More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_1375 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_1375  ABC transporter related protein  100 
 
 
258 aa  504  9.999999999999999e-143  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.239653  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2407  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  52.7 
 
 
245 aa  251  7e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.626164  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21610  aliphatic sulfonates ABC transporter, ATP binding component  54.13 
 
 
266 aa  242  3.9999999999999997e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1797  sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  54.02 
 
 
270 aa  226  2e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.555456  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2658  ABC transporter related  54.78 
 
 
271 aa  227  2e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.360126 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7802  ABC transporter ATP-binding protein  56.89 
 
 
237 aa  224  1e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.208198  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3817  ABC transporter related protein  52.52 
 
 
249 aa  223  2e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3597  ABC transporter  53.04 
 
 
274 aa  223  3e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.284861 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3873  ABC transporter related  54.85 
 
 
289 aa  221  6e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.195534  normal  0.0802572 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3479  ABC transporter related protein  54.22 
 
 
250 aa  217  1e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.558732  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4339  ABC transporter related  52.24 
 
 
252 aa  216  2e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.764562  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1557  ABC transporter-like protein  53.3 
 
 
247 aa  215  5.9999999999999996e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0465  ABC transporter related protein  57.49 
 
 
244 aa  215  5.9999999999999996e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0723  ABC transporter related  52.63 
 
 
251 aa  214  9.999999999999999e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00967662  normal  0.0967044 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1379  ABC transporter-like protein  52.4 
 
 
246 aa  214  9.999999999999999e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.279047 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0249  ABC transporter related  52.21 
 
 
302 aa  213  1.9999999999999998e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1746  ABC transporter related  50.61 
 
 
333 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2510  ABC transporter related  57.77 
 
 
261 aa  213  2.9999999999999995e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.827702  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3465  ABC transporter related  51.1 
 
 
241 aa  212  4.9999999999999996e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.158921  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4422  ABC transporter related  54.67 
 
 
226 aa  212  5.999999999999999e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6405  ABC transporter related  50.82 
 
 
249 aa  211  1e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0333973  normal  0.45445 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1647  ABC transporter related  50 
 
 
330 aa  210  2e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.480345  normal  0.121683 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4520  ABC transporter related  50.84 
 
 
249 aa  209  3e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.719426 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2491  ABC aliphatic sulfonates transporter, ATPase subunit  50.66 
 
 
261 aa  208  5e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.761124 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2637  ABC sulfonate transporter, ATPase subunit  49.12 
 
 
247 aa  207  9e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.327484  hitchhiker  0.00000882208 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5004  ABC transporter related  53.33 
 
 
245 aa  206  3e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.472634  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1685  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  50.22 
 
 
274 aa  205  6e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19580  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  49.78 
 
 
274 aa  202  5e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2227  ABC transporter related protein  50 
 
 
267 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0741245  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2973  ABC transporter related  47.21 
 
 
276 aa  199  3e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.493702  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3158  ABC transporter related  50 
 
 
245 aa  198  6e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0982  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  49.55 
 
 
247 aa  198  9e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2786  ABC transporter related  48.03 
 
 
251 aa  197  1.0000000000000001e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00998807  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30480  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  50.43 
 
 
266 aa  197  1.0000000000000001e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.3789  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2621  ABC transporter related  50.43 
 
 
245 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.585434  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2499  aliphatic sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  49.57 
 
 
335 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3281  ABC transporter related  48.32 
 
 
261 aa  194  9e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2582  ABC transporter related  50 
 
 
245 aa  194  1e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.799893  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2627  ABC transporter related  50 
 
 
245 aa  194  1e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0950652  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0240  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  48.26 
 
 
270 aa  193  2e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.10949  hitchhiker  0.000841582 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1868  ABC transporter ATP-binding protein  45.78 
 
 
288 aa  194  2e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5411  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  46.06 
 
 
268 aa  194  2e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.125743  hitchhiker  0.00768268 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0255  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  48.26 
 
 
270 aa  193  2e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.213675  normal  0.0453993 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1775  ABC transporter related  45.34 
 
 
278 aa  194  2e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1341  aliphatic sulfonate ABC transporter ATP-binding protein  47.76 
 
 
284 aa  192  3e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.120657  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0264  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  48.03 
 
 
270 aa  192  5e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4874  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  45.56 
 
 
270 aa  192  6e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4138  ABC transporter-like  46.98 
 
