More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_4837 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_4837  ABC transporter related  100 
 
 
263 aa  504  9.999999999999999e-143  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.856491 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4901  ABC transporter related  83.77 
 
 
265 aa  398  9.999999999999999e-111  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1327  ABC transporter related  85.54 
 
 
266 aa  384  1e-106  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.193146  normal  0.338067 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1167  ABC transporter related  85.14 
 
 
266 aa  383  1e-105  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.259654  normal  0.174224 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2688  ABC transporter related  67.31 
 
 
264 aa  341  5.999999999999999e-93  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.232656  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5010  ABC transporter related  68.08 
 
 
263 aa  338  5e-92  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2775  ABC transporter related  72.96 
 
 
268 aa  335  5.999999999999999e-91  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3306  alkanesulfonate ABC transporter, ATP binding protein  67.19 
 
 
263 aa  332  3e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2904  ABC transporter related  66.4 
 
 
270 aa  332  4e-90  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2221  ABC transporter-related protein  69.64 
 
 
262 aa  329  3e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000225021  normal  0.260255 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2057  ABC transporter related  67.73 
 
 
280 aa  329  3e-89  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2164  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  65.41 
 
 
276 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4591  ABC transporter related  65 
 
 
265 aa  323  2e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4149  ABC transporter related  67.94 
 
 
266 aa  323  2e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0621662 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4457  ABC transporter related  65 
 
 
265 aa  323  2e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0721203  normal  0.624279 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2673  ABC transporter related  65.89 
 
 
262 aa  323  2e-87  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3676  ABC transporter related  67.56 
 
 
266 aa  320  9.999999999999999e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.618015 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3867  ABC transporter related  65 
 
 
265 aa  319  3e-86  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.685954  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0116  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  65.35 
 
 
276 aa  318  5e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1759  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  68.57 
 
 
275 aa  316  2e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.352483  hitchhiker  0.00557552 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4114  ABC transporter related  66.42 
 
 
273 aa  316  2e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.406402  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4252  ABC transporter related  66.42 
 
 
273 aa  316  2e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0391855  normal  0.0823186 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3265  ABC transporter related  66.42 
 
 
273 aa  316  3e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.745893  normal  0.952951 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31130  ABC transporter ATP binding protein  68.4 
 
 
264 aa  314  9.999999999999999e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.098287  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4338  ABC transporter related  67.76 
 
 
271 aa  309  2.9999999999999997e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3269  ABC transporter related  62 
 
 
263 aa  300  1e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.874896 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5619  ABC transporter related  67.92 
 
 
278 aa  293  2e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.406047 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0859  ABC transporter related  63.07 
 
 
258 aa  271  6e-72  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0340597  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4843  putative ABC transporter ATP-binding protein  55.29 
 
 
284 aa  258  6e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.365039 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1979  ABC transporter related  49.59 
 
 
258 aa  251  1e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000563857  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0378  hypothetical protein  48.54 
 
 
260 aa  245  4.9999999999999997e-64  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1075  ABC transporter related  49.19 
 
 
252 aa  245  6.999999999999999e-64  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.137281  normal  0.464106 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1358  ABC transporter related  48.56 
 
 
262 aa  244  9.999999999999999e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3352  ABC transporter related  49.61 
 
 
261 aa  242  6e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1975  ABC transporter related  48.98 
 
 
263 aa  239  2e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000056178  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0218  ABC transporter related  48.54 
 
 
251 aa  240  2e-62  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1572  ABC transporter related protein  46.86 
 
 
267 aa  239  2.9999999999999997e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7199  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (nitrate/sulfonates)  50.41 
 
 
278 aa  238  8e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0286852  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3458  ABC transporter related  50.4 
 
 
260 aa  238  1e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.914516  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1919  ABC transporter related  49.55 
 
 
265 aa  236  2e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0849  ABC transporter-related protein  48.16 
 
 
253 aa  236  3e-61  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0140067  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2936  ABC transporter related  47.54 
 
 
250 aa  235  4e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1030  ABC transporter, ATP-binding protein  48.29 
 
 
254 aa  234  7e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1352  ABC transporter related  54.04 
 
 
262 aa  234  8e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1899  ABC transporter-related protein  48.13 
 
 
264 aa  234  9e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.126966  hitchhiker  0.000000000000779353 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22550  ABC transporter ATP-binding protein  51.05 
 
 
255 aa  233  3e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3882  ABC transporter related  47.48 
 
 
259 aa  232  5e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  41.87 
 
 
258 aa  232  6e-60  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4887  ABC transporter related  50.6 
 
