More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_4167 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_4167  ABC transporter related  100 
 
 		 249 aa  490  9.999999999999999e-139  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.555902 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0493  sulfonate/nitrate/taurine transport system ATP-binding  64.63 
 
 		 249 aa  301  5.000000000000001e-81  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.187647  normal  0.442901 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1451  ABC transporter related  65.85 
 
 		 249 aa  299  4e-80  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0959261 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1556  ABC transporter related protein  40.95 
 
 		 245 aa  185  7e-46  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000121987  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1348  ABC transporter-related protein  40 
 
 		 246 aa  171  7.999999999999999e-42  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00000000711839  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4038  ABC transporter related  51.27 
 
 		 265 aa  171  1e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0203282 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2681  ABC transporter related  43.35 
 
 		 277 aa  156  2e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1807  ABC transporter related  46.46 
 
 		 286 aa  155  7e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.199283  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1933  ABC transporter related  42.11 
 
 		 238 aa  155  8e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.306396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0892  ABC transporter related  42.58 
 
 		 252 aa  150  2e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0967243 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0779  ABC transporter related  45.15 
 
 		 249 aa  146  3e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3412  ABC transporter related protein  40.61 
 
 		 258 aa  146  3e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0571  ABC transporter related  44.21 
 
 		 267 aa  144  9e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.260264  normal  0.332215 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0243  ABC transporter related  34.88 
 
 		 240 aa  144  1e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.498468  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4902  ABC transporter, ATP-binding protein  36.77 
 
 		 254 aa  144  1e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4936  ABC transporter, ATP-binding protein  36.77 
 
 		 254 aa  144  2e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4676  ABC transporter ATP-binding protein  36.77 
 
 		 254 aa  144  2e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4535  ABC transporter, ATP-binding protein  36.77 
 
 		 254 aa  143  2e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0336  ABC transporter, ATP-binding protein  36.32 
 
 		 254 aa  143  2e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5037  ABC transporter ATP-binding protein  36.77 
 
 		 254 aa  144  2e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4614  ABC transporter related  36.77 
 
 		 254 aa  143  3e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2786  ABC transporter, ATP-binding protein  42.58 
 
 		 232 aa  142  4e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0961461  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4057  ABC transporter related  40.16 
 
 		 288 aa  142  4e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.170324 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3900  ABC transporter related  39.72 
 
 		 228 aa  142  6e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2947  ABC transporter related  40.76 
 
 		 356 aa  141  8e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.196762  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4516  ABC transporter, ATP-binding protein  36.32 
 
 		 254 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3731  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  39.46 
 
 		 274 aa  141  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00678541  normal  0.114622 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0571  ABC transporter related  43.23 
 
 		 271 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.750725  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2273  ABC transporter related  40.85 
 
 		 275 aa  140  9.999999999999999e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4922  ABC transporter, ATP-binding protein  36.32 
 
 		 254 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0059  ABC transporter related  41.36 
 
 		 257 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2866  ABC transporter related protein  39.11 
 
 		 299 aa  140  1.9999999999999998e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1199  ABC transporter ATP-binding protein  40.85 
 
 		 270 aa  139  3e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.621607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2104  ABC transporter related  39.91 
 
 		 282 aa  139  3e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0748494  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1539  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  40.5 
 
 		 264 aa  139  3e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2121  ABC transporter-related protein  40.38 
 
 		 270 aa  140  3e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0515525  normal  0.0482429 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3677  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  39.01 
 
 		 274 aa  139  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1135  ABC transporter related  42.78 
 
 		 270 aa  139  3.9999999999999997e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.185737  normal  0.382668 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2066  ABC transporter related protein  36.41 
 
 		 244 aa  139  4.999999999999999e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.572481  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1043  ABC transporter related  42.78 
 
 		 270 aa  139  6e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3455  ABC transporter-related protein  35.11 
 
 		 254 aa  138  7.999999999999999e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.302044  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4329  ABC transporter related  39.92 
 
 		 243 aa  137  1e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.413281  normal  0.920294 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0392  ABC transporter related  36.45 
 
 		 254 aa  137  1e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.238571  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1264  ABC transporter ATP-binding protein  40.93 
 
 		 284 aa  137  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.150023 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0876  ABC transporter related  35.2 
 
 		 218 aa  137  2e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2164  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  38.46 
 
 		 276 aa  137  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4664  ABC transporter related  38.1 
 
 		 274 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.456657 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1677  ABC transporter related  40 
 
