More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_2514 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_2514  ABC transporter  100 
 
 		 237 aa  475  1e-133  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.36817  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2786  ABC transporter, ATP-binding protein  90.95 
 
 		 232 aa  429  1e-119  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0961461  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4329  ABC transporter related  60.74 
 
 		 243 aa  283  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.413281  normal  0.920294 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19520  ABC transporter ATP-binding protein  58.7 
 
 		 249 aa  278  6e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1680  ABC transporter ATP-binding protein  58.7 
 
 		 249 aa  277  1e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.391829  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0546  ABC transporter related  57.55 
 
 		 245 aa  261  6.999999999999999e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7505  ABC transporter, ATPase subunit  54.81 
 
 		 273 aa  248  7e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000247297  normal  0.575396 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6521  ABC transporter related  53.14 
 
 		 270 aa  245  6e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6755  ABC transporter related  53.14 
 
 		 270 aa  245  6e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0664482 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6344  ABC transporter related  53.14 
 
 		 270 aa  244  9e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.942875  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4034  ABC transporter related  52.36 
 
 		 276 aa  229  3e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.105857 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2623  ABC transporter related  48.57 
 
 		 255 aa  217  1e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000578325  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4335  ABC transporter related protein  49 
 
 		 247 aa  209  2e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2311  putative sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  46.49 
 
 		 251 aa  209  2e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.89952  hitchhiker  0.0000000038093 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2932  putative sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  44.54 
 
 		 251 aa  209  3e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4843  putative ABC transporter ATP-binding protein  48.78 
 
 		 284 aa  209  3e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.365039 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2000  ABC transporter-related protein  49.1 
 
 		 251 aa  209  3e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.554575  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0150  ABC transporter related  48.21 
 
 		 252 aa  208  6e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3505  ABC transporter related  50.22 
 
 		 281 aa  207  1e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.870495  hitchhiker  0.000930317 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4347  ABC transporter related  49.78 
 
 		 281 aa  205  4e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4019  ABC transporter related  49.78 
 
 		 281 aa  205  4e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2099  ABC transporter related  50 
 
 		 298 aa  205  5e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4565  ABC transporter related  52.25 
 
 		 281 aa  204  1e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7233  ABC transporter related  49.12 
 
 		 285 aa  203  2e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.373776  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2064  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  49.79 
 
 		 281 aa  202  4e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.768493  normal  0.657795 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2714  sulfonate ABC transporter ATP-binding protein  45.81 
 
 		 287 aa  202  5e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0521621  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2665  alkanesulfonates transport ATP-binding protein  44.96 
 
 		 251 aa  201  6e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.273275  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2922  sulfonate ABC transporter ATP-binding protein  45.81 
 
 		 251 aa  201  7e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.900883  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2921  putative sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  45.81 
 
 		 251 aa  201  7e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.88235e-19 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3339  ABC transporter related  51.8 
 
 		 260 aa  201  9e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00741331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7645  putative sulfonate ABC transporter, ATP binding protein  51.53 
 
 		 261 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0412308  normal  0.633643 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1573  ABC transporter related  47.92 
 
 		 269 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2157  sulfate ester ABC transporter ATPase  48.95 
 
 		 288 aa  198  7e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0499335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0769  ABC transporter related  50.42 
 
 		 252 aa  197  7.999999999999999e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.159721 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1431  ABC transporter related  50 
 
 		 269 aa  197  9e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.242163  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2642  alkanesulfonates transport ATP-binding protein  44.12 
 
 		 251 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.164892  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1979  ABC transporter related  49.55 
 
 		 258 aa  197  1.0000000000000001e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000563857  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1909  ABC transporter related  46.06 
 
 		 286 aa  197  1.0000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3352  ABC transporter related  48.66 
 
 		 261 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1352  ABC transporter related  49.17 
 
 		 262 aa  196  2.0000000000000003e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0465  ABC transporter related protein  51.6 
 
 		 244 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0131  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  46.53 
 
 		 281 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1831  ABC transporter related protein  50.24 
 
 		 266 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4886  ABC transporter related  46.28 
 
 		 297 aa  197  2.0000000000000003e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2968  putative sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  43.7 
 
 		 251 aa  196  3e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.503094  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0113  ABC transporter related  49.78 
 
 		 261 aa  196  3e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.692675 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3882  ABC transporter related  45.11 
 
 		 259 aa  196  3e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08090  ABC transporter, ATP-binding component  50 
 
 		 269 aa  195  4.0000000000000005e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2961  sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  43.7 
 
 		 251 aa  195  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0749803  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3009  ABC transporter related  47.11 
 