 
259 aa  229  2e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.546298  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0735  ABC transporter related  46.5 
 
 
253 aa  230  2e-59  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0415182  normal  0.371016 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1831  ABC transporter related protein  49.38 
 
 
266 aa  230  2e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2099  ABC transporter related  51.67 
 
 
298 aa  229  3e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3066  ABC transporter related protein  47.41 
 
 
267 aa  229  3e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.583352  normal  0.320404 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1733  ABC transporter related protein  46.28 
 
 
265 aa  229  3e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0467  ABC transporter related  49.13 
 
 
274 aa  229  3e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2804  ABC transporter related protein  43.93 
 
 
256 aa  229  3e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00228299  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2133  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  44.08 
 
 
252 aa  228  7e-59  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0677  ABC transporter related  47.2 
 
 
262 aa  228  1e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.28609 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6457  ABC transporter ATP-binding protein  48.36 
 
 
261 aa  227  2e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4565  ABC transporter related  50.41 
 
 
281 aa  226  3e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5062  ABC transporter related  46.53 
 
 
246 aa  225  5.0000000000000005e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.314971  normal  0.024914 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2064  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  51.03 
 
 
281 aa  225  6e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.768493  normal  0.657795 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0580  ABC transporter related  45.38 
 
 
265 aa  225  7e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.860273  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1431  ABC transporter related  49.79 
 
 
269 aa  223  2e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.242163  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1168  putative ABC transporter, ATP-binding protein  46.79 
 
 
275 aa  224  2e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4331  alkanesulfonate ABC transporter ATP-binding protein  47.18 
 
 
256 aa  223  2e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1909  ABC transporter related  50.88 
 
 
286 aa  223  2e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7233  ABC transporter related  49.17 
 
 
285 aa  223  2e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.373776  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0572  ABC transporter related  45.08 
 
 
269 aa  223  3e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4347  ABC transporter related  50.21 
 
 
281 aa  223  3e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4019  ABC transporter related  50.21 
 
 
281 aa  223  3e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1183  ABC transporter related  43.1 
 
 
279 aa  223  3e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0458641  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2643  ABC transporter related  47.14 
 
 
261 aa  223  3e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.430112  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3159  ABC transporter-like  53.36 
 
 
282 aa  222  4e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0513  ABC transporter related  41 
 
 
254 aa  222  4.9999999999999996e-57  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0792  ABC transporter related protein  45.08 
 
 
308 aa  222  4.9999999999999996e-57  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2157  sulfate ester ABC transporter ATPase  51.65 
 
 
288 aa  222  6e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0499335  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3505  ABC transporter related  49.79 
 
 
281 aa  221  6e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.870495  hitchhiker  0.000930317 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2954  ABC transporter related  47.48 
 
 
272 aa  221  6e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2625  ABC transporter related  49.02 
 
 
267 aa  220  9.999999999999999e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.173465  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0435  ABC transporter related  42.98 
 
 
256 aa  220  9.999999999999999e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.30818  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1857  ABC transporter related  48.73 
 
 
304 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0147  ABC transporter related  46.03 
 
 
259 aa  220  1.9999999999999999e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.288686 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0131  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  47.95 
 
 
281 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4216  ABC transporter related  49.38 
 
 
256 aa  220  1.9999999999999999e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0087  ABC transporter related  44.67 
 
 
263 aa  219  3e-56  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3870  ABC transporter related  49.16 
 
 
272 aa  219  3e-56  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1645  ABC transporter related  44.13 
 
 
253 aa  219  3.9999999999999997e-56  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02330  ABC transporter ATP-binding protein  50.21 
 
 
279 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.366752  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1561  ABC transporter related  49.37 
 
 
291 aa  219  5e-56  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000732497 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0282  ABC transporter related  53.67 
 
 
244 aa  218  6e-56  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.686525  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0209  ABC transporter-like  47.7 
 
 
271 aa  218  6e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4539  ABC transporter related  45.68 
 
 
256 aa  218  7.999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.113352 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4929  ABC transporter-like  47.77 
 
 
278 aa  217  1e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1045  ABC transporter related  47.74 
 
 
259 aa  218  1e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.162928  normal  0.159703 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2086  ABC transporter related  50.21 
 
 
291 aa  218  1e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.124601 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1258  ABC transporter related  49.34 
 
 
244 aa  217  1e-55  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6389  ABC transporter related  46.09 
 
 
256 aa  217  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.350257  normal  0.506492 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0230  ABC transporter related  48.12 
 
 
287 aa  216  2e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1475  ABC transporter related  41.84 
 
 
254 aa  217  2e-55  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>