More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_1451 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_1451  ABC transporter related  100 
 
 		 249 aa  491  9.999999999999999e-139  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0959261 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0493  sulfonate/nitrate/taurine transport system ATP-binding  85.94 
 
 		 249 aa  409  1e-113  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.187647  normal  0.442901 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4167  ABC transporter related  65.85 
 
 		 249 aa  299  3e-80  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.555902 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4038  ABC transporter related  46.85 
 
 		 265 aa  172  3.9999999999999995e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0203282 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1556  ABC transporter related protein  36.21 
 
 		 245 aa  165  6.9999999999999995e-40  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000121987  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1348  ABC transporter-related protein  37.37 
 
 		 246 aa  160  1e-38  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00000000711839  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1807  ABC transporter related  41.63 
 
 		 286 aa  157  1e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.199283  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4664  ABC transporter related  40.67 
 
 		 274 aa  154  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.456657 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1933  ABC transporter related  42.03 
 
 		 238 aa  152  5e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.306396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7381  ABC transporter related  45.13 
 
 		 262 aa  151  8e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17270  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  40.67 
 
 		 274 aa  150  1e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.115827  normal  0.528564 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1539  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  44.23 
 
 		 264 aa  150  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5154  ABC transporter related  45.45 
 
 		 268 aa  150  2e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.597589  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9277  ABC transporter, ATPase subunit  39.92 
 
 		 263 aa  150  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1075  ABC transporter related  42.92 
 
 		 252 aa  150  2e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.137281  normal  0.464106 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0876  ABC transporter related  33.5 
 
 		 218 aa  149  6e-35  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1034  ABC transporter related protein  39.44 
 
 		 272 aa  148  9e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1077  ABC transporter related  43.66 
 
 		 382 aa  145  5e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0202  ABC transporter related  41.79 
 
 		 259 aa  145  5e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3339  ABC transporter related  43.35 
 
 		 260 aa  145  6e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00741331  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1975  ABC transporter related  39.52 
 
 		 263 aa  145  8.000000000000001e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000056178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3876  ABC transporter related  37.04 
 
 		 297 aa  144  9e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0384  ABC transporter related  42.65 
 
 		 288 aa  144  9e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.317269  normal  0.323719 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2681  ABC transporter related  45.45 
 
 		 277 aa  144  1e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1645  ABC transporter related  44.39 
 
 		 253 aa  144  1e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1173  ABC transporter related  42.79 
 
 		 253 aa  144  1e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.628732  normal  0.131881 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1817  ABC transporter  37.45 
 
 		 261 aa  143  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0346  ABC transporter related  41.27 
 
 		 278 aa  144  2e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0849  ABC transporter-related protein  38.7 
 
 		 253 aa  144  2e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0140067  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3188  putative ABC transporter ATP-binding protein  40.87 
 
 		 378 aa  142  3e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4057  ABC transporter related  42.53 
 
 		 288 aa  142  3e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.170324 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3808  ABC transporter-related protein  38.11 
 
 		 271 aa  142  4e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0863  ABC transporter-related protein  39.74 
 
 		 342 aa  142  4e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3892  ABC transporter related  39.74 
 
 		 271 aa  142  5e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0445  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  42.86 
 
 		 362 aa  142  5e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.369014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4511  ABC transporter related  40.72 
 
 		 356 aa  142  5e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3512  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  43.33 
 
 		 362 aa  142  5e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0362101  normal  0.0791586 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0551  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  33.77 
 
 		 236 aa  142  5e-33  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.978201  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1030  ABC transporter, ATP-binding protein  39.06 
 
 		 254 aa  142  6e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02140  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  39.52 
 
 		 272 aa  142  6e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4642  ABC transporter related  36.55 
 
 		 284 aa  142  6e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.842575  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4509  ABC transporter related  43.85 
 
 		 267 aa  142  7e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1677  ABC transporter related  39.23 
 
 		 274 aa  141  8e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.012686  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3570  ABC transporter related  45.05 
 
 		 265 aa  141  8e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.476626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0892  ABC transporter related  40.57 
 
 		 252 aa  141  8e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0967243 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3784  ABC transporter related  39.11 
 
 		 265 aa  141  8e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.15686 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7050  ABC transporter related  42.31 
 
 		 356 aa  141  8e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.348083 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0104  ABC transporter related  41.06 
 
 		 260 aa  141  9e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.464024  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1170  taurine ABC transporter ATP-binding protein  41.9 
 
