More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_7248 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_7248  ABC transporter ATP-binding protein  100 
 
 
222 aa  445  1.0000000000000001e-124  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00375076  normal  0.359257 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1817  ABC transporter  50 
 
 
261 aa  207  1e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5983  ABC transporter ATP-binding protein  47.27 
 
 
267 aa  205  4e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.289741 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0285  ABC transporter related protein  47.25 
 
 
267 aa  202  4e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.120651  hitchhiker  0.0000760001 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1237  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  50 
 
 
659 aa  200  9.999999999999999e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1802  ABC transporter related protein  49.07 
 
 
267 aa  199  1.9999999999999998e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00421209  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2480  ABC transporter related protein  45.33 
 
 
263 aa  199  3e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5351  ABC transporter related  46.33 
 
 
262 aa  198  5e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3080  ABC transporter related  44.5 
 
 
290 aa  198  5e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.178187  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5730  ABC transporter related  46.33 
 
 
259 aa  198  5e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5440  ABC transporter related  46.33 
 
 
262 aa  198  5e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.556345 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34330  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  46.76 
 
 
262 aa  197  1.0000000000000001e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5006  ABC transporter related  47.69 
 
 
257 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4457  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  47.47 
 
 
668 aa  196  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.631806 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4394  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  47.47 
 
 
668 aa  196  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5421  ABC transporter related  50 
 
 
294 aa  196  2.0000000000000003e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1975  ABC transporter related  47.44 
 
 
263 aa  195  4.0000000000000005e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000056178  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0104  ABC transporter related  45.09 
 
 
260 aa  195  6e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.464024  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5555  ABC transporter related  49.07 
 
 
303 aa  194  9e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356356  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5920  ABC transporter related  49.07 
 
 
303 aa  194  9e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2804  ABC transporter related protein  45.12 
 
 
256 aa  194  9e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00228299  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4542  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  47 
 
 
657 aa  194  1e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6427  ABC transporter related  49.07 
 
 
303 aa  194  1e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1857  ABC transporter related  48.11 
 
 
304 aa  194  1e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3541  ABC transporter related  46.48 
 
 
255 aa  193  1e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.774244  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2333  ABC transporter related protein  47.71 
 
 
260 aa  193  2e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1045  ABC transporter related  47.06 
 
 
259 aa  193  2e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.162928  normal  0.159703 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4569  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  45.16 
 
 
275 aa  192  3e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.571931  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3906  ABC transporter related  49.53 
 
 
315 aa  192  3e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.118447  normal  0.091795 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0513  ABC transporter related  46.15 
 
 
254 aa  192  4e-48  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0378  hypothetical protein  44.95 
 
 
260 aa  192  5e-48  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5225  ABC transporter related  46.23 
 
 
304 aa  190  1e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.272963  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3677  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  42.45 
 
 
274 aa  190  1e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0392  ABC transporter related  48.15 
 
 
254 aa  190  1e-47  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.238571  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0445  ABC transporter related  46.79 
 
 
254 aa  189  2e-47  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3731  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  42.45 
 
 
274 aa  189  2e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00678541  normal  0.114622 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2857  ABC transporter-related protein  45.91 
 
 
259 aa  190  2e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.99142  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2718  ABC transporter related  45.45 
 
 
259 aa  189  2.9999999999999997e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4923  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  45.66 
 
 
668 aa  189  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.502071 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0671  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  47.27 
 
 
279 aa  189  2.9999999999999997e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.299048  normal  0.328803 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6457  ABC transporter ATP-binding protein  45.7 
 
 
261 aa  188  4e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4393  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  42.4 
 
 
280 aa  189  4e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0792  ABC transporter related protein  46.73 
 
 
308 aa  188  4e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3083  ABC transporter related  49.24 
 
 
306 aa  189  4e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.724622  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1387  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  46.23 
 
 
304 aa  189  4e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.195746  normal  0.160104 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1475  ABC transporter related  45.74 
 
 
254 aa  189  4e-47  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4456  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  42.4 
 
 
280 aa  189  4e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.458938  normal  0.759518 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0147  ABC transporter related  43.89 
 
 
259 aa  188  5e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.288686 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1733  ABC transporter related protein  48.29 
 
 
265 aa  188  5.999999999999999e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  42.73 
 
 
258 aa  187  9e-47  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4929  ABC transporter-like  47.44 
 
