More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_5004 on replicon NC_008688
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008688  Pden_5004  ABC transporter related  100 
 
 		 245 aa  476  1e-133  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.472634  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4339  ABC transporter related  69.84 
 
 		 252 aa  320  9.999999999999999e-87  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.764562  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21610  aliphatic sulfonates ABC transporter, ATP binding component  63 
 
 		 266 aa  263  2e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0723  ABC transporter related  59.26 
 
 		 251 aa  256  2e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00967662  normal  0.0967044 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2658  ABC transporter related  60.24 
 
 		 271 aa  255  4e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.360126 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1797  sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  60.34 
 
 		 270 aa  251  9.000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.555456  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3597  ABC transporter  60.34 
 
 		 274 aa  248  5e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.284861 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0465  ABC transporter related protein  59.17 
 
 		 244 aa  244  8e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0249  ABC transporter related  57.27 
 
 		 302 aa  244  9.999999999999999e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1379  ABC transporter-like protein  61.06 
 
 		 246 aa  243  3e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.279047 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7802  ABC transporter ATP-binding protein  57.14 
 
 		 237 aa  239  2.9999999999999997e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.208198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2582  ABC transporter related  56.67 
 
 		 245 aa  238  4e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.799893  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3465  ABC transporter related  60.26 
 
 		 241 aa  239  4e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.158921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2627  ABC transporter related  56.67 
 
 		 245 aa  238  4e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0950652  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1557  ABC transporter-like protein  58.95 
 
 		 247 aa  238  5e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2621  ABC transporter related  56.67 
 
 		 245 aa  238  5e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.585434  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3479  ABC transporter related protein  55.92 
 
 		 250 aa  236  2e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.558732  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2510  ABC transporter related  63.27 
 
 		 261 aa  236  2e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.827702  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3158  ABC transporter related  56.36 
 
 		 245 aa  235  4e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3817  ABC transporter related protein  55.9 
 
 		 249 aa  228  6e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2637  ABC sulfonate transporter, ATPase subunit  59.53 
 
 		 247 aa  228  6e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.327484  hitchhiker  0.00000882208 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3781  ABC transporter related  54.77 
 
 		 259 aa  227  2e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1375  ABC transporter related protein  53.33 
 
 		 258 aa  223  1e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.239653  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0424  ABC transporter related protein  53.22 
 
 		 254 aa  222  4.9999999999999996e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.573696  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3873  ABC transporter related  59.03 
 
 		 289 aa  218  5e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.195534  normal  0.0802572 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4422  ABC transporter related  58.74 
 
 		 226 aa  217  1e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6405  ABC transporter related  54.39 
 
 		 249 aa  217  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0333973  normal  0.45445 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4520  ABC transporter related  54.82 
 
 		 249 aa  217  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.719426 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3281  ABC transporter related  55.07 
 
 		 261 aa  216  2.9999999999999998e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3399  ABC transporter related protein  56.96 
 
 		 246 aa  214  7e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.857812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0982  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  59.24 
 
 		 247 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0117  ATPase  52.77 
 
 		 312 aa  212  3.9999999999999995e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.182044  hitchhiker  0.000782511 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4138  ABC transporter-like  50.66 
 
 		 255 aa  209  3e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000371805  hitchhiker  0.00945872 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2973  ABC transporter related  50.88 
 
 		 276 aa  209  3e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.493702  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2786  ABC transporter related  49.58 
 
 		 251 aa  207  1e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00998807  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1775  ABC transporter related  46.91 
 
 		 278 aa  205  6e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4107  ABC transporter related  51.79 
 
 		 242 aa  204  8e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29410  ABC transporter, ATP binding component  52.56 
 
 		 250 aa  203  2e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0766  ABC transporter related  49.14 
 
 		 253 aa  203  2e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2407  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  44.78 
 
 		 245 aa  202  3e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.626164  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19580  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  48.94 
 
 		 274 aa  202  3e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1685  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  48.94 
 
 		 274 aa  202  6e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3716  ABC transporter related  50.21 
 
 		 263 aa  201  7e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00980305 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1237  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  47.74 
 
 		 271 aa  201  7e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0017659 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3600  ABC transporter related  48.95 
 
 		 263 aa  201  8e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00199632  normal  0.177255 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0356  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  47.74 
 
 		 271 aa  201  9.999999999999999e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5411  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  51.17 
 
 		 268 aa  200  9.999999999999999e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.125743  hitchhiker  0.00768268 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30480  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  49.38 
 
 		 266 aa  201  9.999999999999999e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.3789  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2416  ABC transporter related  49.34 
 