 		 245 aa  195  6e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1572  ABC transporter related protein  46.55 
 
 		 267 aa  194  7e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3458  ABC transporter related  47.14 
 
 		 260 aa  194  1e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.914516  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1919  ABC transporter related  44.89 
 
 		 265 aa  193  2e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0209  ABC transporter-like  49.09 
 
 		 271 aa  192  3e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2625  ABC transporter related  50.24 
 
 		 267 aa  192  3e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.173465  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0677  ABC transporter related  47.56 
 
 		 262 aa  192  5e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.28609 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02330  ABC transporter ATP-binding protein  48.91 
 
 		 279 aa  191  6e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.366752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0230  ABC transporter related  48.88 
 
 		 287 aa  191  7e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5006  ABC transporter related  49.78 
 
 		 287 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0264  ABC transporter ATP-binding protein  48.91 
 
 		 279 aa  191  1e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.419692  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1075  ABC transporter related  46.22 
 
 		 252 aa  190  2e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.137281  normal  0.464106 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7199  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (nitrate/sulfonates)  48.33 
 
 		 278 aa  190  2e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0286852  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2275  ABC transporter related  47.41 
 
 		 264 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0996963 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0528  ABC transporter related  44.74 
 
 		 247 aa  189  4e-47  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0467  ABC transporter related  50.24 
 
 		 274 aa  188  8e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0679  ABC transporter related  47.16 
 
 		 244 aa  188  8e-47  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0882795 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1358  ABC transporter related  43.91 
 
 		 262 aa  187  1e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1645  ABC transporter related  47.81 
 
 		 253 aa  187  1e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0779  ABC transporter related  48.7 
 
 		 249 aa  186  2e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1384  ABC transporter related protein  47.15 
 
 		 277 aa  186  2e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0283767 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0482  ABC transporter related protein  40.65 
 
 		 255 aa  186  3e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1475  ABC transporter related  44.64 
 
 		 254 aa  185  4e-46  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4887  ABC transporter related  46.4 
 
 		 259 aa  186  4e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.546298  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0378  hypothetical protein  44.35 
 
 		 260 aa  185  4e-46  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0408  ABC transporter related  47.75 
 
 		 259 aa  185  5e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0896853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1561  ABC transporter related  49.8 
 
 		 291 aa  184  8e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000732497 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5004  ABC transporter related  48.25 
 
 		 245 aa  184  9e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.472634  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0378  ABC transporter related  47.79 
 
 		 259 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0550  ABC transporter related  45.18 
 
 		 276 aa  184  1.0000000000000001e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.589055  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5010  ABC transporter related  47.53 
 
 		 263 aa  184  1.0000000000000001e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0572  ABC transporter related  46.05 
 
 		 269 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0445  ABC transporter related  43.81 
 
 		 254 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4664  ABC transporter related  45.83 
 
 		 274 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.456657 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0249  ABC transporter related  47.79 
 
 		 302 aa  183  2.0000000000000003e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22550  ABC transporter ATP-binding protein  48.92 
 
 		 255 aa  183  2.0000000000000003e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1379  ABC transporter-like protein  49.56 
 
 		 246 aa  183  2.0000000000000003e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.279047 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0331  ABC transporter related  46.9 
 
 		 259 aa  182  3e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6405  ABC transporter related  46.36 
 
 		 249 aa  182  3e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0333973  normal  0.45445 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0327  ABC transporter related  45.61 
 
 		 264 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.341199  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4591  ABC transporter related  46.19 
 
 		 265 aa  182  4.0000000000000006e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4457  ABC transporter related  46.19 
 
 		 265 aa  182  4.0000000000000006e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0721203  normal  0.624279 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19370  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  44.31 
 
 		 326 aa  182  5.0000000000000004e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.813225 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2637  ABC sulfonate transporter, ATPase subunit  46.85 
 
 		 247 aa  181  7e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.327484  hitchhiker  0.00000882208 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3440  ABC transporter related  45.24 
 
 		 275 aa  181  8.000000000000001e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.358394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0392  ABC transporter related  42.28 
 
 		 254 aa  181  8.000000000000001e-45  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.238571  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4965  ABC transporter related  53.54 
 
 		 253 aa  181  9.000000000000001e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5128  ABC transporter related  42.92 
 
 		 256 aa  181  9.000000000000001e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.012319  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0723  ABC transporter related  48.07 
 
 		 251 aa  181  1e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00967662  normal  0.0967044 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3265  ABC transporter related  45.23 
 
 		 273 aa  180  1e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.745893  normal  0.952951 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0876  ABC transporter related  44.78 
 
 		 218 aa  181  1e-44  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>