More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_1077 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_1077  ATPase  100 
 
 
251 aa  506  9.999999999999999e-143  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.096527  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0059  ABC transporter related  54.2 
 
 
257 aa  283  3.0000000000000004e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3254  ABC transporter related  53.6 
 
 
258 aa  259  2e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0994591 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1128  ABC transporter related  49.17 
 
 
267 aa  244  6.999999999999999e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2967  ABC transporter-related protein  47.98 
 
 
259 aa  238  5.999999999999999e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0379202  normal  0.762779 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1045  ABC transporter related  49.55 
 
 
259 aa  236  2e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.162928  normal  0.159703 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0404  ABC transporter related protein  48.65 
 
 
261 aa  236  3e-61  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8276  ABC-type transporter, ATP-binding protein  47.01 
 
 
264 aa  235  5.0000000000000005e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2718  ABC transporter related  46.96 
 
 
259 aa  235  6e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2560  ABC transporter related  46.85 
 
 
271 aa  233  3e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1090  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  46.56 
 
 
260 aa  233  3e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2857  ABC transporter-related protein  47.37 
 
 
259 aa  233  3e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.99142  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0467  ABC transporter related  45.56 
 
 
274 aa  231  6e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0513  ABC transporter related  45.19 
 
 
254 aa  231  6e-60  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1505  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  49.58 
 
 
262 aa  231  1e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0234474  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1368  ABC transporter ATP-binding protein  45.42 
 
 
278 aa  231  1e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0478866 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2275  ABC transporter related  50.66 
 
 
264 aa  229  3e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0996963 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0156  ABC transporter related  47.32 
 
 
260 aa  229  4e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3066  ABC transporter related protein  49.78 
 
 
267 aa  228  6e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.583352  normal  0.320404 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1475  ABC transporter related  46.06 
 
 
254 aa  228  8e-59  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0445  ABC transporter related  46.06 
 
 
254 aa  228  9e-59  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1691  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  47.41 
 
 
280 aa  227  1e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0162641  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3643  ABC transporter related  49.32 
 
 
259 aa  227  2e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.857726  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0147  ABC transporter related  47.32 
 
 
259 aa  226  3e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.288686 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1428  ABC transporter related  44.58 
 
 
267 aa  224  9e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.250833  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6457  ABC transporter ATP-binding protein  47.14 
 
 
261 aa  224  9e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4936  ABC transporter related protein  50.23 
 
 
278 aa  224  1e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0551994  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1733  ABC transporter related protein  45 
 
 
265 aa  223  2e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4929  ABC transporter-like  46.69 
 
 
278 aa  223  2e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0327  ABC transporter related  49.34 
 
 
264 aa  223  2e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.341199  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5225  ABC transporter related  46.5 
 
 
304 aa  222  4e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.272963  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1030  ABC transporter, ATP-binding protein  46.4 
 
 
254 aa  222  4.9999999999999996e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0392  ABC transporter related  45.23 
 
 
254 aa  221  6e-57  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.238571  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1210  ABC transporter related  44.44 
 
 
287 aa  222  6e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.502786  normal  0.459492 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2836  ABC transporter related  45.68 
 
 
272 aa  221  7e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.840356  normal  0.83525 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0218  ABC transporter related  49.02 
 
 
251 aa  221  7e-57  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5516  ABC transporter related  43.97 
 
 
271 aa  221  8e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.25838  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1387  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  46.09 
 
 
304 aa  221  8e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.195746  normal  0.160104 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6155  ABC transporter related  46.49 
 
 
286 aa  221  8e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.300039  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1187  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  46.96 
 
 
260 aa  221  9e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0360138  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2643  ABC transporter related  44.64 
 
 
261 aa  220  1.9999999999999999e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.430112  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1321  ABC transporter-like protein  48.33 
 
 
288 aa  219  1.9999999999999999e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.251104 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3034  ABC transporter related  47.98 
 
 
292 aa  220  1.9999999999999999e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.652183  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0039  ABC transporter related  44.84 
 
 
276 aa  219  1.9999999999999999e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.147558  normal  0.492978 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  42.11 
 
 
258 aa  219  3e-56  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2151  ABC transporter related  46.64 
 
 
263 aa  219  3.9999999999999997e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.532453 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5555  ABC transporter related  44.09 
 
 
303 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356356  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5920  ABC transporter related  44.09 
 
 
303 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0398  ABC transporter related  51.42 
 
