More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_4965 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010623  Bphy_4965  ABC transporter related  100 
 
 
253 aa  494  1e-139  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6344  ABC transporter related  58.82 
 
 
270 aa  228  1e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.942875  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6521  ABC transporter related  58.33 
 
 
270 aa  227  2e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6755  ABC transporter related  58.33 
 
 
270 aa  227  2e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0664482 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7505  ABC transporter, ATPase subunit  59.31 
 
 
273 aa  223  3e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000247297  normal  0.575396 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4034  ABC transporter related  58.54 
 
 
276 aa  215  7e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.105857 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0546  ABC transporter related  56.37 
 
 
245 aa  211  9e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4329  ABC transporter related  50 
 
 
243 aa  184  9e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.413281  normal  0.920294 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2786  ABC transporter, ATP-binding protein  52.02 
 
 
232 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0961461  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1680  ABC transporter ATP-binding protein  49.54 
 
 
249 aa  180  2e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.391829  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19520  ABC transporter ATP-binding protein  50 
 
 
249 aa  178  9e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1352  ABC transporter related  51.58 
 
 
262 aa  176  2e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1909  ABC transporter related  49.04 
 
 
286 aa  174  8e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0113  ABC transporter related  50.75 
 
 
261 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.692675 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1358  ABC transporter related  45.79 
 
 
262 aa  172  5e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1831  ABC transporter related protein  49.74 
 
 
266 aa  171  6.999999999999999e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1431  ABC transporter related  50 
 
 
269 aa  170  2e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.242163  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2514  ABC transporter  53.54 
 
 
237 aa  169  3e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.36817  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3009  ABC transporter related  46.89 
 
 
245 aa  169  3e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7645  putative sulfonate ABC transporter, ATP binding protein  47.37 
 
 
261 aa  168  8e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0412308  normal  0.633643 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7222  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  50.54 
 
 
245 aa  167  1e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2932  putative sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  41.18 
 
 
251 aa  166  4e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0230  ABC transporter related  46.89 
 
 
287 aa  165  5e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19370  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  46.33 
 
 
326 aa  165  8e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.813225 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5006  ABC transporter related  46.89 
 
 
287 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3642  ABC transporter related  45.73 
 
 
239 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000649736  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08090  ABC transporter, ATP-binding component  47.34 
 
 
269 aa  164  1.0000000000000001e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3269  ABC transporter related  47.32 
 
 
263 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.874896 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0580  ABC transporter related  40.16 
 
 
265 aa  163  2.0000000000000002e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.860273  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0264  ABC transporter ATP-binding protein  49.21 
 
 
279 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.419692  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02330  ABC transporter ATP-binding protein  49.21 
 
 
279 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.366752  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0769  ABC transporter related  49.75 
 
 
252 aa  163  3e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.159721 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1481  ABC transporter related  47.39 
 
 
283 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2625  ABC transporter related  43.86 
 
 
267 aa  162  5.0000000000000005e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.173465  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1572  ABC transporter related protein  41.78 
 
 
267 aa  162  6e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2623  ABC transporter related  44.55 
 
 
255 aa  162  6e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000578325  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2893  ABC transporter related  48.54 
 
 
259 aa  162  6e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.767338  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0150  ABC transporter related  46.19 
 
 
252 aa  161  7e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0087  ABC transporter related  44.13 
 
 
263 aa  160  1e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2688  ABC transporter related  44.61 
 
 
264 aa  161  1e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.232656  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2954  ABC transporter related  45.15 
 
 
272 aa  160  1e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4843  putative ABC transporter ATP-binding protein  48.29 
 
 
284 aa  160  2e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.365039 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3505  ABC transporter related  46.89 
 
 
281 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.870495  hitchhiker  0.000930317 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4347  ABC transporter related  46.89 
 
 
281 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4019  ABC transporter related  46.89 
 
 
281 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2099  ABC transporter related  45.71 
 
 
298 aa  159  3e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2064  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  47.85 
 
 
281 aa  159  5e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.768493  normal  0.657795 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3352  ABC transporter related  44.39 
 
 
261 aa  159  5e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2000  ABC transporter-related protein  42.86 
 
 
251 aa  159  5e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.554575  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0528  ABC transporter related  39.61 
 
 
247 aa  158  7e-38  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2147  ABC transporter related  45.96 
 
 
274 aa  158  8e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2714  sulfonate ABC transporter ATP-binding protein  39.9 
 
