More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_2275 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_2275  ABC transporter related  100 
 
 		 273 aa  536  1e-151  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.753386  normal  0.352835 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2096  ABC transporter related  95.6 
 
 		 273 aa  491  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.487139 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3637  sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  94.51 
 
 		 273 aa  483  1e-135  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.854122  normal  0.438372 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34500  putative ATP-binding component of ABC transporter  76.28 
 
 		 278 aa  378  1e-104  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000586  normal  0.0781306 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2930  ABC transporter ATP-binding protein  76.28 
 
 		 278 aa  377  1e-103  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.232111  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0458  ABC transporter, ATPase subunit  64 
 
 		 270 aa  318  3.9999999999999996e-86  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0101  nitrate/nitrite/cyanate ABC transporter ATPase  62.14 
 
 		 264 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.435899  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1539  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  58 
 
 		 264 aa  279  3e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6512  ABC transporter related  58.57 
 
 		 264 aa  258  8e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6746  ABC transporter related  58.57 
 
 		 264 aa  258  8e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.665072  normal  0.226989 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6335  ABC transporter related  56.6 
 
 		 264 aa  258  8e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5824  ABC transporter related  52.57 
 
 		 271 aa  255  6e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.971522  normal  0.461602 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2628  sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  51 
 
 		 270 aa  239  5e-62  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.197945  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2857  ABC transporter-related protein  43.31 
 
 		 259 aa  204  1e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.99142  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2718  ABC transporter related  43.31 
 
 		 259 aa  203  3e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4923  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  43.85 
 
 		 668 aa  200  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.502071 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4034  ABC transporter related  47.64 
 
 		 276 aa  199  3e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.105857 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7505  ABC transporter, ATPase subunit  46.81 
 
 		 273 aa  199  3e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000247297  normal  0.575396 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1490  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  41.09 
 
 		 663 aa  199  3.9999999999999996e-50  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.810592  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4676  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  42.69 
 
 		 673 aa  199  5e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1572  ABC transporter related protein  41.44 
 
 		 267 aa  198  6e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2598  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  41.73 
 
 		 669 aa  198  7e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.992008  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3519  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  41.73 
 
 		 669 aa  198  7e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3009  ABC transporter related  45.92 
 
 		 245 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1975  ABC transporter related  40.84 
 
 		 263 aa  196  3e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000056178  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1358  ABC transporter related  42.92 
 
 		 262 aa  196  3e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7645  putative sulfonate ABC transporter, ATP binding protein  44.87 
 
 		 261 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0412308  normal  0.633643 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1919  ABC transporter related  44.25 
 
 		 265 aa  195  5.000000000000001e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1117  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  41.63 
 
 		 265 aa  195  7e-49  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5010  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  44.39 
 
 		 264 aa  194  9e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.453812  normal  0.426331 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3314  putative nitrate ABC transporter, ATP-binding protein  39.16 
 
 		 292 aa  194  1e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.662783  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3655  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  45.11 
 
 		 263 aa  194  1e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1155  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  38.78 
 
 		 264 aa  194  1e-48  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0275  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  42.62 
 
 		 267 aa  194  1e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.219358 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6521  ABC transporter related  44.64 
 
 		 270 aa  194  1e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6755  ABC transporter related  44.64 
 
 		 270 aa  194  1e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0664482 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1384  ABC transporter related protein  49.17 
 
 		 277 aa  194  1e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0283767 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2592  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  45.3 
 
 		 290 aa  194  2e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.939043  normal  0.0506059 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2904  ABC transporter related  44.58 
 
 		 270 aa  194  2e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6344  ABC transporter related  45.11 
 
 		 270 aa  194  2e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.942875  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3440  ABC transporter related  46.27 
 
 		 275 aa  193  2e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.358394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4059  ABC transporter related  39.38 
 
 		 276 aa  193  3e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1802  ABC transporter related protein  43.87 
 
 		 267 aa  193  3e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00421209  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0218  ABC transporter related  40.73 
 
 		 251 aa  192  4e-48  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5730  ABC transporter related  42.34 
 
 		 259 aa  192  5e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1107  ABC transporter related  47.71 
 
 		 255 aa  192  5e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.129879 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5351  ABC transporter related  42.34 
 
 		 262 aa  192  5e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5440  ABC transporter related  42.34 
 
 		 262 aa  192  5e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.556345 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4542  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  43.97 
 
