More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1556 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_1556  ABC transporter related protein  100 
 
 
245 aa  495  1e-139  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000121987  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1348  ABC transporter-related protein  59.27 
 
 
246 aa  297  1e-79  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00000000711839  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1807  ABC transporter related  46.89 
 
 
286 aa  214  8e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.199283  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2681  ABC transporter related  40.5 
 
 
277 aa  184  1.0000000000000001e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4167  ABC transporter related  39.09 
 
 
249 aa  176  4e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.555902 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1308  ABC transporter related  39.71 
 
 
252 aa  165  5e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1933  ABC transporter related  38.73 
 
 
238 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.306396  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4535  ABC transporter, ATP-binding protein  42.79 
 
 
254 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2866  ABC transporter related protein  38.98 
 
 
299 aa  162  6e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4936  ABC transporter, ATP-binding protein  42.79 
 
 
254 aa  161  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4516  ABC transporter, ATP-binding protein  42.31 
 
 
254 aa  161  8.000000000000001e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4922  ABC transporter, ATP-binding protein  42.31 
 
 
254 aa  161  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0336  ABC transporter, ATP-binding protein  42.31 
 
 
254 aa  160  1e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4676  ABC transporter ATP-binding protein  42.31 
 
 
254 aa  161  1e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5037  ABC transporter ATP-binding protein  42.31 
 
 
254 aa  161  1e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4038  ABC transporter related  35.39 
 
 
265 aa  159  3e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0203282 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4902  ABC transporter, ATP-binding protein  41.83 
 
 
254 aa  159  4e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1451  ABC transporter related  36.21 
 
 
249 aa  159  4e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0959261 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1096  ABC transporter-related protein  39.81 
 
 
272 aa  157  1e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.689676 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4614  ABC transporter related  42.58 
 
 
254 aa  156  2e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4901  ABC transporter, ATP-binding protein  43 
 
 
229 aa  157  2e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4548  ABC transporter, ATP-binding protein  43.14 
 
 
249 aa  156  3e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0719358  normal  0.368942 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0393  ABC transporter-related protein  38.86 
 
 
281 aa  156  3e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00688519 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0493  sulfonate/nitrate/taurine transport system ATP-binding  36.07 
 
 
249 aa  155  4e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.187647  normal  0.442901 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0613  ABC transporter-related protein  42.08 
 
 
249 aa  155  4e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0372  ABC transporter-related protein  37.67 
 
 
250 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0642  ABC transporter related  42.65 
 
 
249 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2311  putative sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  40.36 
 
 
251 aa  155  6e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.89952  hitchhiker  0.0000000038093 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0880  ABC transporter, ATP-binding protein  42.65 
 
 
249 aa  155  8e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.018154  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0692  ABC transporter ATP-binding protein  42.16 
 
 
249 aa  154  1e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0636  ABC transporter, ATP-binding protein  42.16 
 
 
249 aa  154  1e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000460876  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0636  ABC transporter, ATP-binding protein  42.16 
 
 
249 aa  154  1e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0803  ABC transporter, ATP-binding protein  42.16 
 
 
249 aa  154  1e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.17589e-46 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0726  ABC transporter ATP-binding protein  42.16 
 
 
249 aa  154  1e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00713867  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0422  nitrate transport ATP-binding protein NrtC  39.32 
 
 
229 aa  154  2e-36  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0783  ABC transporter, ATP-binding protein  42.16 
 
 
249 aa  153  2e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.403076  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2665  alkanesulfonates transport ATP-binding protein  37.92 
 
 
251 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.273275  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2921  putative sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  37.92 
 
 
251 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.88235e-19 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2922  sulfonate ABC transporter ATP-binding protein  37.92 
 
 
251 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.900883  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0796  ABC transporter, ATP-binding protein  42.16 
 
 
249 aa  152  4e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2714  sulfonate ABC transporter ATP-binding protein  38.08 
 
 
287 aa  152  4e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0521621  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2932  putative sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  39.09 
 
 
251 aa  152  5e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0768  ABC transporter, conserved site  38.63 
 
 
432 aa  152  5e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1104  ABC transporter related protein  38.56 
 
 
426 aa  152  7e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.770233  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2642  alkanesulfonates transport ATP-binding protein  37.93 
 
 
251 aa  151  8.999999999999999e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.164892  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0621  ABC transporter related  37.67 
 
 
276 aa  150  1e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2783  ABC transporter related  41.9 
 
 
257 aa  150  2e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2968  putative sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  37.93 
 
