More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B2407 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B2407  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  100 
 
 		 245 aa  494  1e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.626164  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1375  ABC transporter related protein  52.7 
 
 		 258 aa  251  6e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.239653  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0465  ABC transporter related protein  53.74 
 
 		 244 aa  230  1e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21610  aliphatic sulfonates ABC transporter, ATP binding component  51.32 
 
 		 266 aa  226  3e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1379  ABC transporter-like protein  50.87 
 
 		 246 aa  219  3e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.279047 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7802  ABC transporter ATP-binding protein  51.11 
 
 		 237 aa  217  2e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.208198  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1797  sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  48.21 
 
 		 270 aa  214  9e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.555456  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3597  ABC transporter  47.64 
 
 		 274 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.284861 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3817  ABC transporter related protein  51.69 
 
 		 249 aa  213  2.9999999999999995e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2658  ABC transporter related  46.4 
 
 		 271 aa  212  4.9999999999999996e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.360126 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3465  ABC transporter related  52.66 
 
 		 241 aa  208  5e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.158921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3873  ABC transporter related  51.13 
 
 		 289 aa  206  3e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.195534  normal  0.0802572 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2621  ABC transporter related  49.14 
 
 		 245 aa  205  4e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.585434  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2582  ABC transporter related  49.14 
 
 		 245 aa  205  5e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.799893  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2627  ABC transporter related  49.14 
 
 		 245 aa  205  5e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0950652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0249  ABC transporter related  45.64 
 
 		 302 aa  204  9e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1557  ABC transporter-like protein  47.64 
 
 		 247 aa  202  3e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0723  ABC transporter related  46.55 
 
 		 251 aa  202  4e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00967662  normal  0.0967044 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3158  ABC transporter related  45.96 
 
 		 245 aa  200  9.999999999999999e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0424  ABC transporter related protein  46.96 
 
 		 254 aa  197  1.0000000000000001e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.573696  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4339  ABC transporter related  43.53 
 
 		 252 aa  195  5.000000000000001e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.764562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0769  ABC transporter related  50 
 
 		 252 aa  193  2e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.159721 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1868  ABC transporter ATP-binding protein  46.7 
 
 		 288 aa  192  4e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4422  ABC transporter related  49.77 
 
 		 226 aa  192  4e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2510  ABC transporter related  47.83 
 
 		 261 aa  191  1e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.827702  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1647  ABC transporter related  44.78 
 
 		 330 aa  188  5e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.480345  normal  0.121683 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3412  ABC transporter related protein  50.24 
 
 		 258 aa  188  5.999999999999999e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2227  ABC transporter related protein  46.96 
 
 		 267 aa  186  2e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0741245  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2973  ABC transporter related  45.33 
 
 		 276 aa  187  2e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.493702  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1452  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  45.45 
 
 		 256 aa  187  2e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2637  ABC sulfonate transporter, ATPase subunit  49.75 
 
 		 247 aa  187  2e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.327484  hitchhiker  0.00000882208 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3479  ABC transporter related protein  47.69 
 
 		 250 aa  186  3e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.558732  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1341  aliphatic sulfonate ABC transporter ATP-binding protein  45.45 
 
 		 284 aa  186  4e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.120657  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5004  ABC transporter related  44.78 
 
 		 245 aa  186  4e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.472634  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4520  ABC transporter related  46.67 
 
 		 249 aa  185  5e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.719426 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3009  ABC transporter related  47.56 
 
 		 245 aa  185  5e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4418  ABC transporter related  44.12 
 
 		 241 aa  185  6e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.26331  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3412  ABC transporter-related protein  45.89 
 
 		 250 aa  185  7e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0308441  normal  0.818563 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7645  putative sulfonate ABC transporter, ATP binding protein  46.22 
 
 		 261 aa  184  8e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0412308  normal  0.633643 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1237  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  43.78 
 
 		 271 aa  184  8e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0017659 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30480  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  44.54 
 
 		 266 aa  184  9e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.3789  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6544  putative ABC transporter  41.95 
 
 		 259 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.353316 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0356  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  43.78 
 
 		 271 aa  184  1.0000000000000001e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0023  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  45.09 
 
 		 266 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0766  ABC transporter related  44.73 
 
 		 253 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2491  ABC aliphatic sulfonates transporter, ATPase subunit  44.74 
 
 		 261 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.761124 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19580  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  44.98 
 
 		 274 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1486  ABC transporter related  48.54 
 
 		 319 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4216  ABC transporter related  45.41 
 
