More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1530 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_1530  ABC transporter related  100 
 
 
285 aa  588  1e-167  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3513  ABC transporter related  80.83 
 
 
279 aa  455  1e-127  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3115  ABC transporter related  77.69 
 
 
272 aa  423  1e-117  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.200151  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5342  ABC transporter related  74.81 
 
 
272 aa  414  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.682879 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5062  ABC transporter related  75.57 
 
 
272 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.948706 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3328  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  74.14 
 
 
272 aa  412  1e-114  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3960  ABC transporter related  73.93 
 
 
265 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0494  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  72.9 
 
 
264 aa  404  1e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.146722  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4034  ABC transporter related  72.9 
 
 
264 aa  403  1e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2679  ABC transporter, ATP-binding protein  71.54 
 
 
265 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0252  ABC transporter, ATP-binding protein  71.54 
 
 
288 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.616609  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0039  ABC transporter, ATP-binding protein  71.54 
 
 
265 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2698  ABC transporter, ATP-binding protein  71.54 
 
 
288 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0034  ABC transporter related  72.37 
 
 
265 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0039  ABC transporter, ATP-binding protein  71.54 
 
 
265 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0035  ABC transporter related  71.15 
 
 
265 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3273  ABC transporter, ATP-binding protein  71.54 
 
 
288 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1854  ABC transporter, ATP-binding protein  71.54 
 
 
265 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.812783  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3217  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  71.98 
 
 
265 aa  395  1e-109  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.701162 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0036  ABC transporter, ATP-binding protein  71.43 
 
 
265 aa  396  1e-109  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0052  ABC transporter related  71.98 
 
 
265 aa  396  1e-109  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0037  ABC transporter related  71.98 
 
 
265 aa  396  1e-109  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.613239  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0025  ABC transporter related  71.98 
 
 
265 aa  395  1e-109  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0033  ABC transporter related  71.98 
 
 
265 aa  396  1e-109  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0951  ABC transporter related  63.78 
 
 
264 aa  335  7e-91  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.438313  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5601  ABC transporter related  60 
 
 
267 aa  317  1e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.059714  normal  0.713913 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2121  ABC transporter-related protein  55.85 
 
 
270 aa  298  9e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0515525  normal  0.0482429 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2104  ABC transporter related  55.47 
 
 
282 aa  295  7e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0748494  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1043  ABC transporter related  55.6 
 
 
270 aa  294  1e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1135  ABC transporter related  55.21 
 
 
270 aa  293  3e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.185737  normal  0.382668 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1199  ABC transporter ATP-binding protein  54.62 
 
 
270 aa  290  2e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.621607  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1831  ABC transporter related  53.99 
 
 
270 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.747209  normal  0.153605 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2273  ABC transporter related  52.65 
 
 
275 aa  283  2.0000000000000002e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2356  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  54.37 
 
 
270 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0659325  normal  0.0382396 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2747  ABC transporter related  52.87 
 
 
269 aa  281  9e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.769453  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0956  ABC transporter related  54.37 
 
 
274 aa  278  6e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.279168  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4036  ABC transporter related  53.52 
 
 
273 aa  271  9e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.494746  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4148  ABC transporter related  53.52 
 
 
273 aa  271  9e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.958173  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3591  ABC transporter related  50.93 
 
 
281 aa  270  2e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0286  ABC transporter, ATP binding protein  51.54 
 
 
281 aa  267  1e-70  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2253  ABC transporter related  50.98 
 
 
286 aa  266  2e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.460298  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0262  ABC transporter, ATP binding protein  51.54 
 
 
281 aa  266  2.9999999999999995e-70  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.263629  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2335  ABC transporter related  50.55 
 
 
281 aa  265  8.999999999999999e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.853701  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2106  ABC transporter related  51.16 
 
 
272 aa  263  2e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.452782  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3335  ABC transporter related  50.59 
 
 
268 aa  263  4e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.127136  normal  0.191022 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2257  ABC transporter related  53.75 
 
 
285 aa  262  4.999999999999999e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1055  ABC transporter related  51.95 
 
 
292 aa  261  8.999999999999999e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.258334  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1433  ABC transporter related  51.95 
 
 
292 aa  261  1e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.567066  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6068  ABC transporter ATP-binding protein  51.17 
 
 
270 aa  257  1e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3211  ABC transporter related  48.89 
 
 
282 aa  257  2e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.289662  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0218  ABC transporter related  47.83 
 
 
251 aa  251  8.000000000000001e-66  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4883  ABC transporter related  49.22 
 