 
278 aa  187  9e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3876  ABC transporter related  48.6 
 
 
297 aa  187  1e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0079  ABC transporter related  50.25 
 
 
307 aa  187  1e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1490  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  45.62 
 
 
663 aa  187  1e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.810592  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3525  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  47.47 
 
 
669 aa  187  1e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.769679 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2836  ABC transporter related  46.33 
 
 
272 aa  186  2e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.840356  normal  0.83525 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1909  ABC transporter related  46.58 
 
 
286 aa  186  2e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2623  ABC transporter related  47.22 
 
 
255 aa  187  2e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000578325  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0435  ABC transporter related  44.14 
 
 
256 aa  187  2e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.30818  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2967  ABC transporter-related protein  45 
 
 
259 aa  186  2e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0379202  normal  0.762779 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0467  ABC transporter related  46.33 
 
 
274 aa  186  3e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2954  ABC transporter related  49.49 
 
 
272 aa  186  3e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4676  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  45.91 
 
 
673 aa  186  3e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2275  ABC transporter related  47.25 
 
 
264 aa  186  3e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0996963 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4096  ABC transporter related protein  48.15 
 
 
261 aa  186  3e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0795194 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4305  ABC transporter related  48.13 
 
 
273 aa  185  4e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272884  hitchhiker  0.0022322 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1979  ABC transporter related  46.54 
 
 
258 aa  185  4e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000563857  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0327  ABC transporter related  46.33 
 
 
264 aa  185  4e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.341199  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1030  ABC transporter, ATP-binding protein  49.49 
 
 
254 aa  185  5e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3034  ABC transporter related  49.53 
 
 
292 aa  185  6e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.652183  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1788  ABC transporter related  46.7 
 
 
303 aa  184  8e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0876  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  43.58 
 
 
278 aa  184  9e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.190681  hitchhiker  0.00187528 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4570  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  46.54 
 
 
668 aa  183  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.177412  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4543  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  42.99 
 
 
277 aa  184  1.0000000000000001e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3892  ABC transporter related  46.58 
 
 
271 aa  184  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2702  ABC transporter related  48.2 
 
 
263 aa  184  1.0000000000000001e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2802  ABC transporter related protein  47.25 
 
 
260 aa  184  1.0000000000000001e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3808  ABC transporter-related protein  46.58 
 
 
271 aa  184  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4675  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  44.39 
 
 
280 aa  183  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0735  ABC transporter related  45.87 
 
 
253 aa  183  2.0000000000000003e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0415182  normal  0.371016 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3751  ABC transporter, ATPase subunit  46.58 
 
 
271 aa  183  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1428  ABC transporter related  43.18 
 
 
267 aa  183  2.0000000000000003e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.250833  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3519  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  45.45 
 
 
669 aa  182  3e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2598  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  45.45 
 
 
669 aa  182  3e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.992008  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1665  ABC transporter  42.92 
 
 
561 aa  182  3e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0690908  normal  0.0741534 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0029  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  45.05 
 
 
266 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.05113  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1899  ABC transporter-related protein  49.49 
 
 
264 aa  182  4.0000000000000006e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.126966  hitchhiker  0.000000000000779353 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0384  ABC transporter related  43.3 
 
 
288 aa  182  4.0000000000000006e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.317269  normal  0.323719 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1305  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  45.62 
 
 
326 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.433346  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0023  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  45.7 
 
 
266 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2434  ABC transporter related protein  47.51 
 
 
276 aa  182  5.0000000000000004e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0618237 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1572  ABC transporter related protein  44.55 
 
 
267 aa  182  5.0000000000000004e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4050  ABC transporter related  46.73 
 
 
289 aa  181  6e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.95226  normal  0.382919 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1146  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  45.62 
 
 
301 aa  181  6e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.836994  normal  0.976789 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4661  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  45.62 
 
 
326 aa  181  7e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0404  ABC transporter related protein  42.66 
 
 
261 aa  181  7e-45  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0147  ABC transporter related  43.52 
 
 
273 aa  181  8.000000000000001e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0849  ABC transporter-related protein  44.5 
 
 
253 aa  181  8.000000000000001e-45  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0140067  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0307  ABC transporter related  49.07 
 
 
259 aa  181  9.000000000000001e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4642  ABC transporter related  46.26 
 
 
284 aa  181  9.000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.842575  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>