More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_21610 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_21610  aliphatic sulfonates ABC transporter, ATP binding component  100 
 
 
266 aa  521  1e-147  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3597  ABC transporter  77.12 
 
 
274 aa  352  4e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.284861 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1797  sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  78.67 
 
 
270 aa  348  5e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.555456  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2658  ABC transporter related  64.96 
 
 
271 aa  286  4e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.360126 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2510  ABC transporter related  64.1 
 
 
261 aa  270  2.9999999999999997e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.827702  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0465  ABC transporter related protein  60.26 
 
 
244 aa  265  5e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1379  ABC transporter-like protein  61.8 
 
 
246 aa  265  7e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.279047 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3817  ABC transporter related protein  62.39 
 
 
249 aa  264  1e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1557  ABC transporter-like protein  61.44 
 
 
247 aa  263  2e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0723  ABC transporter related  60.62 
 
 
251 aa  254  9e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00967662  normal  0.0967044 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4520  ABC transporter related  58.8 
 
 
249 aa  251  1e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.719426 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3158  ABC transporter related  58.16 
 
 
245 aa  249  3e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3781  ABC transporter related  60.42 
 
 
259 aa  248  5e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2582  ABC transporter related  59.07 
 
 
245 aa  248  6e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.799893  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3465  ABC transporter related  62.83 
 
 
241 aa  248  6e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.158921  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2627  ABC transporter related  59.07 
 
 
245 aa  248  6e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0950652  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2621  ABC transporter related  59.07 
 
 
245 aa  248  7e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.585434  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5004  ABC transporter related  63 
 
 
245 aa  247  2e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.472634  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6405  ABC transporter related  58.33 
 
 
249 aa  246  3e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0333973  normal  0.45445 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3479  ABC transporter related protein  57.2 
 
 
250 aa  243  1.9999999999999999e-63  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.558732  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4339  ABC transporter related  59.29 
 
 
252 aa  243  3e-63  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.764562  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1375  ABC transporter related protein  54.13 
 
 
258 aa  242  3.9999999999999997e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.239653  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0249  ABC transporter related  56.64 
 
 
302 aa  241  7e-63  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3281  ABC transporter related  60.79 
 
 
261 aa  239  4e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4422  ABC transporter related  61.36 
 
 
226 aa  238  5.999999999999999e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2637  ABC sulfonate transporter, ATPase subunit  57.4 
 
 
247 aa  233  3e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.327484  hitchhiker  0.00000882208 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3873  ABC transporter related  59.91 
 
 
289 aa  231  1e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.195534  normal  0.0802572 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29410  ABC transporter, ATP binding component  56.58 
 
 
250 aa  229  3e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4418  ABC transporter related  55.41 
 
 
241 aa  229  4e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.26331  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2407  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  51.32 
 
 
245 aa  226  4e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.626164  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2980  ABC transporter related protein  54.74 
 
 
255 aa  224  1e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0424  ABC transporter related protein  56.82 
 
 
254 aa  224  1e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.573696  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0982  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  57.96 
 
 
247 aa  223  2e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3399  ABC transporter related protein  58.01 
 
 
246 aa  223  3e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.857812  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4107  ABC transporter related  52.79 
 
 
242 aa  221  9e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7802  ABC transporter ATP-binding protein  56.39 
 
 
237 aa  220  1.9999999999999999e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.208198  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3298  putative sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  66.84 
 
 
239 aa  215  5e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0886961  normal  0.245703 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0434  ABC transporter related protein  61.27 
 
 
291 aa  214  9.999999999999999e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.997554  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0117  ATPase  51.79 
 
 
312 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.182044  hitchhiker  0.000782511 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1735  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  51.75 
 
 
257 aa  209  5e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.117102  normal  0.144233 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1685  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  50.42 
 
 
274 aa  207  1e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2973  ABC transporter related  51.58 
 
 
276 aa  207  2e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.493702  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19580  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  50.42 
 
 
274 aa  205  6e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30480  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  50.2 
 
 
266 aa  205  7e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.3789  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1237  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  48.75 
 
 
271 aa  204  8e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0017659 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3412  ABC transporter related protein  51.07 
 
 
258 aa  205  8e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4636  ABC transporter related  50.85 
 
 
326 aa  204  1e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.214467  hitchhiker  0.0000194183 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0356  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  48.75 
 
 
271 aa  204  1e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1868  ABC transporter ATP-binding protein  48.92 
 
