5.000000000000001e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.360126 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7802  ABC transporter ATP-binding protein  59.57 
 
 		 237 aa  248  5e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.208198  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1379  ABC transporter-like protein  57.68 
 
 		 246 aa  247  1e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.279047 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2621  ABC transporter related  60.34 
 
 		 245 aa  246  2e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.585434  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21610  aliphatic sulfonates ABC transporter, ATP binding component  58.33 
 
 		 266 aa  246  3e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4418  ABC transporter related  55.79 
 
 		 241 aa  244  8e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.26331  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2582  ABC transporter related  59.91 
 
 		 245 aa  244  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.799893  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2627  ABC transporter related  59.91 
 
 		 245 aa  244  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0950652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3158  ABC transporter related  58.23 
 
 		 245 aa  242  3e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0424  ABC transporter related protein  58.59 
 
 		 254 aa  242  3.9999999999999997e-63  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.573696  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1797  sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  56.14 
 
 		 270 aa  241  1e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.555456  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0465  ABC transporter related protein  58.19 
 
 		 244 aa  241  1e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2637  ABC sulfonate transporter, ATPase subunit  57.64 
 
 		 247 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.327484  hitchhiker  0.00000882208 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4107  ABC transporter related  56.28 
 
 		 242 aa  238  5e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3597  ABC transporter  55.02 
 
 		 274 aa  237  1e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.284861 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0982  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  56.6 
 
 		 247 aa  233  3e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3399  ABC transporter related protein  57.68 
 
 		 246 aa  232  4.0000000000000004e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.857812  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3479  ABC transporter related protein  57.94 
 
 		 250 aa  232  4.0000000000000004e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.558732  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4422  ABC transporter related  59.03 
 
 		 226 aa  228  6e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3873  ABC transporter related  60.34 
 
 		 289 aa  225  5.0000000000000005e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.195534  normal  0.0802572 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2510  ABC transporter related  55.33 
 
 		 261 aa  225  5.0000000000000005e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.827702  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3817  ABC transporter related protein  54.35 
 
 		 249 aa  221  7e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4636  ABC transporter related  52.84 
 
 		 326 aa  220  9.999999999999999e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.214467  hitchhiker  0.0000194183 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1647  ABC transporter related  51.28 
 
 		 330 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.480345  normal  0.121683 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3465  ABC transporter related  55.41 
 
 		 241 aa  220  1.9999999999999999e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.158921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0766  ABC transporter related  51.69 
 
 		 253 aa  219  3e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2491  ABC aliphatic sulfonates transporter, ATPase subunit  51.52 
 
 		 261 aa  218  8.999999999999998e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.761124 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2973  ABC transporter related  48.95 
 
 		 276 aa  216  2e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.493702  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3041  ABC transporter-related protein  50.65 
 
 		 272 aa  215  5e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.784211  normal  0.0417825 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0117  ATPase  49.37 
 
 		 312 aa  215  5.9999999999999996e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.182044  hitchhiker  0.000782511 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1974  ABC transporter related  47.39 
 
 		 299 aa  214  9e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1746  ABC transporter related  49.79 
 
 		 333 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1375  ABC transporter related protein  50.82 
 
 		 258 aa  211  1e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.239653  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2227  ABC transporter related protein  50.43 
 
 		 267 aa  210  2e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0741245  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2186  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  50 
 
 		 255 aa  209  3e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0564256  normal  0.601575 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2416  ABC transporter related  47.93 
 
 		 270 aa  209  3e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.769125  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1217  ABC transporter related  48.31 
 
 		 279 aa  208  6e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.216616 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4320  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  49.78 
 
 		 266 aa  208  7e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.151299 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1280  ABC transporter related  47.88 
 
 		 279 aa  207  1e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.161997  normal  0.0814876 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0023  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  50 
 
 		 266 aa  207  1e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1868  ABC transporter ATP-binding protein  46.15 
 
 		 288 aa  207  1e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1237  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  49.15 
 
 		 271 aa  207  2e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0017659 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1452  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  50 
 
