More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0876 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_0876  ABC transporter related  100 
 
 		 218 aa  430  1e-119  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0243  ABC transporter related  49.56 
 
 		 240 aa  234  7e-61  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.498468  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1146  ABC transporter related  49.28 
 
 		 237 aa  215  2.9999999999999998e-55  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0318577  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0339  putative sulfonate transport system ATP-binding protein  55.56 
 
 		 231 aa  213  1.9999999999999998e-54  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0720  ABC transporter related  47.21 
 
 		 230 aa  188  7e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0744  ABC transporter related  47.72 
 
 		 230 aa  187  2e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2786  ABC transporter, ATP-binding protein  45.36 
 
 		 232 aa  179  2e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0961461  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2514  ABC transporter  44 
 
 		 237 aa  179  2e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.36817  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3269  ABC transporter related  40.28 
 
 		 263 aa  173  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.874896 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0482  ABC transporter related protein  47.91 
 
 		 255 aa  172  5e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1866  ABC transporter related  42.58 
 
 		 246 aa  168  5e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0546  ABC transporter related  39.82 
 
 		 245 aa  167  9e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3465  ABC transporter related  41.87 
 
 		 241 aa  167  1e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.158921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4329  ABC transporter related  40 
 
 		 243 aa  166  2e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.413281  normal  0.920294 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5128  ABC transporter related  42.52 
 
 		 256 aa  167  2e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.012319  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4038  ABC transporter related  36.94 
 
 		 265 aa  166  2.9999999999999998e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0203282 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2802  ABC transporter related protein  38.68 
 
 		 260 aa  165  5e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0014  ABC transporter related  41.62 
 
 		 235 aa  164  6.9999999999999995e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0590  ABC transporter related protein  36.44 
 
 		 263 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4216  ABC transporter related  40.89 
 
 		 256 aa  163  2.0000000000000002e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2147  ABC transporter related  37.25 
 
 		 274 aa  163  2.0000000000000002e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4843  putative ABC transporter ATP-binding protein  35.86 
 
 		 284 aa  162  3e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.365039 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1680  ABC transporter ATP-binding protein  37.38 
 
 		 249 aa  162  3e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.391829  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2573  ABC transporter related protein  40.48 
 
 		 255 aa  162  4.0000000000000004e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19520  ABC transporter ATP-binding protein  37.38 
 
 		 249 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0190  ABC transporter related  40.74 
 
 		 244 aa  161  7e-39  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0349  ABC transporter, ATPase subunit  44.44 
 
 		 352 aa  161  8.000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0371  sulfate transport protein CysA  43.13 
 
 		 329 aa  160  1e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.322306  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0679  ABC transporter related  40 
 
 		 244 aa  160  1e-38  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0882795 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03650  sulfate transport protein CysA  42.65 
 
 		 329 aa  160  1e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00236886  hitchhiker  0.00000000727844 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0014  ABC transporter related  43.4 
 
 		 245 aa  160  1e-38  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11500  ABC transporter related  44.39 
 
 		 257 aa  160  1e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000319747  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2918  ABC transporter related protein  37.84 
 
 		 336 aa  160  2e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3870  ABC transporter related  36.87 
 
 		 267 aa  160  2e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2640  ABC transporter related  41.95 
 
 		 353 aa  159  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.151039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1993  ABC transporter related  43.96 
 
 		 352 aa  160  2e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.218449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0518  ABC transporter related  38.76 
 
 		 251 aa  159  2e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0668651 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0294  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  42.18 
 
 		 329 aa  159  2e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.491051 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4096  ABC transporter related protein  36.65 
 
 		 261 aa  160  2e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0795194 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0497  ABC transporter component  40.78 
 
 		 366 aa  159  3e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1464  nitrate ABC transporter ATP binding protein  43.06 
 
 		 228 aa  159  3e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.104655  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1258  ABC transporter related  43.06 
 
 		 244 aa  159  3e-38  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9277  ABC transporter, ATPase subunit  35.75 
 
 		 263 aa  159  4e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6389  ABC transporter related  40.98 
 
 		 256 aa  159  4e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.350257  normal  0.506492 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2057  ABC transporter related  36.44 
 
 		 361 aa  159  4e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0452  ABC transporter related  40.91 
 
 		 235 aa  159  4e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3900  ABC transporter related  37 
 
 		 228 aa  159  4e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0437  ABC transporter related  40.91 
 
 		 235 aa  159  4e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1348  ABC transporter-related protein  41.75 
 
 		 246 aa  158  5e-38  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00000000711839  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4232  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.44 
 
