More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_4038 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_4038  ABC transporter related  100 
 
 		 265 aa  499  1e-140  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0203282 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1933  ABC transporter related  53.81 
 
 		 238 aa  231  1e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.306396  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1807  ABC transporter related  51.65 
 
 		 286 aa  204  1e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.199283  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2681  ABC transporter related  49.2 
 
 		 277 aa  191  2e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1348  ABC transporter-related protein  37.13 
 
 		 246 aa  186  4e-46  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00000000711839  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5154  ABC transporter related  49.3 
 
 		 268 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.597589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3339  ABC transporter related  47.21 
 
 		 260 aa  180  2e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00741331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1451  ABC transporter related  45.65 
 
 		 249 aa  181  2e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0959261 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0441  taurine transporter ATP-binding subunit  45.58 
 
 		 255 aa  178  7e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0493  sulfonate/nitrate/taurine transport system ATP-binding  44.59 
 
 		 249 aa  177  2e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.187647  normal  0.442901 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00316  taurine transporter subunit  44.65 
 
 		 255 aa  175  6e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3262  taurine transporter ATP-binding subunit  44.65 
 
 		 255 aa  175  6e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00320  hypothetical protein  44.65 
 
 		 255 aa  175  6e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0876  ABC transporter related  37.22 
 
 		 218 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3499  ABC transporter related  48.02 
 
 		 265 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.14517  normal  0.695761 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0279  taurine transporter ATP-binding subunit  44.65 
 
 		 255 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3241  ABC transporter related protein  44.65 
 
 		 255 aa  173  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2188  ABC transporter related  46.96 
 
 		 260 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0571708  normal  0.474002 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0395  taurine transporter ATP-binding subunit  44.19 
 
 		 255 aa  172  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0430  taurine transporter ATP-binding subunit  44.19 
 
 		 255 aa  172  5.999999999999999e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4167  ABC transporter related  51.27 
 
 		 249 aa  171  9e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.555902 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9277  ABC transporter, ATPase subunit  45.45 
 
 		 263 aa  171  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0839  taurine transporter ATP-binding subunit  46.76 
 
 		 255 aa  171  1e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.266417 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4264  ABC transporter related  46.15 
 
 		 255 aa  168  1e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0906906  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0327  ABC transporter related  47.69 
 
 		 264 aa  167  2e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.341199  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0202  ABC transporter related  45.74 
 
 		 259 aa  167  2e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4096  ABC transporter related protein  46.83 
 
 		 261 aa  166  2.9999999999999998e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0795194 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0378  ABC transporter related  45.18 
 
 		 259 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0282  ABC transporter related  44.55 
 
 		 244 aa  166  4e-40  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.686525  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6201  ABC transporter related  40.51 
 
 		 245 aa  166  5e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.102037 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1107  ABC transporter related  43.75 
 
 		 255 aa  165  5.9999999999999996e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.129879 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0331  ABC transporter related  44.74 
 
 		 259 aa  165  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0408  ABC transporter related  46.19 
 
 		 259 aa  165  8e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0896853  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3136  ABC transporter related protein  48.97 
 
 		 261 aa  165  9e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.257722  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4848  Sigma 54 interacting domain protein  46.4 
 
 		 253 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.627338 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1556  ABC transporter related protein  35.66 
 
 		 245 aa  164  1.0000000000000001e-39  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000121987  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1030  ABC transporter, ATP-binding protein  43.75 
 
 		 254 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0150  ABC transporter related  45.16 
 
 		 252 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4372  ABC transporter related  46.4 
 
 		 253 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.191075 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5800  ABC transporter related  44.6 
 
 		 284 aa  163  2.0000000000000002e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0463  ABC transporter related  46.89 
 
 		 257 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.335416  normal  0.0141237 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2449  ABC transporter related  47.12 
 
 		 255 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.259885 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2563  ABC-transport protein, ATP-binding protein  47.6 
 
 		 288 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.25889 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1075  ABC transporter related  45.85 
 
 		 252 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.137281  normal  0.464106 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4335  ABC transporter related protein  45.5 
 
 		 247 aa  163  3e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5606  ABC transporter related protein  42.36 
 
 		 264 aa  163  3e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.231398  normal  0.622338 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0190  ABC transporter related  44.04 
 
 		 244 aa  163  3e-39  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0849  ABC transporter-related protein  46.27 
 
 		 253 aa  163  3e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0140067  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3867  ABC transporter related  49.27 
 
 		 265 aa  162  4.0000000000000004e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.685954  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0735  ABC transporter related  42.99 
 