 		 256 aa  206  3e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1735  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  48.31 
 
 		 257 aa  206  3e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.117102  normal  0.144233 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1465  ABC transporter related  52.25 
 
 		 319 aa  206  3e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.08781  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1341  aliphatic sulfonate ABC transporter ATP-binding protein  47.72 
 
 		 284 aa  206  4e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.120657  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2499  aliphatic sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  49.57 
 
 		 335 aa  205  5e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0356  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  48.73 
 
 		 271 aa  205  6e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1486  ABC transporter related  52.8 
 
 		 319 aa  204  8e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0029  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  49.56 
 
 		 266 aa  204  1e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.05113  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5314  aliphatic sulfonates ABC transporter, ATP-binding protein  48.51 
 
 		 270 aa  204  1e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19580  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  49.34 
 
 		 274 aa  204  1e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0424  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  48.31 
 
 		 271 aa  204  1e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3298  putative sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  56.22 
 
 		 239 aa  203  2e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0886961  normal  0.245703 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5411  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  47.7 
 
 		 268 aa  202  4e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.125743  hitchhiker  0.00768268 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4706  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  51.36 
 
 		 319 aa  202  4e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1373  ABC transporter-related protein  48.92 
 
 		 291 aa  202  4e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4874  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  48.51 
 
 		 270 aa  202  5e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5004  ABC transporter related  54.39 
 
 		 245 aa  201  7e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.472634  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4339  ABC transporter related  51.09 
 
 		 252 aa  201  8e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.764562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1685  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  48.91 
 
 		 274 aa  201  9e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4138  ABC transporter-like  47.77 
 
 		 255 aa  201  9.999999999999999e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000371805  hitchhiker  0.00945872 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1775  ABC transporter related  47.16 
 
 		 278 aa  200  9.999999999999999e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1084  ABC transporter related  51.87 
 
 		 319 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1564  ABC transporter related  51.87 
 
 		 319 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5467  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (aliphatic sulfonate)  48.33 
 
 		 275 aa  200  1.9999999999999998e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0163214  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1540  ABC transporter related  51.87 
 
 		 318 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0499832  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1641  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  45.68 
 
 		 269 aa  199  3e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30480  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  48.91 
 
 		 266 aa  199  3.9999999999999996e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.3789  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00937  alkanesulfonate transporter subunit  50.44 
 
 		 255 aa  197  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.059764  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2710  ABC transporter related protein  50.44 
 
 		 255 aa  197  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.35574  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1095  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  50.44 
 
 		 255 aa  197  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00325172  normal  0.604485 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4972  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  50 
 
 		 270 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.243489  normal  0.0217357 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1042  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  50.44 
 
 		 255 aa  197  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00944  hypothetical protein  50.44 
 
 		 255 aa  197  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0618654  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1672  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  46.89 
 
 		 267 aa  197  1.0000000000000001e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2663  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  50.44 
 
 		 255 aa  197  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.501147  normal  0.0102717 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1035  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  50.44 
 
 		 255 aa  197  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0244681  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0240  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  48.25 
 
 		 270 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.10949  hitchhiker  0.000841582 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0255  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  48.25 
 
 		 270 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.213675  normal  0.0453993 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0264  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  48.67 
 
 		 270 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2303  ABC transporter related  45.38 
 
 		 275 aa  192  3e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.711472 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2436  ABC transporter related  47.35 
 
 		 277 aa  192  6e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3412  ABC transporter-related protein  47.58 
 
 		 250 aa  191  7e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0308441  normal  0.818563 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1237  aliphatic sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  49.07 
 
 		 273 aa  190  2e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0546  ABC transporter related  48.68 
 
 		 245 aa  190  2e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3716  ABC transporter related  45.9 
 
 		 263 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00980305 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1668  ABC transporter related  52.75 
 
 		 320 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0241971  normal  0.174834 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1991  aliphatic sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  49.07 
 
 		 335 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0937962  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0380  aliphatic sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  49.07 
 
 		 335 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.625066  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>