More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2980 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_2980  ABC transporter related protein  100 
 
 		 255 aa  486  1e-136  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6405  ABC transporter related  66.94 
 
 		 249 aa  295  4e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0333973  normal  0.45445 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4520  ABC transporter related  66.12 
 
 		 249 aa  284  9e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.719426 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1557  ABC transporter-like protein  62.4 
 
 		 247 aa  278  6e-74  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3781  ABC transporter related  62.1 
 
 		 259 aa  268  8.999999999999999e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3281  ABC transporter related  62.82 
 
 		 261 aa  258  8e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0424  ABC transporter related protein  60.61 
 
 		 254 aa  256  2e-67  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.573696  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29410  ABC transporter, ATP binding component  60.78 
 
 		 250 aa  254  8e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0249  ABC transporter related  55.02 
 
 		 302 aa  247  2e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0723  ABC transporter related  59.57 
 
 		 251 aa  242  5e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00967662  normal  0.0967044 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0434  ABC transporter related protein  64.22 
 
 		 291 aa  240  2e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.997554  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1379  ABC transporter-like protein  56.6 
 
 		 246 aa  225  4e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.279047 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4107  ABC transporter related  54.47 
 
 		 242 aa  225  5.0000000000000005e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21610  aliphatic sulfonates ABC transporter, ATP binding component  54.74 
 
 		 266 aa  224  1e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2658  ABC transporter related  53.91 
 
 		 271 aa  223  2e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.360126 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1797  sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  55.98 
 
 		 270 aa  222  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.555456  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3158  ABC transporter related  56.72 
 
 		 245 aa  222  6e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4418  ABC transporter related  53.74 
 
 		 241 aa  221  9.999999999999999e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.26331  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0982  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  52.72 
 
 		 247 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0465  ABC transporter related protein  54.08 
 
 		 244 aa  216  4e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2637  ABC sulfonate transporter, ATPase subunit  53.51 
 
 		 247 aa  215  5.9999999999999996e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.327484  hitchhiker  0.00000882208 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3597  ABC transporter  53.85 
 
 		 274 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.284861 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3465  ABC transporter related  54.96 
 
 		 241 aa  212  3.9999999999999995e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.158921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2621  ABC transporter related  55.93 
 
 		 245 aa  211  1e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.585434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2510  ABC transporter related  56.47 
 
 		 261 aa  210  2e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.827702  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3817  ABC transporter related protein  51.49 
 
 		 249 aa  209  3e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2582  ABC transporter related  55.51 
 
 		 245 aa  207  1e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.799893  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2627  ABC transporter related  55.51 
 
 		 245 aa  207  1e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0950652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3479  ABC transporter related protein  55.75 
 
 		 250 aa  207  2e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.558732  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4636  ABC transporter related  46.74 
 
 		 326 aa  204  8e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.214467  hitchhiker  0.0000194183 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4422  ABC transporter related  56.25 
 
 		 226 aa  204  9e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1974  ABC transporter related  47.77 
 
 		 299 aa  202  6e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2227  ABC transporter related protein  47.83 
 
 		 267 aa  199  3e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0741245  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3399  ABC transporter related protein  55.46 
 
 		 246 aa  198  5e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.857812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3298  putative sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  58.77 
 
 		 239 aa  198  6e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0886961  normal  0.245703 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2973  ABC transporter related  49.57 
 
 		 276 aa  198  6e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.493702  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3041  ABC transporter-related protein  48.54 
 
 		 272 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.784211  normal  0.0417825 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1647  ABC transporter related  50.22 
 
 		 330 aa  196  3e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.480345  normal  0.121683 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3873  ABC transporter related  57.14 
 
 		 289 aa  195  6e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.195534  normal  0.0802572 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7802  ABC transporter ATP-binding protein  50.89 
 
 		 237 aa  194  1e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.208198  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2499  aliphatic sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  50.68 
 
 		 335 aa  191  1e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2491  ABC aliphatic sulfonates transporter, ATPase subunit  50.45 
 
 		 261 aa  191  1e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.761124 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4972  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  47.97 
 
 		 270 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.243489  normal  0.0217357 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4706  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  50.71 
 
 		 319 aa  190  2e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0117  ATPase  49.16 
 
 		 312 aa  190  2e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.182044  hitchhiker  0.000782511 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1486  ABC transporter related  50 
 
 		 319 aa  188  7e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1746  ABC transporter related  49.33 
 
 		 333 aa  187  1e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1373  ABC transporter-related protein  46.67 
 
 		 291 aa  187  2e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0264  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  45.9 
 
