More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_3605 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_3605  ABC transporter related  100 
 
 		 287 aa  574  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.475451  normal  0.0732889 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3757  ABC transporter related  55.98 
 
 		 260 aa  290  2e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0393  ABC transporter-related protein  57.74 
 
 		 281 aa  271  6e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00688519 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1096  ABC transporter-related protein  53.66 
 
 		 272 aa  269  4e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.689676 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2128  ABC transporter related  52.11 
 
 		 284 aa  267  1e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.249776 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1394  ABC transporter-like protein  49.62 
 
 		 267 aa  261  6.999999999999999e-69  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.317135  normal  0.304507 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1139  ABC transporter related  49.81 
 
 		 280 aa  258  7e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.573194  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3960  ABC transporter related  48.26 
 
 		 286 aa  257  2e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1092  ABC transporter-related protein  52.28 
 
 		 274 aa  240  2e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.44747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2974  ABC transporter related  49.36 
 
 		 262 aa  216  2e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0639393 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6033  putative ABC transporter, ATP-binding protein  45.49 
 
 		 261 aa  217  2e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2275  ABC transporter related  48.36 
 
 		 264 aa  216  4e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0996963 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0618  ABC transporter related  42.13 
 
 		 259 aa  214  9.999999999999999e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1168  putative ABC transporter, ATP-binding protein  43.88 
 
 		 275 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1860  ABC transporter related  42.4 
 
 		 259 aa  213  2.9999999999999995e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.188134  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7628  ABC transporter ATP-binding protein  44.27 
 
 		 281 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.494067  normal  0.333376 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2984  ABC transporter related  41.95 
 
 		 271 aa  211  1e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0327  ABC transporter related  46.9 
 
 		 264 aa  211  1e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.341199  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2600  ABC transporter related  45.06 
 
 		 298 aa  211  1e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0941  ABC transporter, ATPase subunit  45.06 
 
 		 297 aa  211  2e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2718  ABC transporter related  43.58 
 
 		 259 aa  209  6e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0771  ABC transporter related  41.2 
 
 		 271 aa  206  4e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6457  ABC transporter ATP-binding protein  45.45 
 
 		 261 aa  206  4e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2760  ABC transporter related protein  46.48 
 
 		 278 aa  206  5e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.398097  normal  0.0252415 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2044  ABC transporter related  45.1 
 
 		 262 aa  206  5e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.471854  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0147  ABC transporter related  42.37 
 
 		 259 aa  205  9e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.288686 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2857  ABC transporter-related protein  41.89 
 
 		 259 aa  204  1e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.99142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3130  ABC transporter related  41.48 
 
 		 278 aa  204  2e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7199  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (nitrate/sulfonates)  48.05 
 
 		 278 aa  203  3e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0286852  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2039  ABC transporter related  45.25 
 
 		 306 aa  203  3e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.768155 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1720  ABC transporter related  44.87 
 
 		 304 aa  202  5e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3034  ABC transporter related  41.7 
 
 		 265 aa  202  6e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.971108  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4096  ABC transporter related protein  48.94 
 
 		 261 aa  202  7e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0795194 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0035  ABC transporter related  41.43 
 
 		 278 aa  201  8e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1081  ABC transporter related  45.97 
 
 		 289 aa  201  8e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0182261 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2526  ABC transporter related  44.79 
 
 		 252 aa  201  9e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2571  ABC transporter related  44.79 
 
 		 252 aa  201  9e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0997  ABC transporter-related protein  43.36 
 
 		 278 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.929403 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2052  ABC transporter related  46.37 
 
 		 284 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.405737 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3141  ABC transporter-related protein  46.09 
 
 		 233 aa  201  9.999999999999999e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0745233  normal  0.0402056 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2703  ABC transporter related  40.37 
 
 		 272 aa  200  1.9999999999999998e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.314887  normal  0.244414 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1045  ABC transporter related  42.8 
 
 		 259 aa  201  1.9999999999999998e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.162928  normal  0.159703 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1733  ABC transporter related  44.96 
 
 		 284 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1358  ABC transporter related  43.4 
 
 		 262 aa  200  3e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3159  ABC transporter-like  42.69 
 
 		 282 aa  200  3e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2104  ABC transporter related protein  43.48 
 
 		 268 aa  199  3e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3040  ABC transporter related  43.14 
 
 		 261 aa  199  3e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.874651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4270  ABC transporter related  47.01 
 
 		 257 aa  200  3e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.74821  normal  0.0108203 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3136  ABC transporter related protein  41.98 
 
