More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0667 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013124  Afer_0667  ABC transporter related  100 
 
 
273 aa  537  9.999999999999999e-153  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1075  ABC transporter related  47.93 
 
 
252 aa  242  5e-63  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.137281  normal  0.464106 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0849  ABC transporter-related protein  51.58 
 
 
253 aa  236  4e-61  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0140067  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44540  ABC transporter  49.17 
 
 
288 aa  235  5.0000000000000005e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1900  ABC transporter related  51.08 
 
 
269 aa  234  1.0000000000000001e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0378  hypothetical protein  46.96 
 
 
260 aa  227  2e-58  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03350  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  47.64 
 
 
261 aa  223  3e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  41.7 
 
 
258 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0845  ABC transporter related  47.62 
 
 
276 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.287253 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1107  ABC transporter related  43.22 
 
 
255 aa  218  7.999999999999999e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.129879 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0087  ABC transporter related  44.13 
 
 
263 aa  218  1e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2133  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  44.66 
 
 
252 aa  216  2e-55  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0218  ABC transporter related  43.87 
 
 
251 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0807  ABC transporter related  45.8 
 
 
269 aa  216  4e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.455697  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0467  ABC transporter related  49.13 
 
 
274 aa  215  7e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2086  ABC transporter related  45.86 
 
 
291 aa  215  8e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.124601 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5800  ABC transporter related  43.4 
 
 
284 aa  214  9e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2011  ABC transporter related  45.97 
 
 
295 aa  214  9e-55  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.284582  normal  0.208139 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0735  ABC transporter related  42.97 
 
 
253 aa  214  9e-55  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0415182  normal  0.371016 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1030  ABC transporter, ATP-binding protein  45.22 
 
 
254 aa  214  9.999999999999999e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5606  ABC transporter related protein  46.4 
 
 
264 aa  213  2.9999999999999995e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.231398  normal  0.622338 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4642  ABC transporter related  45.97 
 
 
284 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.842575  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4202  ABC transporter related  46.44 
 
 
286 aa  212  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.657394  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7587  ABC transporter related protein  46.85 
 
 
258 aa  212  4.9999999999999996e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.439074  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4305  ABC transporter related  44.36 
 
 
273 aa  211  7.999999999999999e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272884  hitchhiker  0.0022322 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6155  ABC transporter related  46.44 
 
 
286 aa  210  2e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.300039  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1691  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  45.86 
 
 
280 aa  210  2e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0162641  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5062  ABC transporter related  45.09 
 
 
246 aa  209  3e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.314971  normal  0.024914 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3159  ABC transporter-like  48.68 
 
 
282 aa  209  4e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1132  ABC transporter related  41.44 
 
 
301 aa  207  1e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.20268 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1788  ABC transporter related  40.34 
 
 
303 aa  207  1e-52  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1475  ABC transporter related  41.83 
 
 
254 aa  207  1e-52  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3418  ABC transporter related  48.54 
 
 
284 aa  207  2e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.647429  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3808  ABC transporter-related protein  47.92 
 
 
271 aa  207  2e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2718  ABC transporter related  43.32 
 
 
259 aa  206  4e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0445  ABC transporter related  42.23 
 
 
254 aa  206  5e-52  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0392  ABC transporter related  43.72 
 
 
254 aa  206  5e-52  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.238571  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1183  ABC transporter related  42.02 
 
 
279 aa  205  6e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0458641  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2643  ABC transporter related  42.51 
 
 
261 aa  205  8e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.430112  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0147  ABC transporter related  42.29 
 
 
259 aa  204  1e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.288686 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3892  ABC transporter related  47.08 
 
 
271 aa  204  2e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0156  ABC transporter related  42.58 
 
 
260 aa  202  3e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1045  ABC transporter related  42.8 
 
 
259 aa  203  3e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.162928  normal  0.159703 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0572  ABC transporter related  45.05 
 
 
269 aa  202  3e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4264  ABC transporter related  46.03 
 
 
255 aa  202  4e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0906906  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0513  ABC transporter related  39.37 
 
 
254 aa  202  5e-51  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0079  ABC transporter related  44.14 
 
 
307 aa  202  5e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4077  ABC transporter related protein  46.69 
 
 
290 aa  202  5e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.264112 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1428  ABC transporter related  44.68 
 
 
267 aa  202  5e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.250833  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5601  ABC transporter related  40.48 
 
 
267 aa  202  5e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.059714  normal  0.713913 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5006  ABC transporter related  46.98 
 