 		 270 aa  186  3e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1465  ABC transporter related  50 
 
 		 319 aa  186  3e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.08781  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0240  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  45.49 
 
 		 270 aa  186  4e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.10949  hitchhiker  0.000841582 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0255  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  45.49 
 
 		 270 aa  186  4e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.213675  normal  0.0453993 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5515  ABC transporter related  47.33 
 
 		 278 aa  186  5e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3716  ABC transporter related  46.28 
 
 		 263 aa  185  7e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00980305 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3600  ABC transporter related  46.22 
 
 		 263 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00199632  normal  0.177255 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1339  ABC transporter related  47.26 
 
 		 283 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0379728 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4320  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  46.69 
 
 		 266 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.151299 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1735  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  45.96 
 
 		 257 aa  183  2.0000000000000003e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.117102  normal  0.144233 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1237  aliphatic sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  53.37 
 
 		 273 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2186  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  49.3 
 
 		 255 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0564256  normal  0.601575 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0023  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  44.96 
 
 		 266 aa  182  3e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1823  aliphatic sulfonates ABC transporter, ATP-binding protein  53.37 
 
 		 327 aa  183  3e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1991  aliphatic sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  53.37 
 
 		 335 aa  183  3e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0937962  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5411  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  45.31 
 
 		 268 aa  182  3e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.125743  hitchhiker  0.00768268 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5129  ABC transporter related  47.86 
 
 		 275 aa  182  3e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0502881 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0781  aliphatic sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  53.37 
 
 		 335 aa  183  3e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.309085  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1838  aliphatic sulfonates ABC transporter, ATP-binding protein  53.37 
 
 		 335 aa  183  3e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.391117  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1084  ABC transporter related  53.33 
 
 		 319 aa  183  3e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1564  ABC transporter related  53.33 
 
 		 319 aa  183  3e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1723  aliphatic sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  53.37 
 
 		 335 aa  183  3e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.915177  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0380  aliphatic sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  53.37 
 
 		 335 aa  183  3e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.625066  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0658  ABC transporter, ATP-binding protein  44.59 
 
 		 245 aa  182  4.0000000000000006e-45  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3407  ABC transporter related  45.87 
 
 		 263 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.81445  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0029  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  44.96 
 
 		 266 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.05113  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4339  ABC transporter related  50 
 
 		 252 aa  181  9.000000000000001e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.764562  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5314  aliphatic sulfonates ABC transporter, ATP-binding protein  44.49 
 
 		 270 aa  181  1e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1540  ABC transporter related  52.82 
 
 		 318 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0499832  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2303  ABC transporter related  46.81 
 
 		 275 aa  181  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.711472 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1775  ABC transporter related  45.06 
 
 		 278 aa  180  2e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19580  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  46.9 
 
 		 274 aa  180  2e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3412  ABC transporter-related protein  50.43 
 
 		 250 aa  180  2e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0308441  normal  0.818563 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1341  aliphatic sulfonate ABC transporter ATP-binding protein  47.06 
 
 		 284 aa  179  2.9999999999999997e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.120657  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1452  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  44.59 
 
 		 256 aa  179  2.9999999999999997e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30480  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  46.28 
 
 		 266 aa  179  2.9999999999999997e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.3789  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4874  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  42.86 
 
 		 270 aa  178  7e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0766  ABC transporter related  46.05 
 
 		 253 aa  178  8e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5004  ABC transporter related  49.78 
 
 		 245 aa  178  9e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.472634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1868  ABC transporter ATP-binding protein  48.46 
 
 		 288 aa  177  1e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1685  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  46.46 
 
 		 274 aa  176  2e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1237  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  45.42 
 
 		 271 aa  177  2e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0017659 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0356  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  45.42 
 
 		 271 aa  176  2e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2786  ABC transporter related  43.75 
 
 		 251 aa  176  3e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00998807  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2416  ABC transporter related  47.6 
 
 		 270 aa  176  3e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.769125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5467  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (aliphatic sulfonate)  45.11 
 
 		 275 aa  176  4e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0163214  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1217  ABC transporter related  45.61 
 
 		 279 aa  176  4e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.216616 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0424  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  45 
 
 		 271 aa  175  6e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1641  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  42.74 
 
 		 269 aa  175  6e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1280  ABC transporter related  45.61 
 
 		 279 aa  175  8e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.161997  normal  0.0814876 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19370  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  46.47 
 
 		 326 aa  175  8e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.813225 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1384  ABC transporter related protein  48.95 
 
 		 277 aa  172  2.9999999999999996e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0283767 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>