More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_0493 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_0493  sulfonate/nitrate/taurine transport system ATP-binding  100 
 
 		 249 aa  499  1e-140  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.187647  normal  0.442901 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1451  ABC transporter related  85.94 
 
 		 249 aa  407  1e-113  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0959261 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4167  ABC transporter related  64.63 
 
 		 249 aa  302  3.0000000000000004e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.555902 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4038  ABC transporter related  44.59 
 
 		 265 aa  168  6e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0203282 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1348  ABC transporter-related protein  37.19 
 
 		 246 aa  163  3e-39  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00000000711839  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1556  ABC transporter related protein  36.07 
 
 		 245 aa  160  1e-38  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000121987  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1807  ABC transporter related  44.55 
 
 		 286 aa  160  2e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.199283  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1933  ABC transporter related  44.1 
 
 		 238 aa  157  1e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.306396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0384  ABC transporter related  40.66 
 
 		 288 aa  156  4e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.317269  normal  0.323719 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5154  ABC transporter related  44.92 
 
 		 268 aa  152  4e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.597589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3188  putative ABC transporter ATP-binding protein  41.75 
 
 		 378 aa  152  4e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0202  ABC transporter related  42.71 
 
 		 259 aa  152  4e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0104  ABC transporter related  42.03 
 
 		 260 aa  152  5.9999999999999996e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.464024  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2649  ABC transporter related  41.1 
 
 		 381 aa  150  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1539  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  41.78 
 
 		 264 aa  150  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0876  ABC transporter related  34.95 
 
 		 218 aa  150  2e-35  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2866  ABC transporter related protein  40.61 
 
 		 299 aa  149  5e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7050  ABC transporter related  43.75 
 
 		 356 aa  149  5e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.348083 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1173  ABC transporter related  42.16 
 
 		 253 aa  149  5e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.628732  normal  0.131881 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02140  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  37.75 
 
 		 272 aa  148  7e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4057  ABC transporter related  44.78 
 
 		 288 aa  148  7e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.170324 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2324  ABC transporter related  40.68 
 
 		 381 aa  148  7e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.517442  normal  0.838202 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5606  ABC transporter related protein  40.58 
 
 		 264 aa  147  1.0000000000000001e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.231398  normal  0.622338 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3499  ABC transporter related  45.99 
 
 		 265 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.14517  normal  0.695761 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1645  ABC transporter related  40.09 
 
 		 253 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2681  ABC transporter related  45.45 
 
 		 277 aa  146  2.0000000000000003e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5129  ABC transporter related  42.72 
 
 		 370 aa  146  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.701996  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8276  ABC-type transporter, ATP-binding protein  41.04 
 
 		 264 aa  146  3e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1034  ABC transporter related protein  42.86 
 
 		 272 aa  146  3e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17270  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  41.12 
 
 		 274 aa  146  4.0000000000000006e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.115827  normal  0.528564 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4936  ABC transporter related protein  39.15 
 
 		 278 aa  145  4.0000000000000006e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0551994  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1075  ABC transporter related  40.43 
 
 		 252 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.137281  normal  0.464106 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0122  ABC transporter related  39.91 
 
 		 347 aa  145  5e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.617953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5983  ABC transporter ATP-binding protein  44.39 
 
 		 267 aa  145  5e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.289741 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4505  ABC transporter  39.58 
 
 		 368 aa  145  6e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.615344 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9277  ABC transporter, ATPase subunit  43.23 
 
 		 263 aa  145  6e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7503  ABC transporter ATP-binding protein  42.93 
 
 		 257 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.704278 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5375  ABC transporter related  40.29 
 
 		 387 aa  144  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0766723  normal  0.734389 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3876  ABC transporter related  37.19 
 
 		 297 aa  144  1e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1899  ABC transporter-related protein  36.6 
 
 		 264 aa  144  1e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.126966  hitchhiker  0.000000000000779353 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1733  ABC transporter related protein  36.82 
 
 		 265 aa  144  1e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6000  ABC transporter related  40.87 
 
 		 356 aa  144  2e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0326013  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4511  ABC transporter related  40.27 
 
 		 356 aa  143  2e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3035  ABC transporter related  42.08 
 
 		 255 aa  143  3e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3593  ABC transporter related  40.1 
 
 		 255 aa  143  3e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3343  ABC transporter related protein  36.16 
 
 		 348 aa  142  4e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0892  ABC transporter related  39.71 
 
 		 252 aa  142  4e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0967243 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7604  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  40.78 
 