 		 256 aa  182  4.0000000000000006e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6405  ABC transporter related  45.74 
 
 		 249 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0333973  normal  0.45445 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2186  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  43.91 
 
 		 255 aa  182  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0564256  normal  0.601575 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0982  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  47.57 
 
 		 247 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0113  ABC transporter related  44.35 
 
 		 261 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.692675 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1465  ABC transporter related  48.54 
 
 		 319 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.08781  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3041  ABC transporter-related protein  46.85 
 
 		 272 aa  182  4.0000000000000006e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.784211  normal  0.0417825 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3399  ABC transporter related protein  47.37 
 
 		 246 aa  182  5.0000000000000004e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.857812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0424  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  44.49 
 
 		 271 aa  182  5.0000000000000004e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0029  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  42.21 
 
 		 266 aa  181  7e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.05113  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2881  ABC transporter related  46.55 
 
 		 280 aa  181  1e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.542857  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1735  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  44.59 
 
 		 257 aa  180  2e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.117102  normal  0.144233 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4874  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  41.3 
 
 		 270 aa  180  2e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1685  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  44.54 
 
 		 274 aa  180  2e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1746  ABC transporter related  43.59 
 
 		 333 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3298  putative sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  54.4 
 
 		 239 aa  178  7e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0886961  normal  0.245703 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1217  ABC transporter related  44.64 
 
 		 279 aa  178  7e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.216616 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5314  aliphatic sulfonates ABC transporter, ATP-binding protein  40.89 
 
 		 270 aa  178  8e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1280  ABC transporter related  45.09 
 
 		 279 aa  178  9e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.161997  normal  0.0814876 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4138  ABC transporter-like  42.92 
 
 		 255 aa  177  1e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000371805  hitchhiker  0.00945872 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4706  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  46.6 
 
 		 319 aa  177  1e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0779  ABC transporter related  48.02 
 
 		 249 aa  177  1e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5128  ABC transporter related  43.62 
 
 		 256 aa  177  1e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.012319  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1672  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  43.48 
 
 		 267 aa  177  1e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2786  ABC transporter, ATP-binding protein  44.34 
 
 		 232 aa  176  2e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0961461  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2188  ABC transporter related  46.5 
 
 		 260 aa  176  2e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0571708  normal  0.474002 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4329  ABC transporter related  44.64 
 
 		 243 aa  177  2e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.413281  normal  0.920294 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2499  aliphatic sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  45.41 
 
 		 335 aa  177  2e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6521  ABC transporter related  40.65 
 
 		 270 aa  176  2e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6755  ABC transporter related  40.65 
 
 		 270 aa  176  2e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0664482 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0773  ABC transporter related  45.26 
 
 		 262 aa  176  4e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.050143 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1084  ABC transporter related  47.09 
 
 		 319 aa  176  4e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1564  ABC transporter related  47.09 
 
 		 319 aa  176  4e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4034  ABC transporter related  42.67 
 
 		 276 aa  175  5e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.105857 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0264  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  42.98 
 
 		 270 aa  175  6e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2786  ABC transporter related  42.54 
 
 		 251 aa  175  7e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00998807  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2303  ABC transporter related  40.94 
 
 		 275 aa  175  7e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.711472 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00937  alkanesulfonate transporter subunit  43.67 
 
 		 255 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.059764  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2710  ABC transporter related protein  43.67 
 
 		 255 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.35574  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0240  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  41.37 
 
 		 270 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.10949  hitchhiker  0.000841582 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0117  ATPase  43.72 
 
 		 312 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.182044  hitchhiker  0.000782511 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5411  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  43.11 
 
 		 268 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.125743  hitchhiker  0.00768268 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1540  ABC transporter related  47.09 
 
 		 318 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0499832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1042  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  43.67 
 
 		 255 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2663  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  43.67 
 
 		 255 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.501147  normal  0.0102717 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00944  hypothetical protein  43.67 
 
 		 255 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0618654  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0255  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  41.37 
 
 		 270 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.213675  normal  0.0453993 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4107  ABC transporter related  45.7 
 
 		 242 aa  174  9.999999999999999e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1095  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  43.67 
 
 		 255 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00325172  normal  0.604485 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4636  ABC transporter related  44.1 
 
 		 326 aa  173  1.9999999999999998e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.214467  hitchhiker  0.0000194183 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3281  ABC transporter related  46.88 
 
 		 261 aa  173  1.9999999999999998e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4972  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  41.13 
 
 		 270 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.243489  normal  0.0217357 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>