 
259 aa  218  5e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.698259 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6226  ABC taurine transporter, ATPase subunit  46.41 
 
 
265 aa  218  5e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1979  ABC transporter related  45.68 
 
 
258 aa  219  5e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000563857  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6427  ABC transporter related  44.09 
 
 
303 aa  219  5e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6201  ABC transporter related  43.04 
 
 
245 aa  218  7e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.102037 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1260  ABC transporter related  43.21 
 
 
293 aa  218  7.999999999999999e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.227509 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1421  ABC transporter related  43.21 
 
 
293 aa  218  8.999999999999998e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0420  ABC transporter related  47.58 
 
 
265 aa  218  8.999999999999998e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.889733 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3083  ABC transporter related  44.63 
 
 
306 aa  218  8.999999999999998e-56  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.724622  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1788  ABC transporter related  44 
 
 
303 aa  218  1e-55  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16920  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  44.4 
 
 
269 aa  217  1e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.407228  normal  0.132168 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0054  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  44.73 
 
 
257 aa  218  1e-55  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5006  ABC transporter related  47.56 
 
 
257 aa  216  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1645  ABC transporter related  45.5 
 
 
253 aa  216  2e-55  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4305  ABC transporter related  44.22 
 
 
273 aa  217  2e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272884  hitchhiker  0.0022322 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1352  ABC transporter related  52.29 
 
 
262 aa  216  2.9999999999999998e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2895  ABC transporter related  47.14 
 
 
265 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.425286 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2270  ABC transporter related  47.14 
 
 
265 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2954  ABC transporter related  46.43 
 
 
272 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2885  ABC transporter related  47.14 
 
 
265 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1764  ABC transporter related  44.18 
 
 
263 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0209  ABC transporter-like  48.12 
 
 
271 aa  216  4e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2147  ABC transporter related  50.75 
 
 
274 aa  216  4e-55  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4050  ABC transporter related  44.39 
 
 
289 aa  215  4e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.95226  normal  0.382919 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0209  nitrate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  46.26 
 
 
283 aa  215  5e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.465549 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0378  hypothetical protein  42.63 
 
 
260 aa  215  5e-55  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0849  ABC transporter-related protein  45.02 
 
 
253 aa  215  5.9999999999999996e-55  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0140067  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1909  ABC transporter related  45.9 
 
 
286 aa  215  5.9999999999999996e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3499  ABC transporter related  48.86 
 
 
265 aa  214  7e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.14517  normal  0.695761 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0079  ABC transporter related  47.75 
 
 
307 aa  214  7e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1899  ABC transporter-related protein  45.9 
 
 
264 aa  215  7e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.126966  hitchhiker  0.000000000000779353 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0671  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  45.16 
 
 
279 aa  214  9.999999999999999e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.299048  normal  0.328803 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4208  ABC taurine transporter, ATPase subunit  48.29 
 
 
265 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.775871 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2086  ABC transporter related  47.51 
 
 
291 aa  214  9.999999999999999e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.124601 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4202  ABC transporter related  46.43 
 
 
286 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.657394  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1801  ABC transporter related protein  45.3 
 
 
267 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0087  ABC transporter related  44.17 
 
 
263 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4372  ABC transporter related  45.37 
 
 
271 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.214252  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3506  ABC transporter related  46.29 
 
 
270 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.715593  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1403  ABC transporter related  42.57 
 
 
267 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1481  ABC transporter related  43.15 
 
 
283 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3948  ABC transporter related  44.94 
 
 
268 aa  213  2.9999999999999995e-54  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000210957  normal  0.419915 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1857  ABC transporter related  45.18 
 
 
304 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2884  ABC transporter related  47.77 
 
 
263 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0693  ABC taurine transporter, ATPase subunit  45.98 
 
 
271 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000207079  normal  0.0416472 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4567  ABC transporter related  46.26 
 
 
260 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1471  ABC transporter related  48.02 
 
 
258 aa  212  3.9999999999999995e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4331  alkanesulfonate ABC transporter ATP-binding protein  47.26 
 
 
256 aa  212  4.9999999999999996e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44540  ABC transporter  43.04 
 
 
288 aa  211  7e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2536  putative taurine ABC transporter, ATP-binding protein  45.95 
 
 
264 aa  211  7.999999999999999e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.280806  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5006  ABC transporter related  52.76 
 
 
287 aa  211  1e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1262  ABC transporter related  45.12 
 
 
259 aa  211  1e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0287206  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>