More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_1729 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_1729  ABC transporter related protein  100 
 
 		 265 aa  541  1e-153  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3891  ABC transporter related  62.55 
 
 		 258 aa  332  4e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.524263  normal  0.0369893 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3154  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  62.55 
 
 		 276 aa  331  6e-90  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4124  ABC transporter related  63.35 
 
 		 264 aa  325  5e-88  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4011  ABC transporter related  63.35 
 
 		 264 aa  325  5e-88  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.38128  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0056  ABC transporter related  63.41 
 
 		 256 aa  323  2e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.128052 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0056  ABC transporter related  63.41 
 
 		 256 aa  322  3e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.672257  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03034  ABC transporter ATP-binding protein  63.82 
 
 		 261 aa  317  1e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.459171  normal  0.0870544 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5059  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (nitrate/sulfonates)  60.56 
 
 		 271 aa  311  1e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6692  putative ABC transporter (ATP binding subunit)  59.92 
 
 		 259 aa  310  1e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4138  ABC transporter (ATP-binding protein)  60.39 
 
 		 279 aa  310  2e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.285064  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4372  ABC transporter related  62.6 
 
 		 256 aa  308  5.9999999999999995e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30910  ABC transporter, ATP-binding protein  61.72 
 
 		 276 aa  306  2.0000000000000002e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0537  putative ABC transporter ATP-binding protein  61.94 
 
 		 254 aa  306  3e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0868338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6048  ABC transporter related  61.11 
 
 		 308 aa  299  3e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.713083 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6245  ABC transporter related  60 
 
 		 272 aa  298  8e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2678  ABC transporter related  59.3 
 
 		 298 aa  296  2e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1398  ABC transporter related  56.93 
 
 		 288 aa  296  3e-79  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.225805  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1121  ABC transporter related  58.27 
 
 		 292 aa  295  5e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.213623 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0155  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  57.63 
 
 		 276 aa  295  5e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.588792 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0338  ABC transporter  58.27 
 
 		 291 aa  294  8e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.471102 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1796  ABC transporter related protein  58.3 
 
 		 284 aa  294  1e-78  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5197  ABC transporter, ATP-binding protein  58.78 
 
 		 286 aa  293  2e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4506  ABC transporter related  60.77 
 
 		 265 aa  293  2e-78  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.843905  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6534  ABC transporter related  59.04 
 
 		 336 aa  291  6e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6249  ABC transporter related  57.65 
 
 		 313 aa  291  9e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.532936  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1243  ABC transporter related  57.87 
 
 		 332 aa  290  2e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.756326  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6589  ABC transporter related  57.87 
 
 		 332 aa  290  2e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.708037 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2171  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  58.57 
 
 		 276 aa  289  3e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.518351  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6193  ABC transporter related  57.87 
 
 		 332 aa  289  4e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3602  ABC transporter related  58.63 
 
 		 279 aa  287  1e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1298  ABC transporter related  58.73 
 
 		 278 aa  285  5e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3451  ABC transporter related  66.2 
 
 		 578 aa  284  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.90461  hitchhiker  0.00285782 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0190  ABC transporter related  58.78 
 
 		 287 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.746927  normal  0.446131 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0171  ABC transporter ATP-binding protein  59.47 
 
 		 287 aa  282  5.000000000000001e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0192  ABC transporter related  59.47 
 
 		 287 aa  281  8.000000000000001e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34780  putative ABC transporter ATP-binding component  60.16 
 
 		 282 aa  280  1e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0748092  normal  0.0155255 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0139  ABC transporter-like  57.92 
 
 		 286 aa  276  2e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1583  ABC transporter related  60.09 
 
 		 271 aa  272  5.000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0820  ABC transporter, ATP-binding protein  56.59 
 
 		 276 aa  270  2e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.0049646  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1880  ABC transporter, ATP-binding protein  56.59 
 
 		 276 aa  270  2e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1685  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  56.59 
 
 		 276 aa  270  2e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.859906  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0341  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  56.59 
 
 		 276 aa  270  2e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1868  ABC transporter, ATP-binding protein  56.59 
 
 		 276 aa  270  2e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2035  ABC transporter, ATP-binding protein  56.2 
 
 		 276 aa  268  1e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.9269  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0513  ABC transporter related  55.43 
 
 		 313 aa  267  2e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5056  ABC transporter related  58.69 
 
 		 287 aa  266  2e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3454  ABC transporter related  61.4 
 
 		 282 aa  259  4e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.162103  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0398  ABC transporter related  53.42 
 
 		 259 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.698259 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4936  ABC transporter related protein  48.65 
 