 		 261 aa  199  3.9999999999999996e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.257722  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2369  ABC transporter related  41.9 
 
 		 263 aa  199  3.9999999999999996e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0194302  normal  0.406873 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2589  ABC transporter related  41.46 
 
 		 284 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.40805 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1094  ABC transporter related  44.87 
 
 		 299 aa  199  5e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0108861  normal  0.165383 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4184  ABC transporter related  43.54 
 
 		 283 aa  199  5e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.378272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4843  putative ABC transporter ATP-binding protein  46.18 
 
 		 284 aa  198  7e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.365039 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0209  nitrate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  43.65 
 
 		 283 aa  198  7.999999999999999e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.465549 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3458  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (nitrate)  41.5 
 
 		 263 aa  197  1.0000000000000001e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3167  ABC transporter, ATPase subunit  43.12 
 
 		 271 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.973861  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3092  ABC transporter related  38.93 
 
 		 275 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.935227  normal  0.896647 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2967  ABC transporter-related protein  44.12 
 
 		 259 aa  197  1.0000000000000001e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0379202  normal  0.762779 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3180  ABC transporter related  44.3 
 
 		 254 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.219824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3905  ABC transporter related  43.12 
 
 		 271 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0156  ABC transporter related  42.23 
 
 		 260 aa  197  1.0000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2563  ABC transporter related  44.4 
 
 		 252 aa  197  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3295  ABC transporter related  41.5 
 
 		 258 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0815311 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3100  ABC transporter related  45.73 
 
 		 276 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.872567 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3345  ABC transporter related  42.05 
 
 		 293 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2643  ABC transporter related  42.68 
 
 		 261 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.430112  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5009  ABC transporter related  42.97 
 
 		 285 aa  196  3e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1940  ABC transporter ATP binding protein  42.25 
 
 		 266 aa  196  4.0000000000000005e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000682948 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0346  ABC transporter related  41.11 
 
 		 278 aa  196  4.0000000000000005e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2978  ABC transporter related  42.53 
 
 		 255 aa  196  4.0000000000000005e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24170  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  48.71 
 
 		 330 aa  195  6e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.505798  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1817  ABC transporter  41.57 
 
 		 261 aa  196  6e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3670  ABC transporter related  41.7 
 
 		 293 aa  195  7e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.206821  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1496  ABC transporter related  41.11 
 
 		 255 aa  195  7e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.409922  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3418  ABC transporter related  40.71 
 
 		 284 aa  195  9e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.647429  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3066  ABC transporter related protein  43.67 
 
 		 267 aa  195  9e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.583352  normal  0.320404 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3211  ABC transporter, ATP-binding protein  42.75 
 
 		 282 aa  194  1e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6051  ABC transporter related  43.14 
 
 		 262 aa  194  1e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.152569  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0332  ABC transporter, ATPase subunit  44.49 
 
 		 267 aa  193  2e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1885  ABC transporter-like protein  43.87 
 
 		 274 aa  193  2e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.152883 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4202  ABC transporter related  43.87 
 
 		 286 aa  193  3e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.657394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1428  ABC transporter related  43.03 
 
 		 267 aa  193  3e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.250833  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1371  ABC transporter related  43.03 
 
 		 333 aa  192  4e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.138832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2157  sulfate ester ABC transporter ATPase  45.45 
 
 		 288 aa  192  4e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0499335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3570  ABC transporter related  45.1 
 
 		 265 aa  192  5e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.476626  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2623  ABC transporter related  39.08 
 
 		 255 aa  192  5e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000578325  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3879  ABC transporter related  46.15 
 
 		 258 aa  192  5e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.898001  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4503  ABC transporter related protein  45.28 
 
 		 267 aa  192  6e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2099  ABC transporter related  46.72 
 
 		 298 aa  192  6e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3892  ABC transporter related  41.02 
 
 		 271 aa  192  6e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1128  ABC transporter related  42.57 
 
 		 267 aa  192  7e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3083  ABC transporter related  40.71 
 
 		 306 aa  191  8e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.724622  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3751  ABC transporter, ATPase subunit  41.02 
 
 		 271 aa  191  1e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0792  ABC transporter related protein  38.98 
 
 		 308 aa  190  2e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1387  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  41.5 
 
 		 304 aa  190  2e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.195746  normal  0.160104 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2544  ABC transporter  40.3 
 
 		 269 aa  190  2e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.569384  normal  0.531117 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5225  ABC transporter related  41.5 
 
 		 304 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.272963  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0769  ABC transporter related  48.97 
 
 		 252 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.159721 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1489  ABC transporter related  42.41 
 
 		 283 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>