 		 270 aa  201  9.999999999999999e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.769125  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1647  ABC transporter related  49.34 
 
 		 330 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.480345  normal  0.121683 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3298  putative sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  63.59 
 
 		 239 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0886961  normal  0.245703 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3407  ABC transporter related  49.79 
 
 		 263 aa  199  3e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.81445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4320  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  48.96 
 
 		 266 aa  199  3e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.151299 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4418  ABC transporter related  47.19 
 
 		 241 aa  199  3.9999999999999996e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.26331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1735  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  48.47 
 
 		 257 aa  199  3.9999999999999996e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.117102  normal  0.144233 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3412  ABC transporter-related protein  49.15 
 
 		 250 aa  198  5e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0308441  normal  0.818563 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1746  ABC transporter related  50.91 
 
 		 333 aa  198  7.999999999999999e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1974  ABC transporter related  49.55 
 
 		 299 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0424  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  46.91 
 
 		 271 aa  197  1.0000000000000001e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2786  ABC transporter, ATP-binding protein  47.53 
 
 		 232 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0961461  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5314  aliphatic sulfonates ABC transporter, ATP-binding protein  48.47 
 
 		 270 aa  196  3e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1540  ABC transporter related  51.2 
 
 		 318 aa  196  3e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0499832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4706  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  52.13 
 
 		 319 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2491  ABC aliphatic sulfonates transporter, ATPase subunit  51.14 
 
 		 261 aa  195  4.0000000000000005e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.761124 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4636  ABC transporter related  49.56 
 
 		 326 aa  195  5.000000000000001e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.214467  hitchhiker  0.0000194183 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1280  ABC transporter related  48.93 
 
 		 279 aa  195  5.000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.161997  normal  0.0814876 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1486  ABC transporter related  50.23 
 
 		 319 aa  195  6e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4874  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  50.7 
 
 		 270 aa  195  7e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1373  ABC transporter-related protein  49.12 
 
 		 291 aa  195  7e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1084  ABC transporter related  51.2 
 
 		 319 aa  194  9e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1564  ABC transporter related  51.2 
 
 		 319 aa  194  9e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2514  ABC transporter  48.25 
 
 		 237 aa  194  1e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.36817  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1217  ABC transporter related  48.48 
 
 		 279 aa  194  1e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.216616 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5515  ABC transporter related  49.6 
 
 		 278 aa  194  1e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1465  ABC transporter related  51.2 
 
 		 319 aa  194  1e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.08781  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3041  ABC transporter-related protein  47.92 
 
 		 272 aa  194  1e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.784211  normal  0.0417825 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0240  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  48.47 
 
 		 270 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.10949  hitchhiker  0.000841582 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2980  ABC transporter related protein  48.52 
 
 		 255 aa  193  2e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2436  ABC transporter related  46.09 
 
 		 277 aa  193  2e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0255  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  48.47 
 
 		 270 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.213675  normal  0.0453993 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5129  ABC transporter related  51.26 
 
 		 275 aa  192  3e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0502881 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4972  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  48.32 
 
 		 270 aa  192  3e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.243489  normal  0.0217357 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0023  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  47.16 
 
 		 266 aa  192  4e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1868  ABC transporter ATP-binding protein  48.5 
 
 		 288 aa  192  5e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0264  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  47.48 
 
 		 270 aa  192  5e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0029  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  47.16 
 
 		 266 aa  191  7e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.05113  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2303  ABC transporter related  48.74 
 
 		 275 aa  191  8e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.711472 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1341  aliphatic sulfonate ABC transporter ATP-binding protein  51.36 
 
 		 284 aa  191  1e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.120657  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2499  aliphatic sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  50.69 
 
 		 335 aa  191  1e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3867  ABC transporter related  47.15 
 
 		 265 aa  191  1e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.685954  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0773  ABC transporter related  51.1 
 
 		 262 aa  189  5e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.050143 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2227  ABC transporter related protein  48.26 
 
 		 267 aa  188  5e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0741245  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1339  ABC transporter related  49.58 
 
 		 283 aa  187  1e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0379728 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2688  ABC transporter related  47.11 
 
 		 264 aa  187  2e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.232656  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0658  ABC transporter, ATP-binding protein  43.06 
 
 		 245 aa  186  2e-46  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1672  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  46.7 
 
 		 267 aa  186  3e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4591  ABC transporter related  45.56 
 
 		 265 aa  186  4e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4457  ABC transporter related  45.56 
 
 		 265 aa  186  4e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0721203  normal  0.624279 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3269  ABC transporter related  47.15 
 
 		 263 aa  185  6e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.874896 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1452  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  45.81 
 
 		 256 aa  185  7e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>