More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_27180 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_27180  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  100 
 
 		 261 aa  541  1e-153  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.785325  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0404  ABC transporter related protein  47.93 
 
 		 261 aa  218  7e-56  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0962  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  45.42 
 
 		 304 aa  217  2e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.439268 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2204  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  44.92 
 
 		 288 aa  216  2.9999999999999998e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3485  putative nitrate transport system ATP-binding protein  41.87 
 
 		 308 aa  211  7e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3974  ABC transporter related  43.95 
 
 		 292 aa  211  1e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0320166 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2587  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  46.45 
 
 		 290 aa  210  2e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00193171 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0164  ABC transporter related  45.87 
 
 		 275 aa  209  4e-53  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2170  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  44.09 
 
 		 308 aa  207  1e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0468857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6457  ABC transporter ATP-binding protein  44.12 
 
 		 261 aa  207  1e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1979  ABC transporter related  50 
 
 		 258 aa  205  6e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000563857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0995  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  43.9 
 
 		 287 aa  205  6e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0849  ABC transporter-related protein  47.96 
 
 		 253 aa  204  1e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0140067  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1428  ABC transporter related  41.76 
 
 		 267 aa  202  3e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.250833  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3740  ABC transporter related  41.83 
 
 		 287 aa  203  3e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2790  ABC transporter related protein  45.8 
 
 		 268 aa  202  3e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1899  ABC transporter-related protein  43.43 
 
 		 264 aa  201  7e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.126966  hitchhiker  0.000000000000779353 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0290  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  43.08 
 
 		 291 aa  201  7e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0398  ABC transporter related  47.51 
 
 		 259 aa  201  8e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.698259 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2804  ABC transporter related protein  44.95 
 
 		 256 aa  201  9.999999999999999e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00228299  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1236  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  44.35 
 
 		 274 aa  200  1.9999999999999998e-50  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.875823 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0435  ABC transporter related  43.78 
 
 		 256 aa  199  3.9999999999999996e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.30818  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3655  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  42.26 
 
 		 263 aa  198  7.999999999999999e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2718  ABC transporter related  42.56 
 
 		 259 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0876  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  41.13 
 
 		 278 aa  197  1.0000000000000001e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.190681  hitchhiker  0.00187528 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0420  ABC transporter related  43.94 
 
 		 265 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.889733 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2895  ABC transporter related  43.56 
 
 		 265 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.425286 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1491  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  42.79 
 
 		 278 aa  197  2.0000000000000003e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.495722  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0054  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  45.27 
 
 		 257 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1471  ABC transporter related  45.78 
 
 		 258 aa  196  3e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4675  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  40.61 
 
 		 280 aa  196  3e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0046  ABC transporter-related protein  44.44 
 
 		 269 aa  196  3e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1024  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  43.17 
 
 		 288 aa  196  4.0000000000000005e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0928841 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1045  ABC transporter related  39.77 
 
 		 259 aa  196  4.0000000000000005e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.162928  normal  0.159703 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1387  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  44.77 
 
 		 304 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.195746  normal  0.160104 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4567  ABC transporter related  44.49 
 
 		 260 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0508  ABC transporter related  45.74 
 
 		 265 aa  195  5.000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0576814 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2836  ABC transporter related  47.25 
 
 		 272 aa  196  5.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.840356  normal  0.83525 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1733  ABC transporter related protein  44.13 
 
 		 265 aa  195  5.000000000000001e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2270  ABC transporter related  43.18 
 
 		 265 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2885  ABC transporter related  43.18 
 
 		 265 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0156  ABC transporter related  40.89 
 
 		 260 aa  195  6e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6226  ABC taurine transporter, ATPase subunit  42.38 
 
 		 265 aa  195  6e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4208  ABC taurine transporter, ATPase subunit  45.29 
 
 		 265 aa  195  6e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.775871 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1645  ABC transporter related  43.88 
 
 		 253 aa  195  6e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1847  ABC transporter ATP-binding protein  47.39 
 
 		 272 aa  194  8.000000000000001e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1077  ATPase  45.16 
 
 		 251 aa  194  8.000000000000001e-49  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.096527  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1956  ABC transporter related  47.39 
 
 		 272 aa  194  8.000000000000001e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5006  ABC transporter related  40.61 
 
