More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_1933 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_1933  ABC transporter related  100 
 
 		 238 aa  465  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.306396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4038  ABC transporter related  53.36 
 
 		 265 aa  214  9e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0203282 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0202  ABC transporter related  45 
 
 		 259 aa  170  2e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1348  ABC transporter-related protein  38.86 
 
 		 246 aa  167  1e-40  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00000000711839  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1807  ABC transporter related  47.09 
 
 		 286 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.199283  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1556  ABC transporter related protein  38.73 
 
 		 245 aa  164  1.0000000000000001e-39  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000121987  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4372  ABC transporter related  45.41 
 
 		 253 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.191075 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4848  Sigma 54 interacting domain protein  45.41 
 
 		 253 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.627338 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4264  ABC transporter related  44.3 
 
 		 255 aa  161  7e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0906906  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1308  ABC transporter related  40.5 
 
 		 252 aa  156  2e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17270  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  44.39 
 
 		 274 aa  156  3e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.115827  normal  0.528564 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2681  ABC transporter related  44.44 
 
 		 277 aa  156  3e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0408  ABC transporter related  45.21 
 
 		 259 aa  155  6e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0896853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4270  ABC transporter related  45.79 
 
 		 257 aa  154  1e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.74821  normal  0.0108203 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0087  ABC transporter related  45.88 
 
 		 263 aa  154  1e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0378  ABC transporter related  45.66 
 
 		 259 aa  154  1e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0331  ABC transporter related  45.66 
 
 		 259 aa  154  2e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3499  ABC transporter related  44.22 
 
 		 265 aa  153  2e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.14517  normal  0.695761 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0513  ABC transporter related  41.33 
 
 		 254 aa  152  5e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5133  ABC transporter related  44.88 
 
 		 266 aa  151  8e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0493  sulfonate/nitrate/taurine transport system ATP-binding  44.1 
 
 		 249 aa  151  8.999999999999999e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.187647  normal  0.442901 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  40.21 
 
 		 258 aa  151  8.999999999999999e-36  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5983  ABC transporter ATP-binding protein  44.13 
 
 		 267 aa  150  1e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.289741 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1677  ABC transporter related  40.43 
 
 		 274 aa  149  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.012686  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2188  ABC transporter related  44.29 
 
 		 260 aa  149  4e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0571708  normal  0.474002 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0441  taurine transporter ATP-binding subunit  39.53 
 
 		 255 aa  149  5e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2804  ABC transporter related protein  40.82 
 
 		 256 aa  149  5e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00228299  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3241  ABC transporter related protein  39.53 
 
 		 255 aa  148  6e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1075  ABC transporter related  42.18 
 
 		 252 aa  148  6e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.137281  normal  0.464106 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5062  ABC transporter related  40.21 
 
 		 246 aa  149  6e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.314971  normal  0.024914 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1802  ABC transporter related protein  44.88 
 
 		 267 aa  148  7e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00421209  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3339  ABC transporter related  44.61 
 
 		 260 aa  148  9e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00741331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0849  ABC transporter-related protein  41.82 
 
 		 253 aa  148  9e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0140067  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3879  ABC transporter related  44.86 
 
 		 258 aa  148  9e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.898001  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0279  taurine transporter ATP-binding subunit  39.53 
 
 		 255 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0339  putative sulfonate transport system ATP-binding protein  44.04 
 
 		 231 aa  147  1.0000000000000001e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3146  ABC transporter related  44.93 
 
 		 266 aa  147  1.0000000000000001e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.25473 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00316  taurine transporter subunit  39.07 
 
 		 255 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3841  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  39.34 
 
 		 278 aa  147  2.0000000000000003e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00320  hypothetical protein  39.07 
 
 		 255 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0395  taurine transporter ATP-binding subunit  39.07 
 
 		 255 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1163  ABC transporter related  45.77 
 
 		 257 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.119429 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1435  ABC transporter related protein  46.31 
 
 		 291 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.597503  normal  0.846861 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6201  ABC transporter related  38.84 
 
 		 245 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.102037 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3262  taurine transporter ATP-binding subunit  39.07 
 
 		 255 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0430  taurine transporter ATP-binding subunit  39.07 
 
 		 255 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3130  ABC transporter related  42.71 
 
 		 278 aa  146  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0059  ABC transporter related  36.44 
 
 		 257 aa  146  3e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5154  ABC transporter related  43.81 
 
 		 268 aa  146  3e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.597589  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0136  hypothetical protein  43.41 
 
 		 432 aa  146  3e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0121  hypothetical protein  43.41 
 
 		 432 aa  146  3e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4138  ABC transporter-like  42.99 
 