 		 263 aa  141  9e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.9171  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1505  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  41.56 
 
 		 262 aa  140  9.999999999999999e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0234474  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7503  ABC transporter ATP-binding protein  42.57 
 
 		 257 aa  141  9.999999999999999e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.704278 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1899  ABC transporter-related protein  41.8 
 
 		 264 aa  140  9.999999999999999e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.126966  hitchhiker  0.000000000000779353 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4936  ABC transporter related protein  37.98 
 
 		 278 aa  141  9.999999999999999e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0551994  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2449  ABC transporter related  43.32 
 
 		 255 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.259885 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2866  ABC transporter related protein  40.21 
 
 		 299 aa  141  9.999999999999999e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1435  ABC transporter related protein  41.9 
 
 		 291 aa  141  9.999999999999999e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.597503  normal  0.846861 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1733  ABC transporter related protein  38.14 
 
 		 265 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2741  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  40.76 
 
 		 360 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1788  ABC transporter related  38.06 
 
 		 303 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2628  sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  41.51 
 
 		 270 aa  140  1.9999999999999998e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.197945  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0467  ABC transporter related  44.21 
 
 		 274 aa  140  1.9999999999999998e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3751  ABC transporter, ATPase subunit  39.3 
 
 		 271 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0087  ABC transporter related  38.46 
 
 		 263 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2712  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  43.6 
 
 		 363 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.12421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2791  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  40.76 
 
 		 360 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3034  ABC transporter related  44.21 
 
 		 292 aa  140  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.652183  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2275  ABC transporter related  42.86 
 
 		 273 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.753386  normal  0.352835 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3212  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  40.76 
 
 		 360 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.504672  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1763  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  40.76 
 
 		 360 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1691  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  40.43 
 
 		 280 aa  139  3e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0162641  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4291  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  39.81 
 
 		 351 aa  140  3e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.603453 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27180  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  36.24 
 
 		 261 aa  140  3e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.785325  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0301  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  42.38 
 
 		 361 aa  140  3e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5983  ABC transporter ATP-binding protein  40.52 
 
 		 267 aa  140  3e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.289741 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3551  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  38.83 
 
 		 324 aa  139  3.9999999999999997e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.375079  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0326  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  42.38 
 
 		 361 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.808152 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2621  ABC transporter related  41.56 
 
 		 245 aa  139  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.585434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3694  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  43.81 
 
 		 360 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0826  ABC transporter, ATPase subunit  43 
 
 		 273 aa  139  3.9999999999999997e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.617854  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3281  ABC transporter related  41.92 
 
 		 261 aa  139  3.9999999999999997e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2582  ABC transporter related  41.56 
 
 		 245 aa  139  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.799893  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3499  ABC transporter related  41.83 
 
 		 265 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.14517  normal  0.695761 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1308  ABC transporter related  35.96 
 
 		 252 aa  139  3.9999999999999997e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2627  ABC transporter related  41.56 
 
 		 245 aa  139  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0950652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3752  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  43.81 
 
 		 360 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2649  ABC transporter related  41.63 
 
 		 381 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3722  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  43.81 
 
 		 360 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.469771  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3778  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  41.98 
 
 		 328 aa  139  4.999999999999999e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4050  ABC transporter related  40.27 
 
 		 289 aa  139  4.999999999999999e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.95226  normal  0.382919 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0713  ABC transporter related protein  38.85 
 
 		 265 aa  139  4.999999999999999e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.423437  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0317  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  42.38 
 
 		 361 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5375  ABC transporter related  40 
 
 		 387 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0766723  normal  0.734389 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6033  putative ABC transporter, ATP-binding protein  39.46 
 
 		 261 aa  139  6e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3694  taurine transporter ATP-binding subunit  37.44 
 
 		 255 aa  139  6e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3731  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  39.45 
 
 		 274 aa  139  6e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00678541  normal  0.114622 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3937  taurine transporter ATP-binding subunit  37.44 
 
 		 255 aa  139  6e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0259  taurine transporter ATP-binding subunit  37.44 
 
 		 255 aa  139  6e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1210  ABC transporter related  41.96 
 
 		 287 aa  139  6e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.502786  normal  0.459492 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0122  ABC transporter related  38.03 
 
 		 347 aa  138  7e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.617953  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3035  ABC transporter related  42.5 
 
 		 255 aa  138  7e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>