More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_3593 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009668  Oant_3593  ABC transporter related  100 
 
 
255 aa  515  1.0000000000000001e-145  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0468  ABC transporter, ATP-binding protein  85.43 
 
 
255 aa  442  1e-123  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0407  ABC transporter, ATP-binding protein  85.43 
 
 
255 aa  442  1e-123  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3035  ABC transporter related  74.8 
 
 
255 aa  393  1e-108  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7503  ABC transporter ATP-binding protein  57.42 
 
 
257 aa  280  2e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.704278 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1691  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  47.52 
 
 
280 aa  226  3e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0162641  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2147  ABC transporter related  44.35 
 
 
274 aa  207  2e-52  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3034  ABC transporter related  43.82 
 
 
292 aa  207  2e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.652183  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0218  ABC transporter related  44.8 
 
 
251 aa  207  2e-52  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4936  ABC transporter related protein  45.23 
 
 
278 aa  206  3e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0551994  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4050  ABC transporter related  44.13 
 
 
289 aa  203  2e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.95226  normal  0.382919 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1030  ABC transporter, ATP-binding protein  44.64 
 
 
254 aa  202  4e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  40.08 
 
 
258 aa  202  6e-51  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03350  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  43.44 
 
 
261 aa  201  7e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0735  ABC transporter related  41.2 
 
 
253 aa  201  9e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0415182  normal  0.371016 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1210  ABC transporter related  44.86 
 
 
287 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.502786  normal  0.459492 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1075  ABC transporter related  45.29 
 
 
252 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.137281  normal  0.464106 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4305  ABC transporter related  41.44 
 
 
273 aa  199  3e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272884  hitchhiker  0.0022322 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6033  putative ABC transporter, ATP-binding protein  47.75 
 
 
261 aa  198  6e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5145  ABC transporter related  42.4 
 
 
267 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.537076  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2274  ABC transporter ATP-binding protein  40.96 
 
 
272 aa  196  3e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1847  ABC transporter ATP-binding protein  40.96 
 
 
272 aa  196  3e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2221  ABC transporter-related protein  46.15 
 
 
262 aa  196  4.0000000000000005e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000225021  normal  0.260255 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4591  ABC transporter related  47.64 
 
 
265 aa  195  6e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4457  ABC transporter related  47.64 
 
 
265 aa  195  6e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0721203  normal  0.624279 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0404  ABC transporter related protein  40.16 
 
 
261 aa  194  8.000000000000001e-49  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1956  ABC transporter related  42.32 
 
 
272 aa  195  8.000000000000001e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1899  ABC transporter-related protein  44.39 
 
 
264 aa  194  2e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.126966  hitchhiker  0.000000000000779353 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0406  ABC transporter related  41.84 
 
 
249 aa  193  2e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0871971  decreased coverage  0.00677494 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2775  ABC transporter related  45.73 
 
 
268 aa  193  2e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3306  alkanesulfonate ABC transporter, ATP binding protein  43.72 
 
 
263 aa  193  2e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8276  ABC-type transporter, ATP-binding protein  43.17 
 
 
264 aa  193  2e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2802  ABC transporter related protein  46.57 
 
 
260 aa  192  4e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3066  ABC transporter related protein  40.91 
 
 
267 aa  192  6e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.583352  normal  0.320404 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2675  putative ABC transporter, ATP-binding protein  43.51 
 
 
281 aa  191  7e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658028  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2044  ABC transporter related  44.1 
 
 
262 aa  191  7e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.471854  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2796  ABC transporter related protein  46.76 
 
 
276 aa  191  9e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00105167 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1368  ABC transporter ATP-binding protein  40.15 
 
 
278 aa  191  9e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0478866 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0307  ABC transporter related  47.09 
 
 
259 aa  191  1e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0513  ABC transporter related  40.91 
 
 
254 aa  190  1e-47  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5606  ABC transporter related protein  40.64 
 
 
264 aa  190  2e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.231398  normal  0.622338 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0826  ABC transporter, ATPase subunit  43.03 
 
 
273 aa  190  2e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.617854  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0807  ABC transporter related  47.3 
 
 
269 aa  190  2e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.455697  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0346  ABC transporter related  47.6 
 
 
278 aa  190  2e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14760  ABC transporter related  40.25 
 
 
248 aa  190  2e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2011  ABC transporter related  41.42 
 
 
295 aa  190  2e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.284582  normal  0.208139 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0463  ABC transporter related  43.86 
 