 		 255 aa  146  3e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000371805  hitchhiker  0.00945872 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0435  ABC transporter related  40.31 
 
 		 256 aa  146  3e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.30818  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0735  ABC transporter related  40.7 
 
 		 253 aa  145  4.0000000000000006e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0415182  normal  0.371016 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0723  ABC transporter related  43.96 
 
 		 251 aa  145  6e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00967662  normal  0.0967044 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3456  ABC transporter related  49.49 
 
 		 252 aa  145  6e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000578297 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1451  ABC transporter related  42.03 
 
 		 249 aa  145  7.0000000000000006e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0959261 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1979  ABC transporter related  40.78 
 
 		 258 aa  144  8.000000000000001e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000563857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1475  ABC transporter related  41.24 
 
 		 254 aa  144  8.000000000000001e-34  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0392  ABC transporter related  41.24 
 
 		 254 aa  144  9e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.238571  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4096  ABC transporter related protein  38.56 
 
 		 261 aa  144  1e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0795194 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2121  ABC transporter-related protein  43.16 
 
 		 270 aa  144  1e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0515525  normal  0.0482429 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4167  ABC transporter related  42.11 
 
 		 249 aa  144  1e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.555902 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3551  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  42.23 
 
 		 324 aa  144  2e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.375079  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2563  ABC-transport protein, ATP-binding protein  44.62 
 
 		 288 aa  143  2e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.25889 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1107  ABC transporter related  36.67 
 
 		 255 aa  143  2e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.129879 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1296  ABC transporter related  41.95 
 
 		 265 aa  143  3e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0769  ABC transporter related  42.92 
 
 		 252 aa  143  3e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.159721 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1801  ABC transporter related protein  41.58 
 
 		 267 aa  142  3e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0218  ABC transporter related  39.71 
 
 		 251 aa  142  3e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2104  ABC transporter related  41.97 
 
 		 282 aa  142  4e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0748494  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1733  ABC transporter related  46.73 
 
 		 284 aa  142  4e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5413  putative nitrate ABC transporter ATP-binding protein (ntrC/D-like protein)  40.49 
 
 		 300 aa  142  5e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.756515  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1574  ABC transporter related protein  35.27 
 
 		 236 aa  142  5e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1472  ABC transporter related  40.27 
 
 		 246 aa  142  5e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2103  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  41.79 
 
 		 263 aa  142  5e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0097031  normal  0.0581699 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0150  ABC transporter related  37.89 
 
 		 252 aa  142  5e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3870  ABC transporter related  41.75 
 
 		 267 aa  142  6e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2333  ABC transporter related protein  44.5 
 
 		 260 aa  142  6e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3876  ABC transporter related  39.18 
 
 		 297 aa  142  6e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0445  ABC transporter related  41.24 
 
 		 254 aa  142  6e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3789  ABC transporter related  45.92 
 
 		 254 aa  141  7e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0962243  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2786  ABC transporter, ATP-binding protein  40.31 
 
 		 232 aa  141  7e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0961461  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6033  putative ABC transporter, ATP-binding protein  45.73 
 
 		 261 aa  142  7e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1358  ABC transporter related  38.38 
 
 		 262 aa  141  7e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1034  ABC transporter related protein  41.9 
 
 		 272 aa  141  8e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1557  ABC transporter-like protein  46.63 
 
 		 247 aa  141  8e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2961  ABC transporter related  41.04 
 
 		 271 aa  141  8e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0491364  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2866  ABC transporter related protein  41.04 
 
 		 299 aa  141  8e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4664  ABC transporter related  40.58 
 
 		 274 aa  141  8e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.456657 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1135  ABC transporter related  42.51 
 
 		 270 aa  141  9e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.185737  normal  0.382668 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1043  ABC transporter related  42.51 
 
 		 270 aa  140  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1735  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  41.7 
 
 		 257 aa  140  9.999999999999999e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.117102  normal  0.144233 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3731  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  38.03 
 
 		 274 aa  140  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00678541  normal  0.114622 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7645  putative sulfonate ABC transporter, ATP binding protein  42.13 
 
 		 261 aa  141  9.999999999999999e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0412308  normal  0.633643 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2747  ABC transporter related  41.06 
 
 		 269 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.769453  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2014  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  42.18 
 
 		 277 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3677  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  38.03 
 
 		 274 aa  140  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24170  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  45.45 
 
 		 330 aa  141  9.999999999999999e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.505798  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21610  aliphatic sulfonates ABC transporter, ATP binding component  42.41 
 
 		 266 aa  141  9.999999999999999e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>