More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_3412 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_3412  ABC transporter-related protein  100 
 
 		 250 aa  488  1e-137  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0308441  normal  0.818563 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3412  ABC transporter related protein  62.5 
 
 		 258 aa  256  3e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3158  ABC transporter related  55.65 
 
 		 245 aa  224  1e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3597  ABC transporter  51.63 
 
 		 274 aa  216  2e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.284861 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1797  sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  52.89 
 
 		 270 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.555456  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2621  ABC transporter related  54.78 
 
 		 245 aa  215  4e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.585434  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1379  ABC transporter-like protein  55.65 
 
 		 246 aa  214  8e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.279047 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0465  ABC transporter related protein  54.24 
 
 		 244 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2582  ABC transporter related  54.35 
 
 		 245 aa  212  4.9999999999999996e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.799893  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2627  ABC transporter related  54.35 
 
 		 245 aa  212  4.9999999999999996e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0950652  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0023  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  50.21 
 
 		 266 aa  210  2e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0029  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  53.27 
 
 		 266 aa  207  2e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.05113  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1735  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  49.36 
 
 		 257 aa  206  4e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.117102  normal  0.144233 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3817  ABC transporter related protein  51.07 
 
 		 249 aa  206  4e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19580  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  51.06 
 
 		 274 aa  204  1e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1685  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  51.06 
 
 		 274 aa  204  2e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4138  ABC transporter-like  50.22 
 
 		 255 aa  201  9e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000371805  hitchhiker  0.00945872 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5411  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  48.72 
 
 		 268 aa  199  3e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.125743  hitchhiker  0.00768268 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21610  aliphatic sulfonates ABC transporter, ATP binding component  48.59 
 
 		 266 aa  199  3e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3399  ABC transporter related protein  53.36 
 
 		 246 aa  199  3e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.857812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0723  ABC transporter related  51.69 
 
 		 251 aa  199  3.9999999999999996e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00967662  normal  0.0967044 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2186  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  52.29 
 
 		 255 aa  199  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0564256  normal  0.601575 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0249  ABC transporter related  49.79 
 
 		 302 aa  197  1.0000000000000001e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1452  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  50.69 
 
 		 256 aa  196  2.0000000000000003e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1647  ABC transporter related  53.3 
 
 		 330 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.480345  normal  0.121683 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1746  ABC transporter related  53.3 
 
 		 333 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1775  ABC transporter related  49.36 
 
 		 278 aa  195  5.000000000000001e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00937  alkanesulfonate transporter subunit  53.21 
 
 		 255 aa  195  7e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.059764  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2710  ABC transporter related protein  53.21 
 
 		 255 aa  195  7e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.35574  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4422  ABC transporter related  55.9 
 
 		 226 aa  195  7e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1042  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  53.21 
 
 		 255 aa  195  7e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1095  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  53.21 
 
 		 255 aa  195  7e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00325172  normal  0.604485 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00944  hypothetical protein  53.21 
 
 		 255 aa  195  7e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0618654  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2663  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  53.21 
 
 		 255 aa  195  7e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.501147  normal  0.0102717 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2658  ABC transporter related  50.22 
 
 		 271 aa  194  8.000000000000001e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.360126 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4874  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  49.54 
 
 		 270 aa  194  1e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4636  ABC transporter related  52.78 
 
 		 326 aa  194  1e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.214467  hitchhiker  0.0000194183 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1672  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  48.94 
 
 		 267 aa  194  1e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1035  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  53.21 
 
 		 255 aa  194  1e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0244681  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3041  ABC transporter-related protein  48.51 
 
 		 272 aa  194  1e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.784211  normal  0.0417825 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5314  aliphatic sulfonates ABC transporter, ATP-binding protein  47.66 
 
 		 270 aa  193  2e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1237  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  46.88 
 
 		 271 aa  193  2e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0017659 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30480  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  46.58 
 
 		 266 aa  193  2e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.3789  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0356  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  46.88 
 
 		 271 aa  192  3e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4972  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  48.92 
 
 		 270 aa  192  4e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.243489  normal  0.0217357 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0240  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  48.29 
 
 		 270 aa  192  5e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.10949  hitchhiker  0.000841582 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0255  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  48.29 
 
 		 270 aa  192  5e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.213675  normal  0.0453993 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6405  ABC transporter related  47.58 
 
 		 249 aa  191  7e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0333973  normal  0.45445 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4320  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  46.61 
 
 		 266 aa  191  8e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.151299 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4339  ABC transporter related  49.14 
 
