More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1348 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_1348  ABC transporter-related protein  100 
 
 
246 aa  492  9.999999999999999e-139  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00000000711839  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1556  ABC transporter related protein  59.27 
 
 
245 aa  297  1e-79  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000121987  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1807  ABC transporter related  51.05 
 
 
286 aa  243  9.999999999999999e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.199283  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2681  ABC transporter related  40.91 
 
 
277 aa  201  8e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4038  ABC transporter related  37.13 
 
 
265 aa  170  2e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0203282 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1933  ABC transporter related  38.86 
 
 
238 aa  167  1e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.306396  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4167  ABC transporter related  40 
 
 
249 aa  167  2e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.555902 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1308  ABC transporter related  40.67 
 
 
252 aa  166  5e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0768  ABC transporter, conserved site  40.42 
 
 
432 aa  164  9e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0422  nitrate transport ATP-binding protein NrtC  38.86 
 
 
229 aa  162  4.0000000000000004e-39  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0876  ABC transporter related  41.75 
 
 
218 aa  158  6e-38  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1451  ABC transporter related  37.37 
 
 
249 aa  157  2e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0959261 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0493  sulfonate/nitrate/taurine transport system ATP-binding  35.86 
 
 
249 aa  154  9e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.187647  normal  0.442901 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0839  taurine transporter ATP-binding subunit  35.37 
 
 
255 aa  153  2e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.266417 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0441  taurine transporter ATP-binding subunit  34.55 
 
 
255 aa  152  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0347  ABC transporter, ATP-binding protein  39.13 
 
 
511 aa  153  2.9999999999999998e-36  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2121  ABC transporter-related protein  37.25 
 
 
270 aa  153  2.9999999999999998e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0515525  normal  0.0482429 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3412  ABC transporter related protein  40.59 
 
 
258 aa  153  2.9999999999999998e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0279  taurine transporter ATP-binding subunit  34.55 
 
 
255 aa  152  5e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3241  ABC transporter related protein  34.55 
 
 
255 aa  152  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2104  ABC transporter related  37.81 
 
 
282 aa  152  5.9999999999999996e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0748494  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4922  ABC transporter, ATP-binding protein  38.01 
 
 
254 aa  152  7e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4516  ABC transporter, ATP-binding protein  38.01 
 
 
254 aa  152  7e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4565  taurine transporter ATP-binding subunit  35.34 
 
 
255 aa  152  7e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.739 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4980  taurine transporter ATP-binding subunit  36.82 
 
 
262 aa  151  8e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.525227  normal  0.591838 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0613  ABC transporter-related protein  42.42 
 
 
249 aa  151  8.999999999999999e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00316  taurine transporter subunit  34.15 
 
 
255 aa  151  1e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3262  taurine transporter ATP-binding subunit  34.15 
 
 
255 aa  151  1e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5601  ABC transporter related  39.32 
 
 
267 aa  150  1e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.059714  normal  0.713913 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0430  taurine transporter ATP-binding subunit  34.55 
 
 
255 aa  150  1e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00320  hypothetical protein  34.15 
 
 
255 aa  151  1e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2866  ABC transporter related protein  37.21 
 
 
299 aa  151  1e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4936  ABC transporter, ATP-binding protein  38.01 
 
 
254 aa  150  2e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4535  ABC transporter, ATP-binding protein  38.01 
 
 
254 aa  150  2e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7381  ABC transporter related  36.29 
 
 
262 aa  150  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1857  ABC transporter related  36.44 
 
 
304 aa  150  2e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4034  ABC transporter related  35.44 
 
 
276 aa  150  2e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.105857 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5154  ABC transporter related  38.83 
 
 
268 aa  150  2e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.597589  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0395  taurine transporter ATP-binding subunit  34.15 
 
 
255 aa  149  3e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0243  ABC transporter related  38.83 
 
 
240 aa  149  4e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.498468  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2311  putative sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  36.97 
 
 
251 aa  149  4e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.89952  hitchhiker  0.0000000038093 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0783  ABC transporter, ATP-binding protein  42.42 
 
 
249 aa  149  4e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.403076  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4676  ABC transporter ATP-binding protein  37.56 
 
 
254 aa  149  5e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5037  ABC transporter ATP-binding protein  37.56 
 
 
254 aa  149  5e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2359  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  35.62 
 
 
259 aa  149  5e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.504714 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  40.1 
 
 
258 aa  149  5e-35  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0892  ABC transporter related  36.84 
 
 
252 aa  149  6e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0967243 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4548  ABC transporter, ATP-binding protein  42.42 
 
 
249 aa  148  8e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0719358  normal  0.368942 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7503  ABC transporter ATP-binding protein  34.05 
 