 		 278 aa  231  7.000000000000001e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0551994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3148  ABC transporter related  48 
 
 		 266 aa  228  9e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4889  putative ABC transporter ATP-binding protein  53.41 
 
 		 257 aa  227  2e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.184184 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3083  ABC transporter related  52.05 
 
 		 306 aa  226  3e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.724622  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1691  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  56.8 
 
 		 280 aa  226  4e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0162641  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4567  ABC transporter related  49.77 
 
 		 260 aa  223  2e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1899  ABC transporter-related protein  52.45 
 
 		 264 aa  221  7e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.126966  hitchhiker  0.000000000000779353 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18140  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  50.41 
 
 		 267 aa  220  9.999999999999999e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1481  ABC transporter related  50.88 
 
 		 283 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1262  ABC transporter related  48.88 
 
 		 259 aa  219  3e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0287206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2954  ABC transporter related  49.33 
 
 		 272 aa  218  6e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0079  ABC transporter related  49.32 
 
 		 307 aa  217  1e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0218  ABC transporter related  49.1 
 
 		 251 aa  218  1e-55  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1475  ABC transporter related  46.4 
 
 		 254 aa  217  2e-55  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1368  ABC transporter ATP-binding protein  50 
 
 		 278 aa  216  2e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0478866 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  45.95 
 
 		 258 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3034  ABC transporter related  45.88 
 
 		 292 aa  216  4e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.652183  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5606  ABC transporter related protein  51.36 
 
 		 264 aa  216  4e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.231398  normal  0.622338 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4331  alkanesulfonate ABC transporter ATP-binding protein  45.68 
 
 		 256 aa  215  7e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0378  hypothetical protein  49.31 
 
 		 260 aa  214  8e-55  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0792  ABC transporter related protein  49.77 
 
 		 308 aa  214  9e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0445  ABC transporter related  45.95 
 
 		 254 aa  214  9.999999999999999e-55  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1030  ABC transporter, ATP-binding protein  47.09 
 
 		 254 aa  214  9.999999999999999e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3751  ABC transporter, ATPase subunit  49.12 
 
 		 271 aa  214  9.999999999999999e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0392  ABC transporter related  46.4 
 
 		 254 aa  214  9.999999999999999e-55  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.238571  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3870  ABC transporter related  50 
 
 		 272 aa  213  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8276  ABC-type transporter, ATP-binding protein  45.68 
 
 		 264 aa  213  1.9999999999999998e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3876  ABC transporter related  50.49 
 
 		 297 aa  213  2.9999999999999995e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5062  ABC transporter related  48.65 
 
 		 246 aa  212  4.9999999999999996e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.314971  normal  0.024914 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1733  ABC transporter related protein  47.6 
 
 		 265 aa  212  5.999999999999999e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5577  ABC transporter related  49.78 
 
 		 262 aa  211  7e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0087  ABC transporter related  48.87 
 
 		 263 aa  211  7.999999999999999e-54  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0826  ABC transporter, ATPase subunit  48.37 
 
 		 273 aa  211  7.999999999999999e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.617854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0513  ABC transporter related  44.14 
 
 		 254 aa  211  1e-53  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2675  putative ABC transporter, ATP-binding protein  48.89 
 
 		 281 aa  209  4e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2836  ABC transporter related  47.23 
 
 		 272 aa  209  6e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.840356  normal  0.83525 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1857  ABC transporter related  48.4 
 
 		 304 aa  208  6e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3808  ABC transporter-related protein  49.54 
 
 		 271 aa  208  6e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5920  ABC transporter related  48.86 
 
 		 303 aa  208  7e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6155  ABC transporter related  49.07 
 
 		 286 aa  208  7e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.300039  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6427  ABC transporter related  48.86 
 
 		 303 aa  208  8e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4929  ABC transporter-like  50.68 
 
 		 278 aa  207  1e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1387  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  48.4 
 
 		 304 aa  207  1e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.195746  normal  0.160104 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1260  ABC transporter related  46.72 
 
 		 293 aa  207  1e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.227509 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0849  ABC transporter-related protein  51.52 
 
 		 253 aa  207  1e-52  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0140067  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3892  ABC transporter related  49.08 
 
 		 271 aa  206  2e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1421  ABC transporter related  46.72 
 
 		 293 aa  206  3e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3066  ABC transporter related protein  45.82 
 
 		 267 aa  206  3e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.583352  normal  0.320404 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5555  ABC transporter related  48.4 
 
 		 303 aa  206  3e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356356  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1788  ABC transporter related  50 
 
 		 303 aa  205  5e-52  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2086  ABC transporter related  50 
 
 		 291 aa  205  5e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.124601 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>