 
269 aa  251  1e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.641028  normal  0.709013 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3277  translation initiation factor IF-2  51.38 
 
 
261 aa  250  2e-65  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00123612  normal  0.0327391 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0230  ABC transporter related protein  47.66 
 
 
275 aa  248  1e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0079  ABC transporter related  47.15 
 
 
307 aa  240  2e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4936  ABC transporter related protein  45.77 
 
 
278 aa  240  2e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0551994  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3034  ABC transporter related  44.93 
 
 
292 aa  240  2e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.652183  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4305  ABC transporter related  47.06 
 
 
273 aa  239  5e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272884  hitchhiker  0.0022322 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1481  ABC transporter related  45.79 
 
 
283 aa  237  2e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  43.3 
 
 
258 aa  236  2e-61  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1691  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  45.69 
 
 
280 aa  235  7e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0162641  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2675  putative ABC transporter, ATP-binding protein  47.48 
 
 
281 aa  235  8e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658028  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0087  ABC transporter related  47.56 
 
 
263 aa  233  3e-60  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1075  ABC transporter related  42.86 
 
 
252 aa  231  7.000000000000001e-60  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.137281  normal  0.464106 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3083  ABC transporter related  49.78 
 
 
306 aa  231  1e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.724622  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5062  ABC transporter related  47.56 
 
 
246 aa  229  4e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.314971  normal  0.024914 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44540  ABC transporter  44.94 
 
 
288 aa  228  9e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0398  ABC transporter related  46.59 
 
 
259 aa  227  2e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.698259 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1262  ABC transporter related  45.6 
 
 
259 aa  227  2e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0287206  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1183  ABC transporter related  43.87 
 
 
279 aa  226  3e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0458641  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4567  ABC transporter related  44 
 
 
260 aa  223  2e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1857  ABC transporter related  43.39 
 
 
304 aa  223  3e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0513  ABC transporter related  42.86 
 
 
254 aa  223  3e-57  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3876  ABC transporter related  44.81 
 
 
297 aa  223  4e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6427  ABC transporter related  45.99 
 
 
303 aa  222  4e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5555  ABC transporter related  45.99 
 
 
303 aa  222  4e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356356  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5920  ABC transporter related  45.99 
 
 
303 aa  222  4e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0445  ABC transporter related  44.66 
 
 
254 aa  222  7e-57  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1475  ABC transporter related  43.87 
 
 
254 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1387  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  45.99 
 
 
304 aa  219  3e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.195746  normal  0.160104 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0826  ABC transporter, ATPase subunit  45.42 
 
 
273 aa  219  3e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.617854  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8276  ABC-type transporter, ATP-binding protein  44.4 
 
 
264 aa  219  3.9999999999999997e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0845  ABC transporter related  42.8 
 
 
276 aa  219  5e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.287253 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1030  ABC transporter, ATP-binding protein  44.25 
 
 
254 aa  219  6e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0392  ABC transporter related  43.25 
 
 
254 aa  219  6e-56  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.238571  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7628  ABC transporter ATP-binding protein  47.6 
 
 
281 aa  218  7e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.494067  normal  0.333376 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0792  ABC transporter related protein  46.93 
 
 
308 aa  218  7e-56  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1900  ABC transporter related  45.23 
 
 
269 aa  218  7e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4929  ABC transporter-like  42.46 
 
 
278 aa  218  7.999999999999999e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5800  ABC transporter related  44.4 
 
 
284 aa  218  8.999999999999998e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5225  ABC transporter related  44.21 
 
 
304 aa  218  1e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.272963  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3906  ABC transporter related  47.79 
 
 
315 aa  217  2e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.118447  normal  0.091795 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2133  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  44 
 
 
252 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4050  ABC transporter related  42.91 
 
 
289 aa  216  2.9999999999999998e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.95226  normal  0.382919 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4356  ABC transporter related  45.2 
 
 
275 aa  216  4e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0157567  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1899  ABC transporter-related protein  45.26 
 
 
264 aa  215  5e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.126966  hitchhiker  0.000000000000779353 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1260  ABC transporter related  43.9 
 
 
293 aa  215  5.9999999999999996e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.227509 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2836  ABC transporter related  45.49 
 
 
272 aa  215  5.9999999999999996e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.840356  normal  0.83525 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2857  ABC transporter-related protein  44.22 
 
 
259 aa  215  5.9999999999999996e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.99142  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4255  ABC transporter related protein  45.27 
 
 
267 aa  215  5.9999999999999996e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0122186  normal  0.606643 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>