More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_2681 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_2681  ABC transporter related  100 
 
 
277 aa  540  1e-153  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1807  ABC transporter related  60.87 
 
 
286 aa  265  7e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.199283  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1348  ABC transporter-related protein  40.74 
 
 
246 aa  224  1e-57  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00000000711839  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1556  ABC transporter related protein  40.33 
 
 
245 aa  203  3e-51  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000121987  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4038  ABC transporter related  49.2 
 
 
265 aa  186  4e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0203282 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1802  ABC transporter related protein  47.2 
 
 
267 aa  182  7e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00421209  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1933  ABC transporter related  44.44 
 
 
238 aa  176  3e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.306396  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0209  nitrate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  43.28 
 
 
283 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.465549 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3159  ABC transporter-like  47.18 
 
 
282 aa  170  3e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2359  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  45.54 
 
 
259 aa  169  4e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.504714 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1075  ABC transporter related  42.99 
 
 
252 aa  168  9e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.137281  normal  0.464106 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2884  ABC transporter related  42.21 
 
 
263 aa  168  1e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0441  taurine transporter ATP-binding subunit  44.34 
 
 
255 aa  168  1e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3241  ABC transporter related protein  43.87 
 
 
255 aa  167  2e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0430  ABC transporter related protein  42.67 
 
 
437 aa  167  2e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2815  ABC transporter related  45.37 
 
 
241 aa  167  2e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000485223 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0395  taurine transporter ATP-binding subunit  43.4 
 
 
255 aa  166  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0430  taurine transporter ATP-binding subunit  43.4 
 
 
255 aa  166  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5009  ABC transporter related  47.69 
 
 
285 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34330  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  41.47 
 
 
262 aa  166  2.9999999999999998e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1107  ABC transporter related  44.93 
 
 
255 aa  167  2.9999999999999998e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.129879 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0408  ABC transporter related  42.91 
 
 
259 aa  166  4e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0896853  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6201  ABC transporter related  40.95 
 
 
245 aa  166  5e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.102037 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3455  ABC transporter-related protein  38.12 
 
 
254 aa  166  5e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.302044  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0279  taurine transporter ATP-binding subunit  43.4 
 
 
255 aa  166  5e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5606  ABC transporter related protein  42.52 
 
 
264 aa  165  5.9999999999999996e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.231398  normal  0.622338 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00316  taurine transporter subunit  43.4 
 
 
255 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00320  hypothetical protein  43.4 
 
 
255 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3262  taurine transporter ATP-binding subunit  43.4 
 
 
255 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4167  ABC transporter related  43.35 
 
 
249 aa  164  1.0000000000000001e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.555902 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3912  ABC transporter related  44.1 
 
 
276 aa  164  1.0000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00786464  normal  0.17343 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1403  ABC transporter related  44.22 
 
 
267 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0136  hypothetical protein  40.45 
 
 
432 aa  164  2.0000000000000002e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0121  hypothetical protein  40.45 
 
 
432 aa  164  2.0000000000000002e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5577  ABC transporter related  44.22 
 
 
262 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3136  ABC transporter related protein  43.96 
 
 
261 aa  164  2.0000000000000002e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.257722  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0285  ABC transporter related protein  44.34 
 
 
267 aa  163  3e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.120651  hitchhiker  0.0000760001 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10000  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  46.23 
 
 
241 aa  163  3e-39  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0152878  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7381  ABC transporter related  46.19 
 
 
262 aa  163  3e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2086  ABC transporter related  40.45 
 
 
291 aa  163  3e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.124601 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4523  ABC transporter related  43 
 
 
280 aa  163  3e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  42.27 
 
 
258 aa  163  3e-39  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1817  ABC transporter  43.56 
 
 
261 aa  163  3e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4208  ABC taurine transporter, ATPase subunit  42.29 
 
 
265 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.775871 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1183  ABC transporter related  42.71 
 
 
279 aa  163  4.0000000000000004e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0458641  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0150  ABC transporter related  43.35 
 
 
252 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1139  ABC transporter related  45.1 
 
 
280 aa  162  5.0000000000000005e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.573194  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2536  putative taurine ABC transporter, ATP-binding protein  43 
 
 
264 aa  162  6e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.280806  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4516  ABC transporter, ATP-binding protein  37.78 
 
 
254 aa  162  7e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4922  ABC transporter, ATP-binding protein  37.78 
 
 
254 aa  162  7e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2702  ABC transporter related  42.47 
 