 		 274 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.012686  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2514  ABC transporter  43.84 
 
 		 237 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.36817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0658  ABC transporter, ATP-binding protein  37.56 
 
 		 245 aa  136  3.0000000000000003e-31  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7481  ABC transporter ATP-binding protein  41.24 
 
 		 267 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0421656  normal  0.0607667 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2563  ABC-transport protein, ATP-binding protein  41.98 
 
 		 288 aa  135  4e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.25889 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1975  ABC transporter related  37 
 
 		 263 aa  136  4e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000056178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1472  ABC transporter related  37.96 
 
 		 246 aa  136  4e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2014  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  38.21 
 
 		 277 aa  135  4e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1308  ABC transporter related  34.76 
 
 		 252 aa  135  4e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2783  ABC transporter related  36.63 
 
 		 257 aa  135  5e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0157  ABC transporter related  30.36 
 
 		 246 aa  135  5e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.624067  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0162  ABC transporter related  30.36 
 
 		 246 aa  135  5e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3642  ABC transporter related  39.61 
 
 		 239 aa  135  5e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000649736  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0202  ABC transporter related  39.8 
 
 		 259 aa  135  7.000000000000001e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5824  ABC transporter related  38.82 
 
 		 271 aa  135  9e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.971522  normal  0.461602 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02140  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  39.89 
 
 		 272 aa  134  9.999999999999999e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  34.29 
 
 		 258 aa  134  9.999999999999999e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5550  ABC transporter, ATP-binding protein  37.6 
 
 		 434 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1680  ABC transporter ATP-binding protein  40.55 
 
 		 249 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.391829  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1505  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  41.15 
 
 		 262 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0234474  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0332  ABC transporter, ATPase subunit  42.63 
 
 		 267 aa  134  9.999999999999999e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5515  ABC transporter related  40.67 
 
 		 278 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3339  ABC transporter related  42.71 
 
 		 260 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00741331  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4034  ABC transporter related  39.13 
 
 		 276 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.105857 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2449  ABC transporter related  38.57 
 
 		 255 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.259885 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0800  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  39.15 
 
 		 276 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.872437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0259  ABC transporter related  41.67 
 
 		 270 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.511865 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3186  ABC transporter-related protein  38.98 
 
 		 448 aa  134  9.999999999999999e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.19185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0513  ABC transporter related  35.05 
 
 		 254 aa  134  9.999999999999999e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3188  putative ABC transporter ATP-binding protein  38.39 
 
 		 378 aa  134  9.999999999999999e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0467  ABC transporter related  42.93 
 
 		 274 aa  133  1.9999999999999998e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0327  ABC transporter related  42.86 
 
 		 264 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.341199  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1475  ABC transporter related  35.51 
 
 		 254 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6521  ABC transporter related  43.2 
 
 		 270 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1967  ABC-type nitrate transporter, ATP-binding protein  37.95 
 
 		 293 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.528623  normal  0.207247 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6755  ABC transporter related  43.2 
 
 		 270 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0664482 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7503  ABC transporter ATP-binding protein  39.5 
 
 		 257 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.704278 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6245  ABC transporter related  38.42 
 
 		 272 aa  133  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0101  nitrate/nitrite/cyanate ABC transporter ATPase  38.1 
 
 		 264 aa  133  3e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.435899  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0378  ABC transporter related  40.84 
 
 		 259 aa  133  3e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19520  ABC transporter ATP-binding protein  40.09 
 
 		 249 aa  133  3e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0331  ABC transporter related  40.31 
 
 		 259 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0445  ABC transporter related  35.51 
 
 		 254 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5090  ABC transporter  37.19 
 
 		 433 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1869  ABC transporter related  38.86 
 
 		 357 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.443333 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0590  ABC transporter related protein  35.59 
 
 		 263 aa  132  3.9999999999999996e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2673  ABC transporter related  39.42 
 
 		 262 aa  132  5e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7505  ABC transporter, ATPase subunit  41.83 
 
 		 273 aa  132  5e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000247297  normal  0.575396 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2747  ABC transporter related  39.17 
 
 		 269 aa  132  5e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.769453  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3269  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  37.56 
 
 		 270 aa  132  5e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.454908  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1817  ABC transporter  35.06 
 
 		 261 aa  132  5e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4511  ABC transporter related  38.86 
 
 		 356 aa  132  5e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17270  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  42.39 
 
 		 274 aa  132  5e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.115827  normal  0.528564 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>