 
251 aa  150  2e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.503094  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1857  ABC transporter related  37.34 
 
 
304 aa  150  2e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2563  ABC-transport protein, ATP-binding protein  37.2 
 
 
288 aa  150  2e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.25889 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5601  ABC transporter related  39.52 
 
 
267 aa  149  3e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.059714  normal  0.713913 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0792  ABC transporter related protein  37.5 
 
 
308 aa  148  6e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0079  ABC transporter related  37.25 
 
 
307 aa  149  6e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0347  ABC transporter, ATP-binding protein  40.28 
 
 
511 aa  148  7e-35  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5090  ABC transporter  37.45 
 
 
433 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24170  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  38.83 
 
 
330 aa  147  1.0000000000000001e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.505798  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0271  ABC transporter related  37.55 
 
 
435 aa  147  1.0000000000000001e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.342926 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2961  sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  39.53 
 
 
251 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0749803  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0243  ABC transporter related  36.77 
 
 
240 aa  147  2.0000000000000003e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.498468  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6282  ABC transporter related  36.44 
 
 
266 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.166424  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2675  putative ABC transporter, ATP-binding protein  38.14 
 
 
281 aa  146  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658028  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2434  ABC transporter related protein  39.91 
 
 
276 aa  146  3e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0618237 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3960  ABC transporter related  37.27 
 
 
286 aa  145  4.0000000000000006e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2359  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  36.53 
 
 
259 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.504714 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4759  ABC transporter related  33.88 
 
 
276 aa  146  4.0000000000000006e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.328175  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2155  ABC transporter related  38.66 
 
 
448 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000186456 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1677  ABC transporter related  39.34 
 
 
274 aa  145  4.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.012686  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5550  ABC transporter, ATP-binding protein  37.02 
 
 
434 aa  145  5e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1139  ABC transporter related  37.73 
 
 
280 aa  145  5e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.573194  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1153  ABC transporter related  38.1 
 
 
246 aa  145  5e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5527  ABC transporter related  39.91 
 
 
448 aa  145  5e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.690154 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3083  ABC transporter related  36.52 
 
 
306 aa  145  5e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.724622  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3611  ABC transporter related  39.91 
 
 
448 aa  145  5e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.635562  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4756  ABC transporter related  39.91 
 
 
448 aa  145  5e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.230075 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2786  ABC transporter, ATP-binding protein  38.29 
 
 
232 aa  145  6e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0961461  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3455  ABC transporter-related protein  41.63 
 
 
254 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.302044  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17270  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  39.49 
 
 
274 aa  145  8.000000000000001e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.115827  normal  0.528564 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2623  ABC transporter related  40.58 
 
 
255 aa  144  9e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000578325  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0035  ABC transporter related  40.67 
 
 
278 aa  144  9e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4664  ABC transporter related  37.8 
 
 
274 aa  144  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.456657 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0279  taurine transporter ATP-binding subunit  35.04 
 
 
255 aa  144  1e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  38.35 
 
 
258 aa  144  1e-33  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0972  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  39.47 
 
 
448 aa  144  1e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2984  ABC transporter related  38.22 
 
 
271 aa  144  1e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3382  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  37.39 
 
 
448 aa  144  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.433884 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0876  ABC transporter related  38.05 
 
 
218 aa  144  1e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0441  taurine transporter ATP-binding subunit  34.65 
 
 
255 aa  144  1e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1130  ABC transporter related  37.39 
 
 
448 aa  144  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1746  ABC transporter related  40.21 
 
 
333 aa  144  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4604  ABC transporter related  38.24 
 
 
448 aa  143  2e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.988663  normal  0.150792 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5724  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  38.24 
 
 
445 aa  143  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4186  ABC transporter related  38.24 
 
 
273 aa  144  2e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.431014 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3465  ABC transporter related  37.74 
 
 
241 aa  143  2e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.158921  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2850  ABC transporter related  36.11 
 
 
255 aa  143  2e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.220732  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3900  ABC transporter related  35.81 
 
 
228 aa  144  2e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2306  ABC transporter related  38.24 
 
 
445 aa  143  2e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.72885  normal  0.89546 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2401  ABC transporter related  38.24 
 
 
445 aa  143  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.381271  normal  0.0482566 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2442  ABC transporter related  38.24 
 
 
445 aa  143  2e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.383367  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4139  ABC transporter related  38.24 
 
 
453 aa  143  2e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.131853 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2397  ABC transporter related  38.24 
 
 
445 aa  143  2e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.579445  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>