More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_0766 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_0766  ABC transporter related  100 
 
 
253 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5467  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (aliphatic sulfonate)  64.34 
 
 
275 aa  289  3e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0163214  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3600  ABC transporter related  61.34 
 
 
263 aa  276  3e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00199632  normal  0.177255 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3407  ABC transporter related  60.92 
 
 
263 aa  274  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.81445  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3716  ABC transporter related  60.08 
 
 
263 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00980305 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0773  ABC transporter related  63.45 
 
 
262 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.050143 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2303  ABC transporter related  57.71 
 
 
275 aa  271  5.000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.711472 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2436  ABC transporter related  59.23 
 
 
277 aa  263  3e-69  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1280  ABC transporter related  58.33 
 
 
279 aa  261  4.999999999999999e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.161997  normal  0.0814876 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2881  ABC transporter related  57.85 
 
 
280 aa  261  8e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.542857  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5515  ABC transporter related  62.66 
 
 
278 aa  260  1e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1217  ABC transporter related  57.5 
 
 
279 aa  259  4e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.216616 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1237  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  52.99 
 
 
271 aa  259  4e-68  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0017659 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1868  ABC transporter ATP-binding protein  60.09 
 
 
288 aa  258  6e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5129  ABC transporter related  61.92 
 
 
275 aa  258  7e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0502881 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0356  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  52.99 
 
 
271 aa  258  7e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1672  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  55.33 
 
 
267 aa  258  8e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1341  aliphatic sulfonate ABC transporter ATP-binding protein  57.09 
 
 
284 aa  256  2e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.120657  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1339  ABC transporter related  61.51 
 
 
283 aa  256  2e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0379728 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30480  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  53.6 
 
 
266 aa  255  5e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.3789  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1974  ABC transporter related  57.74 
 
 
299 aa  255  6e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0424  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  53.47 
 
 
271 aa  254  9e-67  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0023  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  54.24 
 
 
266 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4320  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  53.85 
 
 
266 aa  252  3e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.151299 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19580  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  57.63 
 
 
274 aa  252  5.000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4874  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  54.24 
 
 
270 aa  251  6e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1685  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  56.36 
 
 
274 aa  251  6e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5314  aliphatic sulfonates ABC transporter, ATP-binding protein  54.66 
 
 
270 aa  251  7e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1641  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  52.76 
 
 
269 aa  251  7e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0029  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  53.39 
 
 
266 aa  250  2e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.05113  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0240  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  53.2 
 
 
270 aa  249  4e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.10949  hitchhiker  0.000841582 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0255  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  53.2 
 
 
270 aa  249  4e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.213675  normal  0.0453993 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5411  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  51.78 
 
 
268 aa  248  5e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.125743  hitchhiker  0.00768268 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1373  ABC transporter-related protein  54.39 
 
 
291 aa  248  5e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1647  ABC transporter related  56.28 
 
 
330 aa  246  3e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.480345  normal  0.121683 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0264  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  52.8 
 
 
270 aa  245  4e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0117  ATPase  54.58 
 
 
312 aa  245  6e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.182044  hitchhiker  0.000782511 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2227  ABC transporter related protein  55.65 
 
 
267 aa  243  9.999999999999999e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0741245  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1775  ABC transporter related  55.51 
 
 
278 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1452  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  55.56 
 
 
256 aa  243  1.9999999999999999e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4972  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  52.8 
 
 
270 aa  243  3e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.243489  normal  0.0217357 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1486  ABC transporter related  56.61 
 
 
319 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1084  ABC transporter related  57.02 
 
 
319 aa  242  5e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1564  ABC transporter related  57.02 
 
 
319 aa  242  5e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2491  ABC aliphatic sulfonates transporter, ATPase subunit  56.41 
 
 
261 aa  241  7.999999999999999e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.761124 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4138  ABC transporter-like  53.42 
 
 
255 aa  241  9e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000371805  hitchhiker  0.00945872 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1465  ABC transporter related  56.61 
 
 
319 aa  241  9e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.08781  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2973  ABC transporter related  55.74 
 
 
276 aa  241  1e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.493702  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1735  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  49.4 
 
 
257 aa  239  2e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.117102  normal  0.144233 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2186  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  54.7 
 
 
255 aa  240  2e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0564256  normal  0.601575 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1540  ABC transporter related  56.6 
 
 
318 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0499832  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4706  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  56.6 
 
 
319 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4636  ABC transporter related  54.43 
 
