More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BRA0468 on replicon NC_004311
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004311  BRA0468  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 
255 aa  515  1.0000000000000001e-145  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0407  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 
255 aa  515  1.0000000000000001e-145  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3593  ABC transporter related  85.43 
 
 
255 aa  442  1e-123  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3035  ABC transporter related  73.73 
 
 
255 aa  390  1e-107  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7503  ABC transporter ATP-binding protein  57.42 
 
 
257 aa  283  2.0000000000000002e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.704278 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1691  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  47.5 
 
 
280 aa  218  5e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0162641  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0404  ABC transporter related protein  42.41 
 
 
261 aa  205  5e-52  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4936  ABC transporter related protein  44.35 
 
 
278 aa  204  1e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0551994  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  40.08 
 
 
258 aa  201  8e-51  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3034  ABC transporter related  44.49 
 
 
292 aa  199  3e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.652183  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4305  ABC transporter related  43.44 
 
 
273 aa  199  3.9999999999999996e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272884  hitchhiker  0.0022322 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1030  ABC transporter, ATP-binding protein  43.61 
 
 
254 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2147  ABC transporter related  44.91 
 
 
274 aa  196  3e-49  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0218  ABC transporter related  40.82 
 
 
251 aa  196  3e-49  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1847  ABC transporter ATP-binding protein  43.24 
 
 
272 aa  191  8e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2274  ABC transporter ATP-binding protein  43.24 
 
 
272 aa  191  8e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0735  ABC transporter related  40.4 
 
 
253 aa  191  1e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0415182  normal  0.371016 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1956  ABC transporter related  46.34 
 
 
272 aa  190  2e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2133  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  42.98 
 
 
252 aa  190  2e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0513  ABC transporter related  41.89 
 
 
254 aa  190  2e-47  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2802  ABC transporter related protein  47.03 
 
 
260 aa  189  2.9999999999999997e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03350  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  42.45 
 
 
261 aa  189  2.9999999999999997e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0826  ABC transporter, ATPase subunit  42.92 
 
 
273 aa  189  2.9999999999999997e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.617854  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0435  ABC transporter related  42.86 
 
 
256 aa  189  4e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.30818  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22550  ABC transporter ATP-binding protein  47.23 
 
 
255 aa  189  5e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5145  ABC transporter related  41.53 
 
 
267 aa  188  8e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.537076  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2703  ABC transporter related  46.15 
 
 
272 aa  187  1e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.314887  normal  0.244414 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4591  ABC transporter related  46.38 
 
 
265 aa  187  1e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4457  ABC transporter related  46.38 
 
 
265 aa  187  1e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0721203  normal  0.624279 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8276  ABC-type transporter, ATP-binding protein  42.54 
 
 
264 aa  186  3e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2796  ABC transporter related protein  47.6 
 
 
276 aa  186  3e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00105167 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0445  ABC transporter related  39.76 
 
 
254 aa  186  4e-46  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18140  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  43.51 
 
 
267 aa  185  5e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1899  ABC transporter-related protein  41.75 
 
 
264 aa  185  7e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.126966  hitchhiker  0.000000000000779353 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0392  ABC transporter related  40.32 
 
 
254 aa  185  7e-46  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.238571  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4050  ABC transporter related  42.37 
 
 
289 aa  185  8e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.95226  normal  0.382919 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1979  ABC transporter related  42.73 
 
 
258 aa  184  1.0000000000000001e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000563857  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5606  ABC transporter related protein  42.13 
 
 
264 aa  184  1.0000000000000001e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.231398  normal  0.622338 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1857  ABC transporter related  44.93 
 
 
304 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2221  ABC transporter-related protein  44.4 
 
 
262 aa  183  2.0000000000000003e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000225021  normal  0.260255 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4096  ABC transporter related protein  42.86 
 
 
261 aa  184  2.0000000000000003e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0795194 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14760  ABC transporter related  40.08 
 
 
248 aa  183  2.0000000000000003e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1733  ABC transporter related protein  40.17 
 
 
265 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1210  ABC transporter related  46.38 
 
 
287 aa  182  3e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.502786  normal  0.459492 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1475  ABC transporter related  38.96 
 
 
254 aa  182  3e-45  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1090  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  38.1 
 
 
260 aa  183  3e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2775  ABC transporter related  44.92 
 
 
268 aa  182  3e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2804  ABC transporter related protein  40.09 
 
 
256 aa  182  4.0000000000000006e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00228299  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2011  ABC transporter related  40.17 
 