 
287 aa  202  6e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7628  ABC transporter ATP-binding protein  44.09 
 
 
281 aa  202  7e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.494067  normal  0.333376 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1857  ABC transporter related  41.32 
 
 
304 aa  202  7e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2275  ABC transporter related  45.97 
 
 
264 aa  201  7e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0996963 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5225  ABC transporter related  42.34 
 
 
304 aa  201  8e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.272963  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8276  ABC-type transporter, ATP-binding protein  44.58 
 
 
264 aa  201  8e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0327  ABC transporter related  44.19 
 
 
264 aa  201  9e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.341199  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5154  ABC transporter related  47.08 
 
 
268 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.597589  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1472  ABC transporter related  40.59 
 
 
292 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.211771  normal  0.769555 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0463  ABC transporter related  45.38 
 
 
257 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.335416  normal  0.0141237 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4356  ABC transporter related  44.3 
 
 
275 aa  201  9.999999999999999e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0157567  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4096  ABC transporter related protein  45.75 
 
 
261 aa  201  9.999999999999999e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0795194 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4843  putative ABC transporter ATP-binding protein  44.23 
 
 
284 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.365039 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0404  ABC transporter related protein  39.04 
 
 
261 aa  200  1.9999999999999998e-50  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5009  ABC transporter related  47.14 
 
 
285 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0826  ABC transporter, ATPase subunit  47.86 
 
 
273 aa  200  1.9999999999999998e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.617854  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3513  ABC transporter related  38.35 
 
 
279 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1572  ABC transporter related protein  42.74 
 
 
267 aa  201  1.9999999999999998e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2804  ABC transporter related protein  41.18 
 
 
256 aa  200  1.9999999999999998e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00228299  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1368  ABC transporter ATP-binding protein  43.19 
 
 
278 aa  199  3e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0478866 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6544  putative ABC transporter  39.46 
 
 
259 aa  199  3e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.353316 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3906  ABC transporter related  42.51 
 
 
315 aa  199  3e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.118447  normal  0.091795 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4050  ABC transporter related  44.11 
 
 
289 aa  199  3.9999999999999996e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.95226  normal  0.382919 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0209  ABC transporter-like  43.02 
 
 
271 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1975  ABC transporter related  40.71 
 
 
263 aa  199  3.9999999999999996e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000056178  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1387  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  43.16 
 
 
304 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.195746  normal  0.160104 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4347  ABC transporter related  49.12 
 
 
281 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4019  ABC transporter related  49.12 
 
 
281 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0671  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  45.3 
 
 
279 aa  199  5e-50  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.299048  normal  0.328803 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0230  ABC transporter related  46.12 
 
 
287 aa  199  5e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6457  ABC transporter ATP-binding protein  43.43 
 
 
261 aa  199  5e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4936  ABC transporter related protein  42.31 
 
 
278 aa  198  6e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0551994  normal 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4186  ABC transporter related  44.53 
 
 
273 aa  199  6e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.431014 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0455  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  44.35 
 
 
287 aa  198  7e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2857  ABC transporter-related protein  41.77 
 
 
259 aa  198  7.999999999999999e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.99142  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5920  ABC transporter related  41.9 
 
 
303 aa  198  9e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3505  ABC transporter related  48.68 
 
 
281 aa  198  9e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.870495  hitchhiker  0.000930317 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0892  ABC transporter related  47.28 
 
 
252 aa  197  1.0000000000000001e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0967243 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2064  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  48.68 
 
 
281 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.768493  normal  0.657795 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6427  ABC transporter related  43.03 
 
 
303 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3751  ABC transporter, ATPase subunit  44.06 
 
 
271 aa  197  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5555  ABC transporter related  41.9 
 
 
303 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356356  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3034  ABC transporter related  43.78 
 
 
292 aa  197  1.0000000000000001e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.652183  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3912  ABC transporter related  42.19 
 
 
276 aa  198  1.0000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00786464  normal  0.17343 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4929  ABC transporter-like  44.02 
 
 
278 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3643  ABC transporter related  42.91 
 
 
259 aa  196  2.0000000000000003e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.857726  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1645  ABC transporter related  43.85 
 
 
253 aa  196  3e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0792  ABC transporter related protein  39.59 
 
 
308 aa  196  3e-49  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18140  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  43.31 
 
 
267 aa  196  3e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2000  ABC transporter-related protein  41.77 
 
 
251 aa  196  3e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.554575  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>