 
288 aa  203  2e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4320  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  51.77 
 
 
266 aa  203  2e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.151299 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1974  ABC transporter related  50.22 
 
 
299 aa  202  4e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3041  ABC transporter-related protein  50.21 
 
 
272 aa  202  4e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.784211  normal  0.0417825 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0424  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  49.56 
 
 
271 aa  201  8e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1775  ABC transporter related  48.67 
 
 
278 aa  201  9e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0240  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  50 
 
 
270 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.10949  hitchhiker  0.000841582 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5411  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  49.78 
 
 
268 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.125743  hitchhiker  0.00768268 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0255  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  50 
 
 
270 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.213675  normal  0.0453993 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0766  ABC transporter related  50.68 
 
 
253 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0264  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  50 
 
 
270 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3412  ABC transporter-related protein  48.59 
 
 
250 aa  199  3e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0308441  normal  0.818563 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0023  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  50 
 
 
266 aa  199  3e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1452  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  46.86 
 
 
256 aa  199  3.9999999999999996e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1280  ABC transporter related  48.26 
 
 
279 aa  198  7e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.161997  normal  0.0814876 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1341  aliphatic sulfonate ABC transporter ATP-binding protein  49.34 
 
 
284 aa  198  7.999999999999999e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.120657  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4874  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  48.46 
 
 
270 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4138  ABC transporter-like  47.37 
 
 
255 aa  196  2.0000000000000003e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000371805  hitchhiker  0.00945872 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2227  ABC transporter related protein  46.67 
 
 
267 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0741245  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4972  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  50 
 
 
270 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.243489  normal  0.0217357 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5314  aliphatic sulfonates ABC transporter, ATP-binding protein  48.46 
 
 
270 aa  196  3e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0029  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  49.56 
 
 
266 aa  196  3e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.05113  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1217  ABC transporter related  46.96 
 
 
279 aa  195  6e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.216616 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2786  ABC transporter related  49.54 
 
 
251 aa  194  1e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00998807  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1373  ABC transporter-related protein  48.05 
 
 
291 aa  194  1e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2416  ABC transporter related  46.43 
 
 
270 aa  194  2e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.769125  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1647  ABC transporter related  48.02 
 
 
330 aa  194  2e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.480345  normal  0.121683 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3867  ABC transporter related  49.34 
 
 
265 aa  192  6e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.685954  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1746  ABC transporter related  48.46 
 
 
333 aa  191  8e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2491  ABC aliphatic sulfonates transporter, ATPase subunit  48.67 
 
 
261 aa  191  1e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.761124 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1358  ABC transporter related  40.87 
 
 
262 aa  191  1e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5467  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (aliphatic sulfonate)  47.93 
 
 
275 aa  190  2e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0163214  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2186  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  42.86 
 
 
255 aa  189  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0564256  normal  0.601575 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3306  alkanesulfonate ABC transporter, ATP binding protein  49.12 
 
 
263 aa  189  4e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2303  ABC transporter related  47.21 
 
 
275 aa  189  5e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.711472 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1672  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  48.43 
 
 
267 aa  188  5.999999999999999e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4591  ABC transporter related  45.27 
 
 
265 aa  187  2e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4457  ABC transporter related  45.27 
 
 
265 aa  187  2e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0721203  normal  0.624279 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7645  putative sulfonate ABC transporter, ATP binding protein  42.62 
 
 
261 aa  186  3e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0412308  normal  0.633643 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3716  ABC transporter related  46.38 
 
 
263 aa  186  4e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00980305 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0773  ABC transporter related  49.56 
 
 
262 aa  185  5e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.050143 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3407  ABC transporter related  46.38 
 
 
263 aa  186  5e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.81445  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4706  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  50.72 
 
 
319 aa  185  7e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1641  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  46.9 
 
 
269 aa  185  7e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3600  ABC transporter related  46.38 
 
 
263 aa  185  8e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00199632  normal  0.177255 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0779  ABC transporter related  46.93 
 
 
249 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1486  ABC transporter related  50.72 
 
 
319 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1465  ABC transporter related  50.72 
 
 
319 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.08781  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2688  ABC transporter related  47.56 
 
 
264 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.232656  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2663  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  43.24 
 
 
255 aa  183  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.501147  normal  0.0102717 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00944  hypothetical protein  43.24 
 
 
255 aa  183  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0618654  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1084  ABC transporter related  51.2 
 
 
319 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>