 
295 aa  182  7e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.284582  normal  0.208139 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5516  ABC transporter related  40.57 
 
 
271 aa  181  7e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.25838  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2151  ABC transporter related  45.45 
 
 
263 aa  181  9.000000000000001e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.532453 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4886  ABC transporter related  50.75 
 
 
297 aa  181  1e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0807  ABC transporter related  47.55 
 
 
269 aa  181  1e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.455697  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1284  ABC transporter-like protein  41 
 
 
254 aa  181  1e-44  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0530246 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1075  ABC transporter related  42.08 
 
 
252 aa  180  2e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.137281  normal  0.464106 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2480  ABC transporter related protein  45.02 
 
 
263 aa  180  2e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2275  ABC transporter related  42.92 
 
 
264 aa  180  2e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0996963 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2623  ABC transporter related  41.34 
 
 
255 aa  180  2e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000578325  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3306  alkanesulfonate ABC transporter, ATP binding protein  42.63 
 
 
263 aa  180  2e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3876  ABC transporter related  42.22 
 
 
297 aa  180  2e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3066  ABC transporter related protein  38.43 
 
 
267 aa  180  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.583352  normal  0.320404 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4642  ABC transporter related  38.89 
 
 
284 aa  180  2e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.842575  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6033  putative ABC transporter, ATP-binding protein  47.44 
 
 
261 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0054  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  40.16 
 
 
257 aa  179  2.9999999999999997e-44  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1260  ABC transporter related  45.02 
 
 
293 aa  179  4e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.227509 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1421  ABC transporter related  45.02 
 
 
293 aa  179  4e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5690  ABC transporter related  47.37 
 
 
246 aa  179  4e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5800  ABC transporter related  38.96 
 
 
284 aa  179  4.999999999999999e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0307  ABC transporter related  44.7 
 
 
259 aa  179  4.999999999999999e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3870  ABC transporter related  41.27 
 
 
272 aa  178  5.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44540  ABC transporter  38.46 
 
 
288 aa  178  5.999999999999999e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3570  ABC transporter related  42.73 
 
 
265 aa  178  7e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.476626  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2311  putative sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  36.51 
 
 
251 aa  178  7e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.89952  hitchhiker  0.0000000038093 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1729  ABC transporter related protein  44.83 
 
 
265 aa  178  7e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3808  ABC transporter-related protein  44.66 
 
 
271 aa  178  8e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3892  ABC transporter related  44.66 
 
 
271 aa  178  9e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0406  ABC transporter related  39.76 
 
 
249 aa  178  9e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0871971  decreased coverage  0.00677494 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0028  ABC transporter related  47.12 
 
 
273 aa  178  9e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2718  ABC transporter related  39.06 
 
 
259 aa  177  1e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7199  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (nitrate/sulfonates)  41.74 
 
 
278 aa  177  1e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0286852  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0378  hypothetical protein  45.12 
 
 
260 aa  177  1e-43  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1572  ABC transporter related protein  39.92 
 
 
267 aa  177  1e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2675  putative ABC transporter, ATP-binding protein  43.48 
 
 
281 aa  177  2e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658028  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1132  ABC transporter related  39.83 
 
 
301 aa  177  2e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.20268 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1481  ABC transporter related  42.56 
 
 
283 aa  177  2e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2434  ABC transporter related protein  43.48 
 
 
276 aa  177  2e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0618237 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0429  ABC transporter related  39.69 
 
 
313 aa  176  2e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0115377  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0470  ABC transporter related  41.89 
 
 
276 aa  177  2e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1428  ABC transporter related  39.3 
 
 
267 aa  176  2e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.250833  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0190  ABC transporter related  43.89 
 
 
244 aa  176  3e-43  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11500  ABC transporter related  40.83 
 
 
257 aa  176  3e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000319747  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3083  ABC transporter related  44.44 
 
 
306 aa  176  3e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.724622  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1368  ABC transporter ATP-binding protein  38.76 
 
 
278 aa  176  3e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0478866 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1128  ABC transporter related  38.02 
 
 
267 aa  176  3e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2333  ABC transporter related protein  41.32 
 
 
260 aa  176  3e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0059  ABC transporter related  39.21 
 
 
257 aa  176  3e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1530  ABC transporter related  36.8 
 
 
285 aa  176  3e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1975  ABC transporter related  40.76 
 
 
263 aa  176  4e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000056178  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4331  alkanesulfonate ABC transporter ATP-binding protein  39.38 
 
 
256 aa  176  4e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0580  ABC transporter related  44.5 
 
 
265 aa  176  4e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.860273  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>