 		 253 aa  162  5.0000000000000005e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0415182  normal  0.371016 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1163  ABC transporter related  46.72 
 
 		 257 aa  162  6e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.119429 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1358  ABC transporter related  40.49 
 
 		 262 aa  162  7e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1979  ABC transporter related  44.34 
 
 		 258 aa  162  7e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000563857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5009  ABC transporter related  45.54 
 
 		 285 aa  161  8.000000000000001e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0209  nitrate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  47.57 
 
 		 283 aa  161  9e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.465549 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17270  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  44.23 
 
 		 274 aa  161  9e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.115827  normal  0.528564 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0087  ABC transporter related  43.38 
 
 		 263 aa  161  1e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4338  ABC transporter related  47 
 
 		 271 aa  161  1e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1308  ABC transporter related  39.71 
 
 		 252 aa  160  1e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1801  ABC transporter related protein  43.12 
 
 		 267 aa  160  2e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1764  ABC transporter related  49.28 
 
 		 263 aa  160  2e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4642  ABC transporter related  45.88 
 
 		 284 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.842575  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3694  taurine transporter ATP-binding subunit  44.39 
 
 		 255 aa  160  2e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1802  ABC transporter related protein  46.54 
 
 		 267 aa  160  2e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00421209  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0259  taurine transporter ATP-binding subunit  44.39 
 
 		 255 aa  160  2e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3937  taurine transporter ATP-binding subunit  44.39 
 
 		 255 aa  160  2e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1900  ABC transporter related  45.41 
 
 		 269 aa  160  2e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0833  ABC transporter related  47.66 
 
 		 246 aa  160  2e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.557912  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4565  taurine transporter ATP-binding subunit  43.93 
 
 		 255 aa  159  3e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.739 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1403  ABC transporter related  42.66 
 
 		 267 aa  159  3e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3269  ABC transporter related  46.38 
 
 		 263 aa  159  3e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.874896 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0435  ABC transporter related  42.27 
 
 		 256 aa  160  3e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.30818  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7381  ABC transporter related  48.51 
 
 		 262 aa  159  3e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1435  ABC transporter related protein  49.54 
 
 		 291 aa  160  3e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.597503  normal  0.846861 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3159  ABC transporter-like  46.6 
 
 		 282 aa  159  4e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3329  hypothetical protein  43.57 
 
 		 349 aa  159  4e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0596951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0679  ABC transporter related  46.89 
 
 		 244 aa  159  4e-38  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0882795 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3879  ABC transporter related  46.05 
 
 		 258 aa  159  4e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.898001  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0378  hypothetical protein  42.58 
 
 		 260 aa  159  5e-38  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2282  ABC transporter related  41.52 
 
 		 271 aa  159  5e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000447815  unclonable  0.000000000246868 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0285  ABC transporter related protein  43.18 
 
 		 267 aa  159  5e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.120651  hitchhiker  0.0000760001 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4149  ABC transporter related  46.08 
 
 		 266 aa  159  6e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0621662 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3900  ABC transporter related  39.09 
 
 		 228 aa  159  6e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3676  ABC transporter related  46.08 
 
 		 266 aa  159  6e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.618015 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1759  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  45.62 
 
 		 275 aa  158  9e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.352483  hitchhiker  0.00557552 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2815  ABC transporter related  45.15 
 
 		 241 aa  158  1e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000485223 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4579  ABC transporter related  42.11 
 
 		 262 aa  158  1e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0346  ABC transporter related  42.79 
 
 		 278 aa  157  1e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1797  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  47.14 
 
 		 371 aa  158  1e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.472003 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2536  putative taurine ABC transporter, ATP-binding protein  41.53 
 
 		 264 aa  157  1e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.280806  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3009  ABC transporter related  42.19 
 
 		 245 aa  157  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3570  ABC transporter related  46.84 
 
 		 265 aa  157  2e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.476626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0513  ABC transporter related  41.79 
 
 		 254 aa  157  2e-37  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4114  ABC transporter related  44.95 
 
 		 273 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.406402  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4252  ABC transporter related  44.95 
 
 		 273 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0391855  normal  0.0823186 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1258  ABC transporter related  41.28 
 
 		 244 aa  157  2e-37  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1412  ABC transporter, ATP-binding protein  41.41 
 
 		 333 aa  157  2e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1213  ABC transporter, ATP-binding protein  41.41 
 
 		 366 aa  156  3e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1352  ABC transporter related  42.31 
 
 		 262 aa  156  3e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2275  ABC transporter related  46.15 
 
 		 264 aa  156  3e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0996963 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>