More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_5983 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_5983  ABC transporter ATP-binding protein  100 
 
 		 267 aa  532  1e-150  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.289741 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0104  ABC transporter related  63.86 
 
 		 260 aa  319  3.9999999999999996e-86  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.464024  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0384  ABC transporter related  60.71 
 
 		 288 aa  306  3e-82  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.317269  normal  0.323719 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3541  ABC transporter related  50.85 
 
 		 255 aa  234  1.0000000000000001e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.774244  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1817  ABC transporter  52.05 
 
 		 261 aa  229  4e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1802  ABC transporter related protein  48.52 
 
 		 267 aa  228  6e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00421209  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2333  ABC transporter related protein  50 
 
 		 260 aa  225  6e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3034  ABC transporter related  49.78 
 
 		 292 aa  222  4.9999999999999996e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.652183  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5351  ABC transporter related  48.09 
 
 		 262 aa  221  9.999999999999999e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5440  ABC transporter related  48.09 
 
 		 262 aa  221  9.999999999999999e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.556345 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5730  ABC transporter related  48.09 
 
 		 259 aa  221  9.999999999999999e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0378  hypothetical protein  46.64 
 
 		 260 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0285  ABC transporter related protein  47.39 
 
 		 267 aa  217  1e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.120651  hitchhiker  0.0000760001 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4096  ABC transporter related protein  48.71 
 
 		 261 aa  216  2e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0795194 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3080  ABC transporter related  43.46 
 
 		 290 aa  217  2e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.178187  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  45.22 
 
 		 258 aa  216  4e-55  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1899  ABC transporter-related protein  48.72 
 
 		 264 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.126966  hitchhiker  0.000000000000779353 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1260  ABC transporter related  43.66 
 
 		 293 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.227509 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34330  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  45.81 
 
 		 262 aa  213  1.9999999999999998e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4050  ABC transporter related  42.8 
 
 		 289 aa  213  1.9999999999999998e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.95226  normal  0.382919 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1421  ABC transporter related  43.66 
 
 		 293 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1733  ABC transporter related protein  49.12 
 
 		 265 aa  212  3.9999999999999995e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4936  ABC transporter related protein  52.2 
 
 		 278 aa  212  3.9999999999999995e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0551994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18140  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  52.86 
 
 		 267 aa  211  7e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2804  ABC transporter related protein  44.25 
 
 		 256 aa  211  7.999999999999999e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00228299  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4331  alkanesulfonate ABC transporter ATP-binding protein  48.8 
 
 		 256 aa  211  7.999999999999999e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2274  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  50 
 
 		 265 aa  211  1e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.362973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1368  ABC transporter ATP-binding protein  47.46 
 
 		 278 aa  211  1e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0478866 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1075  ABC transporter related  46.09 
 
 		 252 aa  210  2e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.137281  normal  0.464106 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0235  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  50.43 
 
 		 267 aa  210  2e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.926583  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1691  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  50 
 
 		 280 aa  208  6e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0162641  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7628  ABC transporter ATP-binding protein  49.76 
 
 		 281 aa  208  6e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.494067  normal  0.333376 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0392  ABC transporter related  44.59 
 
 		 254 aa  208  7e-53  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.238571  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1024  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  45.38 
 
 		 288 aa  208  9e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0928841 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5062  ABC transporter related  42.63 
 
 		 246 aa  207  1e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.314971  normal  0.024914 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3570  ABC transporter related  48.75 
 
 		 265 aa  207  1e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.476626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3269  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  48.93 
 
 		 270 aa  207  1e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.454908  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1210  ABC transporter related  45.12 
 
 		 287 aa  207  1e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.502786  normal  0.459492 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1475  ABC transporter related  43.72 
 
 		 254 aa  207  1e-52  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0256  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  50 
 
 		 267 aa  206  2e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.378501 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7645  putative sulfonate ABC transporter, ATP binding protein  45.99 
 
 		 261 aa  206  2e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0412308  normal  0.633643 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0769  ABC transporter related  47.81 
 
 		 252 aa  206  3e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.159721 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2103  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  48.7 
 
 		 263 aa  206  4e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0097031  normal  0.0581699 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3751  ABC transporter, ATPase subunit  47.84 
 
 		 271 aa  206  4e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7248  ABC transporter ATP-binding protein  47.27 
 
 		 222 aa  205  6e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00375076  normal  0.359257 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1412  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  47.21 
 
 		 271 aa  205  6e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.867581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0513  ABC transporter related  42.42 
 
 		 254 aa  205  7e-52  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2480  ABC transporter related protein  44.69 
 
 		 263 aa  205  7e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0445  ABC transporter related  43.72 
 
