More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_1139 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_1139  ABC transporter related  100 
 
 		 280 aa  579  1e-164  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.573194  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3960  ABC transporter related  87.5 
 
 		 286 aa  487  1e-137  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1092  ABC transporter-related protein  88.89 
 
 		 274 aa  483  1e-135  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.44747  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1096  ABC transporter-related protein  78.95 
 
 		 272 aa  444  1e-123  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.689676 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2128  ABC transporter related  77.07 
 
 		 284 aa  429  1e-119  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.249776 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0393  ABC transporter-related protein  73.85 
 
 		 281 aa  402  1e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00688519 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3757  ABC transporter related  61.41 
 
 		 260 aa  318  5e-86  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1394  ABC transporter-like protein  53.67 
 
 		 267 aa  300  2e-80  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.317135  normal  0.304507 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3605  ABC transporter related  49.81 
 
 		 287 aa  258  7e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.475451  normal  0.0732889 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2974  ABC transporter related  51.36 
 
 		 262 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0639393 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2600  ABC transporter related  50.78 
 
 		 298 aa  247  1e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0941  ABC transporter, ATPase subunit  50.78 
 
 		 297 aa  247  2e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1860  ABC transporter related  48.93 
 
 		 259 aa  232  4.0000000000000004e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.188134  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1940  ABC transporter ATP binding protein  50 
 
 		 266 aa  229  5e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000682948 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2984  ABC transporter related  48.31 
 
 		 271 aa  225  6e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7628  ABC transporter ATP-binding protein  46.41 
 
 		 281 aa  222  6e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.494067  normal  0.333376 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0618  ABC transporter related  47.21 
 
 		 259 aa  221  8e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3418  ABC transporter related  44.32 
 
 		 284 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.647429  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3905  ABC transporter related  49.79 
 
 		 271 aa  219  3e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3167  ABC transporter, ATPase subunit  49.79 
 
 		 271 aa  219  3e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.973861  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3180  ABC transporter related  47.88 
 
 		 254 aa  218  1e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.219824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2544  ABC transporter  45.61 
 
 		 269 aa  217  1e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.569384  normal  0.531117 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0771  ABC transporter related  45.71 
 
 		 271 aa  218  1e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3119  ABC transporter related  48.92 
 
 		 267 aa  216  4e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3130  ABC transporter related  46.86 
 
 		 278 aa  214  9e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1168  putative ABC transporter, ATP-binding protein  45.99 
 
 		 275 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4579  ABC transporter related  47.32 
 
 		 262 aa  211  1e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3092  ABC transporter related  42.25 
 
 		 275 aa  208  7e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.935227  normal  0.896647 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3879  ABC transporter related  49.77 
 
 		 258 aa  206  4e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.898001  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6051  ABC transporter related  49.53 
 
 		 262 aa  206  5e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.152569  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4270  ABC transporter related  48.84 
 
 		 257 aa  203  3e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.74821  normal  0.0108203 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3100  ABC transporter related  42.62 
 
 		 276 aa  203  3e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.872567 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2563  ABC-transport protein, ATP-binding protein  43.72 
 
 		 288 aa  202  7e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.25889 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0209  nitrate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  46.46 
 
 		 283 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.465549 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4202  ABC transporter related  44.67 
 
 		 286 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.657394  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6155  ABC transporter related  44.67 
 
 		 286 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.300039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0346  ABC transporter related  46.47 
 
 		 278 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3034  ABC transporter related  45.58 
 
 		 265 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.971108  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2086  ABC transporter related  43.02 
 
 		 291 aa  196  5.000000000000001e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.124601 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1645  ABC transporter related  46.12 
 
 		 253 aa  196  5.000000000000001e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2702  ABC transporter related  41.25 
 
 		 263 aa  194  1e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1817  ABC transporter  44.09 
 
 		 261 aa  194  2e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6033  putative ABC transporter, ATP-binding protein  42.74 
 
 		 261 aa  193  3e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44540  ABC transporter  43.36 
 
 		 288 aa  193  3e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3115  ABC transporter related  46.49 
 
 		 272 aa  192  6e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.200151  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0513  ABC transporter related  43.26 
 
 		 254 aa  192  6e-48  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2760  ABC transporter related protein  42.19 
 
 		 278 aa  191  9e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.398097  normal  0.0252415 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3159  ABC transporter-like  44.2 
 
 		 282 aa  191  2e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2275  ABC transporter related  44.68 
 
 		 264 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0996963 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0156  ABC transporter related  41.95 
 