 
257 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.335416  normal  0.0141237 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0392  ABC transporter related  41.63 
 
 
254 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.238571  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2275  ABC transporter related  44.07 
 
 
264 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0996963 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0693  ABC transporter, conserved site  42.97 
 
 
441 aa  189  4e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4642  ABC transporter related  39.3 
 
 
284 aa  189  4e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.842575  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4149  ABC transporter related  43.28 
 
 
266 aa  189  4e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0621662 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44540  ABC transporter  41.04 
 
 
288 aa  189  5e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0849  ABC transporter-related protein  47.32 
 
 
253 aa  189  5e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0140067  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5603  ABC transporter related protein  39.58 
 
 
263 aa  188  5.999999999999999e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3254  ABC transporter related  41.31 
 
 
258 aa  188  5.999999999999999e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0994591 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5154  ABC transporter related  44.92 
 
 
268 aa  188  7e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.597589  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1857  ABC transporter related  45.45 
 
 
304 aa  188  7e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0470  ABC transporter related  42.46 
 
 
276 aa  188  8e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2703  ABC transporter related  45.93 
 
 
272 aa  188  9e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.314887  normal  0.244414 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2151  ABC transporter related  43.46 
 
 
263 aa  187  1e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.532453 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1090  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  38.28 
 
 
260 aa  187  1e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5690  ABC transporter related  49.76 
 
 
246 aa  187  2e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4096  ABC transporter related protein  44.21 
 
 
261 aa  187  2e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0795194 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1979  ABC transporter related  42.67 
 
 
258 aa  187  2e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000563857  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0087  ABC transporter related  47.83 
 
 
263 aa  187  2e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2133  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  44.06 
 
 
252 aa  186  2e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1496  ABC transporter related  47.34 
 
 
255 aa  187  2e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.409922  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1260  ABC transporter related  42.11 
 
 
293 aa  187  2e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.227509 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4114  ABC transporter related  44.44 
 
 
273 aa  187  2e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.406402  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3676  ABC transporter related  43.97 
 
 
266 aa  187  2e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.618015 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22550  ABC transporter ATP-binding protein  47.23 
 
 
255 aa  186  2e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4252  ABC transporter related  44.44 
 
 
273 aa  187  2e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0391855  normal  0.0823186 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2434  ABC transporter related protein  44.21 
 
 
276 aa  187  2e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0618237 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1421  ABC transporter related  42.11 
 
 
293 aa  186  2e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3083  ABC transporter related  40.15 
 
 
306 aa  187  2e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.724622  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0378  hypothetical protein  46.51 
 
 
260 aa  187  2e-46  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1475  ABC transporter related  40.41 
 
 
254 aa  186  3e-46  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1759  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  43.59 
 
 
275 aa  186  3e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.352483  hitchhiker  0.00557552 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0792  ABC transporter related protein  40.91 
 
 
308 aa  186  3e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0190  ABC transporter related  44.8 
 
 
244 aa  186  3e-46  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1815  ABC transporter related  46.41 
 
 
266 aa  186  3e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.463697  normal  0.452124 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18140  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  44.83 
 
 
267 aa  186  4e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1900  ABC transporter related  41.27 
 
 
269 aa  186  4e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24170  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  46.4 
 
 
330 aa  186  4e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.505798  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3867  ABC transporter related  45.18 
 
 
265 aa  186  4e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.685954  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0028  ABC transporter related  45.98 
 
 
273 aa  186  4e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3295  ABC transporter related  45.12 
 
 
258 aa  186  4e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0815311 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1371  ABC transporter related  46.19 
 
 
333 aa  185  5e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.138832  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1284  ABC transporter-like protein  40.65 
 
 
254 aa  185  5e-46  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0530246 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1428  ABC transporter related  39.66 
 
 
267 aa  185  6e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.250833  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0445  ABC transporter related  40.41 
 
 
254 aa  185  6e-46  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4338  ABC transporter related  44.4 
 
 
271 aa  185  7e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4509  ABC transporter related  42.98 
 
 
267 aa  185  7e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0327  ABC transporter related  42.32 
 
 
264 aa  185  8e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.341199  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0435  ABC transporter related  40.09 
 
 
256 aa  184  9e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.30818  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1530  ABC transporter related  38.28 
 
 
285 aa  184  1.0000000000000001e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3040  ABC transporter related  44.65 
 
 
261 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.874651  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5010  ABC transporter related  44.87 
 
 
263 aa  184  1.0000000000000001e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0282  ABC transporter related  45.91 
 
 
244 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.686525  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>