More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_3900 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_3900  ABC transporter related  100 
 
 		 228 aa  469  1.0000000000000001e-131  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1146  ABC transporter related  43.5 
 
 		 237 aa  192  4e-48  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0318577  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3306  alkanesulfonate ABC transporter, ATP binding protein  41.99 
 
 		 263 aa  184  9e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0735  ABC transporter related  39.09 
 
 		 253 aa  182  3e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0415182  normal  0.371016 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2563  ABC transporter related  44.93 
 
 		 252 aa  178  5.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6544  putative ABC transporter  39.57 
 
 		 259 aa  178  5.999999999999999e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.353316 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2359  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  36.67 
 
 		 259 aa  177  1e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.504714 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2526  ABC transporter related  44.93 
 
 		 252 aa  177  1e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2571  ABC transporter related  44.93 
 
 		 252 aa  177  1e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2118  ABC transporter related protein  38.78 
 
 		 250 aa  177  1e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1667  ABC transporter related  39.67 
 
 		 260 aa  176  2e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0642211  normal  0.357453 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2904  ABC transporter related  39.32 
 
 		 270 aa  176  3e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1975  ABC transporter related  38.96 
 
 		 263 aa  175  5e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000056178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4565  taurine transporter ATP-binding subunit  40.93 
 
 		 255 aa  175  5e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.739 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0282  ABC transporter related  38.53 
 
 		 244 aa  175  6e-43  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.686525  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0734  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  39.5 
 
 		 257 aa  175  6e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.95577 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0116  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  39.09 
 
 		 276 aa  174  8e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4843  putative ABC transporter ATP-binding protein  39.33 
 
 		 284 aa  174  9.999999999999999e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.365039 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0833  ABC transporter related  39.83 
 
 		 246 aa  174  9.999999999999999e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.557912  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4523  ABC transporter related  39.15 
 
 		 280 aa  174  9.999999999999999e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2164  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  38.68 
 
 		 276 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2688  ABC transporter related  38.53 
 
 		 264 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.232656  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0339  putative sulfonate transport system ATP-binding protein  38.29 
 
 		 231 aa  174  9.999999999999999e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2786  ABC transporter, ATP-binding protein  39.73 
 
 		 232 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0961461  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6155  ABC transporter related  39.83 
 
 		 286 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.300039  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0378  hypothetical protein  36.78 
 
 		 260 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0849  ABC transporter-related protein  40.18 
 
 		 253 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0140067  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1258  ABC transporter related  36.78 
 
 		 244 aa  172  5e-42  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1919  ABC transporter related  39.09 
 
 		 265 aa  171  5.999999999999999e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0463  ABC transporter related  39.21 
 
 		 257 aa  171  9e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.335416  normal  0.0141237 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0768  ABC transporter, conserved site  38.87 
 
 		 432 aa  171  1e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2775  ABC transporter related  40.44 
 
 		 268 aa  170  2e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4591  ABC transporter related  38.63 
 
 		 265 aa  170  2e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4457  ABC transporter related  38.63 
 
 		 265 aa  170  2e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0721203  normal  0.624279 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2936  ABC transporter related  37.92 
 
 		 250 aa  169  2e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2932  putative sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  40.8 
 
 		 251 aa  169  3e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0218  ABC transporter related  37.92 
 
 		 251 aa  169  3e-41  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7933  ABC transporter related  40.81 
 
 		 258 aa  169  4e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2057  ABC transporter related  38.91 
 
 		 280 aa  169  4e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0087  ABC transporter related  37.04 
 
 		 263 aa  169  4e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1847  ABC transporter ATP-binding protein  36.63 
 
 		 272 aa  169  4e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2274  ABC transporter ATP-binding protein  36.63 
 
 		 272 aa  169  4e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0679  ABC transporter related  39.11 
 
 		 244 aa  169  4e-41  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0882795 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2673  ABC transporter related  38.08 
 
 		 262 aa  168  6e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5825  ABC transporter related  41.08 
 
 		 256 aa  168  6e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000661116 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4786  ABC transporter related  37.04 
 
 		 260 aa  168  7e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0276947  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2311  putative sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  40.5 
 
 		 251 aa  168  8e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.89952  hitchhiker  0.0000000038093 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1358  ABC transporter related  38.33 
 
 		 262 aa  167  9e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2642  alkanesulfonates transport ATP-binding protein  38.24 
 
 		 251 aa  167  1e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.164892  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1403  ABC transporter related  42.4 
 
