More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_3456 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_3456  ABC transporter related  100 
 
 		 252 aa  478  1e-134  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000578297 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4894  ABC transporter related  84.92 
 
 		 252 aa  368  1e-101  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4848  Sigma 54 interacting domain protein  64.26 
 
 		 253 aa  301  8.000000000000001e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.627338 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4372  ABC transporter related  64.26 
 
 		 253 aa  300  1e-80  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.191075 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4264  ABC transporter related  63.93 
 
 		 255 aa  297  1e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0906906  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2449  ABC transporter related  57.58 
 
 		 255 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.259885 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2804  ABC transporter related protein  45.23 
 
 		 256 aa  212  3.9999999999999995e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00228299  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0849  ABC transporter-related protein  46.37 
 
 		 253 aa  212  3.9999999999999995e-54  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0140067  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4331  alkanesulfonate ABC transporter ATP-binding protein  46.88 
 
 		 256 aa  211  7.999999999999999e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3879  ABC transporter related  51.44 
 
 		 258 aa  211  1e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.898001  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0181  ABC transporter related  55.91 
 
 		 260 aa  210  2e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.945523  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0398  ABC transporter related  48.19 
 
 		 259 aa  209  4e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.698259 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4270  ABC transporter related  51.03 
 
 		 257 aa  209  4e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.74821  normal  0.0108203 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0667  ABC transporter related  50.66 
 
 		 273 aa  209  4e-53  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0769  ABC transporter related  53.02 
 
 		 252 aa  208  8e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.159721 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1262  ABC transporter related  48.52 
 
 		 259 aa  208  9e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0287206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7645  putative sulfonate ABC transporter, ATP binding protein  51.91 
 
 		 261 aa  207  1e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0412308  normal  0.633643 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5062  ABC transporter related  48.02 
 
 		 246 aa  206  2e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.314971  normal  0.024914 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4567  ABC transporter related  47.79 
 
 		 260 aa  206  3e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2369  ABC transporter related  42.86 
 
 		 263 aa  204  9e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0194302  normal  0.406873 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4096  ABC transporter related protein  51.95 
 
 		 261 aa  204  1e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0795194 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1075  ABC transporter related  47.16 
 
 		 252 aa  204  1e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.137281  normal  0.464106 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3870  ABC transporter related  49.36 
 
 		 272 aa  203  2e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3339  ABC transporter related  51.56 
 
 		 260 aa  203  2e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00741331  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1030  ABC transporter, ATP-binding protein  43.51 
 
 		 254 aa  203  3e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0218  ABC transporter related  42.68 
 
 		 251 aa  202  4e-51  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0735  ABC transporter related  45.12 
 
 		 253 aa  202  4e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0415182  normal  0.371016 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3808  ABC transporter-related protein  45.68 
 
 		 271 aa  202  4e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0378  ABC transporter related  48.35 
 
 		 259 aa  202  6e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3876  ABC transporter related  46.12 
 
 		 297 aa  201  7e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3751  ABC transporter, ATPase subunit  46.09 
 
 		 271 aa  201  8e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3892  ABC transporter related  45.68 
 
 		 271 aa  200  9.999999999999999e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0331  ABC transporter related  47.93 
 
 		 259 aa  200  9.999999999999999e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  39.59 
 
 		 258 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0087  ABC transporter related  45.53 
 
 		 263 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0378  hypothetical protein  42.62 
 
 		 260 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0104  ABC transporter related  50 
 
 		 260 aa  200  1.9999999999999998e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.464024  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5983  ABC transporter ATP-binding protein  48.9 
 
 		 267 aa  199  3e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.289741 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0445  ABC transporter related  44.64 
 
 		 254 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4050  ABC transporter related  46.19 
 
 		 289 aa  199  3.9999999999999996e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.95226  normal  0.382919 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0384  ABC transporter related  49.2 
 
 		 288 aa  199  3.9999999999999996e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.317269  normal  0.323719 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1296  ABC transporter related  42.45 
 
 		 265 aa  199  5e-50  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1899  ABC transporter-related protein  44.14 
 
 		 264 aa  198  7e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.126966  hitchhiker  0.000000000000779353 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0408  ABC transporter related  49.38 
 
 		 259 aa  198  9e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0896853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4886  ABC transporter related  48.51 
 
 		 297 aa  197  1.0000000000000001e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0435  ABC transporter related  39.75 
 
 		 256 aa  197  1.0000000000000001e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.30818  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1321  ABC transporter-like protein  51.38 
 
 		 288 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.251104 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2836  ABC transporter related  47.33 
 