 		 260 aa  190  2.9999999999999997e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5009  ABC transporter related  45.13 
 
 		 285 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0621  ABC transporter related  41.35 
 
 		 276 aa  190  2.9999999999999997e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1667  ABC transporter related  43.67 
 
 		 260 aa  189  5e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0642211  normal  0.357453 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1802  ABC transporter related protein  41.47 
 
 		 267 aa  189  5.999999999999999e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00421209  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3136  ABC transporter related protein  41.31 
 
 		 261 aa  189  5.999999999999999e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.257722  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0035  ABC transporter related  43.4 
 
 		 278 aa  187  1e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5601  ABC transporter related  44.21 
 
 		 267 aa  187  1e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.059714  normal  0.713913 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1900  ABC transporter related  40.24 
 
 		 269 aa  187  1e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2563  ABC transporter related  42.19 
 
 		 252 aa  187  1e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2628  ABC transporter related  41.86 
 
 		 275 aa  187  2e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3876  ABC transporter related  40.52 
 
 		 297 aa  187  2e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2369  ABC transporter related  40.7 
 
 		 263 aa  187  2e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0194302  normal  0.406873 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0528  ABC transporter related  41.3 
 
 		 247 aa  187  2e-46  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2526  ABC transporter related  42.19 
 
 		 252 aa  187  2e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2571  ABC transporter related  42.19 
 
 		 252 aa  187  2e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2954  ABC transporter related  43.21 
 
 		 272 aa  187  2e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5062  ABC transporter related  45.37 
 
 		 272 aa  186  3e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.948706 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4255  ABC transporter related protein  43.04 
 
 		 267 aa  186  3e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0122186  normal  0.606643 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5342  ABC transporter related  45.37 
 
 		 272 aa  186  3e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.682879 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1815  ABC transporter related  43.78 
 
 		 266 aa  186  4e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.463697  normal  0.452124 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4356  ABC transporter related  45.54 
 
 		 275 aa  186  4e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0157567  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4305  ABC transporter related  43.09 
 
 		 273 aa  186  5e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272884  hitchhiker  0.0022322 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2802  ABC transporter related protein  44.17 
 
 		 260 aa  185  6e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5690  ABC transporter related  43.04 
 
 		 246 aa  185  6e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1475  ABC transporter related  39.58 
 
 		 254 aa  185  7e-46  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3040  ABC transporter related  42.19 
 
 		 261 aa  185  9e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.874651  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1030  ABC transporter, ATP-binding protein  42.72 
 
 		 254 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0392  ABC transporter related  40 
 
 		 254 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.238571  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3295  ABC transporter related  41.5 
 
 		 258 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0815311 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1132  ABC transporter related  42.55 
 
 		 301 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.20268 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5603  ABC transporter related protein  39.48 
 
 		 263 aa  184  1.0000000000000001e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2857  ABC transporter-related protein  41.95 
 
 		 259 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.99142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1303  ABC transporter related  43.64 
 
 		 299 aa  184  1.0000000000000001e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.419819  normal  0.779102 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4929  ABC transporter-like  41.81 
 
 		 278 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1481  ABC transporter related  40.57 
 
 		 283 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2836  ABC transporter related  39.35 
 
 		 272 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.840356  normal  0.83525 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2104  ABC transporter related protein  39.7 
 
 		 268 aa  183  2.0000000000000003e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3912  ABC transporter related  41.35 
 
 		 276 aa  183  2.0000000000000003e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00786464  normal  0.17343 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2032  ABC transporter related protein  43.04 
 
 		 278 aa  184  2.0000000000000003e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0545807  normal  0.262342 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1055  ABC transporter related  43.03 
 
 		 292 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.258334  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0327  ABC transporter related  44.21 
 
 		 264 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.341199  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3328  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  45.37 
 
 		 272 aa  184  2.0000000000000003e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1572  ABC transporter related protein  42.47 
 
 		 267 aa  183  2.0000000000000003e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0147  ABC transporter related  39.92 
 
 		 259 aa  184  2.0000000000000003e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.288686 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  38.74 
 
 		 258 aa  183  3e-45  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2253  ABC transporter related  41.09 
 
 		 286 aa  183  3e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.460298  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4642  ABC transporter related  40 
 
 		 284 aa  183  3e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.842575  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6457  ABC transporter ATP-binding protein  41.53 
 
 		 261 aa  183  3e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2044  ABC transporter related  43.08 
 
 		 262 aa  183  3e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.471854  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1371  ABC transporter related  39.54 
 
 		 333 aa  183  3e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.138832  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>