More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_5825 on replicon NC_010510
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010510  Mrad2831_5825  ABC transporter related  100 
 
 
256 aa  510  1e-144  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000661116 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2359  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  61.89 
 
 
259 aa  301  5.000000000000001e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.504714 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1352  ABC transporter related  51.1 
 
 
262 aa  219  1.9999999999999999e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5062  ABC transporter related  46.12 
 
 
246 aa  214  9.999999999999999e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.314971  normal  0.024914 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2133  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  43.31 
 
 
252 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0404  ABC transporter related protein  45.41 
 
 
261 aa  212  4.9999999999999996e-54  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0218  ABC transporter related  47.68 
 
 
251 aa  211  7.999999999999999e-54  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1831  ABC transporter related protein  48.96 
 
 
266 aa  211  1e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0849  ABC transporter-related protein  46.31 
 
 
253 aa  210  1e-53  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0140067  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2625  ABC transporter related  46.8 
 
 
267 aa  206  2e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.173465  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0445  ABC transporter related  43.85 
 
 
254 aa  206  4e-52  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5010  ABC transporter related  50.42 
 
 
263 aa  205  4e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4335  ABC transporter related protein  44.54 
 
 
247 aa  206  4e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1431  ABC transporter related  48.13 
 
 
269 aa  205  6e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.242163  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1573  ABC transporter related  47.41 
 
 
269 aa  205  6e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0230  ABC transporter related  49.34 
 
 
287 aa  205  6e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0209  ABC transporter-like  49.14 
 
 
271 aa  204  8e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0392  ABC transporter related  43.85 
 
 
254 aa  204  9e-52  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.238571  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0150  ABC transporter related  44.62 
 
 
252 aa  204  1e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5006  ABC transporter related  49.34 
 
 
287 aa  204  1e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1475  ABC transporter related  43.44 
 
 
254 aa  202  3e-51  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0378  hypothetical protein  46.25 
 
 
260 aa  203  3e-51  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  44.21 
 
 
258 aa  202  5e-51  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2147  ABC transporter related  43.03 
 
 
274 aa  202  6e-51  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3306  alkanesulfonate ABC transporter, ATP binding protein  48.35 
 
 
263 aa  202  6e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4305  ABC transporter related  46.7 
 
 
273 aa  200  1.9999999999999998e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272884  hitchhiker  0.0022322 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4591  ABC transporter related  50.22 
 
 
265 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4457  ABC transporter related  50.22 
 
 
265 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0721203  normal  0.624279 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0513  ABC transporter related  41.18 
 
 
254 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5577  ABC transporter related  47.53 
 
 
262 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08090  ABC transporter, ATP-binding component  48.91 
 
 
269 aa  198  6e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5601  ABC transporter related  43.67 
 
 
267 aa  197  1.0000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.059714  normal  0.713913 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1030  ABC transporter, ATP-binding protein  42.44 
 
 
254 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22550  ABC transporter ATP-binding protein  47.46 
 
 
255 aa  197  2.0000000000000003e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0264  ABC transporter ATP-binding protein  48.25 
 
 
279 aa  196  3e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.419692  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02330  ABC transporter ATP-binding protein  49.3 
 
 
279 aa  196  3e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.366752  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4523  ABC transporter related  45.56 
 
 
280 aa  195  5.000000000000001e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0580  ABC transporter related  44.54 
 
 
265 aa  195  6e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.860273  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0735  ABC transporter related  43.8 
 
 
253 aa  195  7e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0415182  normal  0.371016 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1909  ABC transporter related  47.71 
 
 
286 aa  195  7e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1075  ABC transporter related  44.18 
 
 
252 aa  195  7e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.137281  normal  0.464106 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3867  ABC transporter related  47.58 
 
 
265 aa  195  7e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.685954  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2080  ABC transporter related  47.16 
 
 
270 aa  195  7e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4936  ABC transporter related protein  46.88 
 
 
278 aa  193  3e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0551994  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2544  ABC transporter  44.1 
 
 
269 aa  192  4e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.569384  normal  0.531117 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4059  ABC transporter related  44.1 
 
 
276 aa  192  4e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0679  ABC transporter related  46.96 
 
 
244 aa  192  4e-48  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0882795 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4149  ABC transporter related  47.03 
 
 
266 aa  192  5e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0621662 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2718  ABC transporter related  44.13 
 
 
259 aa  192  6e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2157  sulfate ester ABC transporter ATPase  44.44 
 