 
287 aa  158  9e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0521621  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5062  ABC transporter related  41.41 
 
 
246 aa  158  9e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.314971  normal  0.024914 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2311  putative sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  40.2 
 
 
251 aa  158  9e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.89952  hitchhiker  0.0000000038093 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2961  sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  39.9 
 
 
251 aa  157  1e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0749803  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7233  ABC transporter related  45.37 
 
 
285 aa  157  1e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.373776  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2057  ABC transporter related  46.08 
 
 
280 aa  158  1e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2665  alkanesulfonates transport ATP-binding protein  39.9 
 
 
251 aa  157  2e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.273275  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2642  alkanesulfonates transport ATP-binding protein  39.9 
 
 
251 aa  157  2e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.164892  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0378  hypothetical protein  41.83 
 
 
260 aa  157  2e-37  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2921  putative sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  39.9 
 
 
251 aa  157  2e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.88235e-19 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2922  sulfonate ABC transporter ATP-binding protein  39.9 
 
 
251 aa  157  2e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.900883  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7248  ABC transporter ATP-binding protein  44.55 
 
 
222 aa  156  2e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00375076  normal  0.359257 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2643  ABC transporter related  43.6 
 
 
261 aa  157  2e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.430112  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2157  sulfate ester ABC transporter ATPase  44.7 
 
 
288 aa  156  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0499335  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0079  ABC transporter related  45.26 
 
 
307 aa  156  3e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2718  ABC transporter related  42.13 
 
 
259 aa  156  3e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3306  alkanesulfonate ABC transporter, ATP binding protein  46.57 
 
 
263 aa  156  3e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2968  putative sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  39.9 
 
 
251 aa  156  3e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.503094  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4050  ABC transporter related  43.4 
 
 
289 aa  156  3e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.95226  normal  0.382919 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4565  ABC transporter related  46.89 
 
 
281 aa  156  3e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1384  ABC transporter related protein  46.76 
 
 
277 aa  156  3e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0283767 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1573  ABC transporter related  44.88 
 
 
269 aa  156  3e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0571  ABC transporter related  48.17 
 
 
267 aa  155  4e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.260264  normal  0.332215 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0779  ABC transporter related  45.37 
 
 
249 aa  155  5.0000000000000005e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0209  ABC transporter-like  40.71 
 
 
271 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5824  ABC transporter related  43.78 
 
 
271 aa  155  5.0000000000000005e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.971522  normal  0.461602 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0408  ABC transporter related  47.09 
 
 
259 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0896853  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3676  ABC transporter related  46.23 
 
 
266 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.618015 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2188  ABC transporter related  45.63 
 
 
260 aa  155  7e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0571708  normal  0.474002 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3643  ABC transporter related  43.13 
 
 
259 aa  155  7e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.857726  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1258  ABC transporter related  42.18 
 
 
244 aa  155  7e-37  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1403  ABC transporter related  43.4 
 
 
267 aa  154  9e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4149  ABC transporter related  45.75 
 
 
266 aa  154  1e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0621662 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6457  ABC transporter ATP-binding protein  43.6 
 
 
261 aa  154  1e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2857  ABC transporter-related protein  41.67 
 
 
259 aa  154  1e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.99142  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4338  ABC transporter related  45.5 
 
 
271 aa  154  1e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2775  ABC transporter related  47.94 
 
 
268 aa  154  2e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1759  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  44.55 
 
 
275 aa  154  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.352483  hitchhiker  0.00557552 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0032  ABC transporter related  40.2 
 
 
265 aa  154  2e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0677  ABC transporter related  46.6 
 
 
262 aa  154  2e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.28609 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0131  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  44.55 
 
 
281 aa  154  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0238  ABC sulfate ester transporter, ATPase subunit  49.21 
 
 
286 aa  153  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.81925  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4335  ABC transporter related protein  44.16 
 
 
247 aa  153  2e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2164  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  45.07 
 
 
276 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5010  ABC transporter related  45.1 
 
 
263 aa  153  2.9999999999999998e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0156  ABC transporter related  41.71 
 
 
260 aa  152  4e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3345  ABC transporter related  44.71 
 
 
293 aa  152  4e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0147  ABC transporter related  42.18 
 
 
259 aa  152  4e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.288686 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7199  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (nitrate/sulfonates)  43.33 
 
 
278 aa  152  5e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0286852  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>