 		 267 aa  167  1e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3277  translation initiation factor IF-2  39.74 
 
 		 261 aa  167  1e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00123612  normal  0.0327391 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5606  ABC transporter related protein  40.27 
 
 		 264 aa  167  1e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.231398  normal  0.622338 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5006  ABC transporter related  37.75 
 
 		 257 aa  166  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1956  ABC transporter related  36.21 
 
 		 272 aa  167  2e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  36.1 
 
 		 258 aa  166  2e-40  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3817  ABC transporter related protein  40.36 
 
 		 249 aa  166  2e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2984  ABC transporter related  40.64 
 
 		 271 aa  166  2e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3892  ABC transporter related  36.55 
 
 		 271 aa  167  2e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3751  ABC transporter, ATPase subunit  36.13 
 
 		 271 aa  166  2e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0190  ABC transporter related  37.19 
 
 		 244 aa  167  2e-40  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3203  ABC transporter related  40.09 
 
 		 275 aa  166  2e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.565389  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3141  ABC transporter-related protein  39.41 
 
 		 233 aa  166  2e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0745233  normal  0.0402056 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5009  ABC transporter related  40.17 
 
 		 285 aa  166  2e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0136  hypothetical protein  38.15 
 
 		 432 aa  166  2.9999999999999998e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0121  hypothetical protein  38.15 
 
 		 432 aa  166  2.9999999999999998e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2961  ABC transporter related  40.67 
 
 		 271 aa  166  2.9999999999999998e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0491364  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2804  ABC transporter related protein  35.75 
 
 		 256 aa  166  2.9999999999999998e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00228299  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3808  ABC transporter-related protein  36.55 
 
 		 271 aa  165  4e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2815  ABC transporter related  41.2 
 
 		 241 aa  165  4e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000485223 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1979  ABC transporter related  36.73 
 
 		 258 aa  165  4e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000563857  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0430  ABC transporter related protein  40.17 
 
 		 437 aa  166  4e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3116  ABC transporter related  40.62 
 
 		 241 aa  166  4e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5010  ABC transporter related  38.96 
 
 		 263 aa  166  4e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3066  ABC transporter related protein  38.17 
 
 		 267 aa  166  4e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.583352  normal  0.320404 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6521  ABC transporter related  38.3 
 
 		 270 aa  165  5e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5601  ABC transporter related  38.25 
 
 		 267 aa  165  5e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.059714  normal  0.713913 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6755  ABC transporter related  38.3 
 
 		 270 aa  165  5e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0664482 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2968  putative sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  38.24 
 
 		 251 aa  165  5e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.503094  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2978  ABC transporter related  41.3 
 
 		 255 aa  165  5.9999999999999996e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0378  ABC transporter related  37.34 
 
 		 259 aa  165  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0014  ABC transporter related  39.26 
 
 		 245 aa  165  5.9999999999999996e-40  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4036  ABC transporter related  39.32 
 
 		 273 aa  165  6.9999999999999995e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.494746  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4148  ABC transporter related  39.32 
 
 		 273 aa  165  6.9999999999999995e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.958173  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0331  ABC transporter related  36.93 
 
 		 259 aa  165  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2665  alkanesulfonates transport ATP-binding protein  39.81 
 
 		 251 aa  164  8e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.273275  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1220  ABC transporter related protein  39.08 
 
 		 262 aa  164  8e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0156  ABC transporter related protein  36.97 
 
 		 250 aa  164  8e-40  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2657  ABC transporter related  42.79 
 
 		 254 aa  164  8e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000159789  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3269  ABC transporter related  39.64 
 
 		 263 aa  164  8e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.874896 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3876  ABC transporter related  40.28 
 
 		 297 aa  164  9e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2921  putative sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  39.81 
 
 		 251 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.88235e-19 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0209  nitrate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  41.3 
 
 		 283 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.465549 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1801  ABC transporter related protein  42.18 
 
 		 267 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2714  sulfonate ABC transporter ATP-binding protein  36.86 
 
 		 287 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0521621  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4837  ABC transporter related  41.67 
 
 		 263 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.856491 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2922  sulfonate ABC transporter ATP-binding protein  39.81 
 
 		 251 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.900883  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3034  ABC transporter related  41.59 
 
 		 265 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.971108  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4202  ABC transporter related  38.96 
 
 		 286 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.657394  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6344  ABC transporter related  38.3 
 
 		 270 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.942875  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3867  ABC transporter related  38.1 
 
 		 265 aa  163  2.0000000000000002e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.685954  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>