 		 413 aa  142  4e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3693  ABC transporter related  41.48 
 
 		 357 aa  142  4e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.402658  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1296  ABC transporter related  36.65 
 
 		 265 aa  142  5e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4664  ABC transporter related  39.49 
 
 		 274 aa  142  6e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.456657 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1077  ABC transporter related  42.72 
 
 		 382 aa  142  6e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0433  ferric transporter ATP-binding subunit  35.71 
 
 		 348 aa  141  9.999999999999999e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1128  ABC transporter related  43.62 
 
 		 267 aa  140  9.999999999999999e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0981  ABC transporter related  40.67 
 
 		 353 aa  140  9.999999999999999e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0551  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  37.14 
 
 		 236 aa  141  9.999999999999999e-33  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.978201  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7381  ABC transporter related  41.59 
 
 		 262 aa  140  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3412  ABC transporter related protein  41.03 
 
 		 258 aa  140  1.9999999999999998e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0087  ABC transporter related  37.34 
 
 		 263 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2273  ABC transporter related  42.86 
 
 		 275 aa  140  1.9999999999999998e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1677  ABC transporter related  40.51 
 
 		 274 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.012686  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4331  alkanesulfonate ABC transporter ATP-binding protein  40.31 
 
 		 256 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1465  ABC transporter related  40.55 
 
 		 371 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.778579  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2580  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.46 
 
 		 372 aa  139  3e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3061  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  37.07 
 
 		 259 aa  139  3e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00453099  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3786  ABC transporter related  44.5 
 
 		 305 aa  139  3e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3339  ABC transporter related  43.46 
 
 		 260 aa  140  3e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00741331  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5516  ABC transporter related  39.27 
 
 		 271 aa  139  3e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.25838  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0392  ABC transporter related  36.84 
 
 		 254 aa  139  3e-32  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.238571  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1505  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  42.79 
 
 		 262 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0234474  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1896  ABC transporter related  39.42 
 
 		 359 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0892333  normal  0.42443 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0831  ferric transporter ATP-binding subunit  35.27 
 
 		 348 aa  139  4.999999999999999e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0571  ABC transporter related  40.38 
 
 		 267 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.260264  normal  0.332215 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1475  ABC transporter related  36.36 
 
 		 254 aa  139  4.999999999999999e-32  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0059  ABC transporter related  40.74 
 
 		 257 aa  139  6e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2275  ABC transporter related  42.36 
 
 		 273 aa  139  6e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.753386  normal  0.352835 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1094  ABC transporter related  40.43 
 
 		 356 aa  138  8.999999999999999e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.910142  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0661  glycerol-3-phosphate ABC transporter, ATP-binding protein  38.75 
 
 		 368 aa  137  1e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2749  sulfonate/taurine ABC transporter ATP-binding protein  36.59 
 
 		 259 aa  138  1e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1691  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  38.02 
 
 		 280 aa  137  1e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0162641  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1975  ABC transporter related  36.91 
 
 		 263 aa  137  1e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000056178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3751  ABC transporter, ATPase subunit  43.01 
 
 		 271 aa  137  1e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0571  ABC transporter related  39.71 
 
 		 271 aa  137  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.750725  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4439  ABC transporter related  39.23 
 
 		 348 aa  137  1e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0445  ABC transporter related  35.89 
 
 		 254 aa  137  1e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3746  ABC transporter related  38.83 
 
 		 346 aa  137  2e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1030  ABC transporter, ATP-binding protein  38.54 
 
 		 254 aa  137  2e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4132  ABC transporter related  38.53 
 
 		 357 aa  137  2e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.751697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3570  ABC transporter related  42.62 
 
 		 265 aa  137  2e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.476626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0889  ABC transporter related  38.28 
 
 		 368 aa  137  2e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18140  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  40.95 
 
 		 267 aa  137  2e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4570  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  41.45 
 
 		 668 aa  137  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.177412  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0147  ABC transporter related  37.69 
 
 		 273 aa  137  2e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1407  ABC transporter related protein  40 
 
 		 358 aa  137  2e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3551  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  37.5 
 
 		 324 aa  137  2e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.375079  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2563  ABC-transport protein, ATP-binding protein  37.82 
 
 		 288 aa  137  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.25889 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3148  ABC transporter related  39.49 
 
 		 266 aa  136  2e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3059  taurine import ATP-binding protein TauB  37.07 
 
 		 259 aa  137  2e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1639  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  36.6 
 
 		 359 aa  136  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0636  ABC transporter related  41.35 
 
 		 380 aa  136  3.0000000000000003e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>