 		 257 aa  195  8.000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16920  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  46.64 
 
 		 269 aa  194  9e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.407228  normal  0.132168 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4457  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  43.62 
 
 		 668 aa  194  1e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.631806 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2274  ABC transporter ATP-binding protein  47.39 
 
 		 272 aa  194  1e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4394  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  43.62 
 
 		 668 aa  194  1e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2105  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  45.54 
 
 		 289 aa  194  1e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2599  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  41.05 
 
 		 285 aa  194  1e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2415  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  46.77 
 
 		 284 aa  194  1e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.247099  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3518  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  41.05 
 
 		 285 aa  194  1e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3524  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  44.55 
 
 		 337 aa  193  2e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2884  ABC transporter related  47.53 
 
 		 263 aa  194  2e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2275  ABC transporter related  47.47 
 
 		 264 aa  193  3e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0996963 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0147  ABC transporter related  45.5 
 
 		 259 aa  193  3e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.288686 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2857  ABC transporter-related protein  39.18 
 
 		 259 aa  193  3e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.99142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4569  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  41.67 
 
 		 275 aa  193  3e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.571931  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4393  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  42.65 
 
 		 280 aa  192  4e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0513  ABC transporter related  41.94 
 
 		 254 aa  192  4e-48  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1505  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  44.44 
 
 		 262 aa  192  4e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0234474  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4456  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  42.65 
 
 		 280 aa  192  4e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.458938  normal  0.759518 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4543  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  40.66 
 
 		 277 aa  192  4e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1490  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  43.58 
 
 		 663 aa  192  4e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.810592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1128  ABC transporter related  44.6 
 
 		 267 aa  192  4e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5225  ABC transporter related  48.48 
 
 		 304 aa  192  4e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.272963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2338  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  42.13 
 
 		 276 aa  192  4e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.685879  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1117  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  46.57 
 
 		 265 aa  192  4e-48  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0059  ABC transporter related  44.34 
 
 		 257 aa  192  5e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0482  ABC transporter related protein  41.43 
 
 		 255 aa  192  5e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2967  ABC transporter-related protein  43.35 
 
 		 259 aa  192  5e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0379202  normal  0.762779 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4661  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  41.04 
 
 		 326 aa  192  6e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4922  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  41.05 
 
 		 286 aa  191  7e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.659379  normal  0.550165 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1210  ABC transporter related  47.39 
 
 		 287 aa  191  8e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.502786  normal  0.459492 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1975  ABC transporter related  45.5 
 
 		 263 aa  191  9e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000056178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  41.94 
 
 		 258 aa  191  1e-47  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2151  ABC transporter related  47.12 
 
 		 263 aa  191  1e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.532453 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4570  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  42.57 
 
 		 668 aa  191  1e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.177412  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2147  ABC transporter related  41.27 
 
 		 274 aa  191  1e-47  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2954  ABC transporter related  48.48 
 
 		 272 aa  191  1e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3269  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  45.45 
 
 		 270 aa  191  1e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.454908  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0328  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  49.01 
 
 		 267 aa  190  2e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3677  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  42.17 
 
 		 274 aa  190  2e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3731  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  42.17 
 
 		 274 aa  190  2e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00678541  normal  0.114622 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4050  ABC transporter related  47 
 
 		 289 aa  190  2e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.95226  normal  0.382919 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5145  ABC transporter related  44.4 
 
 		 267 aa  190  2e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.537076  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0327  ABC transporter related  46.46 
 
 		 264 aa  190  2e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.341199  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8276  ABC-type transporter, ATP-binding protein  47.39 
 
 		 264 aa  190  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0378  hypothetical protein  41.8 
 
 		 260 aa  190  2e-47  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1075  ABC transporter related  45.85 
 
 		 252 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.137281  normal  0.464106 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2643  ABC transporter related  46.08 
 
 		 261 aa  189  2.9999999999999997e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.430112  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2817  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  45.97 
 
 		 282 aa  189  2.9999999999999997e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.042803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3643  ABC transporter related  40.3 
 
 		 259 aa  190  2.9999999999999997e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.857726  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4509  ABC transporter related  44.4 
 
 		 267 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3876  ABC transporter related  47.98 
 
 		 297 aa  189  2.9999999999999997e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>