 		 254 aa  205  7e-52  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3892  ABC transporter related  46.61 
 
 		 271 aa  205  7e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3524  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  48.7 
 
 		 269 aa  204  8e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.569935  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4565  ABC transporter related  47.77 
 
 		 281 aa  204  1e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0435  ABC transporter related  41.59 
 
 		 256 aa  204  1e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.30818  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0218  ABC transporter related  47.17 
 
 		 251 aa  204  1e-51  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3808  ABC transporter-related protein  47.84 
 
 		 271 aa  204  2e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1975  ABC transporter related  44.93 
 
 		 263 aa  203  2e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000056178  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1135  ABC transporter related  43.58 
 
 		 270 aa  203  3e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.185737  normal  0.382668 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5421  ABC transporter related  48.9 
 
 		 294 aa  202  3e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4642  ABC transporter related  46.96 
 
 		 284 aa  203  3e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.842575  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2802  ABC transporter related protein  51.67 
 
 		 260 aa  202  3e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5606  ABC transporter related protein  47.83 
 
 		 264 aa  202  3e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.231398  normal  0.622338 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1043  ABC transporter related  43.58 
 
 		 270 aa  203  3e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4077  ABC transporter related protein  46.52 
 
 		 290 aa  202  4e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.264112 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1025  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  43.82 
 
 		 667 aa  202  5e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.129474 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2556  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  47.72 
 
 		 274 aa  202  5e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.140772  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0087  ABC transporter related  44.69 
 
 		 263 aa  201  7e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0275  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  49.57 
 
 		 267 aa  201  7e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.219358 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0328  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  49.13 
 
 		 267 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2104  ABC transporter related  44.59 
 
 		 282 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0748494  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3870  ABC transporter related  49.33 
 
 		 272 aa  201  9.999999999999999e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1237  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  44.44 
 
 		 659 aa  200  1.9999999999999998e-50  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0113  ABC transporter related  44.3 
 
 		 261 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.692675 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7233  ABC transporter related  46.22 
 
 		 285 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.373776  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2147  ABC transporter related  45.65 
 
 		 274 aa  200  1.9999999999999998e-50  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2967  ABC transporter-related protein  44.74 
 
 		 259 aa  201  1.9999999999999998e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0379202  normal  0.762779 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1491  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  43.46 
 
 		 278 aa  200  3e-50  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.495722  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6201  ABC transporter related  45.42 
 
 		 245 aa  199  3e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.102037 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3912  ABC transporter related  44.27 
 
 		 276 aa  199  3e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00786464  normal  0.17343 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0735  ABC transporter related  43.91 
 
 		 253 aa  199  3e-50  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0415182  normal  0.371016 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8276  ABC-type transporter, ATP-binding protein  51.28 
 
 		 264 aa  199  3e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1847  ABC transporter ATP-binding protein  41.46 
 
 		 272 aa  199  3.9999999999999996e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4675  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  42.52 
 
 		 280 aa  199  3.9999999999999996e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4569  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  42.86 
 
 		 275 aa  199  3.9999999999999996e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.571931  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2833  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  48.92 
 
 		 267 aa  199  3.9999999999999996e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.848417  normal  0.24141 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0876  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  42.31 
 
 		 278 aa  199  5e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.190681  hitchhiker  0.00187528 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1956  ABC transporter related  43.69 
 
 		 272 aa  199  5e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1258  ABC transporter related  43.6 
 
 		 244 aa  199  5e-50  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3876  ABC transporter related  42.61 
 
 		 297 aa  199  5e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1199  ABC transporter ATP-binding protein  47.21 
 
 		 270 aa  198  6e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.621607  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2274  ABC transporter ATP-binding protein  43.69 
 
 		 272 aa  198  7e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3148  ABC transporter related  44.16 
 
 		 266 aa  198  7e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1490  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  44.78 
 
 		 663 aa  198  7.999999999999999e-50  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.810592  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4347  ABC transporter related  45.53 
 
 		 281 aa  198  7.999999999999999e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3505  ABC transporter related  45.53 
 
 		 281 aa  198  7.999999999999999e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.870495  hitchhiker  0.000930317 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4019  ABC transporter related  45.53 
 
 		 281 aa  198  7.999999999999999e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2151  ABC transporter related  44.1 
 
 		 263 aa  197  1.0000000000000001e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.532453 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4923  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  41.83 
 
 		 668 aa  197  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.502071 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2064  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  46.32 
 
 		 281 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.768493  normal  0.657795 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2099  ABC transporter related  45.69 
 
 		 298 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0849  ABC transporter-related protein  45.06 
 
 		 253 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0140067  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>