 
257 aa  148  8e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.704278 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2932  putative sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  35.74 
 
 
251 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0336  ABC transporter, ATP-binding protein  37.1 
 
 
254 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4264  ABC transporter related  38.39 
 
 
255 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0906906  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5606  ABC transporter related protein  36.28 
 
 
264 aa  147  2.0000000000000003e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.231398  normal  0.622338 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11500  ABC transporter related  41.18 
 
 
257 aa  147  2.0000000000000003e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000319747  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4902  ABC transporter, ATP-binding protein  37.1 
 
 
254 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1153  ABC transporter related  37.96 
 
 
246 aa  146  2.0000000000000003e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6344  ABC transporter related  35.81 
 
 
270 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.942875  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3382  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  35.81 
 
 
448 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.433884 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5128  ABC transporter related  38.28 
 
 
256 aa  147  2.0000000000000003e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.012319  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0880  ABC transporter, ATP-binding protein  38.4 
 
 
249 aa  146  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.018154  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0384  ABC transporter related  40.67 
 
 
288 aa  147  2.0000000000000003e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.317269  normal  0.323719 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1030  ABC transporter, ATP-binding protein  36.73 
 
 
254 aa  146  3e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1130  ABC transporter related  35.81 
 
 
448 aa  146  3e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2273  ABC transporter related  36.45 
 
 
275 aa  146  3e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4759  ABC transporter related  37.34 
 
 
276 aa  146  3e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.328175  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0642  ABC transporter related  42.55 
 
 
249 aa  145  4.0000000000000006e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3912  ABC transporter related  37.37 
 
 
276 aa  146  4.0000000000000006e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00786464  normal  0.17343 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0796  ABC transporter, ATP-binding protein  38.4 
 
 
249 aa  145  5e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2714  sulfonate ABC transporter ATP-binding protein  36.82 
 
 
287 aa  145  5e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0521621  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2665  alkanesulfonates transport ATP-binding protein  36.82 
 
 
251 aa  145  5e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.273275  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2921  putative sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  36.82 
 
 
251 aa  145  5e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.88235e-19 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5062  ABC transporter related  35.64 
 
 
272 aa  145  5e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.948706 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2922  sulfonate ABC transporter ATP-binding protein  36.82 
 
 
251 aa  145  5e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.900883  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2039  ABC transporter related  36.12 
 
 
306 aa  145  6e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.768155 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0692  ABC transporter ATP-binding protein  41.41 
 
 
249 aa  145  6e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0636  ABC transporter, ATP-binding protein  41.41 
 
 
249 aa  145  6e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0726  ABC transporter ATP-binding protein  41.41 
 
 
249 aa  145  6e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00713867  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0803  ABC transporter, ATP-binding protein  41.41 
 
 
249 aa  145  6e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.17589e-46 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0636  ABC transporter, ATP-binding protein  41.41 
 
 
249 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000460876  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4843  putative ABC transporter ATP-binding protein  38.81 
 
 
284 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.365039 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0816  ABC transporter related  35.6 
 
 
263 aa  145  7.0000000000000006e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.117233  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5342  ABC transporter related  35.15 
 
 
272 aa  145  7.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.682879 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2257  ABC transporter related  36.1 
 
 
285 aa  145  8.000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0209  nitrate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  33.48 
 
 
283 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.465549 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2642  alkanesulfonates transport ATP-binding protein  36.82 
 
 
251 aa  144  1e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.164892  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0136  hypothetical protein  36.49 
 
 
432 aa  144  1e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0121  hypothetical protein  36.49 
 
 
432 aa  144  1e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2968  putative sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  37.39 
 
 
251 aa  144  1e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.503094  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3465  ABC transporter related  38.1 
 
 
436 aa  144  1e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.320704 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1677  ABC transporter related  35.83 
 
 
274 aa  144  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.012686  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4537  ABC transporter related  38.1 
 
 
436 aa  144  1e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.989586 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4372  ABC transporter related  38.21 
 
 
253 aa  144  1e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.191075 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6521  ABC transporter related  35.37 
 
 
270 aa  144  1e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4848  Sigma 54 interacting domain protein  38.21 
 
 
253 aa  144  1e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.627338 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7481  ABC transporter ATP-binding protein  37.5 
 
 
267 aa  144  1e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0421656  normal  0.0607667 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6755  ABC transporter related  35.37 
 
 
270 aa  144  1e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0664482 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1090  ABC transporter related  35.93 
 
 
261 aa  144  2e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1077  ATPase  36.41 
 
 
251 aa  144  2e-33  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.096527  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4341  ABC transporter related  34.93 
 
 
448 aa  144  2e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.253377 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2155  ABC transporter related  35.37 
 
 
448 aa  143  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000186456 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>