 
288 aa  192  6e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0499335  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1691  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  48.58 
 
 
280 aa  191  8e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0162641  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2064  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  46.84 
 
 
281 aa  191  9e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.768493  normal  0.657795 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7165  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  42.86 
 
 
263 aa  191  1e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0408  ABC transporter related  44.72 
 
 
262 aa  191  1e-47  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.468128  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1759  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  46.61 
 
 
275 aa  191  1e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.352483  hitchhiker  0.00557552 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0550  ABC transporter related  48.33 
 
 
276 aa  191  1e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.589055  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6544  putative ABC transporter  43.04 
 
 
259 aa  191  1e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.353316 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1979  ABC transporter related  43.61 
 
 
258 aa  191  1e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000563857  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0087  ABC transporter related  42.26 
 
 
263 aa  191  1e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4356  ABC transporter related  46.26 
 
 
275 aa  191  1e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0157567  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3808  ABC transporter-related protein  48.37 
 
 
271 aa  191  1e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3083  ABC transporter related  42.62 
 
 
306 aa  190  2e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.724622  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3892  ABC transporter related  47.97 
 
 
271 aa  190  2e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2857  ABC transporter-related protein  44.13 
 
 
259 aa  190  2e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.99142  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4331  alkanesulfonate ABC transporter ATP-binding protein  41.04 
 
 
256 aa  190  2e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3034  ABC transporter related  44.64 
 
 
292 aa  190  2e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.652183  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2802  ABC transporter related protein  45 
 
 
260 aa  190  2e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0677  ABC transporter related  42.74 
 
 
262 aa  189  2.9999999999999997e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.28609 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1857  ABC transporter related  46.3 
 
 
304 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4096  ABC transporter related protein  46.09 
 
 
261 aa  189  2.9999999999999997e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0795194 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3676  ABC transporter related  46.81 
 
 
266 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.618015 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4338  ABC transporter related  46.81 
 
 
271 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0282  ABC transporter related  48.7 
 
 
244 aa  189  4e-47  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.686525  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4565  ABC transporter related  45.6 
 
 
281 aa  189  5e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4837  ABC transporter related  50.43 
 
 
263 aa  189  5e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.856491 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1428  ABC transporter related  43.67 
 
 
267 aa  188  7e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.250833  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3751  ABC transporter, ATPase subunit  47.97 
 
 
271 aa  188  7e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2099  ABC transporter related  43.59 
 
 
298 aa  188  7e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3505  ABC transporter related  45.15 
 
 
281 aa  188  9e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.870495  hitchhiker  0.000930317 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4114  ABC transporter related  46.19 
 
 
273 aa  188  9e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.406402  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4252  ABC transporter related  46.19 
 
 
273 aa  188  9e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0391855  normal  0.0823186 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8276  ABC-type transporter, ATP-binding protein  45.98 
 
 
264 aa  187  1e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0769  ABC transporter related  49.78 
 
 
252 aa  187  2e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.159721 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3130  ABC transporter related  42.47 
 
 
278 aa  187  2e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5606  ABC transporter related protein  42.15 
 
 
264 aa  187  2e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.231398  normal  0.622338 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2775  ABC transporter related  47.46 
 
 
268 aa  187  2e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4347  ABC transporter related  45.15 
 
 
281 aa  187  2e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2311  putative sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  39.22 
 
 
251 aa  186  2e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.89952  hitchhiker  0.0000000038093 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4019  ABC transporter related  45.15 
 
 
281 aa  187  2e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11500  ABC transporter related  41.28 
 
 
257 aa  186  3e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000319747  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7233  ABC transporter related  45.79 
 
 
285 aa  186  3e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.373776  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2057  ABC transporter related  45.53 
 
 
280 aa  186  3e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1733  ABC transporter related protein  41.39 
 
 
265 aa  186  4e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3265  ABC transporter related  45.76 
 
 
273 aa  186  4e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.745893  normal  0.952951 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3458  ABC transporter related  45.45 
 
 
260 aa  186  4e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.914516  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5516  ABC transporter related  41.7 
 
 
271 aa  186  4e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.25838  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3269  ABC transporter related  48.4 
 
 
263 aa  185  5e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.874896 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1899  ABC transporter-related protein  39.42 
 
 
264 aa  185  6e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.126966  hitchhiker  0.000000000000779353 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1183  ABC transporter related  42.13 
 
 
279 aa  185  6e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0458641  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1965  ABC transporter, ATP-binding protein  42.37 
 
 
434 aa  185  6e-46  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>