 		 252 aa  191  1e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.764562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4520  ABC transporter related  49.36 
 
 		 249 aa  191  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.719426 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0658  ABC transporter, ATP-binding protein  48.95 
 
 		 245 aa  190  1e-47  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0264  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  48.71 
 
 		 270 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0773  ABC transporter related  52.79 
 
 		 262 aa  191  1e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.050143 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0424  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  48.09 
 
 		 271 aa  191  1e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2973  ABC transporter related  48.09 
 
 		 276 aa  190  2e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.493702  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1974  ABC transporter related  51.61 
 
 		 299 aa  190  2e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1641  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  46.12 
 
 		 269 aa  189  2e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1373  ABC transporter-related protein  53.85 
 
 		 291 aa  190  2e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0424  ABC transporter related protein  50.21 
 
 		 254 aa  190  2e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.573696  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2491  ABC aliphatic sulfonates transporter, ATPase subunit  51.89 
 
 		 261 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.761124 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5515  ABC transporter related  49.33 
 
 		 278 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3716  ABC transporter related  46.61 
 
 		 263 aa  189  4e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00980305 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3407  ABC transporter related  46.61 
 
 		 263 aa  188  5e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.81445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0117  ATPase  47.04 
 
 		 312 aa  188  5.999999999999999e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.182044  hitchhiker  0.000782511 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4539  ABC transporter related  45.08 
 
 		 256 aa  188  7e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.113352 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1557  ABC transporter-like protein  48.99 
 
 		 247 aa  188  9e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1352  ABC transporter related  44.88 
 
 		 262 aa  187  1e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2303  ABC transporter related  49.54 
 
 		 275 aa  187  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.711472 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1486  ABC transporter related  51.2 
 
 		 319 aa  187  1e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1868  ABC transporter ATP-binding protein  49.07 
 
 		 288 aa  187  2e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1217  ABC transporter related  47.46 
 
 		 279 aa  187  2e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.216616 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1465  ABC transporter related  51.2 
 
 		 319 aa  187  2e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.08781  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1280  ABC transporter related  47.88 
 
 		 279 aa  186  3e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.161997  normal  0.0814876 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1341  aliphatic sulfonate ABC transporter ATP-binding protein  49.15 
 
 		 284 aa  186  4e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.120657  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2416  ABC transporter related  49.14 
 
 		 270 aa  186  4e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.769125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2407  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  45.89 
 
 		 245 aa  185  7e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.626164  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3867  ABC transporter related  45.42 
 
 		 265 aa  184  8e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.685954  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3781  ABC transporter related  50.87 
 
 		 259 aa  184  8e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1857  ABC transporter related  44.1 
 
 		 304 aa  184  9e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2881  ABC transporter related  48.9 
 
 		 280 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.542857  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4418  ABC transporter related  47.28 
 
 		 241 aa  183  2.0000000000000003e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.26331  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4107  ABC transporter related  46.88 
 
 		 242 aa  184  2.0000000000000003e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6389  ABC transporter related  42.97 
 
 		 256 aa  182  3e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.350257  normal  0.506492 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3281  ABC transporter related  50 
 
 		 261 aa  182  4.0000000000000006e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3600  ABC transporter related  46.96 
 
 		 263 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00199632  normal  0.177255 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2510  ABC transporter related  52.42 
 
 		 261 aa  182  4.0000000000000006e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.827702  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4706  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  50.71 
 
 		 319 aa  182  6e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1540  ABC transporter related  49.76 
 
 		 318 aa  182  6e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0499832  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5004  ABC transporter related  49.15 
 
 		 245 aa  181  8.000000000000001e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.472634  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1237  aliphatic sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  50.68 
 
 		 273 aa  181  1e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1991  aliphatic sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  50.68 
 
 		 335 aa  180  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0937962  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0781  aliphatic sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  50.68 
 
 		 335 aa  181  1e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.309085  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1084  ABC transporter related  49.76 
 
 		 319 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1564  ABC transporter related  49.76 
 
 		 319 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1723  aliphatic sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  50.68 
 
 		 335 aa  181  1e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.915177  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0380  aliphatic sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  50.68 
 
 		 335 aa  181  1e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.625066  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1838  aliphatic sulfonates ABC transporter, ATP-binding protein  50.68 
 
 		 335 aa  181  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.391117  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2786  ABC transporter related  44.16 
 
 		 251 aa  180  2e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00998807  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2980  ABC transporter related protein  50.43 
 
 		 255 aa  180  2e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>