 
255 aa  192  6e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000371805  hitchhiker  0.00945872 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1452  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  48.26 
 
 
256 aa  191  7e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3781  ABC transporter related  47.66 
 
 
259 aa  191  7e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3399  ABC transporter related protein  51.11 
 
 
246 aa  191  8e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.857812  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2416  ABC transporter related  43.95 
 
 
270 aa  191  8e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.769125  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4706  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  49.77 
 
 
319 aa  191  1e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4972  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  48.03 
 
 
270 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.243489  normal  0.0217357 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3041  ABC transporter-related protein  44.53 
 
 
272 aa  191  1e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.784211  normal  0.0417825 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5314  aliphatic sulfonates ABC transporter, ATP-binding protein  44.76 
 
 
270 aa  190  2e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0424  ABC transporter related protein  49.56 
 
 
254 aa  190  2e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.573696  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0023  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  48.03 
 
 
266 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1217  ABC transporter related  47.62 
 
 
279 aa  188  9e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.216616 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4107  ABC transporter related  49.54 
 
 
242 aa  188  9e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1280  ABC transporter related  46.53 
 
 
279 aa  187  1e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.161997  normal  0.0814876 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3716  ABC transporter related  46.69 
 
 
263 aa  187  1e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00980305 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3600  ABC transporter related  46.75 
 
 
263 aa  187  2e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00199632  normal  0.177255 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4320  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  48.51 
 
 
266 aa  187  2e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.151299 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1084  ABC transporter related  50.48 
 
 
319 aa  187  2e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1564  ABC transporter related  50.48 
 
 
319 aa  187  2e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2186  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  46.52 
 
 
255 aa  187  2e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0564256  normal  0.601575 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1486  ABC transporter related  50.48 
 
 
319 aa  186  3e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1672  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  45.2 
 
 
267 aa  186  3e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1735  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  47.93 
 
 
257 aa  186  5e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.117102  normal  0.144233 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1465  ABC transporter related  50.48 
 
 
319 aa  186  5e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.08781  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0117  ATPase  50 
 
 
312 aa  186  5e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.182044  hitchhiker  0.000782511 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3407  ABC transporter related  46.3 
 
 
263 aa  185  6e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.81445  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0029  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  46.72 
 
 
266 aa  185  6e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.05113  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1237  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  45.69 
 
 
271 aa  184  8e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0017659 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1641  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  44.18 
 
 
269 aa  184  9e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1974  ABC transporter related  43.6 
 
 
299 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0356  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  45.69 
 
 
271 aa  184  1.0000000000000001e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1373  ABC transporter-related protein  47.39 
 
 
291 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1540  ABC transporter related  49.52 
 
 
318 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0499832  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1237  aliphatic sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  50.95 
 
 
273 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0781  aliphatic sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  50.95 
 
 
335 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.309085  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1823  aliphatic sulfonates ABC transporter, ATP-binding protein  50.95 
 
 
327 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1991  aliphatic sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  50.95 
 
 
335 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0937962  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1838  aliphatic sulfonates ABC transporter, ATP-binding protein  50.95 
 
 
335 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.391117  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1723  aliphatic sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  50.95 
 
 
335 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.915177  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0380  aliphatic sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  50.95 
 
 
335 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.625066  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0424  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  45.26 
 
 
271 aa  183  3e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00937  alkanesulfonate transporter subunit  47.39 
 
 
255 aa  182  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.059764  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2710  ABC transporter related protein  47.39 
 
 
255 aa  182  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.35574  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1095  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  47.39 
 
 
255 aa  182  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00325172  normal  0.604485 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1042  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  47.39 
 
 
255 aa  182  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1035  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  46.12 
 
 
255 aa  182  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0244681  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2663  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  47.39 
 
 
255 aa  182  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.501147  normal  0.0102717 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00944  hypothetical protein  47.39 
 
 
255 aa  182  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0618654  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1209  ABC transporter related  50 
 
 
290 aa  182  5.0000000000000004e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4636  ABC transporter related  45.96 
 
 
326 aa  182  5.0000000000000004e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.214467  hitchhiker  0.0000194183 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0658  ABC transporter, ATP-binding protein  45.85 
 
 
245 aa  181  1e-44  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4418  ABC transporter related  46.88 
 
 
241 aa  181  2e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.26331  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2436  ABC transporter related  44.87 
 
 
277 aa  180  2e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>