 
326 aa  238  5e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.214467  hitchhiker  0.0000194183 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1746  ABC transporter related  55.04 
 
 
333 aa  238  5.999999999999999e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1209  ABC transporter related  57.02 
 
 
290 aa  236  2e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2416  ABC transporter related  51.2 
 
 
270 aa  237  2e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.769125  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2499  aliphatic sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  55.9 
 
 
335 aa  234  7e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3041  ABC transporter-related protein  56.17 
 
 
272 aa  234  9e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.784211  normal  0.0417825 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00937  alkanesulfonate transporter subunit  52.99 
 
 
255 aa  231  7.000000000000001e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.059764  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2710  ABC transporter related protein  52.99 
 
 
255 aa  231  7.000000000000001e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.35574  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2663  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  52.99 
 
 
255 aa  231  7.000000000000001e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.501147  normal  0.0102717 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1042  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  52.99 
 
 
255 aa  231  7.000000000000001e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00944  hypothetical protein  52.99 
 
 
255 aa  231  7.000000000000001e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0618654  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1095  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  52.99 
 
 
255 aa  231  7.000000000000001e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00325172  normal  0.604485 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1035  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  52.99 
 
 
255 aa  231  1e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0244681  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2786  ABC transporter related  50 
 
 
251 aa  228  1e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00998807  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1237  aliphatic sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  54.66 
 
 
273 aa  226  4e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0781  aliphatic sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  54.66 
 
 
335 aa  225  7e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.309085  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1723  aliphatic sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  54.66 
 
 
335 aa  225  7e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.915177  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0380  aliphatic sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  54.66 
 
 
335 aa  225  7e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.625066  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1823  aliphatic sulfonates ABC transporter, ATP-binding protein  54.66 
 
 
327 aa  224  7e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1838  aliphatic sulfonates ABC transporter, ATP-binding protein  54.66 
 
 
335 aa  225  7e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.391117  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1991  aliphatic sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  54.66 
 
 
335 aa  224  8e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0937962  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1668  ABC transporter related  56.43 
 
 
320 aa  222  4.9999999999999996e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0241971  normal  0.174834 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6405  ABC transporter related  51.69 
 
 
249 aa  219  3e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0333973  normal  0.45445 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4520  ABC transporter related  49.79 
 
 
249 aa  208  6e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.719426 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1909  ABC transporter related  47.45 
 
 
286 aa  203  2e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2621  ABC transporter related  49.33 
 
 
245 aa  202  5e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.585434  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0249  ABC transporter related  48.72 
 
 
302 aa  201  6e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2582  ABC transporter related  49.33 
 
 
245 aa  200  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.799893  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2627  ABC transporter related  49.33 
 
 
245 aa  200  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0950652  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21610  aliphatic sulfonates ABC transporter, ATP binding component  50.68 
 
 
266 aa  200  1.9999999999999998e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3158  ABC transporter related  49.14 
 
 
245 aa  200  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4418  ABC transporter related  48.71 
 
 
241 aa  199  3e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.26331  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3306  alkanesulfonate ABC transporter, ATP binding protein  51.82 
 
 
263 aa  199  3e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0424  ABC transporter related protein  47.72 
 
 
254 aa  198  7.999999999999999e-50  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.573696  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2637  ABC sulfonate transporter, ATPase subunit  51.1 
 
 
247 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.327484  hitchhiker  0.00000882208 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1557  ABC transporter-like protein  48.05 
 
 
247 aa  196  3e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1797  sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  48.07 
 
 
270 aa  195  6e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.555456  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0465  ABC transporter related protein  48.09 
 
 
244 aa  194  9e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0982  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  51.98 
 
 
247 aa  194  1e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2688  ABC transporter related  49.55 
 
 
264 aa  193  2e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.232656  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1152  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  41.53 
 
 
240 aa  193  2e-48  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4107  ABC transporter related  47.16 
 
 
242 aa  193  2e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0723  ABC transporter related  47.46 
 
 
251 aa  192  4e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00967662  normal  0.0967044 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2057  ABC transporter related  46.15 
 
 
280 aa  192  5e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1379  ABC transporter-like protein  48.26 
 
 
246 aa  192  6e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.279047 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2904  ABC transporter related  47.72 
 
 
270 aa  192  6e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5010  ABC transporter related  44.75 
 
 
263 aa  192  6e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0551  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  47.14 
 
 
236 aa  191  7e-48  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.978201  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>