More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_0202 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008789  Hhal_0202  ABC transporter related  100 
 
 
259 aa  514  1.0000000000000001e-145  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4664  ABC transporter related  45.91 
 
 
274 aa  172  2.9999999999999996e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.456657 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0934  putative ATP-binding transmembrane ABC transporter  45.83 
 
 
457 aa  171  1e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3551  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  46.82 
 
 
324 aa  171  1e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.375079  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17270  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  43.57 
 
 
274 aa  171  1e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.115827  normal  0.528564 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0758  ABC transporter, ATP-binding protein  45.83 
 
 
438 aa  171  1e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0768  ABC transporter, ATP-binding protein  45.83 
 
 
438 aa  171  1e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1933  ABC transporter related  45 
 
 
238 aa  170  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.306396  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0621  ABC transporter, ATP-binding protein  47.23 
 
 
454 aa  168  7e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9277  ABC transporter, ATPase subunit  47.17 
 
 
263 aa  168  8e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1677  ABC transporter related  44.55 
 
 
274 aa  168  9e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.012686  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2275  ABC transporter related  39.44 
 
 
264 aa  167  2e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0996963 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5496  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  41.22 
 
 
446 aa  167  2e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7199  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (nitrate/sulfonates)  40.8 
 
 
278 aa  167  2e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0286852  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1173  ABC transporter related  46.12 
 
 
253 aa  166  2.9999999999999998e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.628732  normal  0.131881 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0571  ABC transporter related  46.19 
 
 
267 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.260264  normal  0.332215 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1358  ABC transporter related  41.67 
 
 
262 aa  166  2.9999999999999998e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7489  ABC transporter ATP-binding protein  42.69 
 
 
433 aa  166  4e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.57359  normal  0.121802 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0023  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  42.69 
 
 
266 aa  166  5e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7481  ABC transporter ATP-binding protein  42.39 
 
 
267 aa  165  5.9999999999999996e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0421656  normal  0.0607667 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5006  ABC transporter related  42.92 
 
 
257 aa  165  6.9999999999999995e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7381  ABC transporter related  42.56 
 
 
262 aa  165  8e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3136  ABC transporter related protein  41.74 
 
 
261 aa  164  1.0000000000000001e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.257722  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0029  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  41.9 
 
 
266 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.05113  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1756  ABC transporter related  41.88 
 
 
433 aa  163  2.0000000000000002e-39  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1163  ABC transporter related  42.67 
 
 
257 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.119429 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2954  ABC transporter related  40.96 
 
 
272 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1824  putative nitrate transport system ATP-binding protein  41.88 
 
 
433 aa  164  2.0000000000000002e-39  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3247  ABC transporter related  43.32 
 
 
457 aa  163  3e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7505  ABC transporter, ATPase subunit  41.46 
 
 
273 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000247297  normal  0.575396 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0571  ABC transporter related  46.58 
 
 
271 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.750725  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0426  ABC transporter related  45.97 
 
 
268 aa  162  4.0000000000000004e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3643  ABC transporter related  37.7 
 
 
259 aa  162  4.0000000000000004e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.857726  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3031  ABC transporter related  42.74 
 
 
448 aa  161  8.000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.146776  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3570  ABC transporter related  42.13 
 
 
457 aa  161  9e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.886427 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0327  ABC transporter related  41.09 
 
 
264 aa  161  9e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.341199  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0014  ABC transporter related  42.62 
 
 
245 aa  161  1e-38  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2786  ABC transporter, ATP-binding protein  40.72 
 
 
232 aa  160  2e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0961461  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2836  ABC transporter related  39.83 
 
 
272 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.840356  normal  0.83525 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1034  ABC transporter related protein  43.97 
 
 
272 aa  160  2e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1647  ABC transporter related  43.53 
 
 
330 aa  160  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.480345  normal  0.121683 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3325  ABC transporter related protein  43.91 
 
 
440 aa  160  2e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3146  ABC transporter related  43.04 
 
 
266 aa  160  2e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.25473 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0467  ABC transporter related  41.27 
 
 
274 aa  159  3e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4537  ABC transporter related  42.98 
 
 
436 aa  159  4e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.989586 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1045  ABC transporter related  37.3 
 
 
259 aa  159  4e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.162928  normal  0.159703 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3465  ABC transporter related  42.98 
 
 
436 aa  159  4e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.320704 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1930  putative sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  41.38 
 
 
262 aa  159  5e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0780137  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1270  ABC transporter related  43.17 
 