 		 657 aa  192  6e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3643  ABC transporter related  44.03 
 
 		 259 aa  192  6e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.857726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1817  ABC transporter  45.69 
 
 		 261 aa  192  6e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2599  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  42.44 
 
 		 285 aa  192  6e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3518  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  42.44 
 
 		 285 aa  192  6e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3525  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  42.21 
 
 		 669 aa  191  1e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.769679 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22550  ABC transporter ATP-binding protein  46.22 
 
 		 255 aa  191  1e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0325  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  41.3 
 
 		 268 aa  191  1e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4494  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  43.95 
 
 		 264 aa  191  1e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4957  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  43.95 
 
 		 264 aa  191  1e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0893912  normal  0.168509 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3745  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  42.86 
 
 		 264 aa  190  2e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.267021  normal  0.105964 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0328  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  42.86 
 
 		 267 aa  190  2e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3867  ABC transporter related  43.67 
 
 		 265 aa  190  2e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.685954  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0113  ABC transporter related  42.13 
 
 		 261 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.692675 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1705  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  44.44 
 
 		 263 aa  189  2.9999999999999997e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3676  ABC transporter related  44.08 
 
 		 266 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.618015 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0667  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  41.74 
 
 		 266 aa  189  2.9999999999999997e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0738173  normal  0.024802 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2817  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  39.25 
 
 		 282 aa  189  4e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.042803  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1236  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  43.21 
 
 		 274 aa  189  4e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.875823 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0792  ABC transporter related protein  43.48 
 
 		 308 aa  189  4e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03652  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  40 
 
 		 295 aa  189  4e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3306  alkanesulfonate ABC transporter, ATP binding protein  44.49 
 
 		 263 aa  189  5e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0832  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  42.47 
 
 		 266 aa  189  5.999999999999999e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0180389 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2688  ABC transporter related  43.27 
 
 		 264 aa  188  5.999999999999999e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.232656  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2967  ABC transporter-related protein  42.06 
 
 		 259 aa  189  5.999999999999999e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0379202  normal  0.762779 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0528  ABC transporter related  39.74 
 
 		 247 aa  189  5.999999999999999e-47  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4675  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  42.42 
 
 		 280 aa  188  7e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2375  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  40.95 
 
 		 268 aa  188  7e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3524  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  42.06 
 
 		 269 aa  188  7e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.569935  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4543  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  43.53 
 
 		 277 aa  187  1e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3269  ABC transporter related  47.14 
 
 		 263 aa  187  1e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.874896 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3159  ABC transporter-like  42.45 
 
 		 282 aa  187  1e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4843  putative ABC transporter ATP-binding protein  41.09 
 
 		 284 aa  187  1e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.365039 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1237  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  44.17 
 
 		 659 aa  188  1e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4922  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  41.48 
 
 		 286 aa  187  1e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.659379  normal  0.550165 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4149  ABC transporter related  43.67 
 
 		 266 aa  187  1e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0621662 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1390  NO3-/NO2- ABC transporter  41.05 
 
 		 266 aa  187  1e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.365373 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3083  ABC transporter related  41.41 
 
 		 306 aa  187  1e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.724622  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4570  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  40.73 
 
 		 668 aa  187  1e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.177412  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0209  nitrate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  43.19 
 
 		 283 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.465549 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0779  ABC transporter related  43.55 
 
 		 249 aa  186  2e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21980  ABC transporter, ATP binding component  44.21 
 
 		 271 aa  187  2e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1759  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  43.27 
 
 		 275 aa  187  2e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.352483  hitchhiker  0.00557552 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2556  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  41.46 
 
 		 274 aa  186  2e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.140772  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1045  ABC transporter related  40.42 
 
 		 259 aa  187  2e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.162928  normal  0.159703 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2103  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  41.05 
 
 		 263 aa  187  2e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0097031  normal  0.0581699 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3269  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  41.67 
 
 		 270 aa  187  2e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.454908  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2057  ABC transporter related  42.45 
 
 		 280 aa  187  2e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4338  ABC transporter related  43.27 
 
 		 271 aa  186  3e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5606  ABC transporter related protein  42.92 
 
 		 264 aa  186  3e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.231398  normal  0.622338 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3042  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  41.56 
 
 		 557 aa  186  3e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.499138  normal  0.908503 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2502  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  41.31 
 
 		 264 aa  186  3e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.541276  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>