 
263 aa  162  7e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2147  ABC transporter related  40.09 
 
 
274 aa  162  7e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0892  ABC transporter related  41.53 
 
 
252 aa  162  7e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0967243 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0667  ABC transporter related  46.73 
 
 
273 aa  162  7e-39  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4676  ABC transporter ATP-binding protein  37.78 
 
 
254 aa  162  8.000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5037  ABC transporter ATP-binding protein  37.78 
 
 
254 aa  162  8.000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1472  ABC transporter related  42.36 
 
 
246 aa  162  8.000000000000001e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4356  ABC transporter related  46.2 
 
 
275 aa  162  8.000000000000001e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0157567  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3116  ABC transporter related  44.17 
 
 
241 aa  161  8.000000000000001e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1764  ABC transporter related  45 
 
 
263 aa  162  8.000000000000001e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0032  ABC transporter related  35.51 
 
 
265 aa  161  9e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0508  ABC transporter related  41.85 
 
 
265 aa  161  9e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0576814 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0826  ABC transporter, ATPase subunit  44.95 
 
 
273 aa  161  9e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.617854  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0768  ABC transporter, conserved site  41.26 
 
 
432 aa  161  1e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4535  ABC transporter, ATP-binding protein  37.78 
 
 
254 aa  161  1e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5825  ABC transporter related  45.27 
 
 
256 aa  161  1e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000661116 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5154  ABC transporter related  45.88 
 
 
268 aa  161  1e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.597589  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4614  ABC transporter related  37.78 
 
 
254 aa  161  1e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14760  ABC transporter related  41.98 
 
 
248 aa  161  1e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6155  ABC transporter related  43.88 
 
 
286 aa  161  1e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.300039  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4848  Sigma 54 interacting domain protein  42.86 
 
 
253 aa  161  1e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.627338 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2951  ABC transporter, ATP-binding protein  38.89 
 
 
435 aa  160  2e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4936  ABC transporter, ATP-binding protein  37.78 
 
 
254 aa  160  2e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3867  ABC transporter related  45.12 
 
 
265 aa  160  2e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.685954  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2932  putative sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  38.97 
 
 
251 aa  160  2e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2563  ABC-transport protein, ATP-binding protein  43.94 
 
 
288 aa  160  2e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.25889 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3499  ABC transporter related  42.92 
 
 
265 aa  160  2e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.14517  normal  0.695761 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4331  alkanesulfonate ABC transporter ATP-binding protein  45 
 
 
256 aa  160  2e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4372  ABC transporter related  44.19 
 
 
253 aa  160  2e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.191075 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1900  ABC transporter related  46.67 
 
 
269 aa  160  3e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4565  taurine transporter ATP-binding subunit  43.66 
 
 
255 aa  160  3e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.739 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0513  ABC transporter related  38.89 
 
 
254 aa  159  4e-38  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0429  ABC transporter related  44.55 
 
 
313 aa  159  4e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0115377  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3960  ABC transporter related  42.65 
 
 
286 aa  159  5e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0336  ABC transporter, ATP-binding protein  37.78 
 
 
254 aa  159  5e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3325  ABC transporter related protein  47 
 
 
440 aa  159  6e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3034  ABC transporter related  45.77 
 
 
292 aa  159  6e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.652183  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1801  ABC transporter related protein  38.84 
 
 
267 aa  159  6e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1368  ABC transporter ATP-binding protein  46.27 
 
 
278 aa  159  6e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0478866 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4902  ABC transporter, ATP-binding protein  37.78 
 
 
254 aa  158  7e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2657  ABC transporter related  39.17 
 
 
254 aa  159  7e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000159789  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4264  ABC transporter related  45.33 
 
 
255 aa  159  7e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0906906  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0546  ABC transporter related  45.75 
 
 
245 aa  158  7e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9277  ABC transporter, ATPase subunit  37.86 
 
 
263 aa  158  8e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4843  putative ABC transporter ATP-binding protein  41.47 
 
 
284 aa  158  8e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.365039 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7628  ABC transporter ATP-binding protein  43.26 
 
 
281 aa  158  8e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.494067  normal  0.333376 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4929  ABC transporter-like  38.65 
 
 
278 aa  158  9e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0463  ABC transporter related  44.85 
 
 
257 aa  158  9e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.335416  normal  0.0141237 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2478  ABC transporter related  44.34 
 
 
263 aa  158  9e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.133156  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2783  ABC transporter related  36.65 
 
 
257 aa  158  9e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>