 
447 aa  159  5e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.904151 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3545  ABC transporter related  45.58 
 
 
453 aa  159  5e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3870  ABC transporter related  41.77 
 
 
267 aa  159  6e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4264  ABC transporter related  41.18 
 
 
255 aa  159  6e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0906906  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1264  ABC transporter ATP-binding protein  43.17 
 
 
284 aa  159  6e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.150023 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0136  hypothetical protein  40.25 
 
 
432 aa  158  7e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0121  hypothetical protein  40.25 
 
 
432 aa  158  7e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0713  ABC transporter related protein  46.36 
 
 
265 aa  158  7e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.423437  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0259  ABC transporter related  43.5 
 
 
270 aa  158  7e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.511865 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0123  ABC transporter-related protein  41.3 
 
 
259 aa  158  7e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.897174  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4642  ABC transporter related  43.05 
 
 
284 aa  158  7e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.842575  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3570  ABC transporter related  47.26 
 
 
265 aa  158  8e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.476626  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0424  ABC transporter related protein  44.87 
 
 
254 aa  158  8e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.573696  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3269  ABC transporter related  45.95 
 
 
263 aa  158  9e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.874896 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5154  ABC transporter related  40.59 
 
 
268 aa  158  9e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.597589  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2625  ABC transporter related  40.32 
 
 
267 aa  158  1e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.173465  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3789  ABC transporter related  45.45 
 
 
254 aa  157  1e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0962243  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1435  ABC transporter related protein  43.28 
 
 
291 aa  157  2e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.597503  normal  0.846861 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0332  ABC transporter, ATPase subunit  47.17 
 
 
267 aa  157  2e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0693  ABC transporter, conserved site  39.23 
 
 
441 aa  156  2e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0792  ABC transporter related protein  40.16 
 
 
308 aa  157  2e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1383  ABC transporter related  42.73 
 
 
269 aa  156  3e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.181644  normal 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4164  ABC transporter related  39.13 
 
 
268 aa  156  3e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.143983  normal  0.780966 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2951  ABC transporter, ATP-binding protein  44.67 
 
 
435 aa  156  4e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0156  ABC transporter related  35.71 
 
 
260 aa  156  4e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5404  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  42.92 
 
 
257 aa  156  4e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.255113  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1094  ABC transporter related  40 
 
 
299 aa  156  4e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0108861  normal  0.165383 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4096  ABC transporter related protein  44.44 
 
 
261 aa  155  5.0000000000000005e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0795194 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2628  sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  43.69 
 
 
270 aa  155  6e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.197945  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0800  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  42.34 
 
 
276 aa  155  6e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.872437  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1308  ABC transporter related  39.01 
 
 
252 aa  155  6e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4503  ABC transporter related protein  42.08 
 
 
267 aa  155  7e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1645  ABC transporter related  38.06 
 
 
253 aa  155  7e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2815  ABC transporter related  45.15 
 
 
241 aa  155  7e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000485223 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4848  Sigma 54 interacting domain protein  40.77 
 
 
253 aa  155  8e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.627338 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0470  ABC transporter related  41.88 
 
 
276 aa  155  8e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1090  ABC transporter related  39.68 
 
 
261 aa  155  8e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3254  ABC transporter related  37.6 
 
 
258 aa  155  9e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0994591 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4372  ABC transporter related  40.77 
 
 
253 aa  154  9e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.191075 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0876  ABC transporter related  36.18 
 
 
218 aa  154  1e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2039  ABC transporter related  39.61 
 
 
306 aa  154  1e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.768155 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1802  ABC transporter related protein  43.1 
 
 
267 aa  154  1e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00421209  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5006  ABC transporter related  39.92 
 
 
287 aa  154  1e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1788  ABC transporter related  36.8 
 
 
303 aa  154  1e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2932  putative sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  35.02 
 
 
251 aa  154  1e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2491  ABC aliphatic sulfonates transporter, ATPase subunit  43.48 
 
 
261 aa  154  1e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.761124 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2904  ABC transporter related  40 
 
 
270 aa  154  1e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0445  ABC transporter related  40.93 
 
 
254 aa  154  1e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3141  ABC transporter-related protein  42.36 
 
 
233 aa  154  1e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0745233  normal  0.0402056 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2967  ABC transporter-related protein  37.2 
 
 
259 aa  154  1e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0379202  normal  0.762779 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1107  ABC transporter related  38.99 
 
 
255 aa  154  1e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.129879 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0430  ABC transporter related protein  42.92 
 
 
437 aa  154  1e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>