 		 272 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.840356  normal  0.83525 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0346  ABC transporter related  42.34 
 
 		 278 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0392  ABC transporter related  40.65 
 
 		 254 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.238571  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2133  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  41.11 
 
 		 252 aa  196  3e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0113  ABC transporter related  50.93 
 
 		 261 aa  196  3e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.692675 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3034  ABC transporter related  50.22 
 
 		 292 aa  196  3e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.652183  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3867  ABC transporter related  47.76 
 
 		 265 aa  196  3e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.685954  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4562  ABC transporter related  46.37 
 
 		 445 aa  196  3e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.661059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1475  ABC transporter related  43.3 
 
 		 254 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1081  ABC transporter related  49.31 
 
 		 289 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0182261 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4138  ABC transporter-like  50 
 
 		 255 aa  195  5.000000000000001e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000371805  hitchhiker  0.00945872 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1733  ABC transporter related protein  49.29 
 
 		 265 aa  195  6e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6282  ABC transporter related  48.41 
 
 		 266 aa  195  7e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.166424  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1055  ABC transporter related  44.92 
 
 		 292 aa  194  8.000000000000001e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.258334  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1358  ABC transporter related  41.7 
 
 		 262 aa  194  9e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3009  ABC transporter related  46.06 
 
 		 245 aa  194  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2151  ABC transporter related  42.39 
 
 		 263 aa  194  1e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.532453 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1885  ABC transporter-like protein  44.76 
 
 		 274 aa  194  1e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.152883 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5128  ABC transporter related  50.22 
 
 		 256 aa  194  1e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.012319  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3325  ABC transporter related protein  46.39 
 
 		 440 aa  194  1e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0150  ABC transporter related  45.04 
 
 		 252 aa  194  2e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1900  ABC transporter related  48.26 
 
 		 269 aa  193  2e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2104  ABC transporter related protein  44.76 
 
 		 268 aa  194  2e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6033  putative ABC transporter, ATP-binding protein  46.73 
 
 		 261 aa  193  2e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5800  ABC transporter related  45.57 
 
 		 284 aa  192  3e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0209  ABC transporter-like  42.46 
 
 		 271 aa  192  3e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1210  ABC transporter related  44.31 
 
 		 287 aa  192  3e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.502786  normal  0.459492 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2147  ABC transporter related  48.6 
 
 		 274 aa  192  4e-48  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1975  ABC transporter related  46.72 
 
 		 263 aa  192  4e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000056178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2359  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  48.43 
 
 		 259 aa  192  4e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.504714 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0513  ABC transporter related  38.06 
 
 		 254 aa  192  4e-48  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02140  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  47.91 
 
 		 272 aa  192  4e-48  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3352  ABC transporter related  43.37 
 
 		 261 aa  192  5e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0259  ABC transporter related  50.48 
 
 		 270 aa  192  6e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.511865 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2954  ABC transporter related  46.28 
 
 		 272 aa  192  6e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1183  ABC transporter related  42.22 
 
 		 279 aa  192  6e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0458641  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2052  ABC transporter related  49.76 
 
 		 284 aa  191  7e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.405737 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1368  ABC transporter ATP-binding protein  44.72 
 
 		 278 aa  191  7e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0478866 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0408  ABC transporter related  44 
 
 		 262 aa  191  8e-48  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.468128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7628  ABC transporter ATP-binding protein  43.15 
 
 		 281 aa  191  9e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.494067  normal  0.333376 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4186  ABC transporter related  45.61 
 
 		 273 aa  191  9e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.431014 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2802  ABC transporter related protein  46.77 
 
 		 260 aa  191  9e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1433  ABC transporter related  44.44 
 
 		 292 aa  191  9e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.567066  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2893  ABC transporter related  51.39 
 
 		 259 aa  191  1e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.767338  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1860  ABC transporter related  45.11 
 
 		 259 aa  191  1e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.188134  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5606  ABC transporter related protein  45.19 
 
 		 264 aa  191  1e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.231398  normal  0.622338 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2338  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  42.29 
 
 		 276 aa  191  1e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.685879  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0618  ABC transporter related  45.33 
 
 		 259 aa  191  1e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1505  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  48.37 
 
 		 262 aa  190  2e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0234474  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0826  ABC transporter, ATPase subunit  48.46 
 
 		 273 aa  190  2e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.617854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3148  ABC transporter related  44.49 
 
 		 266 aa  190  2e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2103  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  44.67 
 
 		 263 aa  190  2e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0097031  normal  0.0581699 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2563  ABC-transport protein, ATP-binding protein  49.13 
 
 		 288 aa  190  2e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.25889 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>