 		 353 aa  158  5e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2057  ABC transporter related  37.09 
 
 		 280 aa  158  6e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0282  ABC transporter related  40.37 
 
 		 244 aa  158  6e-38  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.686525  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2900  ABC transporter related  41.95 
 
 		 353 aa  158  6e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1544  ABC transporter related  37.84 
 
 		 336 aa  158  7e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0675386  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1736  ABC transporter, ATP-binding protein  43.06 
 
 		 228 aa  158  7e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0183932  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3306  alkanesulfonate ABC transporter, ATP binding protein  37.32 
 
 		 263 aa  158  8e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0197  sulphate transport system permease protein 1  41.71 
 
 		 329 aa  157  9e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1075  ABC transporter related  40.47 
 
 		 252 aa  157  9e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.137281  normal  0.464106 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5228  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  41.71 
 
 		 329 aa  157  1e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.138595  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4664  ABC transporter related  38.71 
 
 		 274 aa  157  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.456657 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1930  putative sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  36.65 
 
 		 262 aa  156  2e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0780137  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0112  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  42.44 
 
 		 353 aa  156  2e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.178265  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0102  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  42.44 
 
 		 353 aa  157  2e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.12958  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4539  ABC transporter related  41.46 
 
 		 256 aa  157  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.113352 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2904  ABC transporter related  39.17 
 
 		 270 aa  157  2e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2534  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  43.6 
 
 		 354 aa  156  2e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0417932  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0307  ABC transporter related  37.04 
 
 		 259 aa  156  2e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0947  ABC transporter related  43.14 
 
 		 352 aa  156  2e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.72362  normal  0.167661 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2760  ABC transporter related protein  37.75 
 
 		 278 aa  156  2e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.398097  normal  0.0252415 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2221  ABC transporter-related protein  37.38 
 
 		 262 aa  156  2e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000225021  normal  0.260255 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3188  putative ABC transporter ATP-binding protein  39.22 
 
 		 378 aa  156  2e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1181  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein CysA  40.95 
 
 		 348 aa  155  3e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.36202  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0311  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein CysA  41.23 
 
 		 326 aa  156  3e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31750  sulfate ABC transporter  40.76 
 
 		 323 aa  156  3e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0081  ABC transporter  41.23 
 
 		 326 aa  156  3e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3882  ABC transporter related  42.86 
 
 		 259 aa  155  3e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0332  ABC transporter, ATPase subunit  38.16 
 
 		 267 aa  155  3e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1383  ABC transporter related  39.05 
 
 		 269 aa  155  3e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.181644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5075  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  41.71 
 
 		 329 aa  155  3e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.207952  normal  0.649102 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2032  ABC transporter related protein  34.72 
 
 		 278 aa  156  3e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0545807  normal  0.262342 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6033  putative ABC transporter, ATP-binding protein  42.72 
 
 		 261 aa  156  3e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0238  ABC sulfate ester transporter, ATPase subunit  38.68 
 
 		 286 aa  156  3e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.81925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2137  ABC transporter related  41.46 
 
 		 353 aa  155  3e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0580  ABC transporter related  43.33 
 
 		 265 aa  156  3e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.860273  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4886  ABC transporter related  36.02 
 
 		 297 aa  155  4e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1979  ABC transporter related  38.71 
 
 		 258 aa  155  4e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000563857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0131  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  38.21 
 
 		 281 aa  155  4e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2688  ABC transporter related  39.49 
 
 		 264 aa  155  4e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.232656  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2064  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  36.67 
 
 		 281 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.768493  normal  0.657795 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2188  ABC transporter related  36.54 
 
 		 260 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0571708  normal  0.474002 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1677  ABC transporter related  39.25 
 
 		 274 aa  155  5.0000000000000005e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.012686  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31130  ABC transporter ATP binding protein  40.57 
 
 		 264 aa  155  5.0000000000000005e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.098287  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2958  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  40.48 
 
 		 365 aa  155  5.0000000000000005e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4338  ABC transporter related  35.85 
 
 		 271 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7503  ABC transporter ATP-binding protein  35.38 
 
 		 257 aa  155  6e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.704278 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1435  ABC transporter related protein  37 
 
 		 291 aa  155  6e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.597503  normal  0.846861 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2133  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  39.47 
 
 		 252 aa  155  6e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5168  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  41.23 
 
 		 329 aa  154  7e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.644217 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4034  ABC transporter related  36.36 
 
 		 276 aa  154  8e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.105857 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0202  ABC transporter related  36